Autor: Cajza, M - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Improved method of isolation of total nucleic acids from hop plants and grapevine before the RT-PCR by addition of polyvinylpolypyrrolidone
Usprawniona metoda izolacji calkowitych kwasow nukleinowych z chmielu i winorosli przez RT-PCR przez dodanie poliwinylopolipirolidonu
Autorzy:: Cajza, M
Folkman, W.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65582.pdf
Data publikacji:: 2003
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: isolation
total nucleic acid
nucleic acid
hop plant
grapevine
RT-PCR method zob.reverse transcription polymerase chain reaction
addition
polyvinylpolypyrrolidone
reverse transcription polymerase chain reaction
polymerase chain reaction
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 2003, 43, 4; 375-380
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Elimination of viruses from the hop and propagation of virus-free plant material in the West Poland
Autorzy:: Cajza, M
Zielinska, L.
Lubik, M.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65709.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: Humulus lupulus
heat therapy
virus
Polska
virus-free plant
meristem
hop
propagation
elimination
plant material
Opis:: The hop (Humulus lupulus L.) is one of the most infected plants by viruses. Preparation of apical meristems in combination with heat therapy was successfuly used for obtaining of virus-free hop plants in various countries in the world. In our experiments we prepared the meristems both before and after the heat therapy. Hop plants regenerated from such meristems were free not only from the thermolabile ILAR-viruses, but in the great number also from the thermostable CARLA - viruses. The method of virus elimination and micropropagation of virus-free plants in vitro, described in this paper, enables to obtain a large number of virus-free plantlets in a short time.
Chmiel (Humulus lupulus L.) należy do roślin uprawnych w największym stopniu porażonych przez wirusy. Wirusy występujące w chmielu mogą powodować znaczne obniżenie masy plonu ( 4-38%) i zawartości alfa-kwasów w szyszkach (18-30%). Stosowane do tej pory metody uwalniania chmielu od wirusów, polegające na regeneracji roślin z merystemów wierzchołkowych albo na regeneracji roślin z merystemów w połączeniu z terapią wysokotemperaturową, pozwalały na skuteczne wyeliminowanie z chmielu wirusów termolabilnych zwłaszcza z grupy ILAR, natomiast wirusy termostabilne z grupy CARLA najczęściej pozostawały w zainfekowanych roślinach. Zmodyfikowana metoda uwalniania chmielu od wirusów różni się od dawniej stosowanych tym, że możliwie najmniejsze merystemy (0,2-0,3 mm) wypreparowywano zarówno przed terapią termiczną, jak również po terapii wysokotemperaturowej. Cięcie oddzielające merystem od reszty regenerującej rośliny przeprowadzano w strefie elongacyjnej (powstającej w trakcie wzrostu w wysokiej temperaturze), która hamuje replikację wirusów i najczęściej jest od tych patogenów wolna. Zastosowana metoda charakteryzowała się dużą śmiertelnością merystemów podczas terapii termicznej (około 70%) i regeneracji roślin, ale była skuteczna w eliminowaniu również termostabilnych wirusów z grupy CARLA w około 80-90%. Opracowane zostały także pożywki do hodowli chmielu in vitro dla różnych etapów hodowli tej rośliny. Skład pożywek został maksymalnie uproszczony (całkowicie usunięto składniki termolabilne z pożywek do masowego klonowania roślin) w celu przyspieszenia i ułatwienia prac związanych z ich przygotowaniem. W wyniku przeprowadzonych prac uwolniono od wirusów następujące odmiany chmielu: Lubelska, Lomik, Izabella, Marynka i Northern Brewer. W roku 1995 na terenie Wielkopolski założone zostały pierwsze plantacje produkcyjne z wyprodukowanych sadzonek chmielu, wolnych od wirusów.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: The use of reverse transcription and polymerase chain reaction [RT-PCR] for the detection of hop latent viroid [HLVd]
Wykrywanie wiroida latentnego chmielu [HLVd] przy pomocy odwrotnej transkrypcji reakcji lancuchowej polimerazy [RT-PCR]
Autorzy:: Cajza, M
Wypijewski, K.
Pospieszny, H.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65322.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: patogeny roslin
lancuchowa reakcja polimerazy
wiroid latentny chmielu
wiroidy
odwrotna transkrypcja
wykrywanie
Opis:: The simple method of nucleic acids extraction, based on guanidine thiocyanate extraction buffer, was sufficient for obtaining a good templates for RT-PCR. The RT-PCR reactions were performer from the start to the end (both the reverse transcription and the HLVd-cDNA amplification) in the same reaction mixture and in the very small volume of reaction (10 μI). Both pairs of primers designed by authors were good for reverse transcription and later for amplification of the HLVd-cDNA. The presence of gelatin as a stabilizer of DNA polymerase was indispensable for successful performance of RT-PCR.
Wiroidy, najmniejsze obecnie znane patogeny roślin, zbudowane z pojedynczej nici kolistego RNA, nie zawierające w swej budowie i nie kodujące żadnych białek, są groźnymi patogenami roślin wyższych, rozpowszechnionymi we wszystkich rejonach świata, szczególnie w uprawach roślin rozmnażanych wegetatywnie. Wiroid latentny chmielu (ang. hop latent viroid - HLVd) został wykryty dopiero w 1988 roku w chmielu. Do tej pory odnotowano go w rejonach uprawy chmielu na całym świecie. Chmiel, jedyny znany żywiciel tego patogena, ulega tylko infekcjom utajonym (latentnym). HLVd powoduje zarówno spadek masy plonu szyszek jak i zawartości alfa-kwasów w szyszkach. Bezobjawowe infekcje oraz brak białek strukturalnych i innych produktów translacji powodują, że obecnie patogena tego można wykrywać tylko przy pomocy elektroforezy (metoda bardzo zawodna, wymagająca wysokiego stężenia RNA patogena w tkance), sond hybrydyzacyjnych i rozwijanej w ostatnich latach metody RT-PCR. Podczas opracowywania RT-PCR do wykrywania HLVd w ekstraktach kwasów nukleinowych wykorzystywano dwie pary primerów specyficznych dla sekwencji nukleotydowej HLVd, charakteryzujących się różnymi temperaturami topnienia produktu. Wiroida wykrywano w ekstraktach kwasów nukleinowych z blaszek liściowych i z ogonków liściowych chmielu. Uproszczona metoda guanidynowa do izolacji totalnych kwasów nukleinowych okazała się wystarczająca do przeprowadzenia reakcji RT-PCR. Opracowana metoda charakteryzowała się bardzo dużą czułością, specyficznością (produkty amplifikacji cDNA-HLVd uzyskiwano tylko z próbek materiału roślinnego pochodzącego z roślin zawierających tego wiroida) i szybkością wykonania (dwa dni łącznie z ekstrakcją kwasów nukleinowych). Ponadto w zastosowanej metodzie opracowano warunki do przeprowadzenia zarówno odwrotnej transkrypcji i następnie amplifikacji powstałego cDNA wiroida w jednej probówce, w tej samej mieszaninie reakcyjnej . Oprócz tego wszystkie reakcje RT-PCR prowadzono w bardzo małej objętości równej 10 μl (2 μl zawiesiny kwasów nukleinowych i 8 μl mieszaniny reakcji RT-PCR). Maksymalne uproszczenie metody, wielokrotne obniżenie kosztów reakcji oraz charakterystyczna dla RT-PCR czułość, specyficzność i szybkość przeprowadzenia testu sprawiają, że może być ona wykorzystywana do rutynowego wykrywania nie tylko HLVd ale również innych wiroidów, wirusoidów i wirusów RNA.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2; 52-58
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: The use reverse transcription and polymerase chain reaction [RT-PCR] for the detection of hop latent viroid [HLVd]
Autorzy:: Cajza, M
Wypijewski, K.
Pospieszny, H.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65773.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: hop latent viroid
reverse transcription
viroid
hop
plant pathogen
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
Opis:: The simple method of nucleic acids extraction, based on guanidine thiocyanate extraction buffer, was sufficient for obtaining a good templates for RT-PCR. The RT-PCR reactions were performer from the start to the end (both the reverse transcription and the HLVd-cDNA amplification) in the same reaction mixture and in the very small volume of reaction (10 μI). Both pairs of primers designed by authors were good for reverse transcription and later for amplification of the HLVd-cDNA. The presence of gelatin as a stabilizer of DNA polymerase was indispensable for successful performance of RT-PCR.
Wiroidy, najmniejsze obecnie znane patogeny roślin, zbudowane z pojedynczej nici kolistego RNA, nie zawierające w swej budowie i nie kodujące żadnych białek, są groźnymi patogenami roślin wyższych, rozpowszechnionymi we wszystkich rejonach świata, szczególnie w uprawach roślin rozmnażanych wegetatywnie. Wiroid latentny chmielu (ang. hop latent viroid - HLVd) został wykryty dopiero w 1988 roku w chmielu. Do tej pory odnotowano go w rejonach uprawy chmielu na całym świecie. Chmiel, jedyny znany żywiciel tego patogena, ulega tylko infekcjom utajonym (latentnym). HLVd powoduje zarówno spadek masy plonu szyszek jak i zawartości alfa-kwasów w szyszkach. Bezobjawowe infekcje oraz brak białek strukturalnych i innych produktów translacji powodują, że obecnie patogena tego można wykrywać tylko przy pomocy elektroforezy (metoda bardzo zawodna, wymagająca wysokiego stężenia RNA patogena w tkance), sond hybrydyzacyjnych i rozwijanej w ostatnich latach metody RT-PCR. Podczas opracowywania RT-PCR do wykrywania HLVd w ekstraktach kwasów nukleinowych wykorzystywano dwie pary primerów specyficznych dla sekwencji nukleotydowej HLVd, charakteryzujących się różnymi temperaturami topnienia produktu. Wiroida wykrywano w ekstraktach kwasów nukleinowych z blaszek liściowych i z ogonków liściowych chmielu. Uproszczona metoda guanidynowa do izolacji totalnych kwasów nukleinowych okazała się wystarczająca do przeprowadzenia reakcji RT-PCR. Opracowana metoda charakteryzowała się bardzo dużą czułością, specyficznością (produkty amplifikacji cDNA-HLVd uzyskiwano tylko z próbek materiału roślinnego pochodzącego z roślin zawierających tego wiroida) i szybkością wykonania (dwa dni łącznie z ekstrakcją kwasów nukleinowych). Ponadto w zastosowanej metodzie opracowano warunki do przeprowadzenia zarówno odwrotnej transkrypcji i następnie amplifikacji powstałego cDNA wiroida w jednej probówce, w tej samej mieszaninie reakcyjnej . Oprócz tego wszystkie reakcje RT-PCR prowadzono w bardzo małej objętości równej 10 μl (2 μl zawiesiny kwasów nukleinowych i 8 μl mieszaniny reakcji RT-PCR). Maksymalne uproszczenie metody, wielokrotne obniżenie kosztów reakcji oraz charakterystyczna dla RT-PCR czułość, specyficzność i szybkość przeprowadzenia testu sprawiają, że może być ona wykorzystywana do rutynowego wykrywania nie tylko HLVd ale również innych wiroidów, wirusoidów i wirusów RNA.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 5.

Tytuł:: Identification of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis by the polymerase chain reaction [PCR]
Autorzy:: Cajza, M
Rezler, A.
Pospieszny, H.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65945.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: tomato seed
pathogen
Clavibacter michiganensis
plant protection
bacteria
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
seed
identification
Opis:: The PCR offers the possibility of specific and very sensitive detection and/or identification of Cl. m. subsp. michiganensis in seeds. The described PCR method for identification of this pathogen is very fast (one day) and economical, because of the very small volume (10 μI) of the PCR reaction mixture. The method based on amplification of the bacterial plasmid DNA fragment may be very useful in routine identification of Cl. m. subsp. michiganensis from all other bacteria isolated from tomato seeds and may be an alternative tool in diagnostics, especially for the quarantine services.
Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis jest bardzo groźnym patogenem kwarantannowym pomidora, wywołującym chorobę zwaną bakteryjnym rakiem pomidora. Bakteria ta łatwo przenosi się z zakażonymi nasionami i sadzonkami. Pomimo opracowania różnych technik diagnostycznych do jej wykrywania, nadal stanowi duży problem w diagnozowaniu chorób pomidora. Powszechnie stosowane w Polsce wykrywanie tej bakterii, bazujące na testach enzymoimmunologicznych (ELISA), immunofluorescencyjnych, hodowli na pożywkach półselektywnych i testach biologicznych, jest często zawodne ze względu na duże serologiczne zróżnicowanie poszczególnych szczepów tej bakterii, obecność wielu bakterii saprofitycznych, tworzących kolonie nie różniące się morfologicznie od kolonii właściwych dla Cl. m. subsp. michiganensis, czy też mało przydatne ze względu na długi czas trwania testu i obecność infekcji latentnych. Jedną z nowoczesnych metod wykrywania i identyfikacji bakterii jest amplifikacja fragmentów DNA charakterystycznych dla jej genomu przy pomocy reakcji PCR. Metoda ta dopiero zaczyna być powszechnie stosowana w diagnostyce bakterii (nieliczne doniesienia, w większości z ostatnich trzech lat). Opracowana metoda identyfikacji Cl. m. subsp. michiganensis spośród różnych bakterii saprofitycznych obecnych na nasionach pomidora, charakteryzuje się bardzo dużą czułością (do wykrycia Cl. m. subsp. michiganensis wystarczy 200-300 bakterii / 1 ml), specyficznością (produkty amplifikacji DNA bakteryjnego o oczekiwanej długości 614 bp, uzyskiwano tylko w próbkach, w których znajdował się DNA z Cl. m. subsp. michiganensis) oraz szybkością (jeden dzień, wraz z izolacją DNA bakteryjnego). Ponadto opracowana metoda charakteryzuje się bardzo niskimi kosztami, gdyż cala reakcja amplifikacji DNA zachodzi w objętości 10 μI (4 μI zawiesiny DNA i 6 μI mieszaniny reakcyjnej), co sprawia, że stosowanie tej metody w powszechnej diagnostyce chorób bakteryjnych będzie coraz częstsze i będzie ona coraz bardziej konkurencyjna w stosunku do innych, obecnie stosowanych.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "Cajza, M" wg kryterium: Autor

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język