Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "genetic mapping" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-6 z 6
Tytuł:
Identyfikacja genetycznych podstaw procesu kiełkowania w nasionach rzepaku (Brassica napus L.) z wykorzystaniem mapowania genetycznego
Identification of the genetic basis of germination in rape seed (Brassica napus L.) using genetic mapping
Autorzy:
Gacek, Katarzyna
Bartkowiak-Broda, Iwona
Szala, Laurencja
Cegielska-Taras, Teresa
Bayer, Philipp E.
Edwards, David
Batley, Jacqueline
Penfield, Steven
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199314.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
mapowanie genetyczne
kiełkowanie
rape seed
genetic mapping
germination
Opis:
Badano populację mapującą rzepaku ozimego złożoną z 78 linii podwojonych haploidów uzyskanych z mieszańców pochodzących ze skrzyżowania linii różniących się siłą kiełkowania. Siła kiełkowania nasion była automatycznie rejestrowana co 30 min przy pomocy aparatu fotograficznego umieszczonego w minikomputerze Raspberry Pi. Zdjęcia przeanalizowano przy pomocy oprogramowania stworzonego w John Innes Centre. W kolejnym etapie wykorzystując metodę sekwencjonowania całego genomu (Illumina® HiSeq) wszystkich linii populacji mapującej zidentyfikowano polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNPs) w tych liniach. Dane te posłużą do mapowania genetycznego i identyfikacji genów regulujących proces kiełkowania.
The mapping population of winter oilseed rape composed of 78 doubled haploid lines obtained from hybrids originating from the intersection of lines differing in germination power was examined. Seed germination power was automatically recorded every 30 minutes using a camera placed in the Raspberry Pi mini computer. The photos were analyzed using software created at the John Innes Center. In the next step, using the whole genome sequencing method (Illumina® HiSeq) of all mapping population lines, single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in these lines. This data will be used for genetic mapping and identification of genes regulating the germination process.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 287; 23-24
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Strategie molekularne w nowoczesnej hodowli roślin
Molecular strategies in modern plant breeding
Autorzy:
Jarska, Weronika
Niedziela, Agnieszka
Orłowska, Renata
Bednarek, Piotr T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198604.pdf
Data publikacji:
2015-03-31
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
mapowanie genetyczne
mapowanie asocjacyjne
selekcja genomowa
association mapping
genetic mapping
genomic selection
Opis:
Rozwój biologii molekularnej, a w szczególności technologii markerowych oraz narzędzi statystycznych umożliwiających analizę dużej liczby danych uzyskiwanych dla szerokiego typu populacji mapujących sprawia, że zmienia się podejście do selekcji materiałów roślinnych dla potrzeb hodowli. Coraz silniejszy nacisk kładzie się na selekcję wielu cech użytkowych przy jednoczesnym wykorzystaniu elitarnych, zwykle niespokrewnionych ze sobą lecz wyrównanych pod względem genetycznym materiałów roślinnych. Rozwijane obecnie metody umożliwiające prowadzenie selekcji za pomocą markerów DNA w oparciu o złożone populacje mapujące są znane tylko wąskiej grupie specjalistów natomiast metody wykorzystujące ściśle zdefiniowane modele genetyczne, ze względu na ich liczne ograniczenia, zdają się być negowane. Niniejsza praca poświęcona jest omówieniu możliwości metod selekcji wykorzystujących szeroki wachlarz metod biologii molekularnej.
Advances in molecular biology, including the new marker technologies and statistical tools allow analysis of large data sets evaluated for different types of mapping populations and change approaches to selection of breeding materials. The emphasis is put on selecting many traits simultaneously based on elite, usually non-related but genetically uniform, plant materials. Currently available methods for selecting forms via DNA-based marker technologies using complex mapping populations are well known to a limited number of specialists whilst applications involving defined mendelian populations (due to their numerous limitations) are being neglected. Thus, the review is dedicated to describing wide range of selection approaches that could be applied to different breeding programs depending on experimental requirements.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2015, 275; 17-28
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Characterization and mapping of QTL used in breeding of Scots pine (Pinus sylvestris L.)
Autorzy:
Nowicka, A.
Ukalska, J.
Siminska, J.
Szyp-Borowska, I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/38570.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
genetic mapping
quantitative trait locus
plant breeding
amplified fragment length polymorphism
Scotch pine
Pinus sylvestris
Opis:
This paper reports the construction a map based on Amplified Fragment Length Polymorphic DNA (AFLP) in Scots pine (Pinus sylvestris L.). The main purpose of map construction was its application to quantitative traits loci (QTL) mapping for breeding traits economically important in Scots pine breeding program such as tree height and diameter at breast height, number of needles and their length, width, and area. Genomic DNA of needles and haploid megagamethophytes from seeds originating from a single tree were amplified with 25 AFLP primer-enzyme combinations with three or four selective nucleotides. Sixteen of them generated easily readable patterns and revealed a polymorphism. Each analyzed marker was tested for the expected 1 : 1 segregation ratio using χ2 – test and only 6 were significant with (α ≤ 0.05). The total map size equaled 291,7 cM and all markers were distributed within one linkage group. For all traits only one QTL associated with tree height (H) was detected.
Źródło:
Folia Forestalia Polonica. Series A . Forestry; 2013, 55, 4
0071-6677
Pojawia się w:
Folia Forestalia Polonica. Series A . Forestry
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mapping of India’s contribution on “Down syndrome” during 40 years from 1973-2012
Autorzy:
Siwach, A.K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/10910.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
mapping
India
Down's syndrome
human disease
genetic disease
1973-2012 period
bibliometrics
Opis:
Down syndrome, a genetic disease, is commonly diagnosed congenital malformation/mental retardation syndrome occurring in people of all races and economic levels. The present study is aimed to examine the contribution of Indian scientists on Down syndrome during the 40 years span from 1973-2012. The study analyses the Indian share in the research output, contribution and citation impact of top Indian institutions, most prolific Indian authors, top journals for publication, top collaborating countries, number of citations received and the highly cited papers in the Indian research on Down syndrome.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2015, 07
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Administration-and communication-aware IP core mapping in scalable multiprocessor system-on-chips via evolutionary computing
Autorzy:
Guderian, F.
Schaffer, R.
Fettweis, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/91539.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Społeczna Akademia Nauk w Łodzi. Polskie Towarzystwo Sieci Neuronowych
Tematy:
intellectual property
IP
IP core
mapping
system-on-chips
mixed-integer linear programming
MILP
genetic algorithm
GA
administration
communication
Opis:
In this paper, an efficient mapping of intellectual property (IP) cores onto a scalable multiprocessor system-on-chip with a k-ary 2-mesh network-on-chip is performed. The approach is to place more affine IP cores closer to each other reducing the number of traversed routers. Affinity describes the pairwise relationship between the IP cores quantified by an amount of exchanged communication or administration data. A genetic algorithm (GA) and a mixed-integer linear programming (MILP) solution use the affinity values in order to optimize the IP core mappings. The GA generates results faster and with a satisfactory quality relative to MILP. Realistic benchmark results demonstrate that a tradeoff between administration and communication affinity significantly improves application performance.
Źródło:
Journal of Artificial Intelligence and Soft Computing Research; 2012, 2, 2; 133-146
2083-2567
2449-6499
Pojawia się w:
Journal of Artificial Intelligence and Soft Computing Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Rozważania nad mapowaniem genetycznym QTL odpowiedzialnym za cechę żółtonasienności rzepaku ozimego (Brassica napus L.)
A consideration on genetic mapping of QTL responsible for the yellow-seedness in winter rapeseed (Brassica napus L.)
Autorzy:
Hernacki, Błażej
Bartkowiak-Broda, Iwona
Piotrowska, Aleksandra
Cegielska-Taras, Teresa
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42821929.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak ozimy (Brassica napus)
żółtonasienność
RAPD
AFLP
QTL – loci cech ilościowych
sprzężenie genetyczne
mapowanie
winter rapeseed (Brassica napus)
yellow-seedness
QTL — quantitative trait loci
genetic linkage
mapping
Opis:
Nasiona rzepaku żółtonasiennego zawierają mniej włókna pokarmowego, a więcej tłuszczu i białka, w porównaniu do ciemnych nasion rzepaku. Wpływa to pozytywnie na podatność nasion na tłoczenie i wartość paszową poekstrakcyjnej śruty oraz wytłoków. Jednocześnie jednak pogorszeniu ulegają odporność roślin na patogeny i cechy mechaniczne nasion. Głęboka zmiana genotypu wiąże się również z obniżeniem plenności. Charakterystyka genetyczna uzyskanych w Zakładzie Genetyki i Hodowli Roślin Oleistych IHAR podwójnie ulepszonych (00) linii rzepaku ozimego żółtonasiennego pozwoli na usprawnienie i właściwe ukierunkowanie hodowli tego typu odmian. Zastosowanie markerów molekularnych sprzężonych z danymi cechami pozwala na precyzyjną selekcję pożądanych genotypów. W celu opracowania markerów sprzężonych z cechą żółtonasienności utworzono dwie populacje mapujące linii podwojonych haploidów (DH) złożone z potomstwa otrzymanego w wyniku skrzyżowania dwóch linii zółtonasiennych DH z dwoma czarnonasiennymi liniami DH. Rośliny z obu populacji liczących po około sto linii są obecnie poddawane analizom cech fenotypowych oraz mapowaniu genetycznemu. Do tego ostatniego zadania wybrano kilkadziesiąt standardowych starterów RAPD typowych dla rzepaku oraz jedenaście starterów RAPD o sekwencjach projektowanych, generujących opisane w literaturze markery sprzężone z kolorem nasion. Przeprowadzone dotąd badania wykazały iż większość z tych markerów generuje polimorficzne obrazy rozkładu produktów amplifikacji. Oprócz tego w projekcie w dalszej perspektywie planowane jest użycie trzydziestu par starterów AFLP (z czego piętnaście par generuje opisane sprzężenie z kolorem nasion), ponadto mapę genomu uzupełni również analiza za pomocą mikrosatelitów. Opracowana szczegółowa mapa genomu linii żółtonasiennych ze sprzężonymi markerami dla genów istotnych z punktu widzenia hodowli zostanie porównana z innymi mapami genetycznymi rzepaku.
The yellow seeds of rapeseed contain less fibre and are characterized by higher fat and protein content than the dark seeds. These features have a positive influence on seed performance in oil pressing and on feeding value of the meal and mill cake. However, the resistance to pathogens and the values of mechanical traits are comparatively lower. Moreover, the substantial change in genotype effects in the decrease in yielding level of the yellow-seeded plants. Genetic characterization of double low (00) yellow-seeded lines obtained at the Department of Genetics and Breeding of Oilseed Crops of the Plant Breeding and Acclimatization Institute can contribute to improving the strategy of breading of yellow-seeded varieties. The use of molecular markers linked to specific traits is a simple way to fast and precise selection of desired genotypes. For mapping and searching for markers linked to the yellow-seedness, two populations were developed from two reciprocal crossings of two yellow-seeded doubled haploid (DH) lines and two DH black-seeded lines. Plants from both populations, each consisted of about one hundred individuals, have already been analyzed phenotypically and mapped genetically. For the latter task, several dozen standard Operon RAPD primers and eleven RAPD primers, which are described in literature as generating markers linked to the colour of seeds, were chosen. The results obtained hitherto strongly suggested that the majority of the primers used generate polymorphic products of DNA amplification. In further studies it is planned to use thirty pairs of AFLP primers, fifteen of which have been described to generate markers linked to the colour of seeds. Moreover, the genome map will be supplemented by the data from analysis done using microstatellites. Such a detailed genetic map of the genome of yellow-seeded lines with markers linked to important qualitative genes will be compared with other genetic maps of oilseed rape.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 221-229
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-6 z 6

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies