Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "methods of molecular" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-25 z 45
Tytuł:
Optyczne metody obrazowania molekularnego
Optical methods of molecular imaging
Autorzy:
Sołtysiński, T.
Liebert, A.
Zawicki, I.
Maniewski, R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/261383.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
Tematy:
metody optyczne
obrazowanie molekularne
optical methods
molecular imaging
Opis:
Obrazowanie molekularne jest szybko rozwijającą się dziedziną badań w zakresie biotechnologii i inżynierii biomedycznej. W artykule przedstawiono przegląd technik stosowanych w obrazowaniu molekularnym, wykorzystujących metody medycyny nuklearnej oraz optyczne techniki oparte na analizie promieniowania fluorescencyjnego. W szczególności opisano metody optyczne obrazowania molekularnego stosowane w skali mikroskopowej (mikroskopia konfokalna, obrazowanie czasu relaksacji fluorescencyjnej, transfer energii Foerstera) oraz wykorzystywane w badaniach na zwierzętach doświadczalnych. Omówiono także potencjalne wykorzystanie technik optycznych w badaniach dużych objętości tkanek.
Molecular imaging (MI) is a rapidly emerging field of biomedical, biotechnological and engineering research. This study provides a brief review of the state-of-the-art techniques and methods of MI based on nuclear physics and fluorescent agents. Special attention will be focused on optical methods of MI applied in microscopic scale (multiphoton confocal microscopy, fluorescence lifetime imaging, Forster energy transfer) and in experimental animals. Potential application of MI in large tissue volumes will be also discussed.
Źródło:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2008, 14, 4; 331-335
1234-5563
Pojawia się w:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie dyfraktometrii rentgenowskiej w badaniach mikrobiologicznej korozji metali
Application of X-ray diffraction for studies on microbially induced metal corrosion
Autorzy:
Hryniszyn, A.
Cwalina, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/143211.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. Zakład Wydawniczy CHEMPRESS-SITPChem
Tematy:
dyfraktometria rentgenowska (XRD)
mikrobiologiczna korozja metali
metody mikrobiologiczne
metody molekularne
X-ray diffraction (XRD)
microbially induced metal
microbiological methods
methods of molecular
Opis:
W pracy przedstawiono aktualny stanu wiedzy na temat dyfraktometrii rentgenowskiej (XRD) w aspekcie wykorzystania tej techniki do badania korozji wzbudzonej przez mikroorganizmy. W podsumowaniu stwierdzono, że wskazanie – na podstawie badań XRD – grup mikroorganizmów uczestniczących w MIC nie dowodzi udziału określonych drobnoustrojów w korozji. Sugestie te powinny być potwierdzone za pomocą metod mikrobiologicznych i/lub metod biologii molekularnej.
The paper presents the current state of knowledge on X-ray diffraction (XRD) in terms of the use of this technique to study the corrosion induced by micro-organisms. It was concluded that the indication – on the basis of XRD – groups of micro-organisms involved in the MIC does not prove the participation of specific micro- organisms in corrosion. These suggestions should be confirmed by microbiological methods and/or methods of molecular biology.
Źródło:
Chemik; 2015, 69, 8; 455-462
0009-2886
Pojawia się w:
Chemik
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The importance of molecular identification methods of mosquitoes in epidemiology of vector-borne diseases
Autorzy:
Rydzanicz, K.
Lonc, E.
Becker, N.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/5621.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
vector-borne disease
Culex
Anopheles
molecular identification
molecular method
mosquito
epidemiology
Źródło:
Annals of Parasitology; 2016, 62, Suppl.
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod biotechnologicznych w hodowli molekularnej rzepaku
The use of biotechnological methods in molecular breeding of oilseed rape
Autorzy:
Olejniczak, O.
Mikolajczyk, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/832859.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
hodowla roslin
rzepak ozimy
Brassica napus
metody biotechnologiczne
markery genetyczne
transformacja genetyczna
plant breeding
winter rape
biotechnological method
genetic marker
genetic transformation
Opis:
W pracy przedstawiono przegląd literatury dotyczącej badań genetycznych ważnej uprawnej rośliny oleistej strefy klimatu umiarkowanego, jaką jest rzepak ozimy. Zaprezentowano metody biotechnologiczne, takie jak transformacje genetyczne z użyciem wektorów bakteryjnych oraz metodą wyciszania genów, ukierunkowana mutageneza, a także selekcja z użyciem markerów genetycznych, w odniesieniu do prowadzonych doświadczeń hodowlanych. Metody te stosowane są w celu modyfikacji i polepszenia ważnych gospodarczo cech, takich jak odporność na choroby i szkodniki, plon nasion, plon oleju, skład kwasów tłuszczowych w oleju nasion, występowanie związków aktywnych biologicznie w oleju i wytłoku oraz zawartość włókna w okrywie nasiennej. Podkreślono znaczenie identyfikacji specyficznych markerów genetycznych i ich zastosowania do selekcji w programach hodowli. Wskazano na rozwój nowej, interdyscyplinarnej dziedziny, określonej jako hodowla molekularna. Przedstawiono również praktyczne zastosowanie różnego rodzaju markerów genetycznych, identyfikujących geny i rejony genomu sprzężone z określonymi cechami, z włączeniem markerów opracowanych w IHAR – PIB, Oddział w Poznaniu.
This paper comprises a review of genetic studies of winter oilseed rape, an important oil crop of the moderate climate zone. Biotechnological methods, such as genetic transformation with the use of bacterial vectors and gene silencing, site-directed mutagenesis as well as selection with the use of genetic markers with respect to field experiments were presented. The methods are applied for modification and improving of economically important traits, including resistance to diseases and pests, seed yield, seed oil fatty acid composition, the presence of biologically active compounds in oil and seed meal, and also the fibre content in seed coat. The importance of specific genetic markers development and their use for selection in breeding programs was highlighted. Molecular breeding was mentioned as a new, interdisciplinary domain. Finally, practical use of several genetic markers for identifying genes and genome regions linked to specific traits, including those developed at the Plant Breeding and Acclimatization Institute – NRI, Poznan Branch, was presented.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 1
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular Methods of Characterization and Identification of Globodera Rostochiensis and Globodera Pallida Populations
Autorzy:
Podlewska-Przetakiewicz, Anna
Milczarek, Dorota
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199577.pdf
Data publikacji:
2020-11-27
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
Globodera
inter-and intraspecies identification
molecular methods
potato cyst nematode
Opis:
The cyst nematodes belonging to the genus Globodera are big worldwide problem in countries were Sola-naceaous plants growing. Knowledge of species-composition in populations of Globodera rostochiensis and Globodera pallida is very important for selection of appropriate measure of nematode regulations occurrence. Inter- and intraspecific variability among species of Globodera rostochiensis and Globodera pallida were studied intensively with the use of molecular analyses of DNA methods. This review summarize and compare of methods chosen to distinguishing between Globodera, both pathotypes and species.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2019, 80; 3-12
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molekularne metody identyfikacji gatunkowej wykorzystywane w ekspertyzach sądowych
Molecular methods of species identification used in forensic examinations
Autorzy:
Nakonieczna, S.
Grela, M.
Listos, P.
Gryzińska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2191477.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Źródło:
Journal of Animal Science, Biology and Bioeconomy; 2019, 37, 1; 31-39
2544-4468
Pojawia się w:
Journal of Animal Science, Biology and Bioeconomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Characteristics of selected molecular methods used in identification and assessment of genetic diversity of bacteria belonging to the genus Azotobacter
Autorzy:
Kozieł, Monika
Gałązka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2147979.pdf
Data publikacji:
2019-09-30
Wydawca:
Instytut Uprawy Nawożenia i Gleboznawstwa – Państwowy Instytut Badawczy
Tematy:
Azotobacter
ITS PCR
16S rRNA gen
PCR MP
RAPD
ARDRA
Opis:
Modern molecular techniques have greatly increased our knowledge concerning phylogenetic and functional diversity of microorganisms inhabiting the soil environment. Soil ecosys-tem is relatively complex with a high level of microbiologically diversity. The application of traditional culture-based techniques dose not reflect the total diversity of microbial community in-habiting in soil environment. On the other hand commonly used molecular methods allow for quick and accurate identification and evaluation of the genetic diversity of microorganisms in-habiting this environment. Free-living bacteria belonging to the genus Azotobacter commonly occurring in soil. Azotobacter spp. are the subject of many studies conducted both in Poland and in the world. The interest in these bacteria is largely related to their properties very useful for agriculture. Owing to their capability of fixing atmospheric nitrogen and making it available to plants and production of plant growth promotion and fungicidal substances, they are used in the production of soil bacterial inoculants. In addition, these bacteria are an excellent indicator of soil fertil-ity, which is why they are often used as test microorganisms in many studies. The paper presents an overview of molecular mi-crobiological techniques used to identify and evaluate the genetic diversity of Azotobacter spp. in studies conducted both in Poland and across the world. The ITS PCR, PCR-RFLP methods and 16S rRNA gene amplification are used to identify bacteria of the ge-nus Azotobacter, and PCR MP, RAPD PCR and ARDRA are used to assess the genetic diversity of these microorganisms.
Źródło:
Polish Journal of Agronomy; 2019, 38; 37-45
2081-2787
Pojawia się w:
Polish Journal of Agronomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Badania nad opracowaniem molekularnej metody identyfikacji genów warunkujących ważne cechy użytkowe pomidora
Studies on the development of molecular methods for identifying genes responsible for important traits of tomato
Autorzy:
Nowakowska, Marzena
Kłosińska, Urszula
Nowak, Katarzyna
Szczechura, Wojciech
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199521.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
bakteryjna plamistość
funkcjonalna męska sterylność
fuzaryjne więdniecie
selekcja wspomagana markerami
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 303-307
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod molekularnych w identyfikacji gatunku, wieku i płci owadów użytecznych w entomologii sądowej
Use of molecular methods in the identification of the species, age and sex of insects useful in forensic entomology
Autorzy:
Stojak, Joanna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1373968.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
Tematy:
entomologia sądowa
barkoding DNA
mtDNA
metody molekularne
identyfikacja gatunkowa
forensic entomology
DNA barcoding
molecular methods
identification of species
Opis:
Entomologia sądowa wykorzystuje owady do ustalania czasu i przyczyny śmierci, a nawet miejsca, w którym nastąpiła. W tym celu stosowane są dwie metody. Metoda rozwojowa opiera się na wzorcach rozwoju larw w określonych warunkach temperaturowo-środowiskowych. Metoda sukcesyjna analizuje występujące w różnych środowiskach wzorce pojawiania się poszczególnych taksonów na zwłokach. W obu tych metodach najistotniejszą kwestią jest poprawna identyfikacja gatunków. W poniższym artykule zaprezentowane zostały molekularne metody identyfikacji, takie jak barkoding DNA czy analiza krzywych denaturacji DNA o wysokiej rozdzielczości (DNA-HRM-PCR).
Forensic entomology uses insects to determine the time, cause and place of death. To this end, two entomological methods are used. The development-based method uses the patterns of insect larvae development under the specific thermal and environmental conditions. The succession-based method analyzes the sequence of insect succession on the body in various environmental conditions. The proper insect species identification is essential in both methods. In this article, the molecular methods of species, age and sex identification are presented such as DNA barcoding or DNA-HRM-PCR.
Źródło:
Problemy Kryminalistyki; 2014, 286; 22-26
0552-2153
Pojawia się w:
Problemy Kryminalistyki
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod dynamiki molekularnej w badaniach nad układami z wiązaniami wodorowymi
An application of molecular dynamics methods in investigations of systems with hydrogen bonds
Autorzy:
Jezierska, A.
Panek, J. J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/172356.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
CPMD
dynamika molekularna Cara-Parrinello
klasyczna dynamika molekularna
wewnątrzcząsteczkowe wiązanie wodorowe
międzycząsteczkowe wiązanie wodorowe
zasada Schiffa
zasada Mannicha
N-tlenki
białka
Car-Parrinello molecular dynamics
classical MD
intramolecular HB
intermolecular HB
Schiff base
Mannich base
N-oxides
proteins
Opis:
Modern computational chemistry offers a wide variety of methods allowing us to investigate very complex systems. In the current study, we would like to focus on ab initio and classical molecular dynamics to show their applications in our research. Car-Parrinello molecular dynamics (CPMD) was carried out to study compounds possessing intra- and intermolecular hydrogen bonds. Our simulations were performed in vacuum, in solvent and in crystalline phase. It is well known that intramolecular hydrogen bonding stabilizes 3D structure of molecules. The strength of the bonding and its features are influenced by inductive and steric effects. Our short overview on CPMD application to systems with intramolecular HB we start from Schiff and Mannich bases -model compounds to investigate intramolecular hydrogen bonding. Other examples reported here derive from the class of N-oxide type compounds. Special attention was devoted to another representative structure in such investigations – picolinic acid N-oxide. In some examples listed above proton transfer phenomena occurred making these compounds interesting objects for future excited state studies. Aliphatic boronic acid was used as a model example to study intermolecular hydrogen bonds based on CPMD method. Further, classical molecular dynamics was applied to investigate proteins. Here, we would like to report our results for two biomolecules. The first one is proteinase K for which the impact of mercury(II) on its catalytic center was studied. The second one is streptavidin. For the latter one its complexes with biotinylated ligands were investigated. We close our review with a paragraph describing further development and perspectives related to CPMD method.
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2017, 71, 7-8; 473-495
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod biologii molekularnej do identyfikacji grzybów zasiedlających martwe drewno sosny zwyczajnej (Pinus sylvestris L.)
Application of molecular biology methods to indentify fungi inhabiting dead wood of Scots pine (Pinus sylvestris L.)
Autorzy:
Behnke-Borowczyk, J.
Cichon, J.
Wolowska, D.
Haluszczak, M.
Baranowska-Wasilewska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/791463.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Wyższa Szkoła Zarządzania Środowiskiem w Tucholi
Tematy:
roznorodnosc biologiczna
grzyby zasiedlajace drewno
drewno martwe
identyfikacja
biologia molekularna
zbiorowiska grzybow
sklad gatunkowy
molecular biology
application
identification method
fungi
colonizing fungi
species composition
wood
dead wood
Scotch pine
Pinus sylvestris
fungi community
Źródło:
Zarządzanie Ochroną Przyrody w Lasach; 2017, 11
2081-1438
2391-4106
Pojawia się w:
Zarządzanie Ochroną Przyrody w Lasach
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wyróżnianie form ziemniaka o złożonej odporności na mątwiki atakujące ziemniak przy wykorzystaniu metod konwencjonalnych i molekularnych. Charakterystyka nowego źródła odporności na Globodera pallida znalezionego w Solanum gourlayi
Selection of potato forms with accumulated resistances to nematodes attacking the potato by using conventional and molecular methods. Characterization of a new source of resistance to Globodera pallida found in Solanum gourlayi
Autorzy:
Milczarek, Dorota
Flis, Bogdan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199560.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
cechy użytkowe
mapowanie
mątwik
odporność
Solanum gourlayi
ziemniak
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 247-250
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody analizy ekspresji genów w badaniach nad rzepakiem
Methods for gene expression analysis in studies of oilseed rape
Autorzy:
Olejnik, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833939.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
hodowla roslin
genetyka roslin
ekspresja genow
metody analizy
mikromacierze DNA
seryjna analiza ekspresji genow
odwrotna transkrypcja
biotechnologia
badania molekularne
rape
plant breeding
plant genetics
gene expression
analysis method
transcription
biotechnology
molecular study
Opis:
W pracy przedstawiono przegląd metod analizy ekspresji genów z zastosowaniem technik: mikromacierzy DNA, seryjnej analizy ekspresji genów (SAGE), jak również odwrotnej transkrypcji – RT-PCR oraz qRT-PCR. Zaprezentowano możliwości wykorzystania poszczególnych technik wraz z przykładami ich praktycznego zastosowania w badaniach molekularnych rzepaku.
This paper presents an overview of gene expression analysis methods, including: DNA microarrays, SAGE (Serial Analysis of Gene Expression), as well as reverse transcription techniques: RT-PCR and qRT-PCR. It also includes some examples of application of the methods in molecular studies on oilseed rape genome and transcriptome.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 1
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular modelling in the rational design of some anti-tumor and antifungal agents
Autorzy:
Mazerski, J.
Borowski, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1953949.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
molecular modelling
molecular mechanics
molecular dynamics
semiempirical methods
antifungal agents
anti-tumor agents
rational design
Opis:
In this paper we present our approaches and results concerning application of molecular modelling techniques in the design of new chemotherapeutic agents for the control of eukariotic systems, comprising compounds for the treatment of systemic fungal infections and tumor deseases. In the case of anti-tumor agents we focused our attention on molecular properties of natural and synthetic anthraquinones. In the area of antifungal compounds we adopted two approaches. In one of them we examine molecular nature of undesirable properties of polyene macrolide antifungal antibiotic - amphotericin B using molecular modelling techniques. Another approach was aimed at the development of selective inactivator of glucosamine synthase, a novel target for antifungal compounds. In this problem we have used computational chemistry methods to identify structural features responsible for the selective inactivation of the target enzyme.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 1998, 2, 4; 511-550
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne stosowane w badaniu różnorodności mikroorganizmów glebowych
Molecular methods used in studies of diversity of the soil microorganisms
Autorzy:
Behnke-Borowczyk, J.
Kwaśna, H.
Belka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1006468.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
mikroorganizmy glebowe
identyfikacja
roznorodnosc biologiczna
metody badan
metody molekularne
ekstrakcja DNA
amplifikacja DNA
biodiversity
microbiota
molecular methods
soil
Opis:
Application of the correct methods of study is essential for a proper description and understanding of natural communities of microorganisms and their relationships. Classical methods used for detection and identification of soil microorganisms resulted in underestimation of the microbiota. It has been claimed that classical methods, based mainly on morphology, led to the identification of only 1% of the soil microbiota, usually species that predominate in culture because of their fast growth and abundant sporulation. Molecular methods allow rapid, accurate, sensitive and cost−effective identification and enumeration of microorganisms. They are designed to replace and/or support classical approaches. This review summarizes some of the current and emerging nucleic acid−based molecular approaches used for detection, discrimination and quantification of microbes in the environment, mostly in soil.
Źródło:
Sylwan; 2012, 156, 04; 294-304
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular Dynamics of Proteins Investigated by NMR Relaxation Methods
Autorzy:
Wierzuchowska, D.
Blicharska, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1360657.pdf
Data publikacji:
2014-04
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Fizyki PAN
Tematy:
76.60.-k
76.90.+d
Opis:
The nuclear magnetic resonance relaxation times of solvent water nuclei are known to decrease upon addition of diamagnetic solute protein. For this reason NMR relaxation methods are able to provide information on molecular dynamics changes of water protons and their interaction with macromolecules' surfaces. We present results of measurements of relaxation rates $R_1$ = 1/$T_1$, $R_2$ = 1/$T_2$ and $R_{1ρ}$ = 1/$T_{1ρ}$ in the rotating frame for three proteins: chicken egg white lysozyme, egg white albumin, and bovine serum albumin, obtained at proton resonant frequency of 60 MHz. Besides the relaxation rates dependences on concentration in the 4-23% (g/100 g solution) range, the analysis of the Carr-Purcell-Meiboom-Gill CPMG multi-echo $T_2$ experiments with variable pulse rate τ was performed. The dependences of relaxation rates on protein concentration are linear at low concentration. When protein concentration increases the slope of the straight line rapidly changes at so-called "critical" concentration which depends on MW of the diluted protein. Investigated dispersion of $T_2$, obtained using the CPMG method with a variable pulse rate, for concentrations higher and lower than the "critical" one, exhibits unequal behavior. At high concentration one-exponential curves and at low concentration two-exponential curves correspond closely with experimental data. The obtained parameters of exponents allow an estimation of the ratio of the amount of water with the determined motion freedom, that is free and bounded water, in solution. We showed that the CPMG dispersion method applied to aqueous protein solutions may widen the current understanding of the nature of molecular dynamics of hydrated water protons in non-perturbed environment.
Źródło:
Acta Physica Polonica A; 2014, 125, 4; 907-910
0587-4246
1898-794X
Pojawia się w:
Acta Physica Polonica A
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Selection of methods for activated sludge bulking control using a molecular biology technique combined with respirometric tests
Autorzy:
Milobedzka, A.
Muszynski, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80133.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2016, 97, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The effect of the Glu342Lys mutation in α1-antitrypsin on its structure, studied by molecular modelling methods.
Autorzy:
Jezierski, Grzegorz
Pasenkiewicz-Gierula, Marta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044164.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
serpins
protein structure
energy minimisation
molecular dynamics simulation
Opis:
The structure of native α1-antitrypsin, the most abundant protease inhibitor in human plasma, is characterised primarily by a reactive loop containing the centre of proteinase inhibition, and a β-sheet composed of five strands. Mobility of the reactive loop is confined as a result of electrostatic interactions between side chains of Glu342 and Lys290, both located at the junction of the reactive loop and the β structure. The most common mutation in the protein, resulting in its inactivation, is Glu342→Lys, named the Z mutation. The main goal of this work was to investigate the influence of the Z mutation on the structure of α1-antitrypsin. Commonly used molecular modelling methods have been applied in a comparative study of two protein models: the wild type and the Z mutant. The results indicate that the Z mutation introduces local instabilities in the region of the reactive loop. Moreover, even parts of the protein located far apart from the mutation region are affected. The Z mutation causes a relative change in the total energy of about 3%. Relatively small root mean square differences between the optimised structures of the wild type and the Z mutant, together with detailed analysis of 'conformational searching' process, lead to the hypothesis that the Z mutation principally induces a change in the dynamics of α1-antitrypsin.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 1; 65-75
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
Autorzy:
Krawczyk, Beata
Kur, Józef
Stojowska-Swędrzyńska, Karolina
Śpibida, Marta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038839.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
rapid methods
molecular epidemiology
genotyping
microbial phylogenetics
PCR (polymerase chain reaction)
Opis:
A significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms' characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before DNA amplification by PCR, known as Ligation-Mediated PCR methods (LM PCR), have been successfully applied for the typing of microorganisms below the species level. These molecular methods include: Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites (ADSRRS), PCR Melting Profiles (PCR MP), Ligation Mediated PCR/Shifter (LM PCR/Shifter), Infrequent-Restriction-Site Amplification (IRS PCR), double digestion Ligation Mediated Suppression PCR (ddLMS PCR). These techniques are now applied more and more often because they involve less time, are comparably inexpensive, and require only standard lab equipment. Here, we present a general review of this group of methods showing their possibilities and limitations. We also identify questions and propose solutions which may be helpful in choosing a particular LM PCR method for the achievement of the required goal.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2016, 63, 1; 39-52
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Progress in the molecular methods for the detection and genetic characterization of Cryptosporidium in water samples
Autorzy:
Skotarczak, B
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/52184.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
protozoan parasite
Cryptosporidium
genetic characteristics
molecular method
detection
water sample
food-borne way
oocyst
infection control
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2010, 17, 1; 1-8
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molekularne metody stosowane w diagnostyce zespołu long-QT
Molecular methods used in diagnosis of long-QT syndrome
Autorzy:
Moric-Janiszewska, Ewa
Głowacka, Marta
Węglarz, Ludmiła
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038844.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
zespół long-qt
kanały jonowe
analiza molekularna
long-qt syndrome
ion channels
molecular analysis
Opis:
LQTS (long QT syndrome) is a genetic disorder caused by the mutations of genes adversely affecting the ion channel function in the cellular membranes of cardiac myocytes. Prolonged repolarization detected on a ECG as a longer QT interval (> 450 ms) is responsible for syncope, cardiac arrest and sudden cardiac death (SCD), due to transient “torsade de pointes” (TdP) or ventricular fibrillation. Currently, 12 types of long-QT syndrome have been identified, which are caused by 600 mutations of genes located on chromosomes: 3,4,6,7,11,17,21. Depending on the particular gene mutation in the LQT syndrome, subtypes from LQTS1 to LQTS12 were identified. The knowledge of genetic disorders in different types of LQTS has enabled the introduction of genotype-dependent therapy. Due to the frequent absence of clinical signs in 40% of mutant genes carriers, it is very important to develop fast and effective diagnostics. These patients do not always suit the clinical diagnostic criteria and therefore they should be diagnosed using molecular methods. In the present study we describe some molecular methods (SSCP, sequencing, quantitative PCR) most commonly used in genetic diagnostics of the long-QT syndrome.
LQTS (long-QT syndrome) oznacza wrodzony zespół wydłużonego odcinka QT i jest chorobą kanałów jonowych uwarunkowaną genetycznie. U jej podstaw leżą mutacje genów kodujących białka i podjednostki kanałów jonowych błony podstawnej kardiomiocytów, istotne dla prawidłowego ich funkcjonowania. Jej głównymi cechami są: wydłużenie odstępu QT (> 450 ms) widoczne w obrazie EKG, pojawianie się omdleń, zatrzymania akcji serca oraz nagła śmierć sercowa SCD (sudden cardiac death), spowodowana występowaniem wielokształtnego częstoskurczu komorowego typu torsade de pointes (TdP) lub też migotaniem komór. Obecnie zidentyfi kowano 12 odmian zespołu long-QT, które spowodowane są aż 600 mutacjami genów zlokalizowanych w chromosomach: 3, 4, 6, 7, 11, 17, 21. Zależnie od mutacji konkretnego genu, w zespole LQT wyodrębniono podtypy od LQTS1 do LQTS12. Poznanie zaburzeń genetycznych w poszczególnych typach LQTS umożliwiło wprowadzenie terapii zależnej od genotypu. Ze względu na częste niewystępowanie objawów klinicznych aż u 40% nosicieli zmutowanych genów bardzo ważna jest szybka i skuteczna diagnostyka. U pacjentów takich nie zawsze sprawdzają się kliniczne kryteria diagnostyczne i dlatego należy ich diagnozować metodami molekularnymi. W przedstawionej pracy opisano niektóre (SSCP, sekwencjonowanie, ilościowy PCR) najczęściej stosowane, molekularne metody diagnostyki zespołu long-QT.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2012, 66, 4; 41-47
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dyskretne metody symulacji zjawisk przepływowych w gazach i cieczach
Discrete Methods of Simulation of Flow Phenomena in Gases and Liquids
Autorzy:
Wolszakiewicz, T.
Walenta, Z. A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/403663.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Wojskowa Akademia Techniczna im. Jarosława Dąbrowskiego
Tematy:
metody numeryczne
Bezpośrednia Symulacja Monte Carlo
dynamika molekularna
simulation methods
direct simulation Monte Carlo
molecular dynamics
Opis:
W pracy rozpatrzone zostały dwie metody numerycznej symulacji zjawisk przepływowych w ośrodkach gazowych i ciekłych, oparte na molekularnym opisie ośrodka: metoda Bezpośredniej Symulacji Monte Carlo oraz metoda Dynamiki Molekularnej. Metody te pozwalają na modelowanie w sposób bezpośredni przebiegu reakcji chemicznych, oddziaływania ośrodka ze ściankami ich zaletą jest także względna łatwość dostosowania się do skomplikowanej geometrii. Wadą są długie czasy obliczeń, co jednak może być przezwyciężone przez wykorzystanie coraz powszechniej dostępnych komputerów o dużej szybkości obliczeń.
The paper presents two methods of simulation of flow phenomena in gases and liquids based on molecular description of the medium: the Direct Simulation Monte Carlo method and the Molecular Dynamics method. These methods offer the possibility of direct modelling of chemical reactions and interactions of the medium with solid walls. Apart from that they have the advantage of relatively easy adaptation to complex geometries. Their main disadvantage is the long computing time, which, however, may be overcome with the use of the modern, fast computers presently available.
Źródło:
Problemy Mechatroniki : uzbrojenie, lotnictwo, inżynieria bezpieczeństwa; 2013, 4, 4 (14); 67-76
2081-5891
Pojawia się w:
Problemy Mechatroniki : uzbrojenie, lotnictwo, inżynieria bezpieczeństwa
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wildlife as an environmental reservoir of Enterocytozoon bieneusi (Microsporidia) – analyses of data based on molecular methods
Autorzy:
Leśniańska, Kinga
Perec-Matysiak, Agnieszka
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/972188.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
microsporidia
genotype
zoonosis
wildlife
reservoir
Enterocytozon bieneusi
Opis:
Enterocytozoon bieneusi is the most commonly identified Microsporidia in humans and has also been detected worldwide in a large group of wild living and domestic animals. The identification of E. bieneusi in wildlife has raised the question of the importance of animal reservoirs in the epidemiology of microsporidiosis and the implications of the infection with this pathogen in hosts. This review summarizes the available molecular data on the variety of E. bieneusi genotypes, both potentially zoonotic and host-specific isolated from wild living mammals and birds. In contrast to microsporidial infections of humans and domestic animals, wildlife deserves attention as a source of significant environmental reservoir of E. bieneusi.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2017, 63, 4; 265-281
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Quantum-classical calculations of the nanomechanical properties of metals
Autorzy:
Dziedzic, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1964138.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
hybric methods
cross-scaling
tight-binding
learn-on-the-fly
nanoscale
metals
nanoindentation
molecular-dynamics
Sutton-Chen potential
Opis:
Molecular-dynamics (MD) simulations constitute an important tool in the study of nanoscale metallic systems, especially so in the face of the difficulties plaguing their experimental analysis. Main limitations of the MD method stem from the empirical nature of the potentials employed, their functional form which is postulated ad hoc, and its classical nature. The neglect of electronic effects and the unjustified utilization of the potential for system configurations significantly different from those, for which the potential was parametrized makes the results of strictly classical calculations dubious, at least for a certain class of systems. On the other hand, high computational complexity of quantum-based methods, where atomic interactions are described ab initio, prohibits their direct use in the study of systems larger than several tens of atoms. In the last decade, a growing popularity of so-called hybrid (or cross-scaling) methods can be observed, that is, methods which treat the most interesting part of the system with a quantum-based approach, while the remainder is treated classically. Physically sound handshaking between the two methodologies (quantum and classical) within a single simulation constitutes a serious challenge, the majority of difficulties concentrating around the interface between the fragments of the system treated with the two methods. The aforementioned interface is most easily constructed for covalently bonded systems, where the bonds cut by the isolation of the quantum-based region can be saturated by the introduction of specially crafted link-atoms. In metallic systems, however, due to electronic delocalization, this traditional approach cannot be employed. This paper describes a physically sound and adequately efficient computational technique, which allows for the inclusion of results of locally employed quantum-based computations within a molecular-dynamics simulation, for systems described by the many-body Sutton-Chen (SC) potential, used in the study of fcc metals. The proposed technique was developed taking as a point of departure the Learn-on-the-Fly (LOTF) formalism, a recent development itself. The original LOTF approach is only suitable for two- or three-body potentials and is serial in nature, whereas the proposed technique can be used with many-body potentials and is parallel-ready. An implementation of the proposed approach in the form of computer code, which allows for parallel hybrid computations for metallic systems is also described. Finally, results from a set of hybrid simulations of nanoindentation of a copper workmaterial with a hard indenter utilizing the aforementoned technique and computer code is presented, as evidence of its viability.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2009, 13, 3; 207-310
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-25 z 45

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies