Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "protease" wg kryterium: Temat


Tytuł:
A novel alkaline protease from wild edible mushroom Termitomyces albuminosus
Autorzy:
Zheng, Suyue
Wang, Hexiang
Zhang, Guoqing
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039935.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
alkaline protease
mushroom
Termitomyces albuminosus
purification
Opis:
A protease with a molecular mass of 30 kDa and the N-terminal sequence of GLQTNAPWGLARSS, was isolated from fresh fruiting bodies of the wild edible mushroom Termitomyces albuminosus. The purification protocol included ion exchange chromatography on DEAE-cellulose, Q-Sepharose, SP-Sepharose and FPLC-gel filtration on Superdex 75. The protein was unadsorbed on DEAE-cellulose and Q-Sepharose, but adsorbed on SP-Sepharose. The optimal pH and temperature of the purified enzyme were 10.6 and 60 °C, respectively. The enzyme was stable in the presence of 2 % (v/v) Tween 80 and 4 M urea. More than 80 % of the enzyme activity was retained in 2 % (v/v) Triton X 100, 54 % in 10 mM EDTA and 31 % in 2 % (w/v) SDS. The enzyme was strongly inhibited by phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), but not inhibited by dithiothreitol (DTT), pepstatin or lima bean trypsin inhibitor suggesting that it was a serine protease but not a trypsin-like one. The protease was inhibited by Hg2+, Cu2+, and Fe3+ ions. The Km and Vmax values of the purified enzyme for casein were 8.26 mg ∙ ml-1 and 0.668 mg ∙ ml-1 ∙ min-1, respectively.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 2; 269-274
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A novel alkaline protease with antiproliferative activity from fresh fruiting bodies of the toxic wild mushroom Amanita farinosa
Autorzy:
Sun, Jian
Zhao, Yongchang
Chai, Hongmei
Wang, Hexiang
Ng, Tzi
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039854.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
alkaline protease
fruiting bodies
purification
mushroom
antiproliferative
Amanita farinosa
Opis:
A novel protease with a molecular mass of 15 kDa was purified from fresh fruiting bodies of the wild mushroom Amanita farinosa. The purification protocol entailed anion exchange chromatography on DEAE-cellulose, affinity chromatography on Affi-gel blue gel, cation exchange chromatography on SP-Sepharose, and gel filtration by fast protein liquid chromatography on Superdex 75. The protease was unadsorbed on DEAE-cellulose but adsorbed on Affi-gel blue gel and SP-Sepharose. It demonstrated a single 15-kDa band in sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS/PAGE) and a 15-kDa peak in gel filtration. The optimal pH and optimal temperature of the protease were pH 8.0 and 65 °C, respectively. Proliferation of human hepatoma HepG2 cells was inhibited by the protease with an IC50 of 25 µM. The protease did not have antifungal or ribonuclease activity.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 4; 567-572
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Aktywność metaboliczna grzybni trufli letniej Tuber aestivum/Tuber uncinatum Vittad
Metabolic activity of Tuber aestivum/Tuber uncinatum Vittad mycellium
Autorzy:
Jankiewicz, U.
Russel, S.
Bagińska, E.
Hilszczańska, D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/337774.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Instytut Technologiczno-Przyrodniczy
Tematy:
celulaza
ksylanaza
lakaza
lipaza
proteaza
Tuber aestivum/uncinatum
cellulase
laccase
lipase
protease
xylanase
Opis:
Celem prezentowanych badań było oznaczenie aktywności enzymów wydzielanych do podłoża przez dwie formy trufli letniej: Tuber aestivum i Tuber uncinatum Vittad. W pracy wykazano, że T. aestivum i T. uncinatum uwalniają do podłoża hodowlanego białka enzymatyczne o aktywności: lakazy, proteazy, lipazy oraz celulazy i ksylanazy. Analiza aktywności enzymatycznej w płynnych hodowlach obu form trufli letniej wykazała znaczne różnice biochemiczne pomiędzy nimi. Obserwowano zdecydowanie większą aktywność zewnątrzkomórkowych enzymów u T. aestivum, szczególnie lakazową i peptydazową. Wyniki badań wskazują na różną swoistość substratową lipaz wydzielanych przez te trufle: T. uncinatum syntetyzuje lipazy wykazujące aktywność tylko do octanu p-nitrofenolu, natomiast T. aestivum – także do palmitynianu p-nitrofenolu. W hodowlach obu form trufli wykryto niewielką aktywność celulolityczną i ksylanolityczną. Ksylanazy i celulazy oraz lakazy wydzielane przez grzybnię obu form tych trufli mogą brać udział w procesie zawiązywania symbiozy mykoryzowej.
Truffle have long been appreciated for their culinary value. However, knowledge about their biochemical activity is still insufficient. Therefore, the aim of this study was to preliminarily assess the enzymatic activity of two forms of summer truffle (Tuber aestivum Vittad.). The results showed that studied fungi of the genus truffle (Tuber spp.) – T. aestivum and T. uncinatum secrete extracellular enzymatic proteins with activities of: laccase, protease lipase, cellulase and xylanase. The high activity of the enzyme was observed between 10th and 20th day of truffle cultivation in liquid culture. Higher activity of all tested enzymes was detected in the culture of T. aestivum. Significant differences observed in the level and kind of enzymatic activity might indicate different metabolic activity of studied forms of summer truffle.
Źródło:
Woda-Środowisko-Obszary Wiejskie; 2015, 15, 1; 59-68
1642-8145
Pojawia się w:
Woda-Środowisko-Obszary Wiejskie
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Aktywnosc proteolityczna i amonifikacyjna uzytkowanych rolniczo gleb zlewni jeziora Piaseczno i Glebokie [Pojezierze Leczynsko-Wlodawskie]
Proteolytic and ammonification activity of cultivated soils of the piaseczno and glebokie catchment basin (The Leczynsko-Wlodawskie Lake District)
Autorzy:
Szwed, A
Furczak, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1401802.pdf
Data publikacji:
2000
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Agrofizyki PAN
Tematy:
Pojezierze Leczynsko-Wlodawskie
Jezioro Glebokie
jezioro Piaseczno
zlewnie jeziorne
gleby
gleby bielicowe
proteaza
aktywnosc proteolityczna
amonifikacja
aktywnosc amonifikacyjna
Leczynsko-Wlodawskie Lakeland
Lake Glebokie
Lake Piaseczno
lake catchment
soil
podzolic soil
protease
proteolytic activity
ammonification
ammonification activity
Opis:
Badania realizowano w glebie bielicowej wytworzonej z piasku luźnego, która cechuje się niewielką żyznością oraz w czarnej ziemi wytworzonej z piasku słabo gliniastego, która posiada dużą ilość części spławialnych, wysoki poziom węgla i azotu organicznego oraz znaczną pojemność sorpcyjną. Gleby te występują w sektorze rolniczym zlewni dwu jezior - Piaseczno i Głębokie (Pojezierze Łęczyńsko-Włodawskie). Próby do analiz biochemicznych pobierano 7, różnych stanowisk czterokrotnie w następujących terminach: kwiecień, maj, lipiec i wrzesień. Aktywność proteazy w glebach badano metodą Ladda i Butlera. Natomiast nasilenie procesu amonifikacji określano na podstawie przyrostu zawartości N-NH4+ (w próbkach glebowych inkubowanych z 0,1 % asparaginy) oznaczonego metodą Nesslera. Przeprowadzone badania wykazały, że aktywność proteolityczna zależała od właściwości gleby. W glebie bielicowej kształtowała się na ogół na niższym poziomie w porównaniu z czarną ziemią i była zróżnicowana w zależności od odległości stanowiska od jeziora. Potencjalna zdolność amonifikacyjna gleb nie była wyraźnie powiązana z ich właściwościami. W glebie bielicowej utrzymywała się w całym sektorze na zbliżonym poziomie. Natomiast w przypadku czarnej ziemi stwierdzono zależność badanego procesu od punktu pobrania gleby. Najwyższą wartość tej aktywności odnotowano w glebie zlokalizowanej na brzegu jeziora.
The investigations were carried out in podzolic soil of poor fertility developed from loose sand and black soil formed from slightly loamy sand with great part of fine fraction, high level of carbon and organic nitrogen and considerable sorp tivity. The soils arc located in the agricultural sector of the two lakes basin - Piaseczno and Głębokie (the Łęczyńsko-Włodawskie Lake District),The samples for biochemical analyses were gathered from different test sites for four times in the following terms: April, May, July and September, The protease activity in soils were examined after Ladd and Butler's method. Intensification of ammonification process was determined on die basis of N-NH4+ content growth (in soil samples incubated with 0,1 % asparagine) determined by Nesslef s method. The examinations proved the proteolytic activity depended on soil properties. In podzolic soil it demonstrated a lower level as compared to black soil and was differentiated in relation to test site distance off a lake. Potential ammonification activity of soils was not clearly connected with their characteristics. In podzolic .soil it maintained a similar level all over the agricultural sector, while in black soil there was stated dependence of a process examined on a sampling point. The highest value of the activity was recorded in the soil located on the lake bank.
Źródło:
Acta Agrophysica; 2000, 38; 237-246
1234-4125
Pojawia się w:
Acta Agrophysica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Alkaline trypsin from the viscera and heads of Engraulis anchoita: partial purification and characterization
Autorzy:
Lamas, D.L.
Yeannes, M.I.
Massa, A.E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/951322.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
alkaline protease
trypsin
viscera
head
Engraulis anchoita
purification
proteinase activity
ethylenediaminetetraacetic acid
sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis
proteolytic enzyme
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2017, 98, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analiza wydajności i specyficzności procesu immobilizacji syntetycznego inhibitora proteaz serynowych z zastosowaniem elektroforezy kapilarnej
Analysis of the efficiency and specificity of the synthetic serine protease inhibitor immobilization process using capillary electrophoresis
Autorzy:
Szałapata, K.
Osińska-Jaroszuk, M.
Grąz, M.
Jarosz-Wilkołazka, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2073100.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich
Tematy:
immobilizacja
inhibitor proteaz serynowych AEBSF
elektroforeza kapilarna
immobilization
AEBSF serine protease inhibitor
capillary electrophoresis
Opis:
Przedstawiono proces immobilizacji syntetycznego inhibitora proteaz serynowych AEBSF, który należy do rodziny związków benzosulfonowych. Zastosowanie techniki elektroforezy kapilarnej do celów analizy ilościowej pozwoliło na przeprowadzenie szybkiego pomiaru, charakteryzującego się wysoką specyficznością i precyzją. Na podstawie uzyskanych wyników stwierdzono, że inhibitor AEBSF, poddawany procesowi kowalencyjnej immobilizacji, jest efektywnie wiązany do porowatego nośnika. Jednocześnie określono, że wiąże się on z matrycą także wiązaniami adsorpcyjnymi i hydrofobowymi.
The paper describes a method of immobilization of AEBSF synthetic protease inhibitor which belongs to the family of benzensulfonyl compounds. The application of capillary electrophoresis for a quantitative analysis allows one to perform high-speed measurement characterized by high specificity and repeatability. The obtained results allowed one to confirm that the AEBSF inhibitor under covalent immobilization process is effectively bound to the porous support. It was also determined that AEBSF inhibitor binds to the matrix by adsorption and hydrophobic bonds.
Źródło:
Inżynieria i Aparatura Chemiczna; 2015, 3; 119--120
0368-0827
Pojawia się w:
Inżynieria i Aparatura Chemiczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
AtDeg2 - a chloroplast protein with dual protease/chaperone activity
Autorzy:
Jagodzik, P.
Adamiec, M.
Jackowski, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/57301.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
chloroplast protein
protease
proteolytic enzyme
chaperone
enzyme activity
chloroplast
PDZ domain
Opis:
Chloroplast protease AtDeg2 (an ATP-independent serine endopeptidase) is cytosolically synthesized as a precursor, which is imported into the chloroplast stroma and deprived of its transit peptide. Then the mature protein undergoes routing to its functional location at the stromal side of thylakoid membrane. In its linear structure AtDeg2 molecule contains the protease domain with catalytic triad (HDS) and two PDZ domains (PDZ1 and PDZ2). In vivo AtDeg2 most probably exists as a supposedly inactive haxamer, which may change its oligomeric stage to form active 12-mer, or 24-mer. AtDeg2 has recently been demonstrated to exhibit dual protease/chaperone function. This review is focused on the current awareness with regard to AtDeg2 structure and functional significance.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2014, 83, 3
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Binding of Aedes aegypti trypsin modulating oostatic factor [Aea-TMOF] to its receptor stimulates phosphorylation and protease processing of gut-membrane proteins
Autorzy:
Borovsky, D.
Hamdaoui, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/55079.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Przemysłu Organicznego
Tematy:
protease processing
Aedes aegypti
electrophoresis
trypsin modulating oostatic factor
phosphorylation
mosquito
insect
larva
gut-membrane protein
fluorography
gut receptor
Opis:
The binding of TMOF to its gut receptor was followed by incubating guts removed from male and female Aedes aegypti. TMOF at physiological concentrations, in the presence of [γ32P]ATP, causes phosphorylation and release of gut-membrane protein (45 kDa) that is further processed by proteolysis. In the presence of protease inhibitors only the 45 kDa protein was released. The phosphorylation and processing of the 45 kDa protein does not happen in the absence of TMOF. Both larvae and adult guts release the protein in the presence of TMOF. Male Ae. aegypti do not synthesize trypsin in their gut and do not release the 45 kDa protein in the presence of TMOF because a TMOF receptor is probably absent. Homogenized guts do not release the 45 kDa protein, indicating that the protease processing or the ecto-protein kinase activity is probably reduced after breaking the tissue. The 45 kDa phosphorylated protein can be dephosphorylated by alkaline phosphatase and protein phosphatase, indicating that the phosphate group is covalently linked to either a serine or a tyrosine moiety. This is the first report that shows that in insects, binding of a peptide hormone activates its receptor by proteolysis.
Źródło:
Pestycydy; 2008, 1-2; 13-25
0208-8703
Pojawia się w:
Pestycydy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Bioactive metabolites produced by Spirulina subsalsa from the Baltic Sea
Autorzy:
Szubert, K.
Wiglusz, M.
Mazur-Marzec, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/47501.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Oceanologii PAN
Tematy:
bioactive metabolite
Spirulina subsalsa
Baltic Sea
Cyanoprokaryota
bioremediation
cytotoxic activity
liquid chromatography-tandem mass spectrometry
protease inhibitor
Źródło:
Oceanologia; 2018, 60, 3
0078-3234
Pojawia się w:
Oceanologia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Characterization of disulfide exchange between DsbA and HtrA proteins from Escherichia coli
Autorzy:
Skórko-Glonek, Joanna
Sobiecka-Szkatuła, Anna
Lipińska, Barbara
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041221.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
DsbA oxidoreductase
disulfide exchange
HtrA protease
stoichiometry of HtrA-DsbA interaction
kinetics of HtrA oxidation
Opis:
DsbA is the major oxidase responsible for generation of disulfide bonds in proteins of E. coli envelope. In the present work we provided the first detailed characterization of disulfide exchange between DsbA and its natural substrate, HtrA protease. We demonstrated that HtrA oxidation relies on DsbA, both in vivo and in vitro. We followed the disulfide exchange between these proteins spectrofluorimetrically and found that DsbA oxidizes HtrA with a 1 : 1 stoichiometry. The calculated second-order apparent rate constant (kapp) of this reaction was 3.3 × 104 ± 0.6 × 104 M-1s-1. This value was significantly higher than the values obtained for nonfunctional disulfide exchanges between DsbA and DsbC or DsbD and it was comparable to the kapp values calculated for in vitro oxidation of certain non-natural DsbA substrates of eukaryotic origin.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2006, 53, 3; 585-589
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Charakterystyka biochemiczna proteazy syntetyzowanej przez Streptomyces rimosus
Characterization of the protease synthesized by Streptomyces rimosus
Autorzy:
Jankiewicz, U.
Koblak, S.
Wierzchowski, P.
Russel, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/338007.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Instytut Technologiczno-Przyrodniczy
Tematy:
enzymy proteolityczne
inhibitory proteaz
optimum temperaturowe
promieniowce
Actinomycetes
protease inhibitors
proteolytic enzymes
temperature optimum
Opis:
Badania prezentowane w niniejszej pracy miały na celu charakterystykę biochemiczną zewnątrzkomórkowej proteazy syntetyzowanej przez wyizolowany z gleby szczep Streptomyces rimosus i ocenę możliwości praktycznego wykorzystania tego enzymu w przemyśle. Badany enzym wyizolowano z 7-dniowych hodowli bakterii Streptomyces rimosus. Oczyszczony dwukrotnie enzym wykorzystano do charakterystyki biochemicznej w zakresie optymalnych warunków jego działania oraz wpływu aktywatorów i inhibitorów. Proteaza syntetyzowana przez S. rimosus wykazywała najwyższą aktywność w temperaturze 50°C i pH 7,5 oraz wysoką termostabilność w temperaturze 50°C. Dwuwartościowe jony Zn, Mo, Ni, Cd, Co hamowały aktywność enzymu, natomiast Ca i Mg – aktywowały. Silna inhibicja aktywności enzymu w obecności diizopropylofluorofosforanu (DFP) świadczy o tym, że jest to proteaza serynowa. Aktywność badanego enzymu była stabilna w obecności takich detergentów, jak Triton X-100, Tween 20, Tween 80, bromek heksadecylotrimetyloamoniowy (CTAB) oraz dodecylosiarczanu sodu (SDS).
The research was aimed at isolation and biochemical characterization of the extracellular protease synthesized by the soil Streptomyces rimosus and assessment of the possibilities of practical use of this enzyme in the industry. For this purpose, the test enzyme was isolated from 7 day old culture of S. rimosus. The enzyme two-fold purified was used for biochemical characterization for optimal temperature and pH of activity and activators and inhibitors of activity. The S. rimosus protease showed the highest activity at 50°C and at pH 7.5 and high thermostability at 50°C. Divalent ions such as Zn, Mo, Ni, Cd, Co caused inhibition while Ca and Mg stimulated activity. Strong inhibition of activity in the presence of diisopropylfluorophosphate (DFP) indicates that it is a serine protease. The activity of the test enzyme was stable in the presence of such detergents as Triton X-100, Tween 20, Tween 80, hexadecyl trimethyl ammonium bromide (CTAB) and sodium dodecyl sulfate (SDS).
Źródło:
Woda-Środowisko-Obszary Wiejskie; 2018, 18, 2; 5-14
1642-8145
Pojawia się w:
Woda-Środowisko-Obszary Wiejskie
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Defense against own arms: staphylococcal cysteine proteases and their inhibitors.
Autorzy:
Dubin, Grzegorz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043443.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
staphostatin
staphylococcus
ssp
proteinase
protease inhibitor
staphopain
Opis:
Staphylococcus aureus is a human pathogen causing a wide range of diseases. Most staphylococcal infections, unlike those caused by other bacteria are not toxigenic and very little is known about their pathogenesis. It has been proposed that a core of secreted proteins common to many infectious strains is responsible for colonization and infection. Among those proteins several proteases are present and over the years many different functions in the infection process have been attributed to them. However, little direct, in vivo data has been presented. Two cysteine proteases, staphopain A (ScpA) and staphopain B (SspB) are important members of this group of enzymes. Recently, two cysteine protease inhibitors, staphostatin A and staphostatin B (ScpB and SspC, respectively) were described in S. aureus shedding new light on the complexity of the processes involving the two proteases. The scope of this review is to summarize current knowledge on the network of staphylococcal cysteine proteases and their inhibitors in view of their possible role as virulence factors.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2003, 50, 3; 715-724
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dengue virus (NS2B/NS3 protease) protein engineering. Part I: An automated design for hotspots stability and site-specific mutations by using HotSpot Wizard 3.0 tool
Autorzy:
Lahiri, Madhumita
Ghosh, Ipsita
Talukdar, Partha
Talapatra, Soumendra Nath
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1062840.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
HotSpot Wizard
NS2B/NS3 protease
Non-structural protein
computational tool
protein engineering
Opis:
The non-structural dengue virus (DNV) protein, DNV-2 NS2B/NS3 protease is a combination of two proteins as 2B and 3 and these two proteins in complex replicate faster during dengue fever. The objective of the present study was to detect hot spots and design of smart libraries for engineering protein stability, substrate specificity, tunnels and cavities as well as suitable mutability position of studied protein by using an online tool, HotSpot Wizard (version 3.0). The prediction results were obtained in output interface for functional hot spots, stability hot spots (structural flexibility), correlated hot spots and stability hot spots (sequence consensus) from the sequence string. It is concluded that the prediction of pocket and mutability of this protein can easily be identified the structural alternation especially in disease diagnosis and space for ligand binding site in pocket for the potential of new drug design. Moreover, this computational prediction is suggested to compare with experimental hotspots for studied protein in relation to therapeutic efficacies, which are lacking to prevent viral infection.
Źródło:
World Scientific News; 2019, 127, 3; 177-190
2392-2192
Pojawia się w:
World Scientific News
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Distribution of cathepsin L in human umbilical cord tissues
Autorzy:
Gogiel, Tomasz
Wolańska, Małgorzata
Galewska, Zofia
Kinalski, Piotr
Sobolewski, Krzysztof
Romanowicz, Lech
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038609.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
cathepsin L
cysteine protease inhibitors
umbilical cord
umbilical cord artery
umbilical cord vein
Wharton's jelly
Opis:
The extracellular matrix components show specific distribution patterns within various structures of the umbilical cord, among which Wharton's jelly is especially collagen-rich tissue. Cathepsin L is a potent cysteine protease engaged in degradation of extracellular matrix proteins, including collagens. We evaluated the activity and expression of cathepsin L, and the inhibitory effect of cysteine protease inhibitors in the umbilical cord arteries, vein and Wharton's jelly. Cathepsin L activity and anti-papain inhibitory effect of cysteine protease inhibitors were quantified in extracts of separated umbilical cord tissues using fluorogenic substrates. The results were calculated per DNA content. The enzyme expression was assessed by Western immunoblotting. The active cathepsin L activity (without activation by pepsin digestion), its percentage in the total activity (after pepsin activation), and the expression of the mature single-chain enzyme were the lowest in the umbilical cord arteries and the highest in Wharton's jelly. The effect of cysteine protease inhibitors showed similar distribution as in the case of the active enzyme, being the highest in Wharton's jelly. Distribution of the activity and expression of mature cathepsin L within the umbilical cord probably results from distinctions in the proenzyme activation process. Differences in the action of cysteine protease inhibitors can partly restrict divergences in the enzyme activity that could reflect its expression alone. Differential enzyme action seems to contribute to tissue-specific collagen turnover within the umbilical cord cells, especially those of Wharton's jelly.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2017, 64, 3; 507-512
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Downregulation of chloroplast protease AtDeg5 leads to changes in chronological progression of ontogenetic stages, leaf morphology and chloroplast ultrastructure in Arabidopsis
Autorzy:
Baranek, M.
Wyka, T.P.
Jackowski, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/57852.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
chloroplast protease
AtDeg5 protease
chronological progression
ontogenetic stage
leaf morphology
chloroplast ultrastructure
Arabidopsis
starch grain
Opis:
The chloroplast protein AtDeg5 is a serine-type protease peripherally attached to thylakoid membrane at its lumenal side. Since reliable data regarding the role of AtDeg5 in controlling the course of growth and developmental processes are extremely limited, two independent T-DNA insertional lines with different extent of AtDeg5 reduction were prepared and ontogenesis stage-based analysis performed. Both mutant lines displayed a compensatory overaccumulation of AtDeg8. The repression of AtDeg5 protease altered a range of phenotypic features in at least one of the mutants, with the most prominent being changes in chronological progression of development and growth of individual rosette leaves, flower production and silique ripening as well as in the area of fully expanded leaves and chloroplast ultrastructure. By analyzing the results of parallel-mutant screening we conclude that AtDeg8 overdose may rescue 23% of AtDeg5 deficiency with regard to some AtDeg5-controlled traits; alternatively AtDeg5 may have catalytic sites in excess so that these traits might remain unaltered when AtDeg5 pool is reduced by 23%. For some other AtDeg5-dependent traits the absence of excessive amount of AtDeg5 catalytic sites, lack of AtDeg5 dosage effect and inability of AtDeg8 to compensate deficiency or absence of AtDeg5 occurred.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2015, 84, 1
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies