Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "MALDI-TOF mass spectrometry" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-8 z 8
Tytuł:
Construction and verification of mathematical model of mass spectrometry data
Konstrukcja i weryfikacja matematycznego modelu danych widm masowych
Autorzy:
Plechawska-Wójcik, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/408752.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Politechnika Lubelska. Wydawnictwo Politechniki Lubelskiej
Tematy:
Maldi-Tof mass spectrometry
Gaussians
Gaussian mixture models
SVM-RFE classification
spektrometria masowa Maldi-Tof
rozkłady Gaussa
mieszaniny rozkładów Gaussa
klasyfikacja SVM-RFE
Opis:
The article presents issues concerning construction, adjustment and implementation of mass spectrometry mathematical model based on Gaussians and Mixture Models and the mean spectrum. This task is essential to the analysis and it needs specification of many parameters of the model.
Artykuł przedstawia kwestie związane z konstrukcją, dopasowaniem i implementacją modelu matematycznego widm masowych opartego o rozkłady normalne i mieszaniny rozkładów oraz o widmo średnie. To zadanie jest kluczowe dla analizy, wymaga też określenia wielu parametrów modelu.
Źródło:
Informatyka, Automatyka, Pomiary w Gospodarce i Ochronie Środowiska; 2013, 1; 9-14
2083-0157
2391-6761
Pojawia się w:
Informatyka, Automatyka, Pomiary w Gospodarce i Ochronie Środowiska
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Advanced methods of bacteriological identification in a clinical microbiology laboratory
Autorzy:
Zukowska, M.E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2098275.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
clinical microbiology
molecular method
modern method
multiplex polymerase chain reaction
real-time polymerase chain reaction
next generation sequencing
MALDI-TOF mass spectrometry
Opis:
Introduction and objective. Conventional, culture-based methods of bacterial identification and drug-susceptibility testing are considered the gold standard in medical microbiology. In recent years, classical microbiological methods have been supplemented with modern analytical and molecular methods. The aim of the review was to discusses the methods which have been permanently adapted to bacteriological microbiological diagnostics. Abbreviated description of the state of knowledge. Currently, PCR, as well as other nucleic acid amplification tests and sequencing techniques, are part of the standard repertoire of microbiological diagnostics. With regard to the quality and speed of pathogen identification, the introduction of mass spectrometry techniques into routine microbiological diagnostics work-up has been revolutionary. Within a short time in many laboratories, Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionisation – Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI TOF MS) systems have almost completely replaced conventional biochemical pathogen identification. Conclusions. Microbiological diagnostics is an indispensable element of a targeted therapy. The techniques used in the laboratory depend primarily on the laboratory’s apparatus, the costs of the analysis, as well as the sensitivity and specificity of a method. However, regardless of the culture-based methods universality, advanced techniques have permanently established themselves in diagnostics. Confident information about the detected organism and treatment possibilities in a combination with the clinical context are conducive to successful therapy. Although modern methods still require validation and close collaboration between clinicians, microbiologists and bioinformaticians, these methods, once deemed to be the future, have already arrived.
Źródło:
Journal of Pre-Clinical and Clinical Research; 2021, 15, 2; 68-72
1898-2395
Pojawia się w:
Journal of Pre-Clinical and Clinical Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of a CAPA-PVK [Ixori-PVK] from single cells of the gulf Gulf Coast tick, Amblyomma maculatum
Autorzy:
Neupert, S.
Russell, W.K.
Russell, D.H.
Strey, O.F.
Teel, P.D.
Strey, A.
Nachman, R.J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/55404.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Przemysłu Organicznego
Tematy:
diuresis
MALDI analysis
single cell
periviscerokinin
Boophilus microplus
Ixodidae
immunocytochemistry
Gulf Coast tick
amino acid sequence
MALDI-TOF mass spectrometry
neurohormone
Ixodes ricinus
Amblyomma maculatum
Opis:
MALDI-TOF/TOF tandem mass spectrometry has been applied to determine the complete sequence of a CAPA-PVK in the Gulf Coast tick, Amblyomma maculatum. Single cell analysis allowed the identification of the amino acid sequence of Ixori-PVK (PALIPFPRV-NH2), a periviscerokinin which had previously been identified from two other ticks, Ixodes ricinus and Boophilus microplus. The identification indicates greater conservation of sequence for the CAPA-PVK/CAP2b family in ticks as compared with insects. Side-chain fragmentation experiments provided data to distinguish between Leu/Ile ambiguities. The tick CAPA peptide shows a high sequence homology with other members of the insect periviscerokinin/ CAP2b peptides, which are associated with the regulation of critical physiological processes such as diuresis. Thus, the identification of this neuropeptide will provide the experimental basis to better understand regulation of water balance in these arthropods, providing a potential opportunity to develop neuropeptide-based control strategies against these livestock pests.
Źródło:
Pestycydy; 2008, 1-2; 67-73
0208-8703
Pojawia się w:
Pestycydy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Method for mass spectrometry spectrum deisotoping based on fuzzy inference systems
Autorzy:
Glodek, Anna
Polańska, Joanna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/747419.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Matematyczne
Tematy:
fuzzy logic, fuzzy inference systems, deisotoping, mass spectrometry, algorithms, proteomics, applied mathematics
fuzzy logic, fuzzy inference systems, deisotoping, mass spectrometry, algorithms, MALDI ToF
Opis:
Celem niniejszego artykułu jest omówienie zaproponowanego algorytmu do identyfikacji obwiedni izotopowych, opartego na teorii systemów rozmytych. Obecnie proteomika jest ściśle powiązana z chorobami nowotworowymi. Dlatego też bardzo ważne jest precyzyjne zidentyfikowanie białek znajdujących się w obszarze raka; stosowana jest w tym celu spektrometria masowa. Jedną z technik spektrometrii masowej jest MALDI. Otrzymane dane będące widmem masowym składają się ze stosunku masy do ładunku jonów oraz intensywnosci pików. W celu przetworzenia danych, usunięcia szumu, linii bazowej etc. stosuje się przetwarzanie wstępne. Identyfikacja obwiedni izotopowych jest częścią procesu przetwarzania wstępnego w proteomice. Polega ona na identyfikacji izotopów wchodzących w skład obwiedni izotopowej, a także pozwala na zredukowanie wymiaru danych. Istnieje wiele algorytmów do identyfikacji obwiedni izotopowej, jednak każdy z nich dedykowany jest dla innego rodzaju techniki spektrometrii masowej (MALDI, LC-MS, ESI, etc.) bądź dla konkretnego rodzaju cząsteczek. Dlatego też zaproponowany algorytm został oparty na teorii systemów rozmytych, a reguły wnioskowania zostały oparte na wieloletnich doświadczeniach eksperta w dziedzinie spektrometrii masowej. Przetestowany był on na danych uzyskanych z Instytutu Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie w Gliwicach, pochodzących z badań nad rakiem głowy i szyi dla losowo wybranej grupy peptydów i lipidów. Wyniki autorskiego algorytmu do identyfikacji obwiedni izotopowych porównano z jedną z istniejących metod do identyfikacji obwiedni izotopowych.
Nowadays, mass spectrometry is widely used in proteomics for confident and precise identification of the protein. One of the most important steps in the signal analysis is deisotoping because some peaks in the spectrum are not the unique compound, but there are members of an isotopic envelope. Although the mass spectrometry is present in proteomics for a long time already, the problem of isotope peaks identification is not solved yet. The existing algorithms, usually designed for the particular type of spectrometer, are semi-supervised and do not give satisfactory results. We propose a new algorithm based on fuzzy inference systems that can accurately identify the isotopic envelopes in the spectrum of the complex structure.
Źródło:
Mathematica Applicanda; 2018, 46, 1
1730-2668
2299-4009
Pojawia się w:
Mathematica Applicanda
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Desorption/ionization on silicon for small molecules: a promising alternative to MALDI TOF.
Autorzy:
Kraj, Agnieszka
Dylag, Tomasz
Gorecka-Drzazga, Anna
Bargiel, Sylwester
Dziuban, Jan
Silberring, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043452.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
proteomics
porous silicon
catecholamines
peptides
DIOS
mass spectrometry
desorption/ionization
MALDI TOF
Opis:
A method has been developed for laser desorption/ionization of catecholamines from porous silicon. This methodology is particularly attractive for analysis of small molecules. MALDI TOF mass spectrometry, although a very sensitive technique, utilizes matrices that need to be mixed with the sample prior to their analysis. Each matrix produces its own background, particularly in the low-molecular mass region. Therefore, detection and identification of molecules below 400 Da can be difficult. Desorption/ionization of samples deposited on porous silicon does not require addition of a matrix, thus, spectra in the low-molecular mass region can be clearly readable. Here, we describe a method for the analysis of catecholamines. While MALDI TOF is superior for proteomics/peptidomics, desorption/ionization from porous silicon can extend the operating range of a mass spectrometer for studies on metabolomics (small organic molecules and their metabolites, such as chemical neurotransmitters, prostaglandins, steroids, etc.).
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2003, 50, 3; 783-787
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Maldi – metoda do zastosowań w analizie strukturalnej polimerów
Maldi – method for use in structural analysis of polymers
Autorzy:
Swinarew, B.
Swinarew, A. S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/171598.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
polimery
spektrometria mas z jonizacją laserową wspomaganą matrycą
MALDI-TOF
kopolimery
degradacja polimeru
polymers
matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry
MALDI-TOF MS
copolymers
polymer degradation
Opis:
Polymers as one of the fastest growing groups of widespread use of synthetic materials are characterized by a great diversity of structures. Structural characterization of polymers generally includes: an assessment of the average molecular weight (Mn) and the molar mass distribution (PD) to determine the structure of repeating units (mers) sequence analysis of the copolymer, identification of the end groups, the detection and identification of contaminants and substances present in the composition of the polymer asa dopant. Modern mass spectrometry (MS) offers the opportunity to study the smallest structural details of macromolecular materials [1–10]. Because of the variety of potential structures of polymer analysis process is to answer a few questions by a certain pattern. The first step is to determine the chemical structure of the polymer backbone. The second step is to identify whether the chains have branching points and define the degree of branching. The third important step is to correct end groups identification, also for the detection of cyclic oligomers that can be present. The structural studies can be made by mass spectrometer using reflectron mode. In the essence, the method involves three steps. The first analysis is performed with standard mass spectrum of the sample. Then the precursor ion (parent ion) is selected, which is subjected to further analysis by MS changed voltages and reflectron mode. This paper aims to present the issues related to the detailed analysis and characterization of polymeric materials produced on a large scale. Before, for materials such as poly(propylene), poly(ethylene), poly(styrene), polycarbonate, etc., increasing demands on the mechanical and technological parameters were placed. Maintaining a high level of products is associated with a very rigorous process control of the manufacturing, processing and transportation at every stage. The optimal tool for the structural characteristics of these polymeric materials is the defense technique MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time- -Of-Flight Mass Spectrometer) due to its versatility, speed and extremely high precision. Below, we present some aspects of MALDI MS analysis of polymeric materials and composites. Note, that the following literature review focuses on the recent developments in the field of preparation of the samples, to achieve high mass resolution, the identification of polymers and copolymers, the accuracy of the molar mass determination and the identification of functional end groups, sequence analysis of the copolymer.
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2014, 68, 7-8; 645-660
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The application of MALDI-TOF MS for dermatophyte identification
Autorzy:
Dabrowska, I.
Dworecka-Kaszak, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/6182.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
application
MALDI-TOF MS zob.matrix-assisted laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry
matrix-assisted laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry
dermatophyte
identification
detection
fungi
mammal
skin disease
hair
nail
Opis:
Dermatophytes are keratinolytic fungi responsible for a wide variety of diseases of the skin, nails and hair of mammals. Their identification is often complicated, labor-intensive and time consuming due to the high degree of intra-species morphological similarity, and also requires scientific knowledge and practice. The aim of this study was to demonstrate that MALDI-TOF MS technique may be a faster and more sophisticated method useful for the identification of dermatophytes and mycoses in general.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2014, 60, 3
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analiza syntetycznych polimerów biodegradowalnych metodą spekrometrii mas z udziałem matrycy (MALDI-TOF) kontra pomiary za pomocą wzmocnienia laserowej desorpcji/jonizacji (ELDI-TOF) z wykorzystaniem parylenu
Analyses of synthetic biodegradable polymers by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) versus enhanced laser desorption/ionization (ELDI-TOF) mass spectrometry using the parylene surface
Autorzy:
Miksa, B.
Potrzebowski, M. J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/278479.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Inżynierii Materiałów Polimerowych i Barwników
Tematy:
polimer biodegradowalny
polimer syntetyczny
metoda analityczna
metoda spektroskopowa
spektrometria mas
MS
poli(L-laktyd)
PLLA
matryca jonowa
MALDI-TOF
ELDI-TOF
parylen
biodegradable polymer
synthetic polymer
analytical method
spectroscopic method
mass spectrometry
poly(L-lactide)
ionic matrix
parylene
Opis:
Metody spekrometrii mas w tym MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight) umożliwiają analizę mas cząsteczkowych polimerów syntetycznych (w tym biodegradowalnych) przez dobranie matrycy ułatwiającej ich jonizację lub jak w przypadku ELDI (enhanced laser desorption/ionization) w wyniku zastosowania modyfikowanej powierzchni ułatwiającej jonizację próbek. Ciecze jonowe będące solami N,N-diizopropyloetyloaminy (DEA) oraz kwasów: 2,5-dihydroksybenzoesowego (DHB), 3-indoloakrylowego (IAA) oraz 2-(4-hydroxyfenylazo)benzoesowego (HABA) znalazły zastosowanie jako matryce jonowe do wyznaczania ciężarów cząsteczkowych polilaktydów o Mw ≥ 4000 metodą MALDI-TOF. Polimery o niskich masach molowych ≤ 2000 mogą być łatwo analizowane bez udziału matrycy na powierzchni płytki pokrytej parylenem-N (poli(p-ksylylenem), PPX), który ułatwia proces laserowej desorpcji/jonizacji próbki (LDI) eliminując sygnały pochodzące od matrycy, zakłócające analizę widma masowego związków o niskich - zbliżonych do matrycy ciężarach cząsteczkowych. Zastosowanie parylenu-N do pokrywania powierzchni płytek poddanych silnej energii lasera wywołującego jonizację analizowanej próbki, nie powoduje pojawienie się dodatkowych sygnałów wynikających z obecności parylenu w widmie masowym, zakłócających interpretację otrzymanych ciężarów cząsteczkowych polilaktydu.
Mass spectrometry MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight) enables spectral analysis of synthetic biodegradable polymers with the addition of ammonium salts using ionic matrices from N,N-diisopropylethylamine (DEA) and DHB (2,5-dihydroxybenzoic acid), IAA (3-indoleacrylic acid), and HABA (2-(4-hydroxyphenylazo) benzoic acid. However, the MALDI mass spectra of polymers of molecular mass up to 1000 Da are often heavily populated with peaks originating from the matrix and matrix secondary reaction products that introduce noise, making it difficult to interpret peaks in this region of the mass spectrum. Thus, polymers of molecular masses up to a few kDa can be analyzed, without the use of a matrix, by direct laser desorption/ionization (LDI). We used ELDI-TOF (enhanced laser desorption/ionization time-of-flight) for the rapid characterization of molecules directly from the support covered with a thin layer of parylen-N (poly(p-ksylylenes)). Hydrophobic parylen used as a support on the target plate influenced on decreasing the area size of the droplets, thus concentrating the spot including a sample of the polymer.
Źródło:
Przetwórstwo Tworzyw; 2014, [R.] 20, nr 1 (157), 1 (157); 50-55
1429-0472
Pojawia się w:
Przetwórstwo Tworzyw
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-8 z 8

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies