Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "genomics" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-25 z 30
Tytuł:
Genomika adaptacji
Adaptation genomics
Autorzy:
Konczal, Mateusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1193406.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Opis:
Genomika adaptacji to multidyscyplinarny projektem badawczy, którego celem jest zidentyfikowanie wzorców genomowych związanych z procesem adaptacji. W poniższym artykule staram się zapoznać czytelników z podstawowymi pojęciami związanymi z zagadnieniem genomiki adaptacji. Badania w tym obszarze można podzielić na trzy grupy: laboratoryjne eksperymenty naśladujące naturalne procesy ewolucyjne, badania nad konwergencją i paralelizmem oraz badania prowadzone na całych genomach poszukujące związku alleli z wybranymi cechami. Różne podejścia badawcze wiążą się z koniecznością zróżnicowanej interpretacji uzyskiwanych wyników. W poniższym artykule omawiam szczegółowo te trzy podejścia oraz podaję przykłady prac związanych z konkretną strategią badawczą. Następnie uogólniam uzyskane wyniki, czego wynikiem jest obraz adaptacji jako skomplikowanego na poziomie molekularnym procesu. Powtarzalność adaptacji można zaobserwować na poziomie szlaków metabolicznych; liczba fragmentów genomu ewoluująca pod wpływem działania doboru pozytywnego jest większa niż sądzono wcześniej; niestety inne problemy pozostają jednak wciąż bez satysfakcjonującej odpowiedzi.
Adaptation genomics is a multidisciplinary research program, which aims at detecting genomic patterns resulting from the process of adaptation. Studies in this field can be divided into 3 groups: laboratory experiments that model evolutionary processes, studies on convergence and parallelism and genome wide association studies. Results from particular scientific approaches should be interpreted in different ways. The three approaches accompanied by examples are discussed in detail and then I try to draw some generalizations, which indicate that adaptation is a complex process, also at the molecular level . Repeatability of adaptation is evident at the level of metabolic pathways and large number of genes in genome evolve under positive selection. Unfortunately other problems remain unresolved. Basic terminology related to the field of adaptation genomics is introduced.
Źródło:
Kosmos; 2013, 62, 1; 13-29
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Advances in domestic animal genomics
Autorzy:
Świtoński, Marek
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/703428.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Opis:
Until now genome of six domestic/farm animal species have been sequenced: cattle, horse, chicken, dog, cat and honeybee. Also marker genome maps of these, as well as other species (pig, sheep, goat etc) are well developed. Knowledge on genome organization brings an opportunity for effective searching for gene mutations causing phenotypic variation, including production traits and genetic diseases. The genome scanning, coupled with comparative genomics approach, facilitated identification of gene mutations influencing significantly on fattening, carcass, reproduction and milk traits in cattle, pig, sheep and goats. Recently, application of the expression microarrays were also applied in studies on candidate genes for carcass traits in cattle and pig. Spreading of gene mutations causing hereditary diseases is an important issue in animal breeding. Presently, over 150 mutations are characterized on DNA level in cattle, pig, sheep, horse, cat and dog. Interestingly, over 40% of them were described in dogs. It is mainly an effect of the fact that over 50% of the canine genetic diseases have clinical and molecular counterpart in human. Therefore, this species has became an interesting model in biomedical research, including gene therapy. It is foreseen that in the near future functional genomics as well as epigenomics will bring new insights into molecular background of phenotype variability of domestic animals.
Źródło:
Nauka; 2008, 1
1231-8515
Pojawia się w:
Nauka
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
On the application of compressive sampling techniques to high throughput data in computational genomics
Autorzy:
Hernández-Lemus, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/375726.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
compressive sampling
compressed sensing
computational genomics
Opis:
With the advent of high throughput experiments in genomics and proteomics, the researcher in computational data analysis is faced with new challenges, both with regards to the computational capacities and also in the probabilistic/statistical methodology fields; in order to handle such massive amounts of data in a systematic coherent way. In this paper we describe the basic aspects of the mathematical theory and the computational implications of a recently developed technique called Compressive Sampling, as well as some possible applications within the scope of Computational Genomics, and Computational Biology in general. The central idea behind this work is that most of the information sampled from the experiments turns out to be discarded (for being non-useful) in the final stages of biological analysis, hence it would be better if we could find an algorithm to remove selectively such information in order to get rid of the computational burden associated with processing and analyzing such huge amounts of data. Here we show that a possible algorithm for doing so it is precisely Compressive Sampling. As a working example, we will consider the data-analysis of whole-genome microarray gene expression for 1191 individuals within a breast cancer project.
Źródło:
Theoretical and Applied Informatics; 2011, 23, 3-4; 177-192
1896-5334
Pojawia się w:
Theoretical and Applied Informatics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structural Genomics in Europe and beyond - Shifting Scientific Directions at EMBL Hamburg
Autorzy:
Wilmanns, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2030567.pdf
Data publikacji:
2002-05
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Fizyki PAN
Tematy:
87.15.-v
Opis:
The emerging structural genomics initiatives provide novel opportunities to complement the rapidly increasing amount of genomic sequence data with the three-dimensional molecular structures of the coded genes. Many of these gene products exert their cellular functions by interacting with multiple partners. Unravelling the molecular structures of these interactions provides the most useful information to investigate their involvement in cellular processes. To this end, the determination of structures exceeds the number of coded gene products by several orders of magnitude. Structural genomics offers opportunities to synergise European research in structural biology technologies, with a multitude of excellent centres currently available. In this contribution, current initiatives of the Hamburg Outstation of the European Molecular Biology Laboratory will be outlined.
Źródło:
Acta Physica Polonica A; 2002, 101, 5; 635-646
0587-4246
1898-794X
Pojawia się w:
Acta Physica Polonica A
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA microarrays, a novel approach in studies of chromatin structure.
Autorzy:
Widłak, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043314.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
chromatin
genomics
epigenomics
DNA microarray
nucleosomes
Opis:
The DNA microarray technology delivers an experimental tool that allows surveying expression of genetic information on a genome-wide scale at the level of single genes - for the new field termed functional genomics. Gene expression profiling - the primary application of DNA microarrays technology - generates monumental amounts of information concerning the functioning of genes, cells and organisms. However, the expression of genetic information is regulated by a number of factors that cannot be directly targeted by standard gene expression profiling. The genetic material of eukaryotic cells is packed into chromatin which provides the compaction and organization of DNA for replication, repair and recombination processes, and is the major epigenetic factor determining the expression of genetic information. Genomic DNA can be methylated and this modification modulates interactions with proteins which change the functional status of genes. Both chromatin structure and transcriptional activity are affected by the processes of replication, recombination and repair. Modified DNA microarray technology could be applied to genome-wide study of epigenetic factors and processes that modulate the expression of genetic information. Attempts to use DNA microarrays in studies of chromatin packing state, chromatin/DNA-binding protein distribution and DNA methylation pattern on a genome-wide scale are briefly reviewed in this paper.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2004, 51, 1; 1-8
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Fungal genomes tell a story of ecological adaptations
Autorzy:
Muszewska, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/764966.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Łódzki. Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Tematy:
fungal genomics
osmotroph
pathogenic fungi
mycorrhiza
symbiotic fungi
HGT
Opis:
Grzyby odgrywają zasadniczą rolę w ekosystemach jako patogeny, saprotrofy i symbionty. Ich wszechstronne zdolności metaboliczne czynią z nich kluczowe ogniwo w obiegu węgla w przyrodzie. Dla człowieka stanowią głównie źródło infekcji, ale również zyskują na znaczeniu w biotechnologii. Grzyby są obecne w naszym otoczeniu w formie zarodników, pełzaków, grzybni i owocników. Te same gatunki grzybów w zależności od warunków otoczenia mogą prezentować rożne formy morfologiczne i tworzyć różne relacje z otoczeniem, na przykład owadobójcze grzyby są często spotykane jako endosymbionty roślin. Całe to bogactwo znajduje odzwierciedlenie w genomach grzybów. Osmotroficzny tryb życia grzybów narzuca charakter interakcji grzybów z otoczeniem, która odbywa się przy pomocy wydzielanych na zewnątrz enzymów rozkładających pożywienie, białek efektorowych oraz toksyn wpływających na inne organizmy. Grzyby posiadają złożone kompozycje wydzielanych cząsteczek oraz transportery błonowe przystosowane do efektywnego przenoszenia związków chemicznych w obu kierunkach. Zdolność do rozkładania ligniny i celulozy odpowiada w dużej mierze za sukces ewolucyjny grzybów. Adaptacja organizmu do nowego ekosystemu zwykle przebiega poprzez duplikację genów z ich późniejszymi asymetrycznymi zmianami prowadzącymi do szybkiej zmiany specyficzności substratowej jednego z paralogów. Wielokrotne duplikacje jednej grupy genów prowadzą do rozrostu rodziny kodowanych przez nie białek i rozszerzenia zakresu możliwości np. rozkładanych przez nie wariantów substratów. Zwiększenie liczby genów związanych z metabolizowaniem danej grupy substratów jest jednym z podstawowych sposobów adaptacji do danej niszy ekologicznej widzianej z perspektywy genomu. Charakterystyczne więc dla grzybów związanych z roślinami będzie kodowanie licznych enzymów degradujących węglowodany, a dla dermatofitów – proteazy i lipazy. Kolejnym poziomem adaptacji patogenów/symbiontów jest zmiana profilu ekspresji genów i stały „wyścig zbrojeń” z gospodarzami. Ponadto geny te często sąsiadują z transpozonami, w obrębie szybciej ewoluującej części genomu. Geny związane z metabolizowaniem ksenobiotyków częściej ulegają też horyzontalnemu transferowi genów aniżeli geny metabolizmu podstawowego. Inna wyróżniającą grzyby cechą jest posiadanie różnorodnych modeli rozmnażania płciowego nawet pomiędzy spokrewnionymi gatunkami. Model rozmnażania jest jednym z ważniejszych sposobów dostosowania do trybu życia. Rozmnażanie jednopłciowe pojawiało się wielokrotnie w ewolucji grzybów i wydaje się być adaptacją do patogennego trybu życia.
One genome enables a fungus to have various lifestyles and strategies depending on environmental conditions and in the presence of specific counterparts. The nature of their interactions with other living and abiotic elements is a consequence of their osmotrophism. The ability to degrade complex compounds and especially plant biomass makes them a key component of the global carbon circulation cycle. Since the first fungal genomic sequence was published in 1996 mycology has benefited from the technolgical progress. The available data create an unprecedented opportunity to perform massive comparative studies with complex study design variants targeted at all cellular processes.
Źródło:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biologica et Oecologica; 2014, 10; 9-17
1730-2366
2083-8484
Pojawia się w:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biologica et Oecologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application aspects of animal and human genomics
Aspekty aplikacyjne genomiki mitochondrialnej zwierząt i człowieka
Autorzy:
Slaska, B.
Makarewic, A.
Surdyka, M.
Nisztuk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/44620.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2014, 13, 2
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Portuguese Health System – Challenges in Times of Genomics
Autorzy:
Dias Pereira, André Gonçalo
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/43539286.pdf
Data publikacji:
2024
Wydawca:
Katolicki Uniwersytet Lubelski Jana Pawła II
Tematy:
Right to Health
National Health Service
Private Health Insurance
Genomics
Genetics Tests
Four Ps Medicine
Opis:
This article presents the Portuguese health care system that combines the National Health Service, health subsystems and private health insurance. Genomic medicine is expanding the scope of its activity, and its main challenges in pre-natal medicine and post-natal healthcare will be presented here and it will be discussed whether a private health insurance system can provide genomic medicine. As the Four “Ps” concept of Medicine is increasingly relevant, it is important to check if the private system can accommodate this evolution.
Źródło:
Review of European and Comparative Law; 2024, 57, 2; 203-222
2545-384X
Pojawia się w:
Review of European and Comparative Law
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA – a molecule that transformed science. A short history of research
Autorzy:
Gabryelska, Marta M.
Szymański, Maciej
Barciszewski, Jan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/703398.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
DNA
molecular biology
genomics
genetics
Opis:
Deoxyribonucleic acid (DNA) was identified 140 years ago by a Swiss physician Friedrich Miescher. His discovery was fundamental for the development of biochemistry, genetics and molecular biology. Contemporary biology, biotechnology and medicine largely depends on our ability to analyze, synthesize and manipulate DNA. We present highlights of the history of DNA research from the very beginning to the sequencing of human genome.
Źródło:
Nauka; 2009, 2
1231-8515
Pojawia się w:
Nauka
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie genomiki strukturalnej i funkcjonalnej w nowoczesnej hodowli roślin z rodziny Brassicaceae
Structural and functional genomics usage for modern breeding of Brassicaceae
Autorzy:
Mikolajczyk, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833431.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2008, 29, 2
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mice and humans: chromosome engineering and its application to functional genomics.
Autorzy:
Klysik, Jan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043718.pdf
Data publikacji:
2002
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
gene traps
transgenesis
embryonic stem cell technology
chromosome engineering
ENU mutagenesis
Opis:
Functional modeling of human genes and diseases requires suitable mammalian model organisms. For its genetic malleability, the mouse is likely to continue to play a major role in defining basic genetic traits and complex pathological disorders. Recently, gene targeting techniques have been extended towards developing new engineering strategies for generating extensive lesions and rearrangements in mouse chromosomes. While these advances create new opportunities to address similar aberrations observed in human diseases, they also open new ways of scaling-up mutagensis projects that try to catalogue and annotate cellular functions of mammalian genes.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2002, 49, 3; 553-569
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ewolucjonizm darwinowski w świetle genomiki
Darwinian Evolution in the Light of Genomics
Autorzy:
Koonin, Eugene V.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/553359.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Instytut Filozofii
Tematy:
darwinizm
Nowoczesna Synteza
genomika ewolucyjna
biologia systemowa
Postnowoczesna Synteza biologii ewolucyjnej
dobór oczyszczający
neutralne procesy ewolucyjne
nieadaptacjonistyczna teoria ewolucji
Darwinism
Modern Synthesis
evolutionary genomics
systems biology
Postmodern Synthesis of evolutionary biology
purifying selection
neutral evolutionary processes
non-adaptationist theory of evolution
Opis:
Genomika porównawcza i biologia systemowa oferują niespotykane możliwości testowania głównych zasad biologii ewolucyjnej sformułowanych przez Darwina w O powstawaniu gatunków w 1859 roku i rozszerzonych sto lat później w ramach Nowoczesnej Syntezy. Badania w dziedzinie genomiki ewolucyjnej pokazują, że dobór naturalny stanowi tylko jedną z sił kształtujących ewolucję genomu i wcale nie występującą najczęściej, natomiast procesy nieadaptacyjne mają znacznie większe znaczenie niż wcześniej przypuszczano. Duży wkład horyzontalnego transferu genów i różnych samolubnych elementów genetycznych w ewolucję genomu podważa koncepcję drzewa życia. Adekwatny opis ewolucji wymaga bardziej złożonej koncepcji sieci lub „lasu” życia. Nie istnieje spójny trend ewolucji w kierunku większej złożoności genomowej, a kiedy złożoność wzrasta, wydaje się, że jest to raczej nieadaptacyjna konsekwencja ewolucji drogą słabego doboru oczyszczającego niż adaptacji. Odkryto rozmaite powszechniki ewolucji genomu, w tym niezmiennicze rozkłady tempa ewolucji pośród genów ortologowych z różnych genomów oraz rozmiarów rodzin genów paralogowych. Dostrzeżono też negatywną korelację między poziomem ekspresji genów a tempem ewolucji sekwencji. Niektóre z tych powszechników uzyskują wyjaśnienie dzięki zastosowaniu prostych, nieadaptacjonistycznych modeli ewolucji, co sugeruje, że w dość nieodległej przyszłości powstać może nowa synteza biologii ewolucyjnej.
Comparative genomics and systems biology offer unprecedented opportunities for testing central tenets of evolutionary biology formulated by Darwin in the Origin of Species in 1859 and expanded in the Modern Synthesis 100 years later. Evolutionary-genomic studies show that natural selection is only one of the forces that shape genome evolution and is not quantitatively dominant, whereas non-adaptive processes are much more prominent than previously suspected. Major contributions of horizontal gene transfer and diverse selfish genetic elements to genome evolution undermine the Tree of Life concept. An adequate depiction of evolution requires the more complex concept of a network or “forest” of life. There is no consistent tendency of evolution towards increased genomic complexity, and when complexity increases, this appears to be a non-adaptive consequence of evolution under weak purifying selection rather than an adaptation. Several universals of genome evolution were discovered including the invariant distributions of evolutionary rates among orthologous genes from diverse genomes and of paralogous gene family sizes, and the negative correlation between gene expression level and sequence evolution rate. Simple, non-adaptive models of evolution explain some of these universals, suggesting that a new synthesis of evolutionary biology might become feasible in a not so remote future.
Źródło:
Filozoficzne Aspekty Genezy; 2018, 15; 283-370
2299-0356
Pojawia się w:
Filozoficzne Aspekty Genezy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Helicosporidia: a genomic snapshot of an early transition to parasitism
Autorzy:
Sun, Y.
Pombert, J.-F.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/58197.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
Helicosporidium
green alga
alga
comparative genomics
entomopathogen
parasitism
parasite
invertebrate
Opis:
Helicosporidia are gut parasites of invertebrates. These achlorophyllous, non-photosynthetic green algae are the first reported to infect insects. Helicosporidia are members of the green algal class Trebouxiophyceae and are further related to the photosynthetic and non-photosynthetic genera Auxenochlorella and Prototheca, respectively, the latter of which can also turn to parasitism under opportunistic conditions. Molecular analyses suggest that Helicosporidia diverged from other photosynthetic trebouxiophytes less than 200 million years ago and that its adaptation to parasitism is therefore recent. In this minireview, we summarize the current knowledge of helicosporidian genomics. Unlike many well-known parasitic lineages, the Helicosporidium sp. organelle and nuclear genomes have lost surprisingly little in terms of coding content aside from photosynthesis-related genes. While the small size of its nuclear genome compared to other sequenced trebouxiophycean representatives suggests that Helicosporidium is going through a streamlining process, this scenario cannot be ascertained at this stage. Genome expansions and contractions have occurred independently multiple times in the green algae, and the small size of the Helicosporidium genome may reflect a lack of expansion from a lean ancestor state rather than a tendency towards reduction.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2014, 83, 4
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structural and functional genomics in domestic animals: the way to understand the phenotype
Autorzy:
Schwerin, M
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2042006.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
genome analysis
gene expression
candidate gene
farm animal
phenotype
livestock
domestic animal
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 2001, 42, 3; 293-308
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Od genetyki do genomiki populacji: nowe perspektywy badań w ekologii i biologii ewolucyjnej
From population genetics to population genomics: new perspectives in ecology and evolutionary biology
Autorzy:
Ratkiewicz, Mirosław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1197954.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Opis:
Application of molecular methods in biology has revolutionized ecology, population genetics and evolutionary biology. For example, the molecular studies revealed complex mating systems and social structures. Analysis of molecular markers revealed the existence of cryptic boundaries such as secondary contact (hybrid zones) among previously isolated populations. Most recently, due to simultaneous study of numerous loci (the population genomics approach), the distribution of estimates of genetic differentiation (Fst) from individual loci has allowed the identification of candidate loci to be under selection. Such analyses may help answer many important evolutionary questions and will also improve inferences in classical population genetics dealing with demography and evolutionary history. Several papers concerning interesting aspects of population genetics and molecular ecology revealed by Polish scientists are discussed and future perspective for population genomics approach are highlighted.
Źródło:
Kosmos; 2006, 55, 1; 129-136
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Construcciones verbales en el discurso de la genómica. Tipología verbal y discurso científico
Verbal constructions in the discourse about genomics. Verbal typology and scientific discourse
Autorzy:
Lorente Casafont, Mercè
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1053026.pdf
Data publikacji:
2004-12-01
Wydawca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
Opis:
Based on the linguistic approach of the Communicative Theory of Terminology, this paper, focuses on the semantic classification of verbs taken as a sample of the Human Genome discourse in the Spanish language, in order to describe specialized lexical units and codify verbal lemmas on computational dictionaries for specialized corpora processing and information retrieval. The semantic classifícation proposals of verbs come from Levin (1993) and the CLIPS project (ILC-CNR, Pisa).
Źródło:
Studia Romanica Posnaniensia; 2004, 31; 353-359
0137-2475
2084-4158
Pojawia się w:
Studia Romanica Posnaniensia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Personal remarks on the future of protein crystallography and structural biology
Autorzy:
Jaskolski, Mariusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1040362.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
high-throughput crystallography
single-particle imaging
synchrotron radiation
X-ray free-electron laser
structural genomics
Opis:
Protein crystallography, the main experimental method of structural biology, has undergone in the recent past three revolutionary changes leading to its unexpected renaissance. They were connected with (i) the introduction of synchrotron radiation sources for X-ray diffraction experiments, (ii) implementation of Se-Met multiwavelength anomalous diffraction (MAD) for phasing, and (iii) initiation of structural genomics (SG) programs. It can be foreseen that in the next 10-15 years protein crystallography will continue to be in this revolutionary phase. We can expect not only an avalanche of protein crystal structures from SG centers, but also attacking of more demanding projects, such as the structure of membrane proteins and of very large macromolecular complexes. On the technological front, the introduction of X-ray radiation from free-electron lasers will revolutionize the experimental possibilities, making feasible even the imaging of single molecules and of intact biological cells.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2010, 57, 3; 261-264
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Modelling the virtual physiological human
Autorzy:
Sansom, C.
Mendes, M.
Coveney, P
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80904.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
modelling
molecular biology
genomics
protein
experimental biology
computational biology
human physiology
heart
cancer
modern biology
mathematical model
immune system
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Plastid origin: who, when and why?
Autorzy:
Ku, Chuan
Roettger, M.
Zimorski, V.
Nelsen-Sathi, S.
Sousa, F.L.
Martin, W.F.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/59262.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
plastid
Cyanoprokaryota
endosymbiosis
evolution
gene transfer
genomics
organelle
photosynthesis
phylogenesis
Opis:
The origin of plastids is best explained by endosymbiotic theory, which dates back to the early 1900s. Three lines of evidence based on protein import machineries and molecular phylogenies of eukaryote (host) and cyanobacterial (endosymbiont) genes point to a single origin of primary plastids, a unique and important event that successfully transferred two photosystems and oxygenic photosynthesis from prokaryotes to eukaryotes. The nature of the cyanobacterial lineage from which plastids originated has been a topic of investigation. Recent studies have focused on the branching position of the plastid lineage in the phylogeny based on cyanobacterial core genes, that is, genes shared by all cyanobacteria and plastids. These studies have delivered conflicting results, however. In addition, the core genes represent only a very small portion of cyanobacterial genomes and may not be a good proxy for the rest of the ancestral plastid genome. Information in plant nuclear genomes, where most genes that entered the eukaryotic lineage through acquisition from the plastid ancestor reside, suggests that heterocyst-forming cyanobacteria in Stanier’s sections IV and V are most similar to the plastid ancestor in terms of gene complement and sequence conservation, which is in agreement with models suggesting an important role of nitrogen fixation in symbioses involving cyanobacteria. Plastid origin is an ancient event that involved a prokaryotic symbiont and a eukaryotic host, organisms with different histories and genome evolutionary processes. The different modes of genome evolution in prokaryotes and eukaryotes bear upon our interpretations of plastid phylogeny.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2014, 83, 4
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Forest tree research in post genomic era. Introduction to systems biology of broadleaves
Autorzy:
Staszak, A.M.
Pawlowski, T.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41059.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Dendrologii PAN
Tematy:
forest tree
tree
genomics
proteomics
woody plant
biology
broadleaf
plant reproduction
plant physiology
Opis:
Trees are long living organisms, rarely used in molecular experiments because of large size of the genome and long time of reproduction cycle. Sequencing data from Populus trichocarpa genome allowed for the development of research on the processes associated with tree biology such as secondary wood formation, long-term perennial growth, seasonal changes, biotic interactions, evolution etc. Reference data enable the investigation of non-model trees such as Quercus or Fagus, having ecological and economic significance. During projects scientists use genomic, transcriptomic, proteomic and metabolomic approaches which contribute to better understanding of the physiological processes regulating tree biology. Data collected from these multiple studies need to be integrated. The integration of data is the subject of the newly established field of science called systems biology. This review presents progress in tree research after finishing the sequencing project of Populus. It concentrates on modern trends in 'omics' and systems biology study of temperate broadleave trees during the last 10 years of studies.
Źródło:
Dendrobiology; 2012, 68
1641-1307
Pojawia się w:
Dendrobiology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA microarrays - future in oncology research and therapy
Autorzy:
Krol, M.
Pawlowski, K.M.
Otrebska, D.
Motyl, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/3349.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
DNA microarray
future
oncology
research
therapy
genomics
gene expression
canine mammary cancer
tumour
human disease
cancer
Źródło:
Journal of Pre-Clinical and Clinical Research; 2008, 02, 2
1898-2395
Pojawia się w:
Journal of Pre-Clinical and Clinical Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A common cis-element in promoters of protein synthesis and cell cycle genes
Autorzy:
Wyrwicz, Lucjan
Gaj, Paweł
Hoffmann, Marcin
Rychlewski, Leszek
Ostrowski, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041116.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
gel shift assay
regulation of transcription
comparative genomics
gene expression
promoter
bioinformatics
Opis:
Gene promoters contain several classes of functional sequence elements (cis elements) recognized by protein agents, e.g. transcription factors and essential components of the transcription machinery. Here we describe a common DNA regulatory element (tandem TCTCGCGAGA motif) of human TATA-less promoters. A combination of bioinformatic and experimental methodology suggests that the element can be critical for expression of genes involved in enhanced protein synthesis and the G1/S transition in the cell cycle. The motif was identified in a substantial fraction of promoters of cell cycle genes, like cyclins (CCNC, CCNG1), as well as transcription regulators (TAF7, TAF13, KLF7, NCOA2), chromatin structure modulators (HDAC2, TAF6L), translation initiation factors (EIF5, EIF2S1, EIF4G2, EIF3S8, EIF4) and previously reported 18 ribosomal protein genes. Since the motif can define a subset of promoters with a distinct mechanism of activation involved in regulation of expression of about 5% of human genes, further investigation of this regulatory element is an emerging task.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 1; 89-98
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Implementation of omics research to enhance phytoremediation efficiency - a review
Wdrożenie badań omicznych w celu zwiększenia efektywności fitoremediacji – przegląd
Autorzy:
Jaskulak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/296955.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Politechnika Częstochowska. Wydawnictwo Politechniki Częstochowskiej
Tematy:
phytoremediation
heavy metals
phytotoxicity
omics
transcriptomics
genomics
fitoremediacja
metale ciężkie
fitotoksyczność
badania omiczne
transkryptomika
genomika
Opis:
Phytoremediation is recognized as a cost-effective and widely acceptable alternative to chemical and physical technologies of soil remediation but requires an overall longer time to achieve success. In the last decade, the vast progress in omics research had led to improvements in our understanding of plants metabolism under exposure to toxic substances and the interactions between microbial communities and plants. Omics research includes a numer of disciplines aimed at explaining the biological and chemical principles of functioning a particular organism exposed to selected factors using modern methods of molecular biology (example: rt-qPCR - Quantitative polymerase chain reaction in real time). The names of individual branches of omics studies arise from a group of studied substances, example: transcriptomic refers to research related to changes occurring in the organism at the level of its transcriptome, and proteomics deals with the determination of complete information on the proteomic composition of a given sample. By merging available omics tools with new bioinformatic approaches, it is possible to understand and determinate the specific patterns of plants response to various stress factors. In this review, we provide an overview of how omics research including transcriptomic, proteomic, genomic and metagenomic approaches might be used to reduce the negative impact of toxic elements to plants growth and development in order to ultimately enhance the phytoremediation efficiency.
Fitoremediacja jest uznawana za opłacalną i powszechnie akceptowaną alternatywę dla chemicznych i fizycznych technologii remediacji gleby, ale wymaga dłuższego czasu, aby osiągnąć sukces. W ostatnim dziesięcioleciu ogromny postęp w badaniach omicznych doprowadził do poprawy zrozumienia metabolizmu roślin poddanych ekspozycji na substancje toksyczne oraz interakcji pomiędzy mikroorganizmami symbiotycznymi a roślinami. Badania omiczne obejmują szereg dyscyplin zmierzających do wyjaśniania biologiczno-chemicznych zasad funkcjonowania wybranego organizmu poddanego danym czynnikom za pomocą nowoczesnych metod biologii molekularnej (np. rt-qPCR - ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy w czasie rzeczywistym). Nazwy poszczególnych gałęzi badań omicznych powstają od grupy badanych substancji, np. transkryptomika dotyczy badań związanych ze zmianami zachodzącymi w organizmie na poziomie jego transkryptomu, a proteomika zajmuje się określeniem pełnej informacji o składzie proteomicznym danej próbki. Łącząc dostępne narzędzia omiczne z nowymi technikami bioinformatycznymi, możliwe jest zrozumienie i określenie specyficznych wzorców reakcji komórek roślin na różne czynniki stresowe. W pracy przedstawiono przegląd najnowszych badań omicznych, w tym transkryptomicznych, proteomicznych, genomicznych i metagenomicznych, stosowanych w badaniach nad zmniejszeniem negatywnego wpływu toksycznych substancji na wzrost i rozwój roślin w celu zwiększenia skuteczności procesu fitoremediacji.
Źródło:
Inżynieria i Ochrona Środowiska; 2018, 21, 4; 361-373
1505-3695
2391-7253
Pojawia się w:
Inżynieria i Ochrona Środowiska
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Conservation genetics – science in the service of nature
Autorzy:
Taşkın, Cansel
Skorupski, Jakub
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1386373.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Uniwersytet Szczeciński. Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Szczecińskiego
Tematy:
ecogenomics
extinction risk
extinction vortex
genetic load
genomics
inbreeding depression
management units
depresja wsobna
ekogenomika
genomika
jednostki zarządzania
obciążenie genetyczne
ryzyko wyginięcia
wir wymierania
Opis:
Conservation genetics is a subdicipline of conservation biology which deals with the extinction risk and many other problems of nature conservation by using genetic tools and techniques. Conservation genetics is a very good example of the practical use of scientific achievements in nature protection. Although its name seems to be self-defining, its specific area of interest, conceptual apparatus and methodological workshop are not widely known and recognizable. The purpose of this review is to clarify any ambiguities and inconsistencies in this respect. It explore what is conservation genetics, what research and practical issues does it deal with and how they can be solved.
Genetyka konserwatorska jest subdyscypliną biologii konserwatorskiej, która zajmuje się ryzykiem wyginięcia gatunków i wieloma innymi problemami ochrony przyrody, przy użyciu narzędzi i technik genetycznych. Genetyka konserwatorska jest bardzo dobrym przykładem praktycznego wykorzystania osiągnięć nauki w ochronie przyrody. Choć jej nazwa wydaje się samodefiniująca, to właściwy jej obszar zainteresowań, aparat pojęciowy i warsztat metodyczny nie są powszechnie znane i rozpoznawalne. Celem artykułu przeglądowego jest wyjaśnienie wszelkich niejasności i niespójności w tym zakresie. Artykuł wyjaśnia czym jest genetyka konserwatorska, jakie problemy badawcze i praktyczne podejmuje oraz w jaki sposób mogą być one rozwiązane.
Źródło:
Acta Biologica; 2020, 27; 131-141
2450-8330
2353-3013
Pojawia się w:
Acta Biologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Integrated plant and pathogen‘omics approaches to understanding fungal diseases of wheat
Autorzy:
Rudd, J.J.
Lee, W.-S.
Hammond-Kosack, K.
Kanyuka, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81017.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
plant infection
fungal disease
wheat
septoria tritici blotch
intercellular pathogen
leaf damage
RNA sequence
functional genomics
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-25 z 30

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies