Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "genomic data" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-2 z 2
Tytuł:
Algorithm for genetic data analysis – comparison of the frequency of specific mutations in different populations
Algorytm do analizy danych genetycznych – porównanie częstotliwości występowania określonych mutacji wśród różnych populacji
Autorzy:
Marciniak, Anna
Tarczewska, Martyna
Kloska, Sylwester
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2016298.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Politechnika Bydgoska im. Jana i Jędrzeja Śniadeckich. Wydawnictwo PB
Tematy:
Python 3
bioinformatics
vcf files
genomic data
bioinformatyka
pliki vcf
dane genomowe
Opis:
This paper presents a novel algorithm which can be used to analyze genomic data obtained during Next Generation Sequencing (NGS). Due to the interest in the subject among geneticists, it is necessary to develop algorithms and programs which analyze genetic data that will be user-friendly and accessible to people not related to typical bioinformatics. A way of performing comparative analyze, including proper data preprocessing and final data processing is described. Input data for the algorithm are annotated .vcf files. The outcome of presented algorithm is a file with counted percentage of single nucleotide polymorphisms (SNP) in data for every loaded population.
W artykule przedstawiono nowatorski algorytm służący do analizy danych genomowych uzyskanych podczas sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Ze względu na zainteresowanie tą tematyką wśród genetyków konieczne jest opracowanie przyjaznych dla użytkownika i dostępnych dla osób niezwiązanych z bioinformatyką algorytmów i programów analizujących dane genetyczne. Opisano sposób przeprowadzania analizy porównawczej, w tym wstępne i końcowe przetwarzanie danych. Dane wejściowe algorytmu to pliki formatu .vcf z adnotacjami. Wynikiem przedstawionego algorytmu jest plik zawierający informacje dotyczące częstości występowania polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (ang. single nucleotide polymorphism, SNP) w badanych populacjach.
Źródło:
Zeszyty Naukowe. Telekomunikacja i Elektronika / Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy; 2020, 24; 5-11
1899-0088
Pojawia się w:
Zeszyty Naukowe. Telekomunikacja i Elektronika / Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The Monte Carlo feature selection and interdependency discovery is unbiased
Autorzy:
Dramiński, M.
Kierczak, M.
Nowak-Brzezińska, A.
Koronecki, J.
Komorowski, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/205575.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Badań Systemowych PAN
Tematy:
supervised classification
feature selection
feature interactions
high-dimensional problems
applications to genomic and proteomic data
Opis:
We show that the Monte Carlo feature selection algorithm for supervised classification proposed, by Dramiński et al. (2008), is not biased towards features with many categories (levels or values). While the algorithm, later extended to include the functionality of discovering interdependencies between features, is surprisingly simple and has been successfully used on many biological data and transactional data of commercial origin, and it has never revealed any bias of the type mentioned, the alleged property of its unbiasedness required a closer scrutiny which is thus provided here. Admittedly, the algorithm does reveal some bias coming from another source, but it is negligible. Hence our final claim is that the algorithm is practically unbiased and the results it provides can be considered fully reliable.
Źródło:
Control and Cybernetics; 2011, 40, 2; 199-211
0324-8569
Pojawia się w:
Control and Cybernetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-2 z 2

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies