Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "reakcja łańcuchowa" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 54
Tytuł:
Zastosowanie techniki PCR w badaniach bakteriologicznych
Applications of PCR in microbiology
Autorzy:
Adaszek, L.
Dziegiel, B.
Mazurek, L.
Winiarczyk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/859637.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Krajowa Izba Lekarsko-Weterynaryjna
Tematy:
bakteriologia
diagnostyka bakteriologiczna
metody badan
lancuchowa reakcja polimerazy
16S rRNA
diagnostyka molekularna
Źródło:
Życie Weterynaryjne; 2018, 93, 04
0137-6810
Pojawia się w:
Życie Weterynaryjne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie obecnosci Acanthamoeba sp.w probach srodowiskowych i materiale pochodzacym od pacjentow przy pomocy techniki PCR
Autorzy:
Derda, M
Hadas, E.
Sulek, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/839696.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
proby srodowiskowe
material kliniczny
parazytologia lekarska
Acanthamoeba
lancuchowa reakcja polimerazy
metody wykrywania
ameby
pasozyty czlowieka
Źródło:
Annals of Parasitology; 2004, 50, 4; 747
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie obecności Acanthamoeba sp. w próbach środowiskowych i materiale pochodzącym od pacjentów przy pomocy techniki PCR
Autorzy:
Derda, M.
Hadaś, E.
Sułek, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2147593.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
proby srodowiskowe
material kliniczny
parazytologia lekarska
Acanthamoeba
lancuchowa reakcja polimerazy
metody wykrywania
ameby
pasozyty czlowieka
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2004, 50, 4; 747
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie DNA Toxoplasma gondii w plynach ustrojowych metoda PCR
Autorzy:
Golab, E
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/837546.pdf
Data publikacji:
1995
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
metody badan
plyny ustrojowe
parazytologia
lancuchowa reakcja polimerazy
pasozyty
wykrywanie
DNA
Toxoplasma gondii
Opis:
The polymerase chain reaction (PCR) is used for in vitro amplification of specific DNA fragments. The PCR technique is based on the reiteration of a three-step process: denaturation DNA into single strands, annealing primers (specific synthetic oligonucleotides) to the DNA template and enzymatic extension from the primers along the templates. The usefulness of this new technique to the detection of Toxoplasma gondii DNA has been described.
Źródło:
Annals of Parasitology; 1995, 41, 1; 13-18
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie DNA Toxoplasma gondii w płynach ustrojowych metodą PCR
DETECTION OF TOXOPLASMA GONDII DNA IN BODY FLUIDS BY POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
Autorzy:
Gołąb, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2151376.pdf
Data publikacji:
1995
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
metody badan
plyny ustrojowe
parazytologia
lancuchowa reakcja polimerazy
pasozyty
wykrywanie
DNA
Toxoplasma gondii
Opis:
The polymerase chain reaction (PCR) is used for in vitro amplification of specific DNA fragments. The PCR technique is based on the reiteration of a three-step process: denaturation DNA into single strands, annealing primers (specific synthetic oligonucleotides) to the DNA template and enzymatic extension from the primers along the templates. The usefulness of this new technique to the detection of Toxoplasma gondii DNA has been described.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 1995, 41, 1; 13-18
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie DNA Toxoplasma gondii w łożysku ludzkim metodą polimerazowej reakcji łańcuchowej a ocena histopatologiczna łożyska w procesie rozpoznawania toksoplazmozy wrodzonej
Autorzy:
Nowakowska, D.
Gołąb, E.
Czichos, E.
Krekora, M.
Wilczyński, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2147741.pdf
Data publikacji:
2002
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
rozpoznawanie
badania histopatologiczne
choroby pasozytnicze
toksoplazmoza wrodzona
parazytologia
lancuchowa reakcja polimerazy
lozysko [anat.]
wykrywanie
DNA
Toxoplasma gondii
pasozyty czlowieka
Opis:
Detection of Toxoplasma gondii in human placenta by PCR and placental histologic findings. Since isolation of Toxoplasma gondii from human placenta strongly correlates with fetal infection, the aims of the study were: to detect fragments of T. gondii B1 gene in human placentae by PCR and to evaluate their pathology. 36 placentae included in three groups were obtained: group I (n = 7) from pregnancies with prenatal diagnosis of fetal toxoplasmosis; II (n = 17) from women with serologic features of primary infection during pregnancy; III (n&13) from pregnancies with fetal T. gondii infection based on clinical signs. T. gondii DNA was found in 2/4 samples from the I group and in 1/14 from the II group. Villitis was identified in 3/15 other placentae from the II group. In the III group we did not recognize neither T. gondii DNA nor villitis. We consider PCR and pathologic evaluations of placentae as the two complementary methods. PCR can be especially helpful in pregnancies not screened against T. gondii as positive result in placenta can confirm mother's primary infection.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2002, 48, 3; 301-309
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie DNA Toxoplasma gondii w lozysku ludzkim metoda polimerazowej reakcji lancuchowej a ocena histopatologiczna lozyska w procesie rozpoznawania toksoplazmozy wrodzonej
Autorzy:
Nowakowska, D
Golab, E.
Czichos, E.
Krekora, M.
Wilczynski, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/836662.pdf
Data publikacji:
2002
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
rozpoznawanie
badania histopatologiczne
choroby pasozytnicze
toksoplazmoza wrodzona
parazytologia
lancuchowa reakcja polimerazy
lozysko [anat.]
wykrywanie
DNA
Toxoplasma gondii
pasozyty czlowieka
Opis:
Detection of Toxoplasma gondii in human placenta by PCR and placental histologic findings. Since isolation of Toxoplasma gondii from human placenta strongly correlates with fetal infection, the aims of the study were: to detect fragments of T. gondii B1 gene in human placentae by PCR and to evaluate their pathology. 36 placentae included in three groups were obtained: group I (n = 7) from pregnancies with prenatal diagnosis of fetal toxoplasmosis; II (n = 17) from women with serologic features of primary infection during pregnancy; III (n&13) from pregnancies with fetal T. gondii infection based on clinical signs. T. gondii DNA was found in 2/4 samples from the I group and in 1/14 from the II group. Villitis was identified in 3/15 other placentae from the II group. In the III group we did not recognize neither T. gondii DNA nor villitis. We consider PCR and pathologic evaluations of placentae as the two complementary methods. PCR can be especially helpful in pregnancies not screened against T. gondii as positive result in placenta can confirm mother's primary infection.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2002, 48, 3; 301-309
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie Borrelia burgdorferi sensu lato w kleszczach Ixodes ricinus metoda lancuchowej reakcji polimerazy [PCR]
Autorzy:
Skotarczak, B
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/838375.pdf
Data publikacji:
2000
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
czynniki chorobotworcze
kleszcze
wykrywanie drobnoustrojow
przenoszenie chorob
parazytologia
Ixodes ricinus
lancuchowa reakcja polimerazy
Borrelia burgdorferi
Opis:
Attempts were made to identify the causative orgamsm of Lyme disease in Szczecin from tick Ixodes ricinus as a vector. Ticks were collected in 1997 year in forest areas of Szczecin, from localites associated with numerous attendance of people. The method used in this study was the polymerase chain reaction (PCR) on the flagellin structural gene fla of Borrelia burgdorferi sensu stricto. The flagellin PCR primer set reaction was conservative for B. burgdorferi sensu stricto, B. afzelii and B. garinii. The overall prevalence of B. burgdorferi sensu lato, in tick population studied was 8.8%. The female, nymphs and larves of Ixodes ricinus were infected almost just the some - about 10%, when the male 2.5% only.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2000, 46, 1; 93-99
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie Borrelia burgdorferi sensu lato w kleszczach Ixodes ricinus metoda łańcuchowej reakcji polimerazy [PCR]
Autorzy:
Skotarczak, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2148520.pdf
Data publikacji:
2000
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
czynniki chorobotworcze
kleszcze
wykrywanie drobnoustrojow
przenoszenie chorob
parazytologia
Ixodes ricinus
lancuchowa reakcja polimerazy
Borrelia burgdorferi
Opis:
Attempts were made to identify the causative orgamsm of Lyme disease in Szczecin from tick Ixodes ricinus as a vector. Ticks were collected in 1997 year in forest areas of Szczecin, from localites associated with numerous attendance of people. The method used in this study was the polymerase chain reaction (PCR) on the flagellin structural gene fla of Borrelia burgdorferi sensu stricto. The flagellin PCR primer set reaction was conservative for B. burgdorferi sensu stricto, B. afzelii and B. garinii. The overall prevalence of B. burgdorferi sensu lato, in tick population studied was 8.8%. The female, nymphs and larves of Ixodes ricinus were infected almost just the some - about 10%, when the male 2.5% only.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2000, 46, 1; 93-99
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie bakterii Salmonella metodami molekularnymi w produktach żywnościowych
Detection of Salmonella sp. in food using molecular methods
Autorzy:
Misiewicz, A.
Goncerzewicz, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/796639.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
produkty spozywcze
bakterie
Salmonella
wykrywanie drobnoustrojow
metody molekularne
lancuchowa reakcja polimerazy
food product
bacteria
microorganism detection
molecular method
polymerase chain reaction
Opis:
Bakterie z rodzaju Salmonella są najbardziej znanymi bakteriami patogennymi występującymi w przemyśle spożywczym. Powodują zakażenia prawie wszystkich produktów żywnościowych – od mięsnych, mlecznych, jajecznych po rośliny oleiste i pasze. Wykrycie i identyfi kacja bakterii Salmonella na podstawie tradycyjnej metody mikrobiologicznej, zgodnie z normą PN-EN 6579:2003, jest ciągle powszechnie stosowane w laboratoriach. Analiza ta jest czaso- i pracochłonna, jej wykonanie trwa około 5–7 dni. Wykorzystanie nowoczesnych technik biologii molekularnej, z etapem namnożenia i izolacji DNA, do uzyskania końcowego wyniku trwa znacznie krócej. W niniejszej pracy zastosowano metodę Real-Time PCR i klasyczny PCR do identyfi kacji bakterii Salmonella w różnych produktach żywnościowych. Określono czas potrzebny do wykonania tej analizy molekularnej. Do reakcji Real-Time PCR wykorzystano komercyjny kit. Klasyczną reakcję PCR prowadzono z użyciem starterów Sal465Li Sal142F, uzyskując właściwy produkt o wielkości 343 pz. We wszystkich badanych próbkach wykryto bakterie Salmonella. Wynik analiz molekularnych uzyskano w ciągu 21–25 godzin.
Pathogenic bacteria of Salmonella genus are the most common infections in food industry. They might to contaminate wide range of products, protein food e.g. meat, milk food, eggs and egg foods, plants and its preserves, fodder and feeds. Detection and identifi cation of Salmonella sp. are made using traditional methods corresponding with standard PN-EN 6579:2003. That method is commonly used in the microbiological laboratories its time consuming and laborious analysis. Using a modern molecular biology techniques allow to confi rm the Salmonella infections in 24-hours with enrichment and isolation steps. In our study were used Real-Time PCR and traditional PCR techniques to detect Salmonella pathogens from various foods. In addition we checked time of molecular analysis. In the study was used commercial kit to Real-Time PCR analysis and primer set Sal465L, Sal142F with are based on characteristic and solid genomic fragments of Salmonella genus. In every experiment we got positive results for food contaminated by Salmonella. The results were obtained in 21–25 hours.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2013, 573
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie testu PCR w monitorowaniu populacji Alternaria w uprawie ziemniaka
The use of the PCR test in monitoring the Alternaria population in potato crops
Autorzy:
Gawinska-Urbanowicz, H.
Pawlowska, A.
Osowski, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2135574.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
Alternaria alternata
Alternaria solani
alternarioza
metoda mikroskopowa
odmia-
ny
reakcja łańcuchowa polimerazy
PCR
ziemniak
Opis:
Sprawcy alternariozy ziemniaka, Alternaria solani i A. alternata, od kilkunastu lat mają wpływ na zdro- wotność upraw zarówno towarowych, jak i nasiennych. W miarę rozwoju choroby stosunek ilościowy, w jakim występują oba gatunki, zmienia się i zależy m.in. od terminu i regionu występowania. Ocenę zmian sezonowych w składzie populacji grzybów w latach 2016-2018 przeprowadzono w Boninie na materiale pozyskanym z cotygodniowych ekspertyz chorych liści naturalnie zainfekowanych patoge- nami z rodzaju Alternaria. Największy wysyp zarodników konidialnych zarejestrowano w lipcu i sierp- niu. W zebranej populacji dominowały zarodniki A. alternata. Monitorowanie stanu zagrożenia alterna- riozą na plantacji ziemniaka w doświadczeniach laboratoryjnych prowadzono metodą molekularną (test PCR) oraz mikroskopową, analizując wyrosłe kultury patogenów.
Źródło:
Ziemniak Polski; 2019, 29, 4; 36-42
1425-4263
Pojawia się w:
Ziemniak Polski
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie metody PCR do badania jakosci ziarna pszenicy ozimej uprawianej w systemach ekologicznym, integrowanym, konwencjonalnym oraz monokulturze w aspekcie fitopatologicznym
The use of PCR assay for quality testing of grain of winter wheat cultivated in organic, integrated, conventional system and monoculture in phytopathological aspect
Autorzy:
Lukanowski, A
Sadowski, C
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27419.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
uprawa ekologiczna
uprawa konwencjonalna
monokultury
ziarno
izolacja
jakosc
uprawa integrowana
analiza mikologiczna
gatunki grzybow
metody uprawy
uprawa roslin
pszenica ozima
lancuchowa reakcja polimerazy
Fusarium
grzyby chorobotworcze
ecological cultivation
conventional cultivation
monoculture
grain
isolation
quality
integrated cultivation
mycological analysis
fungi species
cultivation method
plant cultivation
winter wheat
polymerase chain reaction
pathogenic fungi
Opis:
The aim of experiments was to evaluate the occurrence of fungi on grain of winter wheat cv. Roma cultivated in four systems on the experimental fields owned by the Institute of Soil Science and Plant Cultivation. Among pathogenic species, fungi from genus Fusarium dominated. Their number was the lowest on grain harvested in organic system and the highest in integrated one. Saprotrophic species were represented mainly by Alternaria alternata, which occurred the most often in organic system. Determination of F. avenaceum, F. culmorum and F. poae with microscope was confirmed with a PCR assay. All isolates of F. culmorum and F. poae gave an amplification product of Tri 5 gene coding the possibility of trichocene production, while none of isolates of F. avenaceum
Badano zasiedlenie przez grzyby ziarn apszenicy ozimej odmiany Roma uprawianej w czterech systemach w latach 1999-2002 na polach doświadczalnych IL1NG. Wśród gatunków patogenicznych dominowały grzyby rodzaju Fusarium. Ich liczebność była najmniejsza na ziarniakach pochodzących z systemu ekologicznego. Najliczniej grzyby rodzaju Fusarium reprezentowane były na ziarnie zebranym w systemie integrowanym. Spośród gatunków saprotroficznych w każdym systemie zdecydowanie dominował Alternaria alternata. Najliczniej zasiedlał on ziarno w systemie ekologicznym. Potwierdzono poprawność oznaczenia F. avenaceum, F. culmorum oraz F. poae przy użyciu metody PCR. Wszystkie uzyskane izolaty F culmorum i F poae posiadały w swym genomie gen Tri 5, warunkujący ich potencjalną zdolność do produkcji mi- kotoksyn z grupy trichotecenów. Tego genu nie posiadał żaden z badanych izolatów F. avenaceum.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2005, 58, 2; 55-69
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Usefulness of new DNA extraction procedure for PCR technique in species identification of Entamoeba isolates
Przydatnosc nowej metody izolacji DNA do identyfikacji izolatow Entamoeba technika PCR
Autorzy:
Myjak, P
Kur, J.
Pietkiewicz, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/836380.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
metody badan
parazytologia
lancuchowa reakcja polimerazy
izolaty
ameby
pasozyty
izolacja
Entamaeba
identyfikacja
DNA
Opis:
In this study we have developed a modified CLARK and DIAMOND (1992, 1993) method using the polymerase chain reaction to amplify amoebic ribosomal RNA genes that allow either specific detection of Entamoeba histolytica s. str. or amoeba species identification. DNA was isolated from cultured protozoa or from stool samples (cysts andlor trophozoites). Cultures of xenie or axenic material (also stool samples) were treated with Easy Genomic DNA Prep or Genomic DNA Prep Plus (A&A Biotechnology, Poland) for DNA isolation. With these new procedures, DNA can be obtained effectively and with high degree of purity. 13 amoeba strains were investigated. Three strains produced an 876 bp fragment with Psp5 and Psp3 primers (specific product for E. histolytica s. str). Three strains gave a specific 876 bp product for E. dispar with NPsp5 and NPsp3 primers. Two strains were E. moshkovskii as identified by KpnI digestion of PCR products obtained with RD5 and RD3 primers. Four strains (one of them was cultured in two laboratories) were E. invadens as identified by HinfI or HhaI digestion of PCR products obtained with RD5 and RD3 primers. Characteristic RFLP patterns with these enzymes was also obtained for E. terrapinae and Blastocystis hominis. This RFLP analysis show significant promise as a medical diagnostic tool particularly useful for species identification.
W przedstawionej pracy rozwinięto i zmodyfikowano metodę CLARKA i DIAMONDA (1992, 1993) amplifikacji techniką PCR pełzakowych genów kodujących rybosomalne RNA, pozwalających na swoiste wykrywanie Entamoeba histolytica sensu stricto lub identyfikację gatunkową pełzaków. DNA izolowano z pierwotniaków hodowanych in vitro lub z prób kału (cysty i/lub trofozoity). Izolację DNA z aksenicznych lub poliksenicznych kultur (także próbek kału) przeprowadzano przy użyciu Easy Genohistolytica DNA Prep lub Genomic DNA Prep Plus (A&A Biotechnology, Polska). Stosując te nowe procedury uzyskiwano DNA wydajnie i o dużym stopniu czystości. Przebadano 13 szczepów pełzaków. Trzy szczepy dawały produkty PCR o wielkości 876 pz ze starterami Psp5 i Psp3 (swoisty produkt dla E. histolytica s. str). Trzy szczepy dawały swoisty dla E. dispar produkt o wielkości 876 pz ze starterami NPsp5 i NPsp3. Dwa szczepy należały do E. moshkovskii, co wykazała indentyfikacja przez trawienie KpnI produktów PCR otrzymanych ze starterami RD5 i RD3. Cztery szczepy Geden z nich hodowany w dwóch laboratoriach) zidentyfikowano jako E. invadens przez trawienie HinfI i HhaI produktów PCR otrzymanych ze starterami RD5 i RD3. Charakterystyczny wzór RFLP z tymi enzymami otrzymano także z E. terrapinae i Blastocystis hominis. Ta analiza RFLP wskazuje na jej przydatność w diagnostyce medycznej, a szczególnie w identyfikacji gatunków.
Źródło:
Annals of Parasitology; 1997, 43, 2; 163-170
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Usefulness of new DNA extraction procedure for PCR technique in species identification of Entamoeba isolates
Przydatność nowej metody izolacji DNA do identyfikacji izolatów Entamoeba technika PCR
Autorzy:
Myjak, P.
Kur, J.
Pietkiewicz, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2148930.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
metody badan
parazytologia
lancuchowa reakcja polimerazy
izolaty
ameby
pasozyty
izolacja
Entamaeba
identyfikacja
DNA
Opis:
In this study we have developed a modified CLARK and DIAMOND (1992, 1993) method using the polymerase chain reaction to amplify amoebic ribosomal RNA genes that allow either specific detection of Entamoeba histolytica s. str. or amoeba species identification. DNA was isolated from cultured protozoa or from stool samples (cysts andlor trophozoites). Cultures of xenie or axenic material (also stool samples) were treated with Easy Genomic DNA Prep or Genomic DNA Prep Plus (A&A Biotechnology, Poland) for DNA isolation. With these new procedures, DNA can be obtained effectively and with high degree of purity. 13 amoeba strains were investigated. Three strains produced an 876 bp fragment with Psp5 and Psp3 primers (specific product for E. histolytica s. str). Three strains gave a specific 876 bp product for E. dispar with NPsp5 and NPsp3 primers. Two strains were E. moshkovskii as identified by KpnI digestion of PCR products obtained with RD5 and RD3 primers. Four strains (one of them was cultured in two laboratories) were E. invadens as identified by HinfI or HhaI digestion of PCR products obtained with RD5 and RD3 primers. Characteristic RFLP patterns with these enzymes was also obtained for E. terrapinae and Blastocystis hominis. This RFLP analysis show significant promise as a medical diagnostic tool particularly useful for species identification.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 1997, 43, 2; 163-170
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The use of reverse transcription and polymerase chain reaction [RT-PCR] for the detection of hop latent viroid [HLVd]
Wykrywanie wiroida latentnego chmielu [HLVd] przy pomocy odwrotnej transkrypcji reakcji lancuchowej polimerazy [RT-PCR]
Autorzy:
Cajza, M
Wypijewski, K.
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65322.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
patogeny roslin
lancuchowa reakcja polimerazy
wiroid latentny chmielu
wiroidy
odwrotna transkrypcja
wykrywanie
Opis:
The simple method of nucleic acids extraction, based on guanidine thiocyanate extraction buffer, was sufficient for obtaining a good templates for RT-PCR. The RT-PCR reactions were performer from the start to the end (both the reverse transcription and the HLVd-cDNA amplification) in the same reaction mixture and in the very small volume of reaction (10 μI). Both pairs of primers designed by authors were good for reverse transcription and later for amplification of the HLVd-cDNA. The presence of gelatin as a stabilizer of DNA polymerase was indispensable for successful performance of RT-PCR.
Wiroidy, najmniejsze obecnie znane patogeny roślin, zbudowane z pojedynczej nici kolistego RNA, nie zawierające w swej budowie i nie kodujące żadnych białek, są groźnymi patogenami roślin wyższych, rozpowszechnionymi we wszystkich rejonach świata, szczególnie w uprawach roślin rozmnażanych wegetatywnie. Wiroid latentny chmielu (ang. hop latent viroid - HLVd) został wykryty dopiero w 1988 roku w chmielu. Do tej pory odnotowano go w rejonach uprawy chmielu na całym świecie. Chmiel, jedyny znany żywiciel tego patogena, ulega tylko infekcjom utajonym (latentnym). HLVd powoduje zarówno spadek masy plonu szyszek jak i zawartości alfa-kwasów w szyszkach. Bezobjawowe infekcje oraz brak białek strukturalnych i innych produktów translacji powodują, że obecnie patogena tego można wykrywać tylko przy pomocy elektroforezy (metoda bardzo zawodna, wymagająca wysokiego stężenia RNA patogena w tkance), sond hybrydyzacyjnych i rozwijanej w ostatnich latach metody RT-PCR. Podczas opracowywania RT-PCR do wykrywania HLVd w ekstraktach kwasów nukleinowych wykorzystywano dwie pary primerów specyficznych dla sekwencji nukleotydowej HLVd, charakteryzujących się różnymi temperaturami topnienia produktu. Wiroida wykrywano w ekstraktach kwasów nukleinowych z blaszek liściowych i z ogonków liściowych chmielu. Uproszczona metoda guanidynowa do izolacji totalnych kwasów nukleinowych okazała się wystarczająca do przeprowadzenia reakcji RT-PCR. Opracowana metoda charakteryzowała się bardzo dużą czułością, specyficznością (produkty amplifikacji cDNA-HLVd uzyskiwano tylko z próbek materiału roślinnego pochodzącego z roślin zawierających tego wiroida) i szybkością wykonania (dwa dni łącznie z ekstrakcją kwasów nukleinowych). Ponadto w zastosowanej metodzie opracowano warunki do przeprowadzenia zarówno odwrotnej transkrypcji i następnie amplifikacji powstałego cDNA wiroida w jednej probówce, w tej samej mieszaninie reakcyjnej . Oprócz tego wszystkie reakcje RT-PCR prowadzono w bardzo małej objętości równej 10 μl (2 μl zawiesiny kwasów nukleinowych i 8 μl mieszaniny reakcji RT-PCR). Maksymalne uproszczenie metody, wielokrotne obniżenie kosztów reakcji oraz charakterystyczna dla RT-PCR czułość, specyficzność i szybkość przeprowadzenia testu sprawiają, że może być ona wykorzystywana do rutynowego wykrywania nie tylko HLVd ale również innych wiroidów, wirusoidów i wirusów RNA.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2; 52-58
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 54

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies