Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "gene region" wg kryterium: Wszystkie pola


Wyświetlanie 1-32 z 32
Tytuł:
The structural and functional analysis of the human HSPA2 gene promoter region
Autorzy:
Pigłowski, Wojciech
Nowak, Radosława
Krawczyk, Zdzisław
Ścieglińska, Dorota
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041117.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
expression regulation
cancer cell lines
transcript structure
HSPA2
Opis:
HSPA2 is a human counterpart of the testis-specific rodent Hst70/Hsp70.2 gene. In contrast to the latter, the expression of the human HSPA2 gene is not limited to the testis, and recent data show that human tumor cells can express this gene at significant levels. The characteristics of HSPA2 expression suggests that it can influence the phenotype and survival of cancer cells similarly as overexpression of major members of the HSP70 gene family. Until now, neither the structure of the transcription unit of the human HSPA2 gene has been established nor a functional analysis of its promoter performed. In this study we established that the human HSPA2 gene, in contrast to its rodent counterparts, is intronless and has a single transcription start site. We also show that the same type of HSPA2 transcripts are synthesized in the testes and in cancer cell lines. In order to perform a functional study of the HSPA2 promoter, we used a transient transfection assay and found that the 392 bp fragment upstream of the ATG codon was a minimal region required for efficient transcription, while a 150 bp deletion from the 5' end of this region dramatically reduced the promoter activity. Delineation of the minimal promoter is a basic step toward identifiying the cis and trans elements involved in the regulation of the HSPA2 gene expression in cancer cells.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 1; 99-106
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dde I RFLP at the 5 region of bovine kappa-casein gene
Autorzy:
Kaminski, S
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2047278.pdf
Data publikacji:
1996
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
gene region
bovine kappa-casein
polymorphism
milk property
dairy cattle
Opis:
The bovine kappa-casein (CASK) gene is known as a potential quantitative trait locus in dairy cattle breeding. However, the molecular basis of the effect of the CASK allele B on different milk properties remains unclear. In this report, a 214 bp fragment of the 5' untranslated region of the CASK gene containing 5 potential consensus sequenses for different transcription factors was PCR-amplified to find RFLPs. A Dde I RFLP was identified. In a population of 112 Bos taurus (86 cows and 26 bulls of Polish Black and White crossbred Holstein-Friesian) and 7 Bison bonasus individuals, 7 had no recognition sites for Dde I, 23 were heterozygous and 89 were cut completely into two fragments.
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 1996, 37, 2; 173-178
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Constraints on Phylogenetic Interrelationships among Four Free-living Litostomatean Lineages Inferred from 18S rRNA gene-ITS Region sequences and Secondary Structure of the ITS2 molecule
Autorzy:
Rajter, Ľubomír
Vďačný, Peter
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/52400824.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
dorsal brush
Haptoria
molecular synapomorphies
morphological evolution
Pseudoholophryidae
Rhynchostomatia
Opis:
We investigated interrelationships between four free-living litostomatean lineages, using 18S rRNA gene and ITS region sequences as well as the secondary structure of the ITS2 molecules. Our phylogenetic analyses confirmed the deep split of free-living litostomateans into Rhynchostomatia and Haptoria represented here by Haptorida, Pleurostomatida, and Spathidiida. This bifurcation is also corroborated by the signature of the rhynchostomatian and haptorian ITS2 molecules. Specifically, the consensus stems of helices II and III are longer by one base pair in Rhynchostomatia, while the terminal loops of both helices are longer by one or two nucleotide/-s in Haptoria. A close relationship of Pleurostomatida and Haptorida is favored by quartet likelihood-mapping and supported by a 5’-AG vs. CU-3’ motif in the variable part of helix II and by two morphological apomorphies, i.e., meridionally extending somatic kineties and a non-three-rowed dorsal brush. Although monophyletic origin of Spathidiida is poorly supported in phylogenetic trees, the unique motif 5’-GA vs. UC-3’ present in the consensus helix II stem could be an important molecular synapomorphy of spathidiids, apart from the ancestrally anteriorly curved somatic kineties and the three-rowed dorsal brush. The peculiar family Pseudoholophryidae has very likely found its phylogenetic home among spathidiids, as an early branching lineage.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2017, 56, 4; 255-281
0065-1583
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SSCP polymorphism within 5 region of bovine lactoglobulin [LGB] gene
Autorzy:
Kaminski, S
Zabolewicz, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2044462.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
lactoglobulin gene
polymorphism
SSCP method
cattle
gene transcription
electrophoresis
hormonal receptor
mutation
beta-lactoglobulin
milk
Opis:
In the paper the detection of the SSCP polymorphism within the 5’ fragment of bovine beta-lactoglobulin (LGB) gene is described. The 5’ fragment of LGB gene (209 bp) was PCR-amplified and then subjected to electrophoresis allowing the detection of SSCP polymorphism. Among 124 animals (50 cows and 74 bulls) six SSCP patterns were identified and named Rl, R2, R3, R4, R5 and R6, which occured with the frequency of 0.32, 0.51, 0.09, 0.06, 0.01 and 0.01, respectively. The PCR-SSCP method is simple, fast, and relatively inexpensive. The SSCP polymorphism reported in the paper may be useful in looking for the associations between different SSCP patterns and LGB gene expression and milk properties.
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 1998, 39, 1; 97-102
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Comparison of the nuclear organiser region activity in four taxa of the family Canidae
Autorzy:
Pienkowska, A
Zagalska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2041199.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
nuclear organiser region activity
gene cluster
rRNA
sex chromosome
genetics
Canidae
racoon dog
karyotype
rRNA gene
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 2001, 42, 4; 493-501
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Anaplasma phagocytophilum infection of red foxes [Vulpes vulpes]
Autorzy:
Karbowiak, G
Vichova, B.
Majlathova, V.
Hapunik, J.
Pet'ko, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/50073.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
Polska
Mazovia region
parasite
Anaplasma phagocytophilum
infection
animal disease
red fox
Vulpes vulpes
16S rRNA gene
msp4 gene
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2009, 16, 2; 299-300
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The role of the 5 terminal region of p53 mRNA in the p53 gene expression
Autorzy:
Swiatkowska, Agata
Zydowicz, Paulina
Sroka, Joanna
Ciesiołka, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038716.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
p53
transcription
translation
non-coding region
mRNA
IRES
Opis:
The p53 tumour suppressor protein is one of the major factors responsible for cell cycle regulation and protection against cancer development. This is why it is often referred to as "the guardian of the genome". On the other hand, mutations in the p53 gene are connected with more than 50% of tumours of various types. The thirty-six years of extensive research on the p53 gene and its protein products have shown how sophisticated the p53-based cell system control is. An additional level of complexity of the p53 research is connected with at least twelve p53 isoforms which have been identified in the cell. Importantly, disturbance of the p53 isoforms' expression seems to play a key role in tumorigenesis, cell differentiation and cell response to pathogenic bacteria, and RNA and DNA viruses. Expression of various p53 isoforms results from the usage of different transcription promoters, alternative splicing events and translation initiation from alternative AUG codons. The importance of the 5'-terminal regions of different p53 mRNA transcripts in the multi-level regulation of the p53 gene has recently been documented. In this review we focus on the structural features of these regions and their specific role in the p53 translation initiation process.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2016, 63, 4; 645-651
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of the G/C polymorphism in the 5-untranslated region of the RAD51 gene in breast cancer.
Autorzy:
Blasiak, Janusz
Przybyłowska, Karolina
Czechowska, Agnieszka
Zadrożny, Marek
Pertyński, Tomasz
Rykała, Jan
Kołacińska, Agnieszka
Morawiec, Zbigniew
Drzewoski, Józef
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043672.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
genetic polymorphism
RAD51 gene
RFLP-PCR
breast cancer
Opis:
The breast cancer suppressor proteins BRCA1 and BRCA2 interact with RAD51, a protein essential for maintaining genomic stability by playing a central role in homology-dependent recombinational repair of the DNA double-strand breaks. Therefore, genetic variability in the RAD51 gene may contribute to the appearance and/or progression of breast cancer. A single nucleotide polymorphism in the 5'- untranslated region of RAD51 (a G to C substitution at position 135, the G/C polymorphism) is reported to modulate breast cancer risk. We investigated the distribution of genotypes and frequency of alleles of the G/C polymorphism in breast cancer. Tumor tissues were obtained from postmenopausal women with node-negative and node-positive breast carcinoma with uniform tumor size. Blood samples from age matched healthy women served as control. The G/C polymorphism was determined by PCR-based MvaI restriction fragment length polymorphism. The distribution of the genotypes of the G/C polymorphism did not differ significantly (P >0.05) from those predicted by the Hardy-Weinberg distribution. There were no differences in the genotype distribution and allele frequencies between node-positive and node-negative patients. There were no significant differences between distributions of the genotypes in subgroups assigned to histological grades according to Scarf-Bloom-Richardson criteria and the distribution predicted by Hardy-Weinberg equilibrium (P >0.05). Our study implies that the G/C polymorphism of the RAD51 gene may not be directly involved in the development and/or progression of breast cancer and so it may not be useful as an independent marker in this disease.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2003, 50, 1; 249-253
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mutation in the regulatory region of the EDA gene coincides with the symptoms of anhidrotic ectodermal dysplasia
Autorzy:
Kobielak, Krzysztof
Kobielak, Agnieszka
Limon, Janusz
Trzeciak, Wiesław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044878.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1998, 45, 1; 245-250
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Warunki zachowania zasobów genowych wybranych gatunków roślin górskich w regionie gdańskim
Requirements for a gene pool conservation of some mountain species in the Gdańsk-Region
Autorzy:
Markowski, Ryszard
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/945382.pdf
Data publikacji:
1986
Wydawca:
Uniwersytet Łódzki. Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Opis:
The author has carried out a preliminary analysis and an estimation of odds and requirements for the maintenance of mountain plants in the Gdańsk-Region, i.e. in an area of their greatest density in the West Pomerania (Northern Poland). Species contents, commonness of the plants and a role reserves in preserving of their localities were considered. The author has also considered their contribution to plant communities, their reaction to anthropopressure, their capacities for migration, and finally the density of their populations (summary see page 172).
Źródło:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Sozologica; 1986, 3
0208-6131
Pojawia się w:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Sozologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
E2F site in the essential promoter region does not confer S phase-specific transcription of the ABCC10 gene in human prostate cancer cells
Autorzy:
Dabrowska, Magdalena
Sirotnak, Francis
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038667.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
ABCC10
MRP7
E2F
p107
RBL1
cell cycle
non-classical E2F target gene
Opis:
ABCC10 (MRP7) plays a role in cellular detoxification and resistance to anticancer drugs. Since ABCC10 gene transcription in human prostate cancer CWR22Rv1 cells was found dependent on E2F binding sequence motif, ABCC10 expression in G1 and S phases of the cell cycle of CWR22Rv1 cells, was analyzed. The cells were synchronized in G1 phase by double thymidine block and in S phase by thymidine/mimosine double block. ABCC10 mRNA level was found to be similar in S phase-synchronized and asynchronous cell populations. In G1 phase it decreased by 2.4- to 3-fold. It is thus inferred, that ABCC10 expression in CWR22Rv1 cells is not S phase-specific but is primarily associated with cell proliferation.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2017, 64, 2; 371-374
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
LBP gene methylation involved in mRNA expression and resistance to E. coli F18 in weaned piglets
Autorzy:
Gan, L.N.
Bao, W.B.
Wu, S.L.
Qin, W.Y.
Sun, L.
Zhao, C.X.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2087872.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
LBP gene
methylation analysis of the LBP region
E.coli F18 strain
weaned piglets
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2017, 4; 643-650
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Polymorphism in the promoter region of the tumor necrosis factor-alpha gene in cattle herds naturally infected and uninfected with the Bovine Leukemia Virus
Autorzy:
Bojarojc-Nosowicz, B.
Kaczmarczyk, E.
Stachura, A.
Kotkiewicz, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/31844.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Opis:
The objective of this study was to describe and compare the genetic structure (TNF-α-position 824) of dairy cattle herds infected and not infected with the bovine leukemia virus (BLV). The results of the present study indicate that BLV-positive herds were characterized by similar genetic structure (TNF-α-824A/G). The genetic equilibrium in these herds was preserved, but a tendency to increased frequency of G/G homozygotes was found. The genetic structure of the healthy herd differed considerably from that of leukemic herds.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2011, 14, 4
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Prevalence of Anaplasma phagocytophilum in Ixodes ricinus ticks determined by polymerase chain reaction with two pairs of primers detecting 16S rRNA and ankA genes
Autorzy:
Chmielewska-Badora, J
Zwolinski, J.
Cisak, E.
Wojcik-Fatla, A.
Buczek, A.
Dutkiewicz, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/51023.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
Lublin region
Polska
pathogen
Ixodes ricinus
Eastern Poland
tick
determination
animal pathogen
human pathogen
ankA gene
16S rRNA gene
granulocytic anaplasmosis
bacteria
Anaplasma phagocytophilum
polymerase chain reaction
Opis:
A total of 684 Ixodes ricinus ticks (321 nymphs, 184 males, and 179 females) were collected by fl agging lower vegetation in 6 forest districts located on the territory of Lublin province (eastern Poland). Ticks were examined by polymerase chain reaction (PCR) method for the presence of Anaplasma phagocytophilum DNA with two pairs of primers: EHR521/EHR747 for detecting 16S rRNA gene, and LA6/LA1 for detecting ankA gene. To study the relationship between infection in ticks and people occupationally exposed to tick bite, blood serum samples of 261 forestry workers employed in the same forest districts were examined by immunofl uorescence method for the presence of specifi c antibodies against A. phagocytophilum. A total of 70 ticks out of 684 examined (10.2%) showed the presence of A. phagocytophilum 16S rRNA gene. The prevalence of infection was signifi cantly dependent on tick’s stage (χ2=49.2, p<0.00001) and geographical locality (χ2=34.4, p<0.00001). The percentage of I. ricinus females infected with A. phagocytophilum (24.6%) was signifi cantly greater compared to males (6.5%) and nymphs (4.4%) (p<0.00001). Only 19 ticks out of 684 examined (2.8%) showed the presence of A. phagocytophilum ankA gene, signifi cantly less compared to 16S rRNA gene (p<0.00001). The prevalence of infection demonstrated by the presence of ankA gene was also signifi cantly dependent on tick’s stage (χ2=23.6, p<0.00001) but not on locality (χ2=9.8, p=0.082). A signifi cant correlation was found between the presence of A. phagocytophilum 16S rRNA gene in I. ricinus female ticks from the particular forest districts and the serologic response to A. phagocytophilum of forestry workers employed in the same districts (p<0.05). No signifi cant correlation was found between the presence of A. phagocytophilum ankA gene in I. ricinus ticks and serologic response of exposed workers. In conclusion, detection of A. phagocytophilum infection in ticks by PCR with the use of EHR521/EHR747 primers detecting 16S rRNA gene is signifi cantly more sensitive compared to LA6/LA1 primers detecting ankA gene.
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2007, 14, 2
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analiza częstości występowania polimorfizmu C421A genu ABCG2 w przypadkach raków żołądka w regionie łódzkim
Analysis of the incidence of ABCG2 gene C421A polymorphism in cases of gastric cancer in the Łódź region
Autorzy:
Wosiak, Agnieszka
Sałagacka, Aleksandra
Balcerczak, Ewa
Żebrowska, Marta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1032542.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Łódzkie Towarzystwo Naukowe
Tematy:
ABCG2
BCRP
C421A
gastric cancer
gene
polymorphism
abcg2
bcrp
c421a
gen
polimorfizm
rak żołądka
Opis:
Introduction: In the present thesis the association between the variants of C421A polymorphism of ABCG2 gene and the risk of gastric cancer development were searched. The occurrence of polymorphic variant 421 C > A leads to the weakening of the activity of BCRP protein which is encoded by the ABCG2 gene. Due to the presence of BCRP protein in the gastrointestinal tract and its protective role the reduction of the amount of BCRP protein which is the result of the tested polymorphism may lead to the increased predisposition to cancer development. The main aim of this study was to compare the frequency of C421A polymorphism genotypes between the examined and the control groups. Material and methods: The material for the research consisted of DNA isolated from 19 scraps of the tumor tissue taken from patients with gastric cancer and 44 samples of peripheral blood collected from healthy individuals. DNA was extracted from the tested materials by microcolumn-method. Then the obtained samples of DNA were subjected to polymerase chain reaction (PCR) to amplify the ABCG2 gene fragment. To determine C421A polymorphism genotypes ABCG2 gene fragments amplified by PCR the were analyzed by RFLP method using an digestive enzyme MseI. Results: All the examined patients irrespectively of gender, age and clinical stage showed the presence of genotype C/C, which is homozygous wild for C421A polymorphism. All 44 persons from the control group also showed the presence of genotype C/C. Conclusions: No differences in the occurrence of C421A genotypes between the study group and the control group were found. In both the groups 100% of the results for the C/C genotype were obtained. Due to the presence of only one genotype (C/C) for the C421A polymorphism in all the patients no relationship between the occurrence of C421A genotypes and tumor stage, age and gender of the examined patients was evaluated. Although no correlation between the C421A polymorphism and the susceptibility to the development of gastric cancer was found the exclusion of the participation of BCRP protein in the pathogenesis of this disease is possible only after the increase of the number of analyses on larger groups of respondents.
Wstęp: W niniejszej pracy poszukiwano związku między występowaniem wariantów dla polimorfizmu C421A w obrębie genu ABCG2, a zwiększonym ryzykiem rozwoju raka żołądka. Występowanie wariantu polimorficznego 421 C>A prowadzi do zmniejszonej aktywności białka BCRP, kodowanego przez gen ABCG2. Ze względu na obecność białka BCRP w obrębie przewodu pokarmowego i związaną z tym rolę ochronną, zmniejszenie ilości białka BCRP będące efektem badanego polimorfizmu może zwiększać predyspozycję do rozwoju raka. Głównym celem pracy było porównanie częstości występowania genotypów dla polimorfizmu C421A pomiędzy grupą badaną a kontrolną. Materiał i metody: Materiał do badań stanowiło DNA wyizolowane z 19 mrożonych skrawków tkankowych pobranych od pacjentów z rakiem żołądka i z 44 prób krwi obwodowej pobranych od osób zdrowych. Izolację DNA z badanych materiałów biologicznych przeprowadzono wykorzystując metodę kolumienkową. Następnie, uzyskane próby DNA poddawano reakcji łańcuchowej polimerazy, by powielić badany fragmentu genu ABCG2. Celem określenia genotypów dla polimorfizmu C421A na mnożony w reakcji PCR fragment genu ABCG2 poddawano analizie metodą RFLP z użyciem enzymu MseI. Wyniki: U wszystkich badanych, bez względu na płeć, wiek oraz stopień zaawansowania klinicznego raka żołądka, wykazano obecność genotypu C/C, czyli homozygoty dzikiej dla polimorfizmu C421A. Wśród 44 osób z grupy kontrolnej również u wszystkich stwierdzono genotyp C/C. Wnioski: Nie wykazano różnic w częstości występowania genotypów dla polimorfizmu C421A między grupą badaną i kontrolną. W obydwu grupach zaobserwowano tylko jeden z możliwych genotypów dla badanego polimorfizmu - genotyp C/C. Z uwagi na stwierdzenie u wszystkich badanych osób z obu grup tylko genotypu C/C dla polimorfizmu C421A nie oceniano zależności między występowaniem genotypów C421A a stopniem zaawansowania nowotworu, wiekiem i płcią badanych osób. Mimo, że nie wykazano korelacji między polimorfizmem C421A a podatnością na rozwój raka żołądka, jednoznaczne wykluczenie udziału białka BCRP w patogenezie tej jednostki chorobowej jest możliwe dopiero po przeprowadzeniu większej ilości analiz na większych grupach badanych.
Źródło:
Folia Medica Lodziensia; 2014, 41, 1; 33-45
0071-6731
Pojawia się w:
Folia Medica Lodziensia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A stable density approach to probe selection for a custom aCGH design
Autorzy:
Gambin, T.
Stankiewicz, P.
Gambin, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81185.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
genomic region
probe
copy number alternation
comparative genomic hybridization
human genome
microarray
wide range application
gene expression
methylation
binding protein
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wstępna ocena polimorfizmu T-129C w regionie promotorowym genu ABCB1 u pacjentów z rakiem żołądka
Preliminary evaluation of T-129C polymorphism in the promoter region of the ABCB1 gene in patients with gastric adenocarcinoma
Autorzy:
Szmajda, Dagmara
Krygier, Adrian
Balcerczak, Ewa
Żebrowska, Marta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1032613.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Łódzkie Towarzystwo Naukowe
Tematy:
rak żołądka
polimorfizm
region promotorowy
t–129c
abcb1
gastric cancer
polymorphism
promoter region
Opis:
Introduction: Gastric cancer is one of the most common tumors in the world. The pathogenesis of this cancer is not fully known. Among the risk factors for the disease there are: Helicobacter pylori infection, diet, alcohol consumption and smoking. On the other hand, it is assumed that the pathogenesis of the development is related to interdependence between risk factors and patient's genetic susceptibility. One of the genes involved in carcinogenesis can be ABCB1, whose protein product, P–glycoprotein, plays a protective function by removing xenobiotics from the cell into the extracellular environment. Polymorphisms of this gene can alter the protein product, leading to the loss of protective function and the increased risk of diseases development. Polymorphism T–129C can influence the formation of mRNA and thus, lead to changes in the quantity/activity of P–glycoprotein. The aim of this study was to evaluate the polymorphism at position T–129C in promoter region of ABCB1 gene in the group of patients with gastric adenocarcinoma. Material and methods: The material for the study consisted of 19 samples of the tissue taken from patients with gastric adenocarcinoma and 68 samples of peripheral blood taken from healthy donors. Genotyping of the T–129C was performed by using restriction fragments polymorphism method. Results: No statistically significant differences between the group of patients with gastric cancer and the healthy individuals were found. Conclusions: The polymorphism on position T–129C in promoter region of ABCB1 gene did not affect the risk of the development of gastric cancer. The obtained results require confirmation by investigating a large cohort of patients.
Wstęp: Rak żołądka jest jedną z najczęstszych chorób nowotworowych na świecie. Patogeneza tego nowotworu nie została w pełni poznana. Wśród czynników ryzyka rozwoju choroby wymienia się: zakażenie Helicobacter pylori, niewłaściwą dietę, spożywanie alkoholu czy palenie tytoniu. Z drugiej strony, zakłada się, iż patogeneza rozwoju tego raka jest związana ze współzależnością pomiędzy czynnikami ryzyka a predyspozycją genetyczną samego pacjenta. Jednym z genów zaangażowanych w proces kancerogenezy może być ABCB1, którego produkt białkowy – glikoproteina P, poprzez usuwanie ksenobiotyków z komórki do środowiska pozakomórkowego, spełnia funkcję ochronną. Polimorfizmy tego genu mogą zmieniać jego produkt białkowy prowadząc do utraty funkcji ochronnej i zwiększonego ryzyka rozwoju chorób. Polimorfizm w pozycji T–129C może wpływać na powstawanie mRNA, a tym samym prowadzić do zmiany ilości/aktywności glikoproteiny P. Celem pracy była ocena polimorfizmu w regionie promotorowym genu ABCB1 w pozycji T–129C u pacjentów z gruczolakorakiem żołądka. Materiał i metody: Materiał do badania stanowiło 19 skrawków tkankowych pobranych od pacjentów z gruczolakorakiem żołądka oraz 68 prób krwi obwodowej pobranych od zdrowych krwiodawców. Genotypowanie w pozycji T–129C przeprowadzono za pomocą techniki polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych. Wyniki: Nie wykazano istotnych statystycznie różnic pomiędzy grupą pacjentów z rakiem żołądka a grupą osób zdrowych. Wnioski: Polimorfizm w pozycji T–129C regionu promotorowego genu ABCB1 nie ma związku z rozwojem raka żołądka. Uzyskane w pracy wyniki badań wymagają potwierdzenia na większej grupie pacjentów.
Źródło:
Folia Medica Lodziensia; 2015, 42, 1; 19-32
0071-6731
Pojawia się w:
Folia Medica Lodziensia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of a microsatellite region composed of a long homopurine/homopyrimidine tract surrounded by AT -rich sequences upstream of the rat stress-inducible hsp70.1 gene
Autorzy:
Lisowska, Katarzyna
Loch, Tomasz
Fiszer-Kierzkowska, Anna
Ścieglińska, Dorota
Krawczyk, Zdzisław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044976.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1997, 44, 1; 147-152
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Construction of cDNA library from liver RNA of heat shocked rats and DNA sequence analysis of the clone containing the 3' -end untranslated region (3'UTR) of the heat inducible gene hsp70.2
Autorzy:
Lisowska, Katarzyna
Ścieglińska, Dorota
Krawczyk, Zdzisław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1045150.pdf
Data publikacji:
1996
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1996, 43, 2; 313-317
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The bovine tyrosine hydroxylase gene associates in vitro with the nuclear matrix by its first intron sequence*.;
Autorzy:
Lenartowski, Robert
Grzybowski, Tomasz
Miścicka-Śliwka, Danuta
Wojciechowski, Waldemar
Goc, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043467.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
intronic S/MAR
tissue specificity
scaffold/matrix attachment region (S/MAR)
tyrosine hydroxylase
nuclear matrix
Opis:
Recently we have shown that in vitro binding of the proximal part of the human tyrosine hydroxylase gene to the nuclear matrix is correlated with its transcriptional activity. The strongest binding potential was predicted by computing for the first intron sequence (Lenartowski & Goc, 2002, Neurosci Lett.; 330 : 151-154). In this study a 16 kb fragment of the bovine genomic DNA containing the tyrosine hydroxylase gene was investigated for its affinity to the nuclear matrix. Only a 950 bp fragment encoding the distal part of the first intron, second exon and a few nucleotides of the second intron bound to the nuclear matrix. The binding was independent of the tissue-specific tyrosine hydroxylase gene activation. The fragment was subcloned and sequenced. Computer search pointed to one potential intronic matrix attachment region with two AP1-like sites embedded in the sequence. We conclude that even if the position of the matrix binding region is conserved among the tyrosine hydroxylase genes in mammals, its tissue specificity and/or function is not preserved or is achieved by different mechanisms.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2003, 50, 3; 865-873
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Role of polymorphisms TNF.- alpha gene in the development of recurrent miscarriage after in vitro fertilization in the residentS of Odessa region of Ukraine
Autorzy:
Golovatyuk, K. P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/765441.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu. Wydział Nauk o Ziemi i Gospodarki Przestrzennej. Katedra Kultury Fizycznej
Tematy:
recurrent miscarriage, in vitro fertilization, tumor necrosis factor-α r, inheritance, polymorphism, genotype, polymerase chain reaction
Opis:
Golovatyuk K. P. Role of polymorphisms TNF.- alpha gene in the development of recurrent miscarriage after in vitro fertilization in the residentS of Odessa region of Ukraine. Journal of Education, Health and Sport. 2017;7(1):323 - 332. eISSN 2391-8306. DOI http://dx.doi.org/10.5281/zenodo.265805http://ojs.ukw.edu.pl/index.php/johs/article/view/4218    The journal has had 7 points in Ministry of Science and Higher Education parametric evaluation. Part B item 754 (09.12.2016).754 Journal of Education, Health and Sport eISSN 2391-8306 7© The Author (s) 2017;This article is published with open access at Licensee Open Journal Systems of Kazimierz Wielki University in Bydgoszcz, PolandOpen Access. This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Noncommercial License which permits any noncommercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author(s) and source are credited. This is an open access article licensed under the terms of the Creative Commons Attribution Non Commercial License(http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/) which permits unrestricted, non commercial use, distribution and reproduction in any medium, provided the work is properly cited.This is an open access article licensed under the terms of the Creative Commons Attribution Non Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/) which permits unrestricted, non commercial use, distribution and reproduction in any medium, provided the work is properly cited.The authors declare that there is no conflict of interests regarding the publication of this paper.Received: 02.01.2017. Revised 16.01.2017. Accepted: 24.01.2017. UDK 618.177-089.888.11:618.39-0796:575.162 ROLE OF POLYMORPHISMS TNF- alpha GENE IN THE DEVELOPMENT OF recurrent miscarriage after in vitro fertilization in THE  residentS of Odessa region of Ukraine K. P. Golovatyuk Odessa National medical University, Ukraine; nosenko.olena@gmail.com;  info@gameta.od.ua SummaryThe frequency of genotypes and allelic variants of the TNF-α gene (-238 G> A, -308 G> A, -1031 T > C), depending on the reproductive status and evaluation of its association with recurrent miscarriage (RM) in cycles in vitro fertilization (IVF) has been studied. The residents of the Odessaregion of Ukrainehave been under examination. It has been revealed that typing of SNPs of genes of the immune response TNF-α (rs1799964) and TNF-α (rs1800629) may be used as an early diagnostic method and pregravida prediction of reproductive losses in infertile women with RM after IVF. Genotypes AA -308G> A, (GA + AA) -308G> A and TC-1031C, (TC + CC) -1031C TNF-α gene were statistically significant associated with an increased risk of RM after IVF.Key words: recurrent miscarriage, in vitro fertilization, tumor necrosis factor-α r, inheritance, polymorphism, genotype, polymerase chain reaction.
Źródło:
Journal of Education, Health and Sport; 2017, 7, 1
2391-8306
Pojawia się w:
Journal of Education, Health and Sport
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Cloning and expression of the two DNA fragments of the I-18 C region of Chironomus tentans. II. The effects of the applied technology
Autorzy:
Borowicz, B P
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/66157.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
promoter system
cloning
I-18 C gene
T7 RNA polymerase
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
Opis:
The chromosomal I-18 C region of Chironomus tentans contains the I-18 C gene. Two different open reading frames (i.e. the ORF I and II) of two different transcripts (i.e. the 1.8 kb and 4.6 kb RNA) of the I-18 C gene of Chironomus tentans were isolated, at the DNA level, by the Polymerase Chain Reaction, then were cloned into the bluescript vector and finally were cloned into the pET-3a vector in order to translate them in T7 RNA polymerase / promoter system of E. coli. It was possible to obtain the ORF I overexpressed. In a case of the ORF II the low molecular weight polypeptide was detected, however it was not overexpressed, but still this polypeptide was strongly visible on the SDS-polyacrylamide gel.
Region chromosomalny I-18 C Chironomus tentans zawiera gen I-18 C. Dwie odrębne otwarte ramy odczytu (tj. ORF I i II) genu I-18 C Chironomus tentans zostały wyizolowane, na poziomie DNA, przy użyciu Reakcji Łańcuchowej Polimerazy (PCR), a następnie zostały wklonowane do wektora blueskrypt i ostatecznie zostały wklonowane do wektora pET-3a w celu ich translacji w systemie promotora T7 RNA polimerazy w E. coli. Uzyskano bardzo dużą ekspresję ORF I. W przypadku ORF II wykryto obecność polipeptydu o niskiej masie cząsteczkowej i chociaż nie uzyskano jego bardzo dużej ekspresji, tym niemniej polipeptyd ten był silnie widoczny w żelu poliakryloamidowym z SDS.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1998, 38, 1
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular mechanisms of genome expression of coxsackievirus B3 that belongs to enteroviruses
Autorzy:
Dutkiewicz, M.
Swiatkowska, A.
Ojdowska, A.
Smolska, B.
Dymarek-Babs, T.
Jasinska, A.
Ciesiolka, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80289.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
enterovirus
pathogen
human disease
viral infection
coxsackievirus B3
gene expression
molecular mechanism
untranslated region
viral replication
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2012, 93, 4
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of the association between rs12917707 and rs11864909 single nucleotide polymorphisms in the region of the uromoduline gene and chronic kidney disease - a family-based study
Autorzy:
Żywiec, Joanna
Kiliś-Pstrusińska, Katarzyna
Tomaszewski, Maciej
Grzeszczak, Władysław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/990841.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
chronic kidney disease
genetic association
family-based study
umod polymorphism
Opis:
Chronic kidney disease (CKD) is an important challange for healthcare systems wordwide because of its high prevalence and serious late complications. The results of recent studies suggest an association between CKD development and genetic variation within the uromodulin gene (UMOD). The aim of this study was to investigate associations between two common single nucleotide polymorphisms – rs12917707 and rs11864909, located in the region of UMOD and chronic renal disease. The study group consisted of 109 patients with chronic kidney disease, caused by chronic renal glomerulonephritis or chronic tubulointerstitial nephritis, and 109 pairs of their biological parents. Genotyping for rs12917707 and rs11864909 was carried out using the TaqMan Pre-designed SNP Genotyping Assay. In the transsmission disequilibrium test, allele C of rs11864909 was preferentialy transmitted from parents to the children with chronic tubulointerstinal nephritis. The rs12917707 was not associated with CKD. Neither of the investigated polymorphisms was associated with the progression of chronic kidney disease. The obtained results suggest an association of rs11864909 with chronic kidney disease secondary to chronic tubulointerstinal nephritis.
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2017, 24, 3
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Morpho-molecular Characterization of the Litostomatean Predatory Ciliate Phialina pupula (Müller, 1773) Foissner, 1983 (Haptoria, Lacrymariidae)
Autorzy:
Rajter, Ľubomír
Bourland, William
Vďačný, Peter
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/52076120.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
18S rRNA gene
Boise
floodplain sand
ITS region
Lacrymariidae
phylogeny
Opis:
The morphology and phylogenetic position of a haptorian ciliate, Phialina pupula (Müller, 1773) Foissner, 1983, isolated from microaerobic sandy sediments of the floodplain area of the Boise River, Idaho, U.S.A., were studied using live observation, protargol impregnation, scanning electron microscopy, and the 18S rRNA gene as well as the ITS region. The Boise population of P. pupula is characterized by a size of about 60–130 × 20–50 μm, an elliptical macronucleus with a single micronucleus, highly refractive dumbbell-shaped inclusions scattered throughout the cytoplasm and concentrated in the anterior body half, a single subterminal/terminal contractile vacuole, about 10 μm long rod-shaped extrusomes, and an average of 15 ciliary rows. In phylogenetic analyses, the newly obtained sequences from P. pupula and Lacrymaria olor clustered within the family Lacrymariidae with full to moderate statistical support. Neither the genus Phialina nor the genus Lacrymaria was depicted monophyletic both in the single gene and multigene phylogenetic inferences. Specifically, the genus Phialina was shown as a paraphyletic assemblage containing members of the polyphyletic genus Lacrymaria. This indicates that the phialinid bauplan, i.e., an anterior body end differentiated into a head-like structure directly attached to the trunk, might represent the ground pattern in the family Lacrymariidae. On the other hand, the long highly contractile neck carrying the head-like structure probably evolved later and convergently in multiple Lacrymaria species from Phialina-like ancestors.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2019, 58, 2; 53-68
0065-1583
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Cloning and expression of two DNA fregments of the I-18 C region of Chironomus tentans. I. The scheme of the performed experiments and the applied technology
Autorzy:
Borowicz, B P
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65883.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
promoter system
cloning
I-18 C gene
T7 RNA polymerase
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
expression
pET vector
DNA fragment
Opis:
The I-18 C region of the polytenic chromosome of Chironomus tentans contains the I-18 C gene. Two DNA fragments, reflecting two different open reading frames (i.e.ORF I and II) of two different transcripts (i.e. 1.8 and 4.6 kb RNA) of the I-18 C gene were isolated, then were cloned into the intermediate vector and next to the final vector in order to translate them in T7 RNA polymerase / promoter system. The translation of the ORF I and II was performed to obtain the polypeptides of these ORFs for further study. Here, the scheme of the performed experiments and the applied technology that were necessary to realize the goal of this research, are presented.
Region i-18 C chromosomu politenicznego Chironomus tentans zawiera gen I-18 C. Dwa fragmenty DNA, odzwierciedlające dwie różne otwarte ramy odczytu (tj. ORF I i ORF II) dwóch różnych transkryptów (tj. 1.8 i 4.6 kpz RNA) genu I-18 C, zostały wyizolowane i następnie wklonowane do wektora pośredniego, a potem do wektora końcowego, w celu ich translacji w systemie promotora T7 RNA polimerazy. Translacja ORF I i ORF II była wykonana w celu uzyskania polipeptydów określonych przez te ORF do dalszych badań. W niniejszej pracy przedstawiono schemat wykonanych eksperymentów i zastosowaną technologię, która była potrzebna do zrealizowania celu badań.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1998, 38, 1
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ polimorfizmu w regionie promotorowym 5’ genu TG na cechy użytkowości mlecznej bydła rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej
Effect of polymorphism in the 5’ promoter region of the TG gene on the milk production traits of Polish Holstein-Friesian cattle
Autorzy:
Czerniawska-Piatkowska, E.
Kowalewska-Luczak, I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2119753.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Zootechniczne
Tematy:
tyreoglobulina
bydło
SNP
użytkowość mleczna
Opis:
Celem podjętych badań było określenie zależności między występowaniem trzech różnych mutacji punktowych (257C>T, 335A>G, 422 C>T) w regionie promotorowym genu kodują- cego tyreoglobulinę (powodujących jego polimorfizm) a cechami użytkowości mlecznej by- dła. Badaniami objęto stado krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej. Ustalenie genotypów prowadzono z wykorzystaniem metody PCR i jej modyfikacji ACRS. Określono frekwencję częściej występujących alleli dla analizowanych mutacji punktowych: C ‒ 0,830 (257C>T), A ‒ 0,765 (335A>G) i C ‒ 0,635 (422C>T). Analiza statystyczna pokazała, że wszystkie trzy analizowane mutacje punktowe w regonie promotorowym genu TG istotnie (P≤0,05; P≤0,01) wpływają na analizowane cechy użytkowości mlecznej, tj. na dobową wydajność mleka, za- wartość tłuszczu i białka w mleku oraz liczbę komórek somatycznych.
Źródło:
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego; 2020, 16, 1; 9-16
1733-7305
Pojawia się w:
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Polimorfizm genu białka prionowego PrP u polskich owiec nizinnych utrzymywanych na Podlasiu
Polymorphism of the prion protein gene PrP in Polish Lowland Sheep raised in the Podlasie region
Autorzy:
Niznikowski, R.
Czub, G.
Kaminski, J.
Nieradko, M.
Swiatek, M.
Glowacz, K.
Slezak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/843583.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Zootechniczne
Tematy:
genetyka zwierzat
owce
owca corriedale
owca polska nizinna
owca zelaznienska
gen bialka prionowego
gen PrP
polimorfizm genow
allele
genotyp
Opis:
Badaniami objęto stada maciorek i tryków polskich owiec nizinnych (7 stad) z terenu woj. podlaskiego. Ocenie poddano 349 owiec (326 ♀ i 23 ♂) w wieku od 2 do 11 lat, należących do trzech odmian polskich owiec nizinnych: corriedale (2 stada), polskiej owcy nizinnej z regionu podlaskiego (3 stada) i żelaźnieńskiej (2 stada). Wszystkie zwierzęta były poddane identyfikacji genu białka prionowego PrP. Na podstawie przeprowadzonych prac badawczych stwierdzono wysoko istotny wpływ odmiany owiec nizinnych oraz nieistotny płci na frekwencje alleli i genotypów. Wykazano występowanie pięciu alleli (ALRR, ALRQ, ALHQ, AFRQ i VLRQ) u odmiany corriedale, natomiast u polskich owiec nizinnych z regionu podlaskiego nie znaleziono allelu VLRQ, a u żelaźnieńskich alleli VLRQ i AFRQ. Zidentyfikowano 11 genotypów trzęsawki, w tym najwięcej u owcy corriedale – 11 genotypów (11 u maciorek i 3 u tryków), 5 genotypów u polskiej owcy nizinnej z regionu podlaskiego (5 u maciorek i 2 u tryków) oraz 3 genotypy u owcy żelaźnieńskiej (3 u maciorek i 2 u tryków). Stwierdzono bardzo wysoką frekwencję genotypu ALRR/ALRR i ALRR/ALRQ u owcy żelaźnieńskiej i polskiej owcy nizinnej z regionu podlaskiego w porównaniu do owiec corriedale. Genotypy zawierające allel AFRQ (ALHQ/AFRQ, AFRQ/AFRQ, VLRQ/AFRQ) i VLRQ (VLRQ/ALRR, VLRQ/ALRQ, VLRQ/ALHQ, VLRQ/AFRQ) znaleziono u owiec corriedale, natomiast u owiec nizinnych z regionu podlaskiego genotyp ALRR/AFRQ znaleziono tylko u jednej maciorki, wykazując równocześnie bardzo niski poziom ich frekwencji. Stwierdzenie bardzo wysokiej frekwencji alleli i genotypów zawierających allel ALRR u odmiany żelaźnieńskiej i polskiej owcy nizinnej z regionu podlaskiego uznać należy za niezwykle cenne. Ze względu na występowanie u owiec corriedale alleli i genotypów zawierających VLRQ i AFRQ, przy niższej frekwencji ALRR, wskazane jest opracowanie dla tej odmiany programu hodowlanego zmieniającego istniejący rozkład alleli i genotypów trzęsawki.
The study was conducted on ewes and rams of the breed Polish Lowland Sheep from 7 flocks in the Podlasie Voivodeship. The analysis included 349 sheep (326 ♀ and 23 ♂) aged 2 to 11 years, belonging to three varieties of Polish Lowland Sheep: Corriedale (2 herds), Polish Lowland Sheep of Podlasie (3 herds) and Żelaźnieńska Sheep (2 herds). Identification of the PrP prion protein gene was performed in all the animals. The variety of Polish Lowland Sheep was found to have a highly significant effect, and sex an insignificant effect, on the frequency of scrapie alleles and genotypes. Five scrapie alleles (ALRR, ALRQ, ALHQ, AFRQ and VLRQ) were found in the Corriedale Sheep. Of these alleles, VLRQ was not found in the Polish Lowland Sheep of Podlasie and VLRQ and AFRQ were not found in the Żelaźnieńska Sheep. Eleven genotypes of scrapie were identified, with the greatest number in the Corriedale Sheep – 11 genotypes (11 in ewes, 3 in rams), 5 genotypes in the Polish Lowland Sheep of Podlasie (5 in ewes, 2 in rams) and 3 genotypes in the Żelaźnieńska Sheep (3 in ewes, 2 in rams). The frequency of ALRR/ALRR and ALRR/ALRQ genotypes in the Polish Lowland Sheep of Podlasie and Żelaźnieńska Sheep was very high compared to the Corriedale Sheep. Genotypes containing the AFRQ allele (ALHQ/AFRQ, AFRQ/AFRQ, VLRQ/AFRQ) and the VLRQ allele (VLRQ/ALRR, VLRQ/ALRQ, VLRQ/ALHQ, VLRQ/AFRQ) were found in the Corriedale Sheep. In the Polish Lowland Sheep of Podlasie the ALRR/AFRQ genotype was found only in one ewe. The very high frequency of alleles and genotypes containing the ALRR allele in the Żelaźnieńska Sheep and Polish Lowland Sheep of Podlasie must be regarded as a very valuable result. Due to the presence in Corriedale Sheep of alleles and genotypes containing VLRQ and AFRQ, with a lower frequency of ALRR, a breeding programme for this breed should be developed to modify the current frequency of scrapie alleles and genotypes.
Źródło:
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego; 2014, 10, 4
1733-7305
Pojawia się w:
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Use of molecular and conventional techniques to identify and analyze genetic variability of Rhizoctonia spp. isolates
Zastosowanie metod molekularnych i konwencjonalnych do identyfikacji i analizy zroznicowania genetycznego izolatow Rhizoctonia
Autorzy:
Irzykowska, L
Zoltanska, E
Bocianowski, J
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/28502.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
pathogenicity
internal transcribed spacer region
rRNA gene
random amplified polymorphic DNA
genetic variability
Rhizoctonia
isolate
Rhizoctonia cerealis
Rhizoctonia solani
molecular technique
conventional technique
stem infection
leaf infection
plant disease
Opis:
In this study the pathogenicity of Rhizoctonia spp. isolates towards wheat seedlings in laboratory and greenhouse conditions was evaluated. In both experiments seven features were examined: plant height, roots weight, the percentage of infected stems and leaf sheaths and also the degree of stem and leaf sheaths infection. Isolates R1, R29, R39 and R59 were the most pathogenic. Percentage of infected stems ranged from 25.3 to 82.5 and roots from 35 to 82.3. The amplification of internal transcribed spacer regions (ITS1 and ITS2) between 18S, 5.8S and 28S rRNA genes and sequence analysis of these regions have been shown to be sufficiently variable to resolve two Rhizoctonia species. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to assess genetic variability among isolates. The suitability of RAPD method for isolates differentiation at intraspecific level was shown. Using seven arbitrary primers in polymerase chain reaction (PCR) thirty-three RAPD markers were generated. Clustering analysis from RAPD data resolved two groups of R. cerealis isolates at the 36% similarity level. Moreover, significant associations between molecular markers and pathogenicity of R. cerealis isolates were found.
W prezentowanych badaniach oceniano patogeniczność izolatów Rhizoctonia spp. w stosunku do siewek pszenicy w warunkach laboratoryjnych i szklarniowych. W obu doświadczeniach badano 7 cech: wysokość roślin, masę korzeni, procent porażonych łodyg i pochew liściowych oraz stopień porażenia łodygi i pochwy liściowej. Najbardziej patogeniczne okazały się izolaty R1, R29, R39 i R59. Procent porażonych łodyg mieścił się w zakresie od 25.3 do 82.5, a procent porażonych korzeni od 35 do 82.3. Wykazano, że amplifikacja wewnętrznych transkrybowanych sekwencji rozdzielających (ITS1 i ITS2) geny kodujące 18S, 5.8S i 28S rRNAoraz analiza sekwencyjna tych regionów wystarczyły do rozróżnienia dwóch gatunków rodzaju Rhizoctonia. Losowo amplifikowany polimorficzny DNA (RAPD) wykorzystano do oceny zróżnicowania genetycznego między izolatami. Potwierdzono użyteczność metody RAPD w różnicowaniu izolatów na poziomie wewnątrzgatunkowym. Po zastosowaniu siedmiu losowych starterów w łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) uzyskano 33 markery RAPD. W wyniku analizy klasterów danych uzyskanych w reakcjach RAPD wyodrębniono dwie grupy izolatów R. cerealis na poziomie podobieństwa równym 36%. Ponadto, znaleziono istotne związki pomiędzy markerami molekularnymi a patogenicznością izolatów R. cerealis.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2005, 58, 2; 19-32
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Indukowana fenobarbitalem hipermetylacja rejonu promotorowego genu p53 w watrobie szczurow szczepu Wistar
Phenobarbital-induced hypermethylation of the p53 promoter region in the liver of Wistar rats
Autorzy:
Kostka, G
Urbanek-Olejnik, K.
Wiadrowska, B.
Bankowski, R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/876498.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego. Państwowy Zakład Higieny
Tematy:
zwierzeta doswiadczalne
szczury
watroba
gen p53
hipermetylacja
fenobarbital
synteza DNA
metylotransferaza DNA
metylacja DNA
experimental animal
rat
liver
p53 gene
hypermethylation
phenobarbital
DNA synthesis
DNA methyltransferase
DNA methylation
Opis:
Indukowane niegenotoksycznymi kancerogenami (NGCs) zmiany metylacji DNA rozpatrywane są jako mechanizm ich toksycznego, w tym rakotwórczego działania. Zbadano wpływ fenobarbitalu (PB), na poziom metylacji regionu promotorowego genu p53 w wątrobie szczurów szczepu Wis tar. Zmiany metylacji genu p53 korelowano z syntezą DNA, aktywnością metylotransferaz DNA (DNMTs) oraz z masą wątroby. Samce szczurów szczepu Wistar otrzymywały PB w dawce wynoszącej 98,2 mg/ kg m.c. x dzień-1 jednorazowo, 3-krotnie i 14-krotnie. Wykazano, że PB wywoływał hipermetylację w badanych sekwencjach rejonu promotorowego genu p53. Indukowana PB hipermetylacja genu występowała w przebiegu całego okresu doświadczalnego. Stymulację syntezy DNA, która poprzedzała wzrost masy wątroby oraz indukcję DNMTs, wykazano tylko po 1 i 3 dawkach związku. Kontynuowanie narażenia zwierząt na PB (14 dawek) nie wywoływało zmian w syntezie DNA i aktywności DNMTs w porównaniu do kontroli. Przypuszcza się, że indukowana PB de novo metylacja rejonu promotorowego genu p53, nie była związana z aktywnością DNMTs.
Non-genotoxic carcinogens (NGCs)-induced changes of DNA methylation has been proposed as a mechanism of their toxicity, including carcinogenic action. The effect of phénobarbital (PB), a rodent liver carcinogen on the methylation level of the p53 promoter region in rat liver was studied. Changes in the methylation status of the p53 gene were correlated with changes in DNA synthesis, DNA methyltransferase (DNMTs) activity and liver weight. Male Wistar rats received PB in one, three or fourteen daily oral doses of 92.8 mg/kg b.w. x day-1. We have demonstrated that PB increased the methylation of the p53 gene. Cytosine hypermethylation in the analyzed CpG sites of the p53 gene promoter occurred during the whole period of study. However, an increase in DNA synthesis was only observed after 1 and 3 days of treatment with PB and it preceded liver growth. Treatment of rats with PB for 1 and 3 days also produced an increase in nuclear DNMTs activity. After prolonged administration (14 days), no changes in DNMTs activity nor DNA synthesis were observed. It is proposed that PB- induced de novo methylation of the p53 gene was not associated with DNMTs activity.
Źródło:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny; 2008, 59, 4; 455-465
0035-7715
Pojawia się w:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analiza kodujacej sekwencji nukleotydowej genu alfaA-globiny golebia domowego [Columba livia var. domestica] oraz sierpowki [Streptopelia decaocto]
Analysis of coding region sequences of alphaA-globin gene of domestic pigeon [Columbia livia var. domestica] and Eurasian Collared-Dove [Streptopelia decaocto]
Autorzy:
Dolecki, H
Dybus, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45294.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Tematy:
genetyka zwierzat
ptaki
golab domowy
Columba livia domestica
sierpowka
Streptopelia decaocto
gen alfa A globiny
sekwencja nukleotydow
sekwencjonowania DNA
metoda RT-PCR
animal genetics
bird
domestic pigeon
nucleotide sequence
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2009, 08, 4; 13-32
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Polimorfizm genu syntetazy acylo-CoA typu 5 (ACSL5) a występowanie nieprawidłowej masy ciała w korelacji do obwodupasa wraz ze wskaźnikiem insulinooporności wśród populacji zamieszkującej region Polski Południowej
Acyl-CoA type 5 gene polymorphism and inappropriate body mass occurrence related to waist circumference and insulin resistance index among the population living in southern Poland
Autorzy:
Zdebska, Magdalena
Szywacz, Wioletta
Matuszny, Grzegorz
Abouda, Alicja
Szweda, Nikola
Gola, Mateusz
Śnit, Mirosław
Grzeszczak, Władysław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1035763.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
acsl5
bmi
kwasy tłuszczowe
insulinooporność
fatty acids
insulin resistance
Opis:
INTRODUCTION: Lipid metabolism disorders and the obesity connected with them are problems which occur increasingly more frequently in highly-developed countries. Acyl-CoA synthetase (ACSL) is an important enzyme in lipid metabolism taking part in the activation of fatty acids (FA). This makes determining the correlation between the gene polymorphism for ACSL and the development of obesity a relevant research issue. AIMS: The aim of this study was to examine the dependence of the Acyl-CoA synthetase gene polymorphism on the occurrence of inappropriate body weight and HOMA-IR indicator values. MATERIAL AND METHODS: A total of 506 patients were examined, whose ACSL5 rs2419621 polymorphism was determined using probes binding with a specific DNA matrix. RESULTS: The results of the Hardy-Weinberg equilibrium test showed that the genotype proportions within the population are maintained. Among the patients from the research sample, 177 patients with a proper body weight were identified along with 330 patients with inappropriate Body Mass Index (BMI) values. CONCLUSIONS: It was determined that there are no differences between the statistical variables in the distribution of acyl-CoA of isoform 5 synthetase gene polymorphism genotypes. Based on the results of the study, a correlation between the gene polymorphism for ACSL5 and the development of obesity cannot be determined.
WSTĘP: Zaburzenia przemian lipidów i związana z nimi otyłość to problem coraz częściej dotykający ludzi w krajach wysoko rozwiniętych. Syntetaza acylo-CoA typu 5 (ACSL5) jest ważnym enzymem metabolizmu lipidów, biorącym udział w aktywacji kwasów tłuszczowych. Prawidłowe funkcjonowanie tego enzymu zapewnia substraty zarówno dla lipogenezy, jak i oksydacji kwasów tłuszczowych, stąd określenie związku między polimorfizmem genu dla ACSL a kształtowaniem otyłości stanowi istotny problem badawczy. CEL PRACY: Celem pracy było wykazanie zależności między nieprawidłową masą ciała oraz wartością wskaźnika HOMA-IR (homeostasis model assessment) a występowaniem polimorfizmu genu syntetazy acylo-CoA izoformy 5. MATERIAŁ I METODY: Przebadano łącznie 506 pacjentów, u których za pomocą sond specyficznie wiążących się z DNA matrycy oznaczono polimorfizm ACSL5 rs2419621. WYNIKI: Za pomocą testu statystycznego Hardy’ego-Weinberga wykazano, że proporcje genotypów w populacji są zachowane. Wśród pacjentów stanowiących próbę badawczą wyróżniono 177 osób o prawidłowej masie ciała oraz 330 osób z nieprawidłową wartością indeksu BMI. WNIOSKI: Wykazano brak zmiennych różnic statystycznych w rozkładzie genotypów polimorfizmu genu syntetazy acylo-CoA izoformy 5. Wyniki przeprowadzonego badania nie pozwalają wykazać zależności między polimorfizmem genu dla ACSL5 a kształtowaniem otyłości.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2018, 72; 121-127
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-32 z 32

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies