Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "pathogen identification" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-8 z 8
Tytuł:
Enhancement of fungal DNA templates and PCR amplification yield by three types of nanoparticles
Autorzy:
Al-Dhabaan, F.A.
Yousef, H.
Shoala, T.
Shaheen, J.
El Sawi, Y.
Farag, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65369.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
plant pathology
detection
identification
plant pathogen
toxigenic fungi
improvement
specificity
efficiency
polymerase chain reaction
Alternaria alternata
DNA extraction
nanoparticle
Rhizoctonia solani
nanobiotechnology
Opis:
Nanodiagonastic methods in plant pathology are used for enhancing detection and identification of different plant pathogens and toxigenic fungi. Improvement of the specificity and efficiency of the polymerase chain reaction (PCR) by using some nanoparticles is emerging as a new area of research. In the current research, silver, zinc, and gold nanoparticles were used to increase the yield of DNA for two plant pathogenic fungi including soil-borne fungus Rhizoctonia solani and toxigenic fungus Alternaria alternata. Gold nanoparticles combined with zinc and silver nanoparticles enhanced both DNA yield and PCR products compared to DNA extraction methods with ALB buffer, sodium dodecyl sulfate, ALBfree from protinase K, ZnNPs and AgNPs. Also, by using ZnNPs and AgNPs the DNA yield was enhanced and the sensitivity of random amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR products was increased. Application of nanomaterials in the PCR reaction could increase or decrease the PCR product according to the type of applied nanometal and the type of DNA template. Additions of AuNPs to PCR mix increased both sensitivity and specificity for PCR products of the tested fungi. Thus, the use of these highly stable, commercially available and inexpensive inorganic nano reagents open new opportunities for improving the specificity and sensitivity of PCR amplicon, which is the most important standard method in molecular plant pathology and mycotoxicology.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2018, 58, 1
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification and pathogenicity of Botryosphaeria parva associated with grapevine decline in Kurdistan region - Iraq
Identyfikacja i patogeniczność grzybów Botryosphaeria parva związanych z zamieraniem winorośli w regionie Kurdystanu w Iraku
Autorzy:
Haleem, R.A.
Abdullah, S.K.
Jubrael, J.M.S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/28424.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
identification
pathogenicity
Botryosphaeria parva
grapevine
Kurdistan region
Iraq
fungi
plant cultivar
pathogen isolate
canker
green shoot
field condition
black dead arm
plant disease
Opis:
During a survey on fungi associated with decline symptoms on grapevine cultivars growing in Kurdistan region of Iraq, several isolates of Botryosphaeria species were encountered. All isolates were identified as Botryosphaeria parva Pennycook and Samuels. Pathogenicity test for isolate DKI 1 was performed on two cultivars, Taefi and Rashmew. Under greenhouse conditions, one-year grape rooted cuttings were inoculated with the pathogen isolate by two methods, injecting the spore suspension into the green shoots and by artificial inoculation of wounded shoots with mycelial mat. The highest canker length (15.0 mm) was produced after four months on the shoots of the Taife cultivar artificially inoculated with mycelial mat of the pathogen. Under field conditions, two methods of inoculation were adopted, wounding the green shoots and drilling a hole in the arms of mature vine, followed by inoculation with mycelial mat. The highest canker length (11.17 mm) was obtained after 5 months on wounded shoots of the Rashmew cultivar and with a significant difference from the Taefi cultivar. The pathogen caused a reduction in fresh and dry weight of green shoots and roots compared with the non-inoculated control. This is the first report on B. parva in Iraq.
W trakcie prowadzenia badań nad grzybami związanymi z symptomami zamierania gatunków winorośli rosnących w regionie Kurdystan w Iraku natrafiono na kilka izolatów gatunków z rodzaju Botryosphaeria. Wszystkie izolaty oznaczono jako Botryosphaeria parva Pennycook i Samuels. Na dwóch odmianach, ‘Taefi’ i ‘Rashmew’, wykonano test patogeniczności dla izolatu DKI 1. W warunkach szklarniowych jednoroczne ukorzenione sadzonki winorośli inokulowano izolatem patogena przy użyciu dwóch metod: wstrzykując zawiesinę zarodników grzyba w zielone pędy oraz poprzez sztuczną inokulację naciętych pędów za pomocą grzybni. Nekroza o największej długości (15,0 mm) powstała po czterech miesiącach na pędach odmiany Taife sztucznie inokulowanych grzybnią patogena. W warunkach polowych przyjęto dwie metody inokulacji: nacięcie zielonych pędów oraz wywiercenie dziurki w gałęziach dojrzałej winorośli, po czym dokonano inokulacji grzybnią. Nekrozę o największej długości (11,17 mm) uzyskano po 5 miesiącach na naciętych pędach odmiany Rashmew, przy czym różnica w stosunku do odmiany Taefi była istotna. Patogen spowodował zmniejszenie świeżej i suchej masy pędów zielonych i korzeni w porównaniu z nieokulowaną kontrolą. Jest to pierwsze doniesienie na temat grzyba B. parva w Iraku.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2012, 65, 1
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis by the polymerase chain reaction [PCR]
Autorzy:
Cajza, M
Rezler, A.
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65945.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
tomato seed
pathogen
Clavibacter michiganensis
plant protection
bacteria
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
seed
identification
Opis:
The PCR offers the possibility of specific and very sensitive detection and/or identification of Cl. m. subsp. michiganensis in seeds. The described PCR method for identification of this pathogen is very fast (one day) and economical, because of the very small volume (10 μI) of the PCR reaction mixture. The method based on amplification of the bacterial plasmid DNA fragment may be very useful in routine identification of Cl. m. subsp. michiganensis from all other bacteria isolated from tomato seeds and may be an alternative tool in diagnostics, especially for the quarantine services.
Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis jest bardzo groźnym patogenem kwarantannowym pomidora, wywołującym chorobę zwaną bakteryjnym rakiem pomidora. Bakteria ta łatwo przenosi się z zakażonymi nasionami i sadzonkami. Pomimo opracowania różnych technik diagnostycznych do jej wykrywania, nadal stanowi duży problem w diagnozowaniu chorób pomidora. Powszechnie stosowane w Polsce wykrywanie tej bakterii, bazujące na testach enzymoimmunologicznych (ELISA), immunofluorescencyjnych, hodowli na pożywkach półselektywnych i testach biologicznych, jest często zawodne ze względu na duże serologiczne zróżnicowanie poszczególnych szczepów tej bakterii, obecność wielu bakterii saprofitycznych, tworzących kolonie nie różniące się morfologicznie od kolonii właściwych dla Cl. m. subsp. michiganensis, czy też mało przydatne ze względu na długi czas trwania testu i obecność infekcji latentnych. Jedną z nowoczesnych metod wykrywania i identyfikacji bakterii jest amplifikacja fragmentów DNA charakterystycznych dla jej genomu przy pomocy reakcji PCR. Metoda ta dopiero zaczyna być powszechnie stosowana w diagnostyce bakterii (nieliczne doniesienia, w większości z ostatnich trzech lat). Opracowana metoda identyfikacji Cl. m. subsp. michiganensis spośród różnych bakterii saprofitycznych obecnych na nasionach pomidora, charakteryzuje się bardzo dużą czułością (do wykrycia Cl. m. subsp. michiganensis wystarczy 200-300 bakterii / 1 ml), specyficznością (produkty amplifikacji DNA bakteryjnego o oczekiwanej długości 614 bp, uzyskiwano tylko w próbkach, w których znajdował się DNA z Cl. m. subsp. michiganensis) oraz szybkością (jeden dzień, wraz z izolacją DNA bakteryjnego). Ponadto opracowana metoda charakteryzuje się bardzo niskimi kosztami, gdyż cala reakcja amplifikacji DNA zachodzi w objętości 10 μI (4 μI zawiesiny DNA i 6 μI mieszaniny reakcyjnej), co sprawia, że stosowanie tej metody w powszechnej diagnostyce chorób bakteryjnych będzie coraz częstsze i będzie ona coraz bardziej konkurencyjna w stosunku do innych, obecnie stosowanych.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular identification of pathogenic Fusarium species, the causal agents of tomato wilt in western Iran
Autorzy:
Chehri, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/66185.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
molecular identification
pathogen
Fusarium
causal agent
tomato
Lycopersicon esculentum
wilt pathogen
pathogenicity
phylogenetic analysis
Iran
Opis:
Fusarium species are causal agents of fungal diseases occurring frequently in numerous agriculturally important plants, including potato, garlic and are one of the common pathogens of tomato, causing root rot in the west part of Iran. Therefore, the objectives of this study were to isolate and identify disease-causing Fusarium species from infected tomatoes based on the morphological and molecular characteristics. Twenty-five isolates of Fusarium were obtained from infected root of tomato plants collected from the fields in different regions of western Iran. Based on morphological features, the strains were classified into four following Fusarium species: F. oxysporum, F. redolens, F. proliferatum and F. verticillioides. The phylogenetic trees based on tef1 and tub2 dataset clearly distinguished closely related species. All of the isolates were evaluated for their pathogenicity on healthy tomato seedlings in the greenhouse. This is the first report on molecular identification of Fusarium species isolated from tomato plants cultivated in Iran.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2016, 56, 2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Otitis externa: the analysis of relationship between particular signs-symptoms and species and genera of identified microorganisms
Autorzy:
Kurnatowski, P.
Filipiak, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/839086.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
external otitis
otitis
etiological factor
disease symptom
patient
laryngology
microorganism
identification
pathogen
bacteria
fungi
diagnosis
Źródło:
Annals of Parasitology; 2008, 54, 1; 37-41
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Otitis externa: the analysis of relationship between particular signs-symptoms and species and genera of identified microorganisms
Autorzy:
Kurnatowski, P.
Filipiak, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2143724.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
external otitis
otitis
etiological factor
disease symptom
patient
laryngology
microorganism
identification
pathogen
bacteria
fungi
diagnosis
Opis:
Objective. To investigate a relationship between the etiological factor of external otitis and occurrence of particular signs/symptoms. Design. A special questionnaire was designed and completed by all patients covering personal details, medical history, results of otolaryngological examination and bacteriological and mycological investigations. Subjects. 249 patients of the Outpatient Department of Laryngology at the Regional Hospital in Bełchatów with symptoms of external otitis. For analysis of relationships between particular signs/symptoms and species/genera of microorganisms, statistical tests were used: χ2 test, χ2 test with Yate’s modification, C−Pearson index, and Fisher exact test for very small samples. Results. There is a statistical dependence between discharge, hearing loss, swelling of skin, scant, dried discharge with fetid odour and bacteria isolated from the external ear canal. Similar dependence exists between pain, hearing loss, no smelly discharge or wet, black plug of fetid odour and fungi. Also there is a statistical dependence between pruritus, red skin and grey, fetid discharge and mixed flora. Conclusions. Some of symptoms and signs are connected with definite etiological factors which is important not only for correct diagnosis but also for institution of appropriate and effective treatment. On the basis of some characteristic symptoms and signs it is possible to make a tentative diagnosis as to the etiological pathogen responsible for external otitis.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2008, 54, 1; 37-41
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zagrożenie drzewostanów dębowych przez Cryphonectria parasitica
Threat to the oak stands caused by Cryphonectria parasitica
Autorzy:
Bieniek, P.
Oszako, T.
Pusz, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/979289.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
cryphonectria parasitica
oak stands
identification
detection
pathogen control
Opis:
Cryphonectria parasitica is a pathogen that causes chestnut blight – a disease that has decimated chestnut trees Castanea dentata in North America and C. sativa in Europe. C. parasitica also infects other tree species, including oaks. Although the disease on oaks progresses and develops in a milder way, it can pose a threat to them. The main purpose of the work is to investigate the risk of C. parasitica occurring in oak stands. The work is based on a review of the available literature taking into account an analysis of pathogen detection and identification methods, current distribution of disease in Europe, distribution of potential host plants, favourable climatic conditions, and ways of spreading (pathways).
Źródło:
Sylwan; 2020, 164, 07; 576-582
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-8 z 8

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies