Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "SNP" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 22
Tytuł:
SNP-minisequencing as an excellent tool for analysing degraded DNA recovered from archival tissues
Autorzy:
Bąbol-Pokora, Katarzyna
Berent, Jarosław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1040691.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
formalin-fixed paraffin-embedded tissues
SNP
minisequencing
low copy number DNA
Opis:
SNP-minisequencing has become common in forensic genetics, especially for analysing degraded or low copy number DNA (LCN DNA). The aim of this study was to examine the usefulness of five SNP (single nucleotide polymorphism) markers for analyzing degraded and LCN DNA recovered from archival samples. DNA extractions of eight formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues were performed and DNA fragments were amplified in one multiplex PCR (polymerase chain reaction). SNPs were identified in a minisequencing reaction and a gel electrophoresis in ABI Prism® 377 Sequencer. The research confirmed the usefulness of SNP-minisequencing for analysing FFPE tissues.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2008, 55, 4; 815-819
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Search for SNP mutations of chosen genes of the hypothalamic-pituitary axis in laying hens
Poszukiwanie mutacji SNP wybranych genów osi podwzgórzowo-przysadkowej kur nieśnych
Autorzy:
Rozempolska-Rucińska, I.
Ciechocińska, M.
Ślaska, B.
Zięba, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2197069.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Źródło:
Annales Universitatis Mariae Curie-Skłodowska. Sectio EE: Zootechnica; 2011, 29, 1; 36-41
0239-4243
2083-7399
Pojawia się w:
Annales Universitatis Mariae Curie-Skłodowska. Sectio EE: Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The relationship between nitric oxide and plant hormones in SNP administrated sunflower plants under salt stress condition
Relacje między tlenkiem azotu a hormonami roślinnymi słonecznika w obecności SNP w warunkach stresu solnego
Autorzy:
Yurekli, F.
Kirecci, O.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11543435.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Opis:
Nitric oxide (NO) and sodium nitro prusside (SNP) are striking molecules and play important roles in animals and plants. SNP serves as nitric oxide donor in both group. NO can act free radical and impaires important biomolecules functions beside this it has beneficial effect recovery from salinity, drought etc. NO and SNP are beneficial and protectant molecules in cope with stressfull conditions. In plants these molecules are very important, and regulate many physiological events. In the present study, endogen abscisic acid (ABA), indole acetic acid (IAA), gibberellic acid (GA3 ) and NO levels were investigated in NaCl, SNP and plant growth regulators treated sunflower plant (Helianthus annuus L.) leaves and roots. The content of NO was higher in GA3 + SNP treated plant leaves at 72 h. The highest IAA level was determined in IAA + SNP treated plant roots at 72 h. In NaCl + ABA treated plant leaves ABA was higher at 72 and GA3 levels were equal or less than the control group. Our results showed that coadministration of SNP and plant growth regulators cope with salinity stress via elevated internal hormone and NO level versus salinity.
Tlenek azotu (NO) oraz nitroprusydek sodu (SNP) to molekuły odgrywające ważną rolę u zwierząt i roślin. SNP służy jako dawca tlenku azotu w obydwu grupach. NO może działać jako wolny rodnik i pogarszać ważne funkcje biomolekuł, poza tym ma dobry wpływ na zdrowienie po zasoleniu, suszy, itp. NO i SNP są dobroczynnymi ochronnymi molekułami, które radzą sobie z warunkami stresu. U roślin molekuły te są bardzo ważne i regulują wiele zjawisk fizjologicznych. W doświadczeniu badano poziomy kwasu abscysynowego (ABA), kwasu giberelinowego (GA3 ) oraz NO w liściach i korzeniach słonecznika (Helianthus annuus L.), na którego działano NaCl, SNP oraz regulatorami wzrostu roślin. Zawartość NO była większa w liściach roślin pod wpływem GA3 + SNP w 72 godzinie. Największy poziom IAA stwierdzono w korzeniach roślin pod wpływem IAA + SNP w 72 godzinie. W liściach roślin traktowanych za pomocą NaCl + ABA, ABA był większy w 72 godzinie, a poziomy GA3 były równe lub mniejsze niż w grupie kontrolnej. Wnioskuje się, że jednoczesne zastosowanie SNP i regulatorów wzrostu pomaga sprostać stresowi zasolenia poprzez podniesienie poziomu wewnętrznego hormonu i NO w porównaniu z zasoleniem.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2016, 15, 6; 177-191
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
MutS as a tool for mutation detection
Autorzy:
Stanisławska-Sachadyn, Anna
Sachadyn, Paweł
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041359.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
fusion
SNP
chimeric protein
MutS
mutation detection
Opis:
MutS, a DNA mismatch-binding protein, seems to be a promising tool for mutation detection. We present three MutS based approaches to the detection of point mutations: DNA retardation, protection of mismatched DNA against exonuclease digestion, and chimeric MutS proteins. DNA retardation in polyacrylamide gels stained with SYBR-Gold allows mutation detection using 1-3 µg of Thermus thermophilus his6-MutS protein and 50-200 ng of a PCR product. The method enables the search for a broad range of mutations: from single up to several nucleotide, as mutations over three nucleotides could be detected in electrophoresis without MutS, due to the mobility shift caused by large insertion/deletion loops in heteroduplex DNA. The binding of DNA mismatches by MutS protects the complexed DNA against exonuclease digestion. The direct addition of the fluorescent dye, SYBR-Gold, allows mutation detection in a single-tube assay. The limited efficiency of T4 DNA polymerase as an exonuclease hampers the application of the method in practice. The assay required 300-400 ng of PCR products in the range of 200-700 bp and 1-3 µg of MutS. MutS binding to mismatched DNA immobilised on a solid phase can be observed thanks to the activity of a reporter domain linked to MutS. We obtained chimeric bifunctional proteins consisting of T. thermophilus MutS and reporter domains, like β-galactosidase or GFP. Very low detection limits for β-galactosidase could theoretically enable mutation detection not only by the examination of PCR products, but even of genomic DNA.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2005, 52, 3; 575-583
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SCD1 SNP in relation to breeding value of milk production traits in Polish Holstein-Friesian cows
SNP w genie SCD1 w powiązaniu z wartością hodowlaną dla cech użytkowości mlecznej u krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej
Autorzy:
Kulig, H.
Kowalewksa-Luczak, I.
Zukowski, K.
Kunicka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45069.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Opis:
The aim of this study was to investigate associations between SCD1 polymorphism and the estimated breeding value of milk production traits (milk, fat and protein yield, kg; fat and protein content, %) in the Polish Holstein-Friesian cows’ herd. The genotype and allele frequencies for g.10329C>T SNP in exon 5 of SCD1 gene were estimated in the examined herd. Statistical analysis revealed that studied polymorphism significantly affected the breeding value of protein content in milk (P ≤ 0.05). The results indicated that selection for the SCD1-TT individuals might contribute to increased protein content in milk in the Polish Holstein-Friesian cows. Further studies are needed to confirm these results
Celem badań było zbadanie zależności między polimorfizmem genotypu SCD1 a oszacowaną wartością hodowlaną dla cech użytkowości mlecznej (wydajnoś ci mleka, tłuszczu i białka, kg oraz zawartością tłuszczu i białka w mleku, %) w stadzie krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej. Oszacowano częstość występowania genotypów i alleli SNP g.10329C>T zlokalizowanego w eksonie 5. genu SCD1. Analiza statystyczna wykazała, że badany polimorfizm wpływał istotnie na wartość hodowlaną dla zawartości białka (P ≤ 0,01). Wyniki wskazują, że uwzględnienie w selekcji osobników z genotypem SCD1-TT mogłoby przyczynić się do zwiększenia zawartości białka w mleku krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej.Wymagane jest jednak kontynuowanie badań aby móc zweryfikować uzyskane wyniki.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2013, 12, 1
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Assessment of ANXA9 SNP effects on milk performance traits in Polish Holstein-Friesian cows
Ocena wpływu SNP w genie ANXA9 na cechy użytkowości mlecznej krów polskich holszyńsko-fryzyjskich
Autorzy:
Kulig, H.
Wojdak-Maksymiec, K.
Szewczuk, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2615761.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Tematy:
milk performance trait
annexin A9
polymorphism
dominance effect
cattle
Polish Holstein-Friesian breed
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2019, 18, 4; 57-62
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of susceptibility loci for juvenile idiopathic arthritis in the extended MHC region using high resolution SNP and HLA allele typing
Autorzy:
Biesiada, J.
Sudman, M.
Wagner, M.
Rupert, A.
Hollenbach, J.
Haas, J. P.
Meller, J.
Thompson, S. D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1935824.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
HLA
MHC region
autoimmunology
Juvenile Idiopathic Arthritis
HLA independent association
SNP genotyping
HLA alleles
Opis:
Juvenile idiopathic arthritis ( JIA ) spans several pediatric arthropathies that involve autoimmune responses. Primary genetic risk factors for JIA have been mapped to Major Histocompatibility Complex ( MHC ) class I and class II genes. Recent genome-wide association studies using SNP arrays have shown that the nonHLA genetic component of JIA involves multiple low-risk loci, reinforcing the notion that JIA is a complex genetic trait with a strong HLA component. In this work, with the goal of detailed mapping and analysis of lin kage disequilibrium ( LD ) patterns and associations with JIA in the extended MHC (x MHC ) region, we combined SNP data from Affymetrix SNP Array 6.0 and Immunochip ( IC ) platforms with high resolution typing of 8 classical HLA genes. A cohort of about 800 affected individuals and about 500 ethnically matched controls from the Cincinnati region, as well as secondary validation cohorts of affected individuals and matched controls from Germany were used to perform the analysis, and to assess reproducibility of the results across different platforms and p opulations. Accurate high resolution maps of linkage with classical HLA genes and association with individual HLA alleles were generated. High concordance of results obtained using Affymetrix SNP Array 6.0 and IC was observed, with an additional resolution and improved mapping of associat ions provided by the latter in some regions. Several new peaks of statistically signific ant and reproducible association with JIA outside the regions of strong LD with classical HLA genes were observed, including one peak in the class III region, and one in the telomeric end of x MHC . Conditional analysis provided further evidence that these associations appear to be independent of classical HLA genes studied here. The results and observed association patterns are further discussed in the context of other recent studies on autoimmune diseases, including the role of HLA DRB 1 in adult Rheumatoid Arthritis.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2014, 18, 4; 305--320
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The em Algorithm and Its Implementation for the Estimation of Frequencies of snp-Haplotypes
Autorzy:
Polańska, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/908153.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
genetyka
informatyka
algorithms
haplotypes
likelihood functions
gene frequency
Opis:
A haplotype analysis is becoming increasingly important in studying complex genetic diseases. Various algorithms and specialized computer software have been developed to statistically estimate haplotype frequencies from marker phenotypes in unrelated individuals. However, currently there are very few empirical reports on the performance of the methods for the recovery of haplotype frequencies. One of the most widely used methods of haplotype reconstruction is the Maximum Likelihood method, employing the Expectation-Maximization (EM) algorithm. The aim of this study is to explore the variability of the EM estimates of the haplotype frequency for real data. We analyzed haplotypes at the BLM, WRN, RECQL and ATM genes with 8-14 biallelic markers per gene in 300 individuals. We also re-analyzed the data presented by Mano et al. (2002). We studied the convergence speed, the shape of the loglikelihood hypersurface, and the existence of local maxima, as well as their relations with heterozygosity, the linkage disequilibrium and departures from the Hardy-Weinberg equilibrium. Our study contributes to determining practical values for algorithm sensitivities.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2003, 13, 3; 419-429
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Senior Non-preferred Bonds as an Instrument to Meet the MREL Requirement
Obligacje typu senior non-preferred jako instrument spełnienia wymogu MREL
Autorzy:
Kozińska, Magdalena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/36106547.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Uniwersytet Łódzki. Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Tematy:
przymusowa restrukturyzacja
MREL
podrzędny dług uprzywilejowany
SNP
finansowanie bankowe
resolution
senior non-preferred
SNP bonds
bank financing
Opis:
The purpose of the article is to present the results of the first assessment of the senior non-preferred (SNP) bond market’s development in Poland. SNP bonds were introduced to facilitate meeting the banks’ MREL, which aims to build banks’ loss absorption and recapitalization capacity. At the same time, they are the next source of bank funding. The development of the SNP bond market has been initiated relatively recently with the full establishment of resolution systems and the introduction of the MREL requirement for banks. Although the first non-binding decisions to impose the MREL requirement were issued in 2016, the concept of SNP was formally introduced in 2017. In 2019, an amendment to the rules for determining the MREL requirement was adopted, which was implemented into the Polish legal framework in 2021, and in 2022, an amendment to the regulations on bonds was introduced, enabling the issuance of SNP bonds counted to MREL. Since then (2022), there has been a full legal framework for setting and maintaining the MREL requirement, and therefore full conditions for the development of this market in Poland. Therefore, it is justified to say that this market is relatively young. Moreover, it is under-investigated by scientists. This justifies the assessment of the potential scale of this market, its ability to achieve the goal for which it was created, as well as the premises and barriers to its development. Methodology. The research methods were quantitative analysis (calculation of the potential shortage of the MREL requirement and needs in the field of securities issuance based on reporting data) and qualitative analysis (in terms of assessing the challenges). Results of the research. The main determinant of its potential is the amount of MREL shortfall, which depends on the financial situation of banks and partly on the strategy of resolution authorities (responsible for setting the level of this requirement). The main challenges for the Polish SNP bond market are related to the prospects for further development of the banking sector and its environment (business and strategic). Nevertheless, it seems that the potential of the SNP bond market in Poland is underrated. The article contributes to general knowledge about bank funding sources.
Cel artykułu/hipoteza. Celem artykułu jest przedstawienie wyników pierwszej oceny rozwoju rynku obligacji niepreferowanych (SNP) w Polsce. Obligacje SNP zostały wprowadzone, aby ułatwić osiągnięcie przez banki MREL, którego celem jest budowanie zdolności banków do absorpcji strat i dokapitalizowania. Jednocześnie są kolejnym źródłem finansowania banków. Rozwój rynku obligacji SNP został zapoczątkowany stosunkowo niedawno wraz z pełnym utworzeniem systemów przymusowej restrukturyzacji i wprowadzeniem wymogu MREL dla banków. Choć pierwsze niewiążące decyzje o nałożeniu wymogu MREL wydano już w 2016 r., to już w 2017 r. formalnie wprowadzono koncepcję SNP. W 2019 r. przyjęto nowelizację zasad ustalania wymogu MREL, która została wdrożona do polskiego prawa w 2021 r. i 2022 r. wprowadzono nowelizację przepisów o obligacjach, umożliwiającą emisję obligacji SNP zaliczanych do MREL. Od tego czasu (2022 r.) istnieją pełne ramy prawne umożliwiające ustalanie i utrzymywanie wymogu MREL, a co za tym idzie pełne warunki rozwoju tego rynku w Polsce. Uzasadnione jest zatem stwierdzenie, że jest to rynek stosunkowo młody. Co więcej, jest on niedostatecznie zbadany przez naukowców. Uzasadnia to ocenę potencjalnej skali tego rynku, realizacji celu, dla którego został stworzony, a także przesłanek i barier jego rozwoju. Metodyka. Zastosowanymi metodami badawczymi była analiza ilościowa (obliczenie potencjalnego niedoboru wymogu MREL i potrzeb w zakresie emisji papierów wartościowych na podstawie danych sprawozdawczych) oraz analiza jakościowa (pod kątem oceny wyzwań). Wyniki/Rezultaty badania. Główną determinantą jego potencjału jest wielkość niedoboru MREL, która jest uzależniona od sytuacji finansowej banków, a częściowo od strategii organów przymusowej restrukturyzacji (odpowiedzialnych za ustalenie poziomu tego wymogu). Główne wyzwania stojące przed polskim rynkiem obligacji SNP związane są z perspektywami dalszego rozwoju sektora bankowego i jego otoczenia (biznesowego i strategicznego). Niemniej jednak wydaje się, że potencjał rynku obligacji SNP w Polsce jest niedoceniany. Artykuł wzbogaca ogólną wiedzę na temat źródeł finansowania banków.
Źródło:
Finanse i Prawo Finansowe; 2023, 2 (Numer Specjalny); 145-167
2391-6478
2353-5601
Pojawia się w:
Finanse i Prawo Finansowe
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SNP panel for evaluation of genetic variability and relationship in roe deer (Capreolus capreolus)
Autorzy:
Oleński, K.
Zalewski, D.
Kamiński, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16647455.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
Capreolus capreolus
genetic diversity
roe deer
Single Nucleotide Polymorphism marker
Opis:
Blood samples from forty-six roe deer (Capreolus capreolus) acquired during officially approved hunting in six hunting divisions throughout Poland were used to isolate the genomic DNA. All individuals were genotyped by MD_Bovine BeadChip (Illumina) for 46.750 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. SNPs of inappropriate clusters, with a marker call rate lower than 90% and with a minor allele frequency (MAF) lower than 0.01, located on sex chromosomes and mitochondrial DNA, were removed. Altogether, 21.033 SNP markers were included for further analysis. Observed and expected heterozygosity amounted to 0.098 and 0.119, respectively. Among 21.033 markers, a panel of 148 SNPs were selected for relationship analysis. They were unlinked and had a MAF higher than 0.2. This set of SNPs showed a probability of parentage exclusion of 1.29x10 -6 and 2.37x10 -19 for one, and two known parents, respectively. The probability of identity was estimated at 1.8x10 -40. The probabilities obtained in this study are sufficient for the monitoring and effective management of the genetic diversity of roe deer in Poland and is a cost-effective complementary tool for forensic applications.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2023, 26, 1; 29-37
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Barretts esophagus associates with a variant of IL23R gene
Autorzy:
Gaj, Pawel
Mikula, Michal
Wyrwicz, Lucjan
Regula, Jaroslaw
Ostrowski, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1040756.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Barrett's esophagus
risk
SNP
IL23R
association study
Opis:
Gastroesophageal reflux disease is regarded as a spectrum of diseases: non-erosive reflux disease (NERD), erosive reflux disease (ERD), and the far end of the spectrum represented by patients with Barrett's esophagus. Among predisposing factors, both risk and protective polymorphic variants of several genes may influence the clinical outcomes of reflux disease. Consequently, different molecular mechanisms are likely to underlie the development of clinical variants of reflux disease. Ninety six patients with reflux disease were screened for polymorphisms of CARD15, SLC22A4 (OCTN1), SLC22A5 (OCTN2), DLG5, ATG16L1 and IL23R genes which had previously been found to associate with immune-mediated chronic inflammatory disorders. While none of the polymorphisms were associated with NERD or ERD, the 1142G/A variant of the IL23R gene was found to be a risk variant in Barrett's esophagus patients. The IL23/IL23R pathway may modulate STAT3 transcriptional activity which is an essential regulator not only of immune-mediated inflammation, but also of inflammatory-associated apoptosis resistance. Although the mechanisms of metaplastic transition of inflamed squamous epithelium are undetermined as yet, our findings suggest potential involvement of alternations in the IL23/IL23R pathway as a molecular background of Barrett's esophagus development.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2008, 55, 2; 365-369
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Effect of CYP19 SNPs on milk production traits of Jersey cows
Wpływ SNP w genie CYP19 na cechy użytkowości mlecznej krów jersey
Autorzy:
Kowalewska-Luczak, I.
Michniewicz, E.
Kulig, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45215.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Opis:
The aim of this study was to examine the relationship between genotype two SNPs located in the promoter region of CYP19 gene and milk production traits. The study included 181 Jersey cows. The genotypes were identified by the PCRRFLP method. The frequencies of the most common alleles were as follows: A – 0.98 (CYP19/PvuII) and A – 0.94 (CYP19/Cfr13I). The results showed that there were no statistically significant associations between the individual genotypes of both SNPs and milk traits; however, the animals with heterozygous genotypes achieved the lowest milk yield and the highest protein and fat content in milk.
Celem pracy było zbadanie zależności między poszczególnymi genotypami dwóch SNPs zlokalizowanych w regionie promotorowym genu CYP19 a cechami użytkowości mlecznej. Badaniami objęto 181 krów rasy jersey. Genotypy poszczególnych osobników oznaczano za pomocą metody PCR-RFLP. Frekwencje alleli występujących z najwyższą częstością były następujące: 0,98 (CYP19/PvuII) i 0,94 (CYP19/Cfr13I). Statystyczna analiza wyników badań nie wykazała istotnych zależności między poszczególnymi genotypami w odniesieniu do obydwu analizowanych SNP i cech użytkowości mlecznej. Jednak w przypadku zwierząt o heterozygotycznych genotypach wykazano, że osiągały niższą wydajność mleka oraz cechowały się wyższą zawartością białka i tłuszczu w mleku.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2013, 12, 1
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Sampling Properties of Estimators of Nucleotide Diversity at Discovered snp Sites
Autorzy:
Renwick, A.
Bonnen, P. E.
Trikka, D.
Nelson, D. L.
Chakraborty, R.
Kimmel, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/908150.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
genetyka
statystyka
single nucleotide polymorphisms
ascertainment bias
nucleotide diversity
molecular evolution
Opis:
SNP sites are generally discovered by sequencing regions of the human genome in a limited number of individuals. This may leave SNP sites present in the region, but containing rare mutant nucleotides, undetected. Consequently, estimates of nucleotide diversity obtained from assays of detected SNP sites are biased. In this research we present a statistical model of the SNP discovery process, which is used to evaluate the extent of this bias. This model involves the symmetric Beta distribution of variant frequencies at SNP sites, with an additional probability that there is no SNP at any given site. Under this model of allele frequency distributions at SNP sites, we show that nucleotide diversity is always underestimated. However, the extent of bias does not seem to exceed 10-15% for the analyzed data. We find that our model of allele frequency distributions at SNP sites is consistent with SNP statistics derived based on new SNP data at ATM, BLM, RQL and WRN gene regions. The application of the theory to these new SNP data as well as to the literature data at the LPL gene region indicates that in spite of ascertainment biases, the observed differences of nucleotide diversity across these gene regions are real. This provides interesting evidence concerning the heterogeneity of the rates of nucleotide substitution across the genome.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2003, 13, 3; 385-394
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ink based on poly(3,4-ethylene dioxythiophene), poly(sulfonostyrene) and silver nanoparticles (PEDOT/PSS/SNP) blends for fabrics printing
Atrament na bazie mieszaniny poli(3,4-etylenodioksytiofenu), poli(sulfonostyrenu) i nanocząstek srebra (PEDOT/PSS/SNP) do drukowania tkanin
Autorzy:
Shahrim, Nur’Aishah Ahmad
Hafiz, Nur Nadia Mohd
Ahmad, Zuraida
Azman, Amelia Wong
Buys, Yose Fachmi
Sarifuddin, Norshahida
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2200486.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Chemii Przemysłowej
Tematy:
poly(3,4-ethylenedioxythiophene)
poly(sulfonostyrene)
silver nanoparticles
inkjet printing
fabric
poli(3,4-etyleno dioksytiofen)
poli(sulfonostyren)
nanocząstki srebra
druk atramentowy
tkanina
Opis:
The influence of co-solvents such as: dimethylsulfoxide (DMSO), isopropyl alcohol (IPA), ethylene glycol (EG), ethanol (EtOH) and deionized water (DI) on the properties of ink based on poly(3,4--ethylene dioxythiophene), poly(sulfonostyrene) and silver nanoparticles (PEDOT/PSS/SNP) blends was investigated. The ink was obtained by the ultrasonic dispersion method by mixing PEDOT, PSS and SNP and then adding co-solvents. The ink was applied to the cotton fabric by printing method. The structure, electrical and functional properties of fabrics were investigated. The increase in electrical conductivity was found as a result of the phase separation between PEDOT and PSS due to the use of co-solvents. SEM micrographs showed good adhesion of the ink to the cotton fiber, which was confirmed by the FTIR method. The developed ink has great application potential, especially in electronic devices for biomedical purposes.
Zbadano wpływ współrozpuszczalników, takich jak: dimetylosulfotlenek (DMSO), alkohol izopropylowy (IPA), glikol etylenowy (EG), etanol (EtOH) i dejonizowana woda (DI) na właściwości atramentu otrzymanego na bazie mieszaniny poli(3,4-etyleno dioksytiofenu), poli(sulfonostyrenu) i nanocząstek srebra (PEDOT/PSS/SNP). Atrament otrzymano metodą dyspersji ultradźwiękowej poprzez wymieszanie PEDOT, PSS i SNP, a następnie dodanie współrozpuszczalników. Na tkaninę bawełnianą atrament nanoszono metodą druku. Zbadano strukturę, właściwości elektryczne i funkcjonalne tkaniny. Stwierdzono zwiększenie przewodnictwa elektrycznego jako efekt rozdziału faz między PEDOT i PSS na skutek zastosowania współrozpuszczalników. Mikrofotografie SEM wykazały dobrą adhezję atramentu do włókna bawełnianego, co potwierdzono metodą FTIR. Opracowany atrament ma duży potencjał aplikacyjny, zwłaszcza w urządzeniach elektronicznych do celów biomedycznych.
Źródło:
Polimery; 2022, 67, 6; 249--254
0032-2725
Pojawia się w:
Polimery
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Genetic polymorphism of Klotho gene and bladder cancer risk
Polimorfizm genu Klotho a ryzyko raka pęcherza moczowego
Autorzy:
Szymczak, Agnieszka
Forma, Ewa
Krześlak, Anna
Jóźwiak, Paweł
Bryś, Magdalena
Madej, Adam
Różański, Waldemar
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1032775.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Łódzkie Towarzystwo Naukowe
Tematy:
genetic polymorphism
klotho
bladder cancer
snp
polimorfizm genów
rak pęcherza
Opis:
Introduction: Bladder cancer is the most frequent tumor of the urinary tract in Poland. Klotho gene can act as an suppressor gene. Therefore, variability of this gene might be implicated in the carcinogenesis of urinary bladder. The aim of the study was analysis of the association between the g.33590184 G>A (rs1207568), g.33634983 C>T (rs564481), g.33628193 G>C (rs9527025) polymorphisms of the Klotho gene and bladder cancer risk. Materials and methods: The study included 96 patients diagnosed with transitional cell carcinoma of the bladder (TCC) and 114 healthy, cancer-free individuals. Three selected polymorphisms were typed by PCR with confronting two-pair primers (PCR-CTPP) and Real Time PCR with TaqMan probes. Results: The GA and AA genotypes of the rs1207568 polymorphism increased the risk of bladder cancer (OR = 1.86, 95% CI [1.04-3.33], p = 0.03 and OR = 6.58, 95% CI [1.27-34.02], p = 0.01, respectively). Individuals who were heterozygous and homozygous for the A variant had 2.10-fold higher risk of bladder cancer (OR = 2.10, 95% CI [1.20-3.65], p = 0.009). On the other hand, heterozygous subjects and homozygous carriers of the wild-type allele (G) had a decreased bladder cancer risk (OR = 0.19, 95% CI [0.04-0.95], p = 0.043). Also, the occurrence of bladder cancer was positively correlated with the presence of the GC genotype of the rs9527025 polymorphism (OR = 2.84, 95% CI [1.57-5.15], p = 0.0001). Conclusions: Two polymorphisms of Klotho gene (rs1207568 and rs9527025) may play a role in susceptibility to bladder cancer.
Wstęp: Rak pęcherza moczowego jest najczęściej występującym nowotworem układu moczowego w Polsce. Sugeruje się, że gen Klotho może pełnić funkcje genu supresorowego. W związku z tym, polimorfizm genu Klotho może mieć wpływ na proces transformacji nowotworowej pęcherza moczowego. Celem przedstawionych badań był analiza związku pomiędzy występowaniem wybranych polimorfizmów pojedynczych nukleotydów g.33590184 G>A (rs1207568), g.33634983 C>T (rs564481), g.33628193 G>C (rs9527025) a ryzykiem zachorowania na raka pęcherza moczowego. Materiały i metody: Do badań włączono 96 pacjentów ze zdiagnozowanym przejściowokomórkowym rakiem pęcherza moczowego (TCC; transitional cell carcinoma) oraz 114 osób zdrowych, u których nie stwierdzono choroby nowotworowej. Występowanie trzech wybranych polimorfizmów analizowano przy użyciu techniki PCR z dwiema parami przeciwstawnych starterów (PCR-CTPP; PCR with confronting two-pair primers) oraz metody Real Time PCR z sondami fluorescencyjnymi TaqMan. Wyniki: Genotypy GA i AA polimorfizmu rs1207568 wpływają na wzrost ryzyka zachorowania na przejściowokomórkowego raka pęcherza moczowego (OR = 1,86, 95% PU [1,04-3,33], p = 0,03 oraz OR = 6,58, 95% CI [1,27-34,02], p = 0,01, odpowiednio). U osób będących heterozygotami lub homozygotami pod względem allela A wykazano ponad 2-krotnie wyższe ryzyko zachorowania na raka pęcherza moczowego (OR = 2,10, 95% PU [1,20-3,65], p = 0,009). Natomiast w przypadku nosicieli allela G, w układzie homozygotycznym lub heterozygotycznym, obserwowano spadek ryzyka zachorowania na badany nowotwór (OR = 0,19, 95% PU [0,04-0,95], p = 0,043). W przypadku polimorfizmu rs952705 wykazano, że genotyp GC zwiększa ryzyko zachorowania na przejściowokomórkowego raka pęcherza moczowego (OR = 2,84, 95% PU [1,57-5,15], p = 0,0001).Wnioski: Dwa spośród badanych polimorfizmów genu Klotho (rs1207568 i rs9527025) mogą mieć wpływ na predyspozycję do zachorowania na przejściowokomórkowego raka pęcherza moczowego.
Źródło:
Folia Medica Lodziensia; 2012, 39, 2; 189-205
0071-6731
Pojawia się w:
Folia Medica Lodziensia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 22

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies