Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "gene expression" wg kryterium: Temat


Tytuł:
A calcium-dependent protein kinase-NADPH oxidase activation circuit in rapid defense signal propagation
Autorzy:
Seybold, H.
Dubiella, U.
Lassing, R.
Schulze, W.
Romeis, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80432.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
calcium-dependent protein kinase
phosphorylation
NADPH oxidase
pathogen-associated molecular pattern
innate immune system
plant
phytohormone
gene expression
reactive oxygen species
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A common cis-element in promoters of protein synthesis and cell cycle genes
Autorzy:
Wyrwicz, Lucjan
Gaj, Paweł
Hoffmann, Marcin
Rychlewski, Leszek
Ostrowski, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041116.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
gel shift assay
regulation of transcription
comparative genomics
gene expression
promoter
bioinformatics
Opis:
Gene promoters contain several classes of functional sequence elements (cis elements) recognized by protein agents, e.g. transcription factors and essential components of the transcription machinery. Here we describe a common DNA regulatory element (tandem TCTCGCGAGA motif) of human TATA-less promoters. A combination of bioinformatic and experimental methodology suggests that the element can be critical for expression of genes involved in enhanced protein synthesis and the G1/S transition in the cell cycle. The motif was identified in a substantial fraction of promoters of cell cycle genes, like cyclins (CCNC, CCNG1), as well as transcription regulators (TAF7, TAF13, KLF7, NCOA2), chromatin structure modulators (HDAC2, TAF6L), translation initiation factors (EIF5, EIF2S1, EIF4G2, EIF3S8, EIF4) and previously reported 18 ribosomal protein genes. Since the motif can define a subset of promoters with a distinct mechanism of activation involved in regulation of expression of about 5% of human genes, further investigation of this regulatory element is an emerging task.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 1; 89-98
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A comparative molecular analysis of two genotypes of Solanum lycopersicum in respect of the expression of selected salt responsive genes in leaves and roots
Autorzy:
Roy, C.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81170.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
plant
Solanum lycopersicum
tomato cultivar
molecular analysis
salt stress
abiotic stress
reactive oxygen species
gene expression
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 4
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A comparison of antioxidant systems between Pisum sativum and Brassica juncea indicates high disproportion in H2O2 level
Autorzy:
Kutrowska, A.
Piechalak, A.
Wojtera-Kwiczor, J.
Malecka, A.
Tomaszewska, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80674.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
antioxidant
gene expression
Pisum sativum
Brassica juncea
hydrogen peroxide
trace element
reactive oxygen species
oxidative stress
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A green light for plants
Autorzy:
Jasinski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80884.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
bioinformatics
climate change
demand
DNA marker
feed
food
food security
gene expression
global population
grain
green light
plant
plant biotechnology
plant genetics
plant science
worldwide consumption
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A membrane bound NAC transcription factor is a regulator of mitochondrial retrograde regulation of the oxidative stress
Autorzy:
Van Breusegem, F.
De Clercq, I.
Vermeirssen, V.
Van Aken, O.
Wheelan, J.
Vandepoele, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80443.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
NAC transcription factor
mitochondrial retrograde regulation
reactive oxygen species
protein signalling
gene expression
oxidative stress
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A rapid system for studying foreign gene expression in wheat [Triticum aestivum L.]
Autorzy:
Ortiz, J P A
Ravizzini, R A
Morata, M M
Vallejos, R H
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2046807.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Buck Ombu cultivar
gene expression
wheat
leaf segment
transgenic plant
Triticum aestivum
embryo
Opis:
The present work describes a rapid and easy way to study foreign gene expression in wheat through microparticle bombardment. Transient expression of the GUS reporter gene was evaluated in different tissues of the cultivar Buck Ombú. Transformation was carried out employing a helium gun microparticle accelerator and several plasmids. Embryogcnic calli, immature embryos and immature inflorescences showed a higher number of transformed cells per Petri dish. Basal leaf segments were the least efficient. When vectors were tested in scutellar tissue of immature embryos, the maize ubiquitin promoter (Ubil) produced the highest level of transient GUS expression, followed by the alcohol dehydrogenase promoter of maize plus its first intron (Adh1 Adh-intron 1) and the sunflower ubiquitin promoter. The CaMV35S promoter was the least effective. These results were in agreement with previous reports carried out in cell suspensions or embryogenic calli and indicate that wheat immature embryos and immature inflorescences are suitable for rapid test of promoter sequences or transformation conditions. Moreover, efficient transformation of these explants could help in the stable transformation of agronomically important genotypes.
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 1997, 38, 2; 123-130
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A stable density approach to probe selection for a custom aCGH design
Autorzy:
Gambin, T.
Stankiewicz, P.
Gambin, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81185.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
genomic region
probe
copy number alternation
comparative genomic hybridization
human genome
microarray
wide range application
gene expression
methylation
binding protein
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Acid alpha-galactosidase is involved in D-chiro-inositol accumulation during tartary buckwheat germination
Autorzy:
Jia, C.-F.
Hu, W.-H.
Chang, Z.
Gao, H.-L.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/59199.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
alpha-galactosidase
D-chiro-inositol
accumulation
tartary buckwheat
Fagopyrum tataricum
duckwheat zob.tartary buckwheat
India buckwheat zob.tartary buckwheat
India wheat zob.tartary buckwheat
green buckwheat zob.tartary buckwheat
germination
gene expression
Opis:
Tartary buckwheat seed and especially its sprouts are rich in D-chiroinositol (DCI). The research was to evaluate when DCI was most accumulated in tartary buckwheat sprouts. In addition, we explored the activity and expression pattern of α-galactosidase during tartary buckwheat seed germination. The results showed that DCI contents steadily increased at early stage of germination and reached the highest level of 33.42 μg/seed at 24 h during the 72 h trail. However, the total fagopyritol contents sharply decreased from 214.6 μg/seed to 46 μg/seed at the end of the germination. The activity of acid α-galactosidase increased gradually to the peak of 0.36 nkat/seed at 24 h after the primed seed imbibition. We cloned the gene fragment of α-galactosidase in tartary buckwheat for the first time. The deduced amino acid sequence is 93% identical to that of P. vulgaris. The quantitative PCR result of gene expression pattern was consistent with its enzyme activity during seed germination.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2015, 84, 1
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Activation of phenylpropanoid pathway in legume plants exposed to heavy metals. Part I. Effects of cadmium and lead on phenylalanine ammonia-lyase gene expression, enzyme activity and lignin content
Autorzy:
Pawlak-Sprada, Sylwia
Arasimowicz-Jelonek, Magdalena
Podgórska, Magdalena
Deckert, Joanna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039918.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
cadmium
gene expression
lead
lignin
lupine
phenylalanine ammonia-lyase (PAL)
soybean
Opis:
Species-specific changes in expression of phenylalanine ammonia-lyase (PAL) and lignin content were detected in roots of soybean (Glycine max L.) and lupine (Lupinus luteus L.) seedlings treated with different concentrations of cadmium (Cd2+, 0-25 mg/l) or lead (Pb2+, 0-350 mg/l). The stimulatory effect of both metals was observed in mRNA coding for PAL in soybean. In the case of lupine, changes of PAL mRNA level were dependent on the metal used: Cd2+ caused a decrease, whereas Pb2+ an increase of PAL transcript level. The activity of PAL was enhanced in both plant species at higher metal concentrations (15-25 mg/l of Cd2+ or 150-350 mg/l of Pb2+); however it was not directly correlated with PAL mRNA. This suggests a transcriptional and posttranscriptional control of PAL expression under heavy metals stress. In soybean, Cd2+ or Pb2+ treatment increased lignin content, while in lupine the effect was opposite. The decreased lignin accumulation in lupine roots in response to heavy metals, despite an increased PAL activity, suggests that the activated phenylpropanoid pathway was involved in the synthesis of secondary metabolites other than lignin.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 2; 211-216
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Adaptation factors of Borrelia for host and vectors
Autorzy:
Skotarczak, B
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/50116.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
Borrelia burgdorferi
adaptation factor
host
metabolism
genome
quorum sensing
protein expression
vls gene
spirochete zob.spirochaete
spirochaete
human disease
etiological factor
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2009, 16, 1; 1-8
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Aktyna i miozyny w jądrze komórkowym
Actins and myosins in the nucleus
Autorzy:
Nowak, Jolanta
Rędowicz, Maria
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1033936.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tematy:
actin
gene expression
myosin
nucleus
nucleolus
polymerase
transcription
aktyna
ekspresja genów
miozyna
jądro
jąderko
polimeraza
transkrypcja
Opis:
Aktyna i miozyna to białka kojarzone przede wszystkim z ich kluczową rolą w generacji skurczu mięśni. Natomiast poza izoformami charakterystycznymi dla mięśni są również izoformy aktyny i miozyny, które występują we wszystkich typach komórek i tkanek (patrz artykuł Suszek i współaut. w tym zeszycie KOSMOSU). Badania prowadzone w ostatnich dwóch dekadach wykazały niezbicie, że zarówno aktyna (i szereg białek wiążących aktynę) oraz liczne miozyny (przedstawiciele rodzin I, II, V, VI, XVI i XVIII) lokalizują się w jądrze komórkowym gdzie są zaangażowane w procesy transkrypcji i naprawy DNA, transport w nukleoplazmie oraz import i eksport jądrowy, a także w utrzymywanie architektury jądra. Niniejszy artykuł opisuje dotychczasowy stan wiedzy o roli układu akto-miozynowego w jądrze komórkowym.
Actin and myosins are the proteins mainly known from their key roles in muscle contraction. However, besides typical muscle isoforms there are actins and myosins that are present in all cell and tissue types. Studies performed within the last two decades have irrefutably shown that both the cytoplasmic actin isoforms (along with numerous actin-binding proteins) as well as many myosins (representing class I, II, V, VI, XVI and XVIII) are present within the nucleus. They play important roles in nuclear processes as they are involved in transcription and DNA repair, intranuclear transport as well as nuclear import and export, and in maintenance of nuclear architecture. This article describes the current knowledge on the acto-myosin system in this biggest cellular compartment.
Źródło:
Kosmos; 2018, 67, 1; 75-93
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
An evaluation of the genetic conditioning of evoking pain
Autorzy:
Pacian, A.B.
Kocki, J.
Pacian, J.
Kaczoruk, M.
Bylina, M.
Kaczor-Szkodny, P.
Galińska, E.M.
Kulik, T.
Panasiuk, L.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2085535.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
genetics
chronic pain
genes expression
DRD1 gene
molecular research
Opis:
Introduction and objective. Pain is an integral element of the pathogenic process and sometimes determines its course. Disorders in pain sensation, as well as its lack, the pain threshold, and variability in sensation of the same pain stimuli as more or less intensive by different persons, may be genetically conditioned. The aim of the study is to examine genes in pathogenesis of chronic pain. Materials and method. The study was conducted in a specially selected group of 31 persons: study group – 20 patients with chronic pain, and control group – 11 healthy individuals who did not experience pain. The control group of 11 healthy persons, compared with the study group, was the catalyst for determining the relative quantification (RQ) of gene expression. Biological material in the form of venous blood was collected from the study participants into the tubes containing anticoagulant EDTA KE/2.7 ml (ethylenediaminetetraacetic acid), preventing extracorporeal blood clotting. Results. Analysis of expression of the examined genes showed over-expression of the DRD1 gene in patients experiencing chronic pain, which means that in these patients an increased number of dopamine D1 receptors encoded by this gene should be expected. The dopamine D1 receptor is a G-protein-coupled receptor which regulates (stimulates or inhibits) adenyl cyclase – the enzyme responsible for synthesis of cyclic AMP (cAMP). An increase in the concentration of cAMP in neurons enhances the sensation of pain. Conclusions. The genes (DRD1, COMT, OPRK1, HCN2) have a significant role in the pathogenesis of chronic pain in various diseases; they can also influence the perception of pain. Knowledge of these genes can contribute to the development of effective methods of combating pain.
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2020, 27, 2; 274-278
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
An Extension of TSP-family Algorithms for Microarray Classification
Rozszerzenie metod z rodziny TSP w klasyfikacji mikromacierzy DNA
Autorzy:
Czajkowski, M.
Krętowski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/341039.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Politechnika Białostocka. Oficyna Wydawnicza Politechniki Białostockiej
Tematy:
klasyfikacja par genów zależnych
analiza mikromacierzy
reguły decyzyjne
ekspresja genów
pairwise classification
decision rules
microarray
gene expression
Opis:
Classification of microarray data and generation of simple and efficient decision rules may be successfully performed with Top Scoring Pair algorithms. TSP-family methods are based on pairwise comparisons of gene expression values. This paper presents a new method, referred as Linked TSP that extends previous approaches kˇTSP and Weight kˇTSP algorithms by linking top pairwise mRNA comparisons of gene expressions in different classes. Opposite to existing TSP-family classifiers, the proposed approach creates decision rules involving single genes that most frequently appeared in top scoring pairs. Motivation of this paper is to improve classification accuracy results and to extract simple, readily interpretable rules providing biological insight as to how classification is performed. Experimental validation was performed on several human microarray datasets and obtained results are promising.
Klasyfikacja danych mikromacierzowych a także późniejsza interpretacja reguł decyzyjnych może być skutecznie przeprowadzona za pomocą metod z rodziny Top Scoring Pair, polegających na analizie par genow o przeciwstawych poziomach ekspresji w róźnych klasach. W poniższym artykule zaprezentowano nową metodę: Linked TSP, ktora rozszerza działanie klasyfikatorów k-TSP i Weight k-TSP. W przeciwieństwie do algorytmow z rodziny TSP proponowane rozwiązanie tworzy reguły decyzyjne zbudowane z pojedynczych genów, co znacznie ułatwia ich późniejszą interpretację medyczną. W algorytmie wykorzystywane są pary genow uzyskane z algorytmow TSP z których następnie, wybierane są pojedyncze, najczęściej powtarzające się geny. Testy algorytmu Linked TSP przeprowadzone zostająy na rzeczywistych zbiorach danych pacjentow a uzyskane wyniki są obiecujące.
Źródło:
Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka; 2009, 4; 31-45
1644-0331
Pojawia się w:
Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
An introduction to DNA chips: principles, technology, applications and analysis.
Autorzy:
Gabig, Magdalena
Węgrzyn, Grzegorz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044090.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
gene expression
DNA array
oligonucleotide array
hybridisation
Opis:
This review describes the recently developed GeneChip technology that provides efficient access to genetic information using miniaturised, high-density arrays of DNA or oligonucleotide probes. Such microarrays are powerful tools to study the molecular basis of interactions on a scale that would be impossible using conventional analysis. The recent development of the microarray technology has greatly accelerated the investigation of gene regulation. Arrays are mostly used to identify which genes are turned on or off in a cell or tissue, and also to evaluate the extent of a gene's expression under various conditions. Indeed, this technology has been successfully applied to investigate simultaneous expression of many thousands of genes and to the detection of mutations or polymorphisms, as well as for their mapping and sequencing.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 3; 615-622
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies