Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "BIOINFORMATYKA" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-8 z 8
    Tytuł:
    Models of computational intelligence in bioinformatics
    Autorzy:
    Pedrycz, W.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/333235.pdf
    Data publikacji:
    2003
    Wydawca:
    Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
    Tematy:
    obliczenia granularne
    logika
    bioinformatyka
    granulki informacji
    zbiory rozmyte
    zbiory przybliżone
    granular computing
    logics
    bioinformatics
    information granules
    fuzzy sets
    rough sets
    Opis:
    Computational Intelligence has emerged as a synergistic environment of Granular Computing (including fuzzy sets, rough sets, interval analysis), neural networks and evolutionary optimisation. This symbiotic framework addresses the needs of system modelling with regard to its transparency, accuracy and user friendliness. This becomes of paramount interest in various modelling in bioinformatics especially when we are concerned with decision-making processes. The objective of this study is to elaborate on the two essential features of CI that is Granular Computing and the resulting aspects of logic-oriented processing and its transparency. As the name stipulates, Granular Computing is concerned with processing carried out at a level of coherent conceptual entities - information granules. Such granules are viewed as inherently conceptual entities formed at some level of abstraction whose processing is rooted in the language of logic (especially, many valued or fuzzy logic). The logic facet of processing is cast in the realm of fuzzy logic and fuzzy sets that construct a consistent processing background necessary for operating on information granules. Several main categories of logic processing units (logic neurons) are discussed that support aggregative (and-like and or-like operators) and referential logic mechanisms (dominance, inclusion, and matching). We show how the logic neurons contribute to high functional transparency of granular processing, help capture prior domain knowledge and give rise to a diversity of the resulting models.
    Źródło:
    Journal of Medical Informatics & Technologies; 2003, 5; IP13-23
    1642-6037
    Pojawia się w:
    Journal of Medical Informatics & Technologies
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Application of fRMSDchiral for mathematical description of mutual position between stereoisomers
    Autorzy:
    Urniaz, Rafal Damian
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/748148.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Matematyczne
    Tematy:
    fragment-level RMSD
    chiral recognition
    bioinformatics
    molecular modeling
    fragment-level RMSD, związki chiralne, stereoselektywność, bioinformatyka, modelowanie molekularne
    Opis:
    The ability of biological systems to recognize and distinguish between compounds is crucial for living systems. A detailed study of this mechanism seems to be an important supplement for analysis of possible contact interactions between compounds and environment. This process could be characterized by variety of descriptors respond to compounds’ structural and physicochemical properties. Usually, the measure of variation in molecule positions in the three dimensional space is realized by the Root Mean Square Deviation (RMSD) calculation. Here, the traditional concept of RMSD was readjusted as fragment-level RMSD (fRMSD) and applied for mathematical description of stereoisomers’ role in the chiral recognition process.
    Źródło:
    Mathematica Applicanda; 2015, 43, 1
    1730-2668
    2299-4009
    Pojawia się w:
    Mathematica Applicanda
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Assigning NMR spectra of irregular RNAs by heuristic algorithms
    Autorzy:
    Szachniuk, M.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/201820.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    bioinformatics
    NMR
    tabu search
    beam search
    RNA structure
    bioinformatyka
    wyszukiwarka tabu
    wyszukiwarka wiązki
    struktura RNA
    Opis:
    Computer-aided analysis and preprocessing of spectral data is a prerequisite for any study of molecular structures by Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy. The data processing stage usually involves a considerable dedication of time and expert knowledge to cope with peak picking, resonance signal assignment and calculation of structure parameters. A significant part of the latter step is performed in an automated way. However, in peak picking and resonance assignment a multistage manual assistance is still essential. The work presented here is focused on the theoretical modeling and analyzing the assignment problem by applying heuristic approaches to the NMR spectra recorded for RNA structures containing irregular regions.
    Źródło:
    Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences; 2015, 63, 1; 329-338
    0239-7528
    Pojawia się w:
    Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    TIME CAPSULE EDUARDO KACA JAKO EKSPERYMENTALNA ANALIZA POLITYKI CIAŁA W SPOŁECZEŃSTWIE KONTROLI
    ‘Time Capsule’ by Eduardo Kac as Experimental Analysis of the policy of the body in a society of control
    Autorzy:
    Ożóg, Maciej
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/487900.pdf
    Data publikacji:
    2016-12-05
    Wydawca:
    Akademia Sztuk Pięknych im. Eugeniusza Gepperta we Wrocławiu
    Tematy:
    the body as information
    body policy
    bioinformatics
    super vision
    control
    identity
    CIAŁO JAKO INFORMACJA
    POLITYKA CIAŁA
    BIOINFORMATYKA
    NADZÓR
    KONTROLA
    TOŻSAMOŚĆ
    Opis:
    Maciej Ożóg ‘Time Capsule’ by Eduardo Kac as Experimental Analysis of the policy of the body in a society of control Ożóg analyses the project entitled ‘Time Capsule’ by Eduardo Kac, one of the pioneers of biological art. Artist’s work is interpreted as a voice in the debate on the consequences of computerization of the biological body and the specifics of bioinformatics’ supervision and control. Controversial artistic and existential action by Kac touches such issues as transformation of individual identity in an era of biotechnological remediation of the body, the relationship between the material, physical body and its virtual-information mapping, the activity of the embodied subject in the context of the dynamic development of various tools of digital surveillance, as well as the specifics of control mechanisms and supervision in the era of bioinformation technologies.
    Źródło:
    DYSKURS: Pismo Naukowo-Artystyczne ASP we Wrocławiu; 2016, 22; 100-111
    1733-1528
    Pojawia się w:
    DYSKURS: Pismo Naukowo-Artystyczne ASP we Wrocławiu
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Tabu search for the RNA partial degradation problem
    Autorzy:
    Rybarczyk, A.
    Hertz, A.
    Kasprzak, M.
    Blazewicz, J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/330324.pdf
    Data publikacji:
    2017
    Wydawca:
    Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
    Tematy:
    RNA degradation
    tabu search
    bioinformatics
    rozkład RNA
    algorytm tabu search
    bioinformatyka
    Opis:
    In recent years, a growing interest has been observed in research on RNA (ribonucleic acid), primarily due to the discovery of the role of RNA molecules in biological systems. They not only serve as templates in protein synthesis or as adapters in the translation process, but also influence and are involved in the regulation of gene expression. The RNA degradation process is now heavily studied as a potential source of such riboregulators. In this paper, we consider the so-called RNA partial degradation problem (RNA PDP). By solving this combinatorial problem, one can reconstruct a given RNA molecule, having as input the results of the biochemical analysis of its degradation, which possibly contain errors (false negatives or false positives). From the computational point of view the RNA PDP is strongly NP-hard. Hence, there is a need for developing algorithms that construct good suboptimal solutions. We propose a heuristic approach, in which two tabu search algorithms cooperate, in order to reconstruct an RNA molecule. Computational tests clearly demonstrate that the proposed approach fits well the biological problem and allows to achieve near-optimal results. The algorithm is freely available at http://www.cs.put.poznan.pl/arybarczyk/tabusearch.php.
    Źródło:
    International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2017, 27, 2; 401-415
    1641-876X
    2083-8492
    Pojawia się w:
    International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Algorithm for genetic data analysis – comparison of the frequency of specific mutations in different populations
    Algorytm do analizy danych genetycznych – porównanie częstotliwości występowania określonych mutacji wśród różnych populacji
    Autorzy:
    Marciniak, Anna
    Tarczewska, Martyna
    Kloska, Sylwester
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2016298.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Politechnika Bydgoska im. Jana i Jędrzeja Śniadeckich. Wydawnictwo PB
    Tematy:
    Python 3
    bioinformatics
    vcf files
    genomic data
    bioinformatyka
    pliki vcf
    dane genomowe
    Opis:
    This paper presents a novel algorithm which can be used to analyze genomic data obtained during Next Generation Sequencing (NGS). Due to the interest in the subject among geneticists, it is necessary to develop algorithms and programs which analyze genetic data that will be user-friendly and accessible to people not related to typical bioinformatics. A way of performing comparative analyze, including proper data preprocessing and final data processing is described. Input data for the algorithm are annotated .vcf files. The outcome of presented algorithm is a file with counted percentage of single nucleotide polymorphisms (SNP) in data for every loaded population.
    W artykule przedstawiono nowatorski algorytm służący do analizy danych genomowych uzyskanych podczas sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Ze względu na zainteresowanie tą tematyką wśród genetyków konieczne jest opracowanie przyjaznych dla użytkownika i dostępnych dla osób niezwiązanych z bioinformatyką algorytmów i programów analizujących dane genetyczne. Opisano sposób przeprowadzania analizy porównawczej, w tym wstępne i końcowe przetwarzanie danych. Dane wejściowe algorytmu to pliki formatu .vcf z adnotacjami. Wynikiem przedstawionego algorytmu jest plik zawierający informacje dotyczące częstości występowania polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (ang. single nucleotide polymorphism, SNP) w badanych populacjach.
    Źródło:
    Zeszyty Naukowe. Telekomunikacja i Elektronika / Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy; 2020, 24; 5-11
    1899-0088
    Pojawia się w:
    Zeszyty Naukowe. Telekomunikacja i Elektronika / Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Gwas data analysis with the use of machine learning algorithms – review
    Analiza danych GWAS przy użyciu algorytmów uczenia maszynowego – przegląd literatury
    Autorzy:
    Kloska, Sylwester Michał
    Marciniak, Anna
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2016322.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Politechnika Bydgoska im. Jana i Jędrzeja Śniadeckich. Wydawnictwo PB
    Tematy:
    machine learning
    genome-wide association studies
    GWAS
    artificial intelligence
    bioinformatics
    uczenie maszynowe
    badanie asocjacyjne całego genomu
    sztuczna inteligencja
    bioinformatyka
    Opis:
    Machine learning is a part of field concerned with AI. The main goal of machine learning algorithms is to create automatic system that improves itself with the use of its experience (given data) to gain new knowledge. Genome-Wide Association Studies compare whole genomes of different individuals in order to see if any of genetic variants are correlated with a trait. Using ML for GWAS analysis can be beneficial for scientists. It has been proved several times in various ways.
    Uczenie maszynowe jest dziedziną nauki związaną ze sztuczną inteligencją. Głównym celem algorytmów uczenia maszynowego jest stworzenie automatycznego systemu, który poprawia się dzięki wykorzystaniu swojego doświadczenia (danych) w celu zdobycia nowej wiedzy. Badania asocjacyjne całego genomu (GWAS) porównują całe genomy różnych osobników, aby sprawdzić, czy którykolwiek z wariantów genetycznych jest skorelowany z cechą. Wykorzystanie ML do analizy GWAS może być korzystne dla naukowców. Zostało to udowodnione na różne sposoby.
    Źródło:
    Zeszyty Naukowe. Telekomunikacja i Elektronika / Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy; 2019, 23; 23-32
    1899-0088
    Pojawia się w:
    Zeszyty Naukowe. Telekomunikacja i Elektronika / Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Wykorzystanie potencjału mikrobiomu środowiskowego w kryminalistyce
    Harnessing the potential of the environmental microbiome in forensic science
    Autorzy:
    Jagiełło, Agata
    Woźniak, Anna
    Szczerba, Błażej
    Płoski, Rafał
    Rydzanicz, Małgorzata
    Pollak, Agnieszka
    Frolova, Alina
    Kowalski, Michał
    Łabaj, Paweł
    Ossowski, Andrzej
    Branicki, Wojciech
    Herda, Kinga
    Marszałek, Kamila
    Zbieć-Piekarska, Renata
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/23050939.pdf
    Data publikacji:
    2021
    Wydawca:
    Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
    Tematy:
    mikrobiom
    gleba
    kryminalistyka
    metagenomika
    analizy metataksonomiczne
    sekwencjonowanie
    MPS
    bioinformatyka
    projekt NCBiR
    microbiome
    soil
    forensics
    metagenomics
    metataxonomic analysis
    MPS sequencing
    bioinformatics
    NCBiR project
    Opis:
    Konsorcjum naukowe pod przewodnictwem Centralnego Laboratorium Kryminalistycznego Policji podjęło się opracowania metody analizy DNA mikrobiomu gleby, która znajdzie zastosowanie w badaniach kryminalistycznych. Celem projektu o akronimie SMAFT (Soil Microbiome Analysis Forensic Tool, http://smaft.eu/), finansowanego przez Narodowe Centrum Badań i Rozwoju (DOB-BIO10/03/01/2019), jest stworzenie nowego narzędzia umożliwiającego powiązanie śladu w postaci próbki gleby z określoną lokalizacją geograficzną. W pierwszej części artykułu przybliżono pojęcie mikrobiomu oraz przedstawiono możliwości wykorzystania analiz DNA mikrobiomu w kryminalistyce. W jego drugiej części szczegółowo opisano etapy realizowanego projektu, począwszy od zbierania próbek gleby z różnych miejsc Polski w czterech porach roku i izolacji z nich DNA mikrobiomów, poprzez oparte na technologii MPS (ang. Massively Parallel Sequencing) sekwencjonowanie izolatów oraz opracowanie testu genetycznego zawierającego zestaw markerów metagenomicznych pozwalających na skuteczną indywidualizację próbek gleby, aż po stworzenie systemu informatycznego umożliwiającego analizę i interpretację otrzymanych wyników, który obejmuje bazę danych profili DNA mikrobiomów gleb pochodzących z różnych miejsc Polski.
    A scientific consortium led by the Central Forensic Laboratory of the Police has undertaken to develop a method for DNA analysis of the soil microbiome to be used in forensic investigations. The aim of the project entitled Soil Microbiome Analysis Forensic Tool – SMAFT (http://smaft.eu/), financed by the National Center for Research and Development (DOB-BIO10/03/01/2019), is to develop a new tool that enables the association of a trace in the form of a soil sample with a specific geographical location. The first part of the paper introduces the concept of the microbiome and presents the possibilities of using microbiome DNA analysis in forensic science. In the second part, the stages of the SMAFT project are described in detail, beginning from the collection of soil samples from different sites in Poland across all seasons and isolation of microbiome DNA through massively parallel sequencing (MPS) technology-based analysis of isolates and the development of a genetic test containing a set of metagenomic markers allowing for effective individualization of soil samples, up to the creation of an IT system enabling analysis and interpretation of the obtained results, which includes a database of soil microbiome DNA profiles from various locations in Poland.
    Źródło:
    Problemy Kryminalistyki; 2021, 312; 25-31(pol), 61-67(eng)
    0552-2153
    Pojawia się w:
    Problemy Kryminalistyki
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-8 z 8

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies