Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "genomics" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-10 z 28
Tytuł:
Genomika adaptacji
Adaptation genomics
Autorzy:
Konczal, Mateusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1193406.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Opis:
Genomika adaptacji to multidyscyplinarny projektem badawczy, którego celem jest zidentyfikowanie wzorców genomowych związanych z procesem adaptacji. W poniższym artykule staram się zapoznać czytelników z podstawowymi pojęciami związanymi z zagadnieniem genomiki adaptacji. Badania w tym obszarze można podzielić na trzy grupy: laboratoryjne eksperymenty naśladujące naturalne procesy ewolucyjne, badania nad konwergencją i paralelizmem oraz badania prowadzone na całych genomach poszukujące związku alleli z wybranymi cechami. Różne podejścia badawcze wiążą się z koniecznością zróżnicowanej interpretacji uzyskiwanych wyników. W poniższym artykule omawiam szczegółowo te trzy podejścia oraz podaję przykłady prac związanych z konkretną strategią badawczą. Następnie uogólniam uzyskane wyniki, czego wynikiem jest obraz adaptacji jako skomplikowanego na poziomie molekularnym procesu. Powtarzalność adaptacji można zaobserwować na poziomie szlaków metabolicznych; liczba fragmentów genomu ewoluująca pod wpływem działania doboru pozytywnego jest większa niż sądzono wcześniej; niestety inne problemy pozostają jednak wciąż bez satysfakcjonującej odpowiedzi.
Adaptation genomics is a multidisciplinary research program, which aims at detecting genomic patterns resulting from the process of adaptation. Studies in this field can be divided into 3 groups: laboratory experiments that model evolutionary processes, studies on convergence and parallelism and genome wide association studies. Results from particular scientific approaches should be interpreted in different ways. The three approaches accompanied by examples are discussed in detail and then I try to draw some generalizations, which indicate that adaptation is a complex process, also at the molecular level . Repeatability of adaptation is evident at the level of metabolic pathways and large number of genes in genome evolve under positive selection. Unfortunately other problems remain unresolved. Basic terminology related to the field of adaptation genomics is introduced.
Źródło:
Kosmos; 2013, 62, 1; 13-29
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Advances in domestic animal genomics
Autorzy:
Świtoński, Marek
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/703428.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Opis:
Until now genome of six domestic/farm animal species have been sequenced: cattle, horse, chicken, dog, cat and honeybee. Also marker genome maps of these, as well as other species (pig, sheep, goat etc) are well developed. Knowledge on genome organization brings an opportunity for effective searching for gene mutations causing phenotypic variation, including production traits and genetic diseases. The genome scanning, coupled with comparative genomics approach, facilitated identification of gene mutations influencing significantly on fattening, carcass, reproduction and milk traits in cattle, pig, sheep and goats. Recently, application of the expression microarrays were also applied in studies on candidate genes for carcass traits in cattle and pig. Spreading of gene mutations causing hereditary diseases is an important issue in animal breeding. Presently, over 150 mutations are characterized on DNA level in cattle, pig, sheep, horse, cat and dog. Interestingly, over 40% of them were described in dogs. It is mainly an effect of the fact that over 50% of the canine genetic diseases have clinical and molecular counterpart in human. Therefore, this species has became an interesting model in biomedical research, including gene therapy. It is foreseen that in the near future functional genomics as well as epigenomics will bring new insights into molecular background of phenotype variability of domestic animals.
Źródło:
Nauka; 2008, 1
1231-8515
Pojawia się w:
Nauka
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
On the application of compressive sampling techniques to high throughput data in computational genomics
Autorzy:
Hernández-Lemus, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/375726.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
compressive sampling
compressed sensing
computational genomics
Opis:
With the advent of high throughput experiments in genomics and proteomics, the researcher in computational data analysis is faced with new challenges, both with regards to the computational capacities and also in the probabilistic/statistical methodology fields; in order to handle such massive amounts of data in a systematic coherent way. In this paper we describe the basic aspects of the mathematical theory and the computational implications of a recently developed technique called Compressive Sampling, as well as some possible applications within the scope of Computational Genomics, and Computational Biology in general. The central idea behind this work is that most of the information sampled from the experiments turns out to be discarded (for being non-useful) in the final stages of biological analysis, hence it would be better if we could find an algorithm to remove selectively such information in order to get rid of the computational burden associated with processing and analyzing such huge amounts of data. Here we show that a possible algorithm for doing so it is precisely Compressive Sampling. As a working example, we will consider the data-analysis of whole-genome microarray gene expression for 1191 individuals within a breast cancer project.
Źródło:
Theoretical and Applied Informatics; 2011, 23, 3-4; 177-192
1896-5334
Pojawia się w:
Theoretical and Applied Informatics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structural Genomics in Europe and beyond - Shifting Scientific Directions at EMBL Hamburg
Autorzy:
Wilmanns, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2030567.pdf
Data publikacji:
2002-05
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Fizyki PAN
Tematy:
87.15.-v
Opis:
The emerging structural genomics initiatives provide novel opportunities to complement the rapidly increasing amount of genomic sequence data with the three-dimensional molecular structures of the coded genes. Many of these gene products exert their cellular functions by interacting with multiple partners. Unravelling the molecular structures of these interactions provides the most useful information to investigate their involvement in cellular processes. To this end, the determination of structures exceeds the number of coded gene products by several orders of magnitude. Structural genomics offers opportunities to synergise European research in structural biology technologies, with a multitude of excellent centres currently available. In this contribution, current initiatives of the Hamburg Outstation of the European Molecular Biology Laboratory will be outlined.
Źródło:
Acta Physica Polonica A; 2002, 101, 5; 635-646
0587-4246
1898-794X
Pojawia się w:
Acta Physica Polonica A
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA microarrays, a novel approach in studies of chromatin structure.
Autorzy:
Widłak, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043314.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
chromatin
genomics
epigenomics
DNA microarray
nucleosomes
Opis:
The DNA microarray technology delivers an experimental tool that allows surveying expression of genetic information on a genome-wide scale at the level of single genes - for the new field termed functional genomics. Gene expression profiling - the primary application of DNA microarrays technology - generates monumental amounts of information concerning the functioning of genes, cells and organisms. However, the expression of genetic information is regulated by a number of factors that cannot be directly targeted by standard gene expression profiling. The genetic material of eukaryotic cells is packed into chromatin which provides the compaction and organization of DNA for replication, repair and recombination processes, and is the major epigenetic factor determining the expression of genetic information. Genomic DNA can be methylated and this modification modulates interactions with proteins which change the functional status of genes. Both chromatin structure and transcriptional activity are affected by the processes of replication, recombination and repair. Modified DNA microarray technology could be applied to genome-wide study of epigenetic factors and processes that modulate the expression of genetic information. Attempts to use DNA microarrays in studies of chromatin packing state, chromatin/DNA-binding protein distribution and DNA methylation pattern on a genome-wide scale are briefly reviewed in this paper.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2004, 51, 1; 1-8
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Fungal genomes tell a story of ecological adaptations
Autorzy:
Muszewska, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/764966.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Łódzki. Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Tematy:
fungal genomics
osmotroph
pathogenic fungi
mycorrhiza
symbiotic fungi
HGT
Opis:
Grzyby odgrywają zasadniczą rolę w ekosystemach jako patogeny, saprotrofy i symbionty. Ich wszechstronne zdolności metaboliczne czynią z nich kluczowe ogniwo w obiegu węgla w przyrodzie. Dla człowieka stanowią głównie źródło infekcji, ale również zyskują na znaczeniu w biotechnologii. Grzyby są obecne w naszym otoczeniu w formie zarodników, pełzaków, grzybni i owocników. Te same gatunki grzybów w zależności od warunków otoczenia mogą prezentować rożne formy morfologiczne i tworzyć różne relacje z otoczeniem, na przykład owadobójcze grzyby są często spotykane jako endosymbionty roślin. Całe to bogactwo znajduje odzwierciedlenie w genomach grzybów. Osmotroficzny tryb życia grzybów narzuca charakter interakcji grzybów z otoczeniem, która odbywa się przy pomocy wydzielanych na zewnątrz enzymów rozkładających pożywienie, białek efektorowych oraz toksyn wpływających na inne organizmy. Grzyby posiadają złożone kompozycje wydzielanych cząsteczek oraz transportery błonowe przystosowane do efektywnego przenoszenia związków chemicznych w obu kierunkach. Zdolność do rozkładania ligniny i celulozy odpowiada w dużej mierze za sukces ewolucyjny grzybów. Adaptacja organizmu do nowego ekosystemu zwykle przebiega poprzez duplikację genów z ich późniejszymi asymetrycznymi zmianami prowadzącymi do szybkiej zmiany specyficzności substratowej jednego z paralogów. Wielokrotne duplikacje jednej grupy genów prowadzą do rozrostu rodziny kodowanych przez nie białek i rozszerzenia zakresu możliwości np. rozkładanych przez nie wariantów substratów. Zwiększenie liczby genów związanych z metabolizowaniem danej grupy substratów jest jednym z podstawowych sposobów adaptacji do danej niszy ekologicznej widzianej z perspektywy genomu. Charakterystyczne więc dla grzybów związanych z roślinami będzie kodowanie licznych enzymów degradujących węglowodany, a dla dermatofitów – proteazy i lipazy. Kolejnym poziomem adaptacji patogenów/symbiontów jest zmiana profilu ekspresji genów i stały „wyścig zbrojeń” z gospodarzami. Ponadto geny te często sąsiadują z transpozonami, w obrębie szybciej ewoluującej części genomu. Geny związane z metabolizowaniem ksenobiotyków częściej ulegają też horyzontalnemu transferowi genów aniżeli geny metabolizmu podstawowego. Inna wyróżniającą grzyby cechą jest posiadanie różnorodnych modeli rozmnażania płciowego nawet pomiędzy spokrewnionymi gatunkami. Model rozmnażania jest jednym z ważniejszych sposobów dostosowania do trybu życia. Rozmnażanie jednopłciowe pojawiało się wielokrotnie w ewolucji grzybów i wydaje się być adaptacją do patogennego trybu życia.
One genome enables a fungus to have various lifestyles and strategies depending on environmental conditions and in the presence of specific counterparts. The nature of their interactions with other living and abiotic elements is a consequence of their osmotrophism. The ability to degrade complex compounds and especially plant biomass makes them a key component of the global carbon circulation cycle. Since the first fungal genomic sequence was published in 1996 mycology has benefited from the technolgical progress. The available data create an unprecedented opportunity to perform massive comparative studies with complex study design variants targeted at all cellular processes.
Źródło:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biologica et Oecologica; 2014, 10; 9-17
1730-2366
2083-8484
Pojawia się w:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biologica et Oecologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application aspects of animal and human genomics
Aspekty aplikacyjne genomiki mitochondrialnej zwierząt i człowieka
Autorzy:
Slaska, B.
Makarewic, A.
Surdyka, M.
Nisztuk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/44620.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2014, 13, 2
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA – a molecule that transformed science. A short history of research
Autorzy:
Gabryelska, Marta M.
Szymański, Maciej
Barciszewski, Jan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/703398.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
DNA
molecular biology
genomics
genetics
Opis:
Deoxyribonucleic acid (DNA) was identified 140 years ago by a Swiss physician Friedrich Miescher. His discovery was fundamental for the development of biochemistry, genetics and molecular biology. Contemporary biology, biotechnology and medicine largely depends on our ability to analyze, synthesize and manipulate DNA. We present highlights of the history of DNA research from the very beginning to the sequencing of human genome.
Źródło:
Nauka; 2009, 2
1231-8515
Pojawia się w:
Nauka
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ewolucjonizm darwinowski w świetle genomiki
Darwinian Evolution in the Light of Genomics
Autorzy:
Koonin, Eugene V.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/553359.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Instytut Filozofii
Tematy:
darwinizm
Nowoczesna Synteza
genomika ewolucyjna
biologia systemowa
Postnowoczesna Synteza biologii ewolucyjnej
dobór oczyszczający
neutralne procesy ewolucyjne
nieadaptacjonistyczna teoria ewolucji
Darwinism
Modern Synthesis
evolutionary genomics
systems biology
Postmodern Synthesis of evolutionary biology
purifying selection
neutral evolutionary processes
non-adaptationist theory of evolution
Opis:
Genomika porównawcza i biologia systemowa oferują niespotykane możliwości testowania głównych zasad biologii ewolucyjnej sformułowanych przez Darwina w O powstawaniu gatunków w 1859 roku i rozszerzonych sto lat później w ramach Nowoczesnej Syntezy. Badania w dziedzinie genomiki ewolucyjnej pokazują, że dobór naturalny stanowi tylko jedną z sił kształtujących ewolucję genomu i wcale nie występującą najczęściej, natomiast procesy nieadaptacyjne mają znacznie większe znaczenie niż wcześniej przypuszczano. Duży wkład horyzontalnego transferu genów i różnych samolubnych elementów genetycznych w ewolucję genomu podważa koncepcję drzewa życia. Adekwatny opis ewolucji wymaga bardziej złożonej koncepcji sieci lub „lasu” życia. Nie istnieje spójny trend ewolucji w kierunku większej złożoności genomowej, a kiedy złożoność wzrasta, wydaje się, że jest to raczej nieadaptacyjna konsekwencja ewolucji drogą słabego doboru oczyszczającego niż adaptacji. Odkryto rozmaite powszechniki ewolucji genomu, w tym niezmiennicze rozkłady tempa ewolucji pośród genów ortologowych z różnych genomów oraz rozmiarów rodzin genów paralogowych. Dostrzeżono też negatywną korelację między poziomem ekspresji genów a tempem ewolucji sekwencji. Niektóre z tych powszechników uzyskują wyjaśnienie dzięki zastosowaniu prostych, nieadaptacjonistycznych modeli ewolucji, co sugeruje, że w dość nieodległej przyszłości powstać może nowa synteza biologii ewolucyjnej.
Comparative genomics and systems biology offer unprecedented opportunities for testing central tenets of evolutionary biology formulated by Darwin in the Origin of Species in 1859 and expanded in the Modern Synthesis 100 years later. Evolutionary-genomic studies show that natural selection is only one of the forces that shape genome evolution and is not quantitatively dominant, whereas non-adaptive processes are much more prominent than previously suspected. Major contributions of horizontal gene transfer and diverse selfish genetic elements to genome evolution undermine the Tree of Life concept. An adequate depiction of evolution requires the more complex concept of a network or “forest” of life. There is no consistent tendency of evolution towards increased genomic complexity, and when complexity increases, this appears to be a non-adaptive consequence of evolution under weak purifying selection rather than an adaptation. Several universals of genome evolution were discovered including the invariant distributions of evolutionary rates among orthologous genes from diverse genomes and of paralogous gene family sizes, and the negative correlation between gene expression level and sequence evolution rate. Simple, non-adaptive models of evolution explain some of these universals, suggesting that a new synthesis of evolutionary biology might become feasible in a not so remote future.
Źródło:
Filozoficzne Aspekty Genezy; 2018, 15; 283-370
2299-0356
Pojawia się w:
Filozoficzne Aspekty Genezy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie genomiki strukturalnej i funkcjonalnej w nowoczesnej hodowli roślin z rodziny Brassicaceae
Structural and functional genomics usage for modern breeding of Brassicaceae
Autorzy:
Mikolajczyk, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833431.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2008, 29, 2
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-10 z 28

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies