Genomika adaptacji

Genomika adaptacji to multidyscyplinarny projektem badawczy, którego celem jest zidentyfikowanie wzorców genomowych związanych z procesem adaptacji. W poniższym artykule staram się zapoznać czytelników z podstawowymi pojęciami związanymi z zagadnieniem genomiki adaptacji. Badania w tym obszarze można podzielić na trzy grupy: laboratoryjne eksperymenty naśladujące naturalne procesy ewolucyjne, badania nad konwergencją i paralelizmem oraz badania prowadzone na całych genomach poszukujące związku alleli z wybranymi cechami. Różne podejścia badawcze wiążą się z koniecznością zróżnicowanej interpretacji uzyskiwanych wyników. W poniższym artykule omawiam szczegółowo te trzy podejścia oraz podaję przykłady prac związanych z konkretną strategią badawczą. Następnie uogólniam uzyskane wyniki, czego wynikiem jest obraz adaptacji jako skomplikowanego na poziomie molekularnym procesu. Powtarzalność adaptacji można zaobserwować na poziomie szlaków metabolicznych; liczba fragmentów genomu ewoluująca pod wpływem działania doboru pozytywnego jest większa niż sądzono wcześniej; niestety inne problemy pozostają jednak wciąż bez satysfakcjonującej odpowiedzi.

Adaptation genomics is a multidisciplinary research program, which aims at detecting genomic patterns resulting from the process of adaptation. Studies in this field can be divided into 3 groups: laboratory experiments that model evolutionary processes, studies on convergence and parallelism and genome wide association studies. Results from particular scientific approaches should be interpreted in different ways. The three approaches accompanied by examples are discussed in detail and then I try to draw some generalizations, which indicate that adaptation is a complex process, also at the molecular level . Repeatability of adaptation is evident at the level of metabolic pathways and large number of genes in genome evolve under positive selection. Unfortunately other problems remain unresolved. Basic terminology related to the field of adaptation genomics is introduced.