Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "Real time PCR" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 46
Tytuł:
PCR and real-time PCR assays to detect fungi of Alternaria alternata species
Autorzy:
Kordalewska, Milena
Brillowska-Dąbrowska, Anna
Jagielski, Tomasz
Dworecka-Kaszak, Bożena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038891.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Alternaria alternata
detection
identification
PCR
real-time PCR
Opis:
Fungi of the Alternaria genus are mostly associated with allergic diseases. However, with a growing number of immunocompromised patients, these fungi, with A. alternata being the most prevalent one, are increasingly recognized as etiological agents of infections (phaeohyphomycoses) in humans. Nowadays, identification of Alternaria spp. requires their pure culture and is solely based on morphological criteria. Clinically, Alternaria infections may be indistinguishable from other fungal diseases. Therefore, a diagnostic result is often delayed or even not achieved at all. In this paper we present easy to perform and interpret PCR and real-time PCR assays enabling detection of A. alternata species. On the basis of alignment of β-tubulin gene sequences, A. alternata-specific primers were designed. DNA from fungal isolates, extracted in a two-step procedure, were used in PCR and real-time PCR assays followed by electrophoresis or melting temperature analysis, respectively. The assays specificity was confirmed, since positive results were obtained for all A. alternata isolates, and no positive results were obtained neither for other molds, dermatophytes, yeast-like fungi, nor human DNA. The assays developed here enable fast and unambiguous identification of A. alternata pathogens.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 4; 707-712
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analizatory DNA/PCR typu lab-chip z detekcją fluorymetryczną
Lab-on-a-chip DNA/PCR analyzers with fluorometric detection
Autorzy:
Walczak, R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/154783.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich
Tematy:
real-time PCR
lab-chip
fluorescencja
fluorescence
Opis:
W artykule przedstawiono przegląd analizatorów DNA wykorzystujących technikę real-time PCR i lab-chipy. Zaprezentowano opis opracowanej metodologii i instrumentarium do detekcji fluorescencji z wykorzystaniem miniaturowych komponentów optoelektronicznych i "inteligentnego" oprogramowania analizującego. Przedstawiono dwa przykłady miniaturowych analizatorów real-time PCR/DNA opracowanych w ramach projektów europejskich i krajowych wykorzystujących lab-chipy i nowatorską metodę detekcji fluorymetrycznej.
The paper presents a novel miniaturized optical instrumentation for fluorescence excitation and detection for miniaturized real-time PCR analyzers using lab-on-a-chip (LOC) devices. Application of miniaturized semiconductor laser to fluorescence excitation, CCD-minicamera as fluorescence photodetector and specialized software for optical signal conditioning led to development of low-cost and highly sensitive optical instrumentation. To carry out full characterization of the optical instrumentation, miniaturized thermocycler co-working with LOC was built. The optical instrumentation was tested with three LOC made of different materials and technologies, giving proper detection of fluorescence signals during real-time PCR. Finally, two miniaturized devices for real-time PCR detection and identification of DNA and utilizing described here novel optical instrumentation were briefly described. The scheme and technical realization of the novel instrumentation in laboratory version is shown in Fig. 4. The detection limit of DNA was about 0,1 ng/ml (Fig. 5). It was also found that the optical instrumentation co-works with different constructions of lab-on-a-chips for DNA real-time PCR amplification (Fig. 6). The developed optical instrumentation was successfully applied to two miniaturized devices for DNA detection and identification by real-time PCR. Technical realizations of the devices and views of the lab-on-a-chips are shown in Figs. 7 and 9. In both cases, proper detection of fluorescence signals generated during real-time PCR of Campylobacter j. DNA (Fig. 8) or complementary DNA (Fig. 10) were observed. It confirmed high sensitivity of the developed optical instrumentation.
Źródło:
Pomiary Automatyka Kontrola; 2010, R. 56, nr 7, 7; 805-808
0032-4140
Pojawia się w:
Pomiary Automatyka Kontrola
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Development of TaqMan-based real-time PCR assay based on the E1 genefor the quantitative detection of the Getah virus
Autorzy:
Lin, A.
Hu, X.
Cui, S.
Yang, T.
Zhang, Z.
Li, P.
Guo, M.
Lu, Y.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16647453.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
Getah virus
real-time PCR
TaqMan
detection
Opis:
To develop a sensitive, specific, and rapid approach for the detection Getah virus (GETV), a set of primers targeting the conserved region of the E1 gene was created. The TaqMan-based real-time PCR method for GETV detection was developed by optimizing the reaction conditions. The method demonstrated excellent specificity, and amplification did not occur with the causative agents of all prevalent swine viral infections (CSFV, PRRSV, PRV, PEDV, PTV, and JEV), except GETV. Additionally, upon assessing the sensitivity of the method, the minimum detection limit for GETV was found to be 5.94 copies/μL, which is 10 times higher than that of the traditional PCR approach. Further, the intra- and inter-assay variation coefficients were less than 1%, demonstrating good repeatability. Moreover, GETV was found in 10 of the 20 field serum samples using real-time PCR but only in three of the samples using traditional PCR. Consequently, the first GETV TaqMan-based real-time PCR approach based on the E1 gene was developed for GETV pathogenic diagnoses, and this exhibited high specificity, sensitivity, and repeatability. This assay is practical for the pathogenic diagnosis and epidemiology of GETV.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2023, 26, 1; 21-28
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Evaluation of the activity of thermostable DNA polymerases in the presence of heme, as a key inhibitor in the real time PCR method in diagnostics of sepsis
Autorzy:
Gosiewski, Tomasz
Brzychczy-Włoch, Monika
Pietrzyk, Agata
Sroka, Agnieszka
Bulanda, Małgorzata
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039451.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
polymerase inhibitor
heme
real time PCR
sepsis
Opis:
The study aim was evaluation of the usefulness of several thermostable DNA polymerases in real time PCR conducted in the presence of the heme. Our study had the advantage of testing several different polymerases, one of which proved to be the least sensitive to heme activity. We also found that there is no need of supplementing the reaction mixture with protective substances like BSA. Selection of the appropriate polymerase can increase the efficiency of the PCR reaction which is very important for diagnosis of sepsis and for other analyses performed on DNA template isolated from the blood.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2013, 60, 4; 603-606
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Anticancer activity of new molecular hybrids combining 1,4-naphthalenedione motif with phosphonic acid moiety in hepatocellular carcinoma HepG2 cells
Autorzy:
Długosz, Angelika
Gach, Katarzyna
Szymański, Jacek
Modranka, Jakub
Janecki, Tomasz
Janecka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038683.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
MTT test
apoptosis
real-time PCR
flow cytometry
Opis:
Structural motifs found in naturally occurring compounds are frequently used by researchers to develop novel synthetic drug candidates. Some of these new agents are hybrid molecules which are designed through a concept of combining more than one functional element. In this report, anticancer activity of new synthetic molecular hybrids, substituted 3-diethoxyphosphorylnaphtho[2,3-b]furan-4,9-diones and 3-diethoxyphosphorylbenzo[f]indole-4,9-diones, which integrate natural 1,4-naphtalenedione scaffold, present in several anticancer agents, with pharmacophoric phosphonate moiety, were tested against hepatocellular cell line HepG2. Cytotoxicity was examined using MTT assay. Two most potent compounds, furandione 8a and benzoindoldione 12a, which reduced the number of viable HepG2 cells with the IC50 values of 4.13 µM and 5.9 µM, respectively, were selected for further research. These compounds decreased the mRNA expression levels of several genes: Bcl-2, angiogenic vascular endothelial growth factor (VEGF), c-Fos, caspase-8 and increased the expression of Bax, caspase-3 and -9, c-Jun, p21, p53, as determined by quantitative real-time PCR. The ability of these compounds to induce apoptosis and DNA damage was studied by flow cytometry. The obtained data showed that the new compounds inhibited cell viability by increasing apoptosis and decreasing angiogenesis. Compound 8a was a much stronger apoptosis inducer as compared with 12a and strongly activated the intrinsic pathway of apoptosis, associated with the loss of mitochondrial membrane potential and changes in Bax/Bcl-2 ratio. These findings show that the synthetic hybrids combining 1,4-naphthalenedione system and phosphonic acid moiety display potential to be further explored in the development of new anticancer agents.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2017, 64, 1; 41-48
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metoda PCR w ocenie zafałszowań składu surowcowego produktów mięsnych ze strusia (Struthio camelus)
The pCR method in the assessment authenticity of meat products from ostrich (Struthio camelus)
Autorzy:
Sawicki, W.
Zych, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2130220.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Technologów Żywności
Tematy:
mięso strusia
identyfikacja
zafałszowania żywności
real-time PCR
Opis:
Poprawne znakowanie mięsa pozwalające konsumentowi świadomie wybrać jego rodzaj jest istotne z wielu względów – od zdrowotnych po religijne. Ponadto ze względu na różnice cen i dostępność surow- ców mięsnych pochodzących z różnych gatunków zwierząt zdarzają się przypadki fałszowania żywności. Składniki wyrobów mięsnych są wykorzystywane nieadekwatnie do informacji podanej na etykiecie. Niezgodności dotyczą zarówno użytych surowców, jak i ich zawartości w produkcie mięsnym. Mięso o wysokiej jakości zastępuje się tańszym lub jego zawartość jest mniejsza od deklarowanej. Choć obowią- zują przepisy dotyczące znakowania przetworzonych produktów mięsnych, zdarzają się przypadki wystę- powania na rynku wyrobów mięsnych zafałszowanych. W niniejszych badaniach podjęto się opracowania procedury weryfikacji autentyczności wyrobów z mięsa strusia czerwonoskórego (Struthio camelus). Zaproponowano metodę wykorzystującą technikę real-time PCR. Jak wykazano, DNA jest wystarczająco stabilne, aby wytrzymać zróżnicowaną obróbkę technologiczną. Badania prowadzono z użyciem wyrobów modelowych oraz wyrobów mięsnych (kiełbas, steków, mięsa gulaszowego) zakupionych w handlu deta- licznym. Próbki były analizowane pod względem obecności niedeklarowanych gatunków mięsa (wie- przowiny, wołowiny, mięsa z kurcząt, kaczek i gęsi) z wykorzystaniem gatunkowo specyficznych starte- rów. Na podstawie otrzymanych wyników wykazano, że opracowana procedura identyfikacji mięsa strusia może być z powodzeniem stosowana w rutynowych kontrolach, zarówno jakościowych (wykluczenie danego gatunku), jak i ilościowych (oznaczenie udziału mięsa strusia) w tego typu żywności. Wykazano ponadto, że w wyrobach przetworzonych może występować problem niedeklarowanego dodatku mięsa innego niż wskazane na etykiecie.
Źródło:
Żywność Nauka Technologia Jakość; 2019, 26, 2; 32 - 42
1425-6959
Pojawia się w:
Żywność Nauka Technologia Jakość
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Real-time PCR approach in dermatophyte detection and Trichophyton rubrum identification
Autorzy:
Kobylak, Natalia
Bykowska, Barbara
Nowicki, Roman
Brillowska-Dąbrowska, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039146.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
fungal infections
dermatophytosis
DNA extraction
real-time PCR
Opis:
Dermatophytes are keratinophilic molds that infect human hair, nails and skin. Diagnosis of dermatophytosis is based on morphological, serological and biochemical features. However, identification is difficult and laborious due to similarities between microorganisms. Thus, there is considerable interest to develop mycological diagnostic procedures based on molecular biology methods. In this study, fast, two-step DNA extraction method and real-time PCR was used for detection of dermatophytes DNA using pan-dermatophyte primers and identification of Trichophyton rubrum from pure cultures. The applied method allowed correct detection of all dermatophytes and correct identification of Trichophyton rubrum in less than 2 hours.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 1; 119-122
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Fusarium species and Fusarium mycotoxins in grain of barley in Poland in 2009 and 2010. Short communication
Gatunki Fusarium oraz toksyny fuzaryjne w ziarnie jęczmienia w Polsce w 2009 i 2010r. Komunikat
Autorzy:
Góral, Tomasz
Ochodzki, Piotr
Kærgaard Nielsen, Linda
Walentyn-Góral, Dorota
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199480.pdf
Data publikacji:
2020-02-12
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
DNA
Fusarium
jęczmień
real-time PCR
trichoteceny
barley
trichothecenes
Opis:
Grain samples of spring barley from the 2009 and 2010 harvest were analysed for the content of DNA of Fusarium species and Fusarium toxins (type B trichothecenes). Samples originated from different fields in Radzików, Central Poland. Qualitative and quantitative determination of Fusarium species in the grain was performed using a real-time PCR. Fusarium toxins in the grain were analysed by gas chromatography. Seven Fusarium species were detected in barley grain. The dominating species were F. avenaceum, F. graminearum and F. poae. The presence of F. culmorum, F. langsethiae, F. sporotrichioides and F. tricinctum was also detected. The concentration of trichothecene toxins in grain (deoxynivalenol, nivalenol) was low. The highest correlation coefficient of deoxynivalenol vs. Fusarium DNA was found for F. graminearum. Regarding nivalenol, the highest correlation coefficient was with F. poae DNA.  
Próby ziarna jęczmienia jarego ze zbiorów w 2009 i 2010r. zostały przeanalizowane pod kątem zawartości DNA gatunków Fusarium i toksyn fuzaryjnych (trichotecenów B). Próbki pochodziły z różnych pól z Radzikowa, w środkowej Polsce. Jakościowe i ilościowe oznaczanie gatunków Fusarium w ziarnie przeprowadzono techniką real-time PCR. Toksyny fuzaryjne w ziarnie analizowano metodą chromatografii gazowej. W ziarnie jęczmienia wykryto siedem gatunków Fusarium. Dominujące gatunki to F. avenaceum, F. graminearum i F. poae. Wykryto również występowanie F. culmorum, F. langsethiae, F. sporotrichioides i F. tricinctum. Stężenie trichotecenów B (deoksyniwalenolu, niwalenolu) w ziarnie było niskie. Najwyższy współczynnik korelacji deoksyniwalenol vs. DNA Fusarium stwierdzono dla F. graminearum. Jeśli chodzi o niwalenol, najwyższy był współczynnik korelacji z DNA F. poae.  
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 288; 41-46
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Usefulness of real-time PCR in long-term follow-up of follicular lymphoma patients
Autorzy:
Tysarowski, Andrzej
Fabisiewicz, Anna
Paszkiewicz-Kozik, Ewa
Kulik, Jadwiga
Walewski, Jan
Siedlecki, Janusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041125.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
real-time PCR
follicular lymphoma
minimal residual disease
molecular remission
Opis:
The aim of this study was to evaluate the usefulness of quantitative real-time PCR (RQ-PCR) for the monitoring of molecular remission in follicular lymphoma (FL) patients during long-term follow-up. RQ-PCR by the use of TaqMan® detection system is a sensitive tool to monitor minimal residual disease (MRD) in FL through amplification of the t(14;18) fusion gene during and post-therapy. In most cases the breakpoint region occurs within the major breakpoint region (MBR). Among 75 patients diagnosed with FL, cells harboring the fusion gene BCL2/JH were found in peripheral blood of 31 patients (41%). We further monitored 30 of these patients in a period varying from 6 months to 5 years by RQ-PCR. In our study the level indicating the possibility of the presence of MRD was established at more than five t(14;18)-positive cells in the background of 83000 normal cells. The results of this work also confirmed that the presence of MRD detected by RQ-PCR is an indication for careful observation of patients because of a higher risk of disease recurrence.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 1; 135-142
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Cryptosporidiosis outbreak on a dairy farm: Detection of Cryptosporidium parvum as a causative agent in the water source
Autorzy:
Karakavuk, M.
Can, H.
Döşkaya, M.
Karakavuk, T.
Erkunt-Alak, S.
Köseoğlu, A.E.
Gül, A.
Ün, C.
Gürüz, Y.
Değirmenci-Döşkaya, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2087099.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
neonatal calves
Cryptosporidium parvum
diarrhea
Real-time PCR
calf lose
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2021, 24, 3; 323-333
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Development of a SYBR Green I real-time PCR assay for detection of novel porcine parvovirus 7
Autorzy:
Li, Y.D.
Yu, Z.D.
Bai, C.X.
Zhang, D.
Sun, P.
Peng, M.L
Liu, H.
Wang, J.
Wang, Y.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2087207.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Capsid gene
PPV7
SYBR Green I real-time PCR
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2021, 24, 1; 43-49
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
TaqMan real-time PCR for detecting bovine viral diarrhea virus
Autorzy:
Liang, H.
Geng, J.
Bai, S.
Aimuguri, A.
Gong, Z.
Feng, R.
Shen, X.
Wei, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2087557.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
bovine viral diarrhea virus
quantitative real time PCR
TaqMan probe
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2019, 2; 405-413
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Presence of Coxiella burnetii in dairy cattle and farms in the Czech Republic
Autorzy:
Dobos, A.
Fodor, I.
Tekin, T.
Đuričić, D.
Samardzija, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16539155.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
Q fever
surveillance
ELISA
real-time PCR
bulk tank milk
Opis:
The aims of this study were to evaluate the prevalence of Coxiella burnetii on both herd and animal level based on ELISA and PCR tests. Antibodies to C. burnetii were detected in 22 out of the 24 bulk tank milk samples (91.6%) tested by ELISA and the IS1111 element of C. burnetii was detected in 10 out of the 24 samples (41.6%) by real-time polymerase chain reaction (PCR). ELISA testing showed individual seropositivity in 67 out of the 165 cows (40.6%) examined in 24 dairy cattle farms in different parts of the Czech Republic. Our study revealed that the prevalence of C. burnetii has increased substantially in the Czech Republic over the past 30 years, and that the causative agent is a potential risk factor for some reproductive problems in dairy farms and a possible risk factor for human infection.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2022, 25, 2; 231-235
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Optimization of flotation, DNA extraction and PCR methods for detection of Toxoplasma gondii oocysts in cat faeces
Autorzy:
Sroka, J.
Karamon, J.
Dutkiewicz, J.
Wójcik-Fatla, A.
Cencek, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2081971.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
flotation
Toxoplasma gondii
faeces
Real time PCR
nested PCR
cats
oocysts detection
Opis:
Introduction and objective. The aim of the study was to compare the effectiveness of selected oocysts concentration methods, DNA extraction protocols and PCR assays targeting the B1 gene, for the development of procedures which would be effective and useful in laboratory practice for the detection of T. gondii in faecal samples from cats. Materials and method. In order to compare the influence of the flotation fluids on microscopy and PCR detection of T. gondii, saturated solutions of saccharose, MgSO4, ZnSO4 and NaNO3 were used. To determine the sensitivity of PCR tests used: Real time PCR (RT) and nested PCR, water samples spiked with T. gondii tachyzoites and oocysts were tested. DNA was extracted using DNeasy Blood and Tissue Kit (Qiagen) (K1). The same PCR tests were used to assess the efficacy of T. gondii DNA detection in samples of cat faeces spiked with oocysts, using DNA extraction by a K1 set and a K2 set (QIamp DNA Stool Mini Kit, (Qiagen). Results. The initial results showed that NaNO3 was most useful as a flotation fluid due to the lack negative effect on the oocysts and amplification efficacy in PCR. The level of detection for water samples (100 μl) was determined as 100 tachyzoites and 1–50 oocysts in RT, and 2–20 oocysts in nested PCR. The limit of detection (LD) for stool samples (250 mg) spiked with oocysts, where the K1 set was used, determined as 250 and 5 oocysts in RT and nested PCR, respectively. For samples extracted with the K2 set, LD in RT was determined as 1–50 oocysts (depending on the variant) and 50 oocysts in nested PCR. Conclusions. The most effective methods for detection of T. gondii in cat faeces seem to be centrifugal flotation with NaNO3, followed by DNA extraction with removing of inhibitors (K2 set) and Real Time PCR targeting B1 gene.
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2018, 25, 4; 680-685
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Physical state of human papillomavirus type 16 in cervical intraepithelial lesions and cancers determined by two different quantitative real-time PCR methods
Autorzy:
Szostek, Slawa
Biesaga, Beata
Zawilinska, Barbara
Klimek, Malgorzata
Kosz-Vnenchak, Magdalena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038944.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
real-time PCR
human papillomavirus
squamous intraepithelial lesions
cervical carcinoma
Opis:
The aim of this study was to analyse the correlation between a new multiplex qPCR assay and a reference qPCR assay for assessment of the human papillomavirus (HPV16) load and the viral genome status. The study was performed on 100 HPV16 positive samples containing premalignant lesions and carcinomas. HPV16 E2 and E6 gene loads were assessed by two PCR methods. The load of E2 and E6 was normalized to the cell number by qPCR targeting the RNase P open reading frame. The physical state of the viral genome was determined as a ratio of E2/E6 copies number per cell. Among 100 samples analysed, there were no statistically significant differences in the E2 and E6 viral load evaluated by multiplex qPCR and qPCR, the correlation coefficients were 0.98 and 0.97, respectively. There were 19% of samples with the integrated, 73% with mixed and 8% with episomal state of viral genome detected by multiplex qPCR and 17%, 79%, 4%, respectively, found by qPCR. Prevalence of integrated and episomal forms estimated by multiplex qPCR was higher than the one obtained by qPCR (Chi2, p < 0.0001), but in samples with premalignant and malignant diagnoses no significant differences were demonstrated regardless of the methods used. Sensitivity and specificity of multiplex qPCR were 93.7% and 100% as compared with qPCR, the positive predictive value was 100%. In summary, the multiplex qPCR assay in respect of HPV16 load and the frequency of viral genome status was shown to be a sensitive and specific reference method. Simultaneous estimation of E2 and E6 genes in one reaction tube reduces the cost of testing.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 4; 923-928
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 46

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies