- Tytuł:
-
Przygotowanie populacji mapującej uzyskanej ze skrzyżowania odmian ‘Elsanta’ i ‘Senga Sengana’ dla analizy regionów QTL sprzężonych z wybranymi cechami użytkowymi gatunku Fragaria.
Preparation of the mapping population derived from the cross of ‘Elsanta’and ‘Senga Sengana’ sutble for analysis of QTL regions linked to selected Fragaria traits. - Autorzy:
-
Keller-Przybyłkowicz, Sylwia
Masny, Agnieszka
Idczak, Bogusława
Strączyńska, Krystyna
Mostafa Abdelwahab Mohamed, Abdelrahmen - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/2199251.pdf
- Data publikacji:
- 2020-12-09
- Wydawca:
- Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
- Tematy:
-
allele heterozygotyczne
genom Fragaria
mapa genetyczna
SSR
Fragaria genome
genetic map
heterozygous alleles - Opis:
-
Celem przeprowadzonych badań było przygotowanie populacji mapującej uzyskanej w wyniku skrzyżowaniaodmian ‘Elsanta’ i ‘Senga Sengana’, przydatnej do badań genotypowo-fenotypowych, poprzedzonych porządzeniem ‘szkieletu’ mapy genetycznej. Pierwszym etapem badań była ocena molekularna roślin form rodzicielskich pod kątem stopnia polimorfizmu genetycznego. Na postawie analizy wytypowanych 450 markerów SSR w genomie odmiany ‘Elsanta’ zidentyfikowano łącznie 418 alleli polimorficznych, natomiast w genomie odminay ‘Senga Sengana’ – 337 alleli. Przeprowadzone badania potwierdzają wysoki stopień heterozygotyczności genomów obu wytypowanych do badań odmian.Kolejnym etapem prac była analiza molekularna siewek uzyskanych w wyniku krzyżowania obu heterozygotycznych form rodzicielskich oraz ocena satusu genetycznego genotypów potomnych. Badania te potwierdziły, że w obrębie roślin populacji mapującej ‘Elsanta’ i ‘Senga Sengana’ występują genotypy pochodzące tylko z kontrolowanego zapylenia. Ponadto, analiza segregacji, w populacji mapującej, alleli heterozygotycznych, zidentyfkowanych w genomach form rodzicielskich, umożliwiła sporządzenie szkieltu zintegrowanej mapy obu badanych genomów truskawki. Wstępna mapa genetyczna, do sporządzenia której zastosowano wybranych 44 polimorficznych markerów SSR, zawiera łącznie 27 grup sprzężeń, na których zidentyfikowano loci 53 alleli polimorficznych, pokrywających 1 033 cM genomu truskawki. W wyniku przeprowadzonych testów potwierdzono, że uzyskana populacja stanowi wartościowy materiał do badań związanych z opracowaniem mapy genetycznej truskawki. Ponadto, sporządzony ‘szkielet’ mapy ‘Elsanta’ × ‘Senga Sengana’ poszerza bazę do dalszej lokalizacji genów i identyfikacji regionów QTL sprzężonych z ważnymi cechami użytkowymi truskawki.
The aim of the study was to generate a mapping population derived from an 'Elsanta' and ‘Senga Sengana’ cross, so as to be useful for genotypic-phenotypic studies, and subsequently, to construct a 'skeleton' of the strawberry genetic map.The first stage of the research was based on molecular assessment of parental plants for genetic polymorphism. After analysis of 450 selected SSR markers, 418 polymorphic alleles were identified in the genome of the 'Elsanta', and 337 alleles in the genome of the 'Senga Sengana'. The study confirms the high degree of genetic heterozygosity of both of the strawberry varieties. In the next stage of the work, molecular analysis of seedlings resulted from the cross of the heterozygous parental forms, as well as the confirmation of genetic status of hybrid genotypes were conducted. These studies confirm that the origin of the prepared mapping population was the result of the controlled pollination. Moreover, segregation of heterozygous alleles in the mapping population enabled the preparation of the 'skeleton' of an integrated map of 'Elsanta' x 'Senga Sengana'. Herein, the initial genetic map was found to contain 27 linkage groups representing the loci of 53 polymorphic allele, covering 1 033 cM of the strawberry genome. Generally, as a result of the tests, we confirmed that the obtained population represents valuable material for research related to the development of a strawberry genetic map. Additionally, the 'skeleton' of 'Elsanta' x 'Senga Sengana' genetic map enlarged the database for further gene localization and for identifying QTL regions linked to important strawberry traits. - Źródło:
-
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 291; 3-19
0373-7837
2657-8913 - Pojawia się w:
- Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł