Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "plant identification" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Partial characterisation of cucumber mosaic virus isolate infecting Lonicera caprifolium L. plants
Częściowa charakterystyka izolatu wirusa mozaiki ogórka (CMV) z roślin Lonicera caprifolium L.
Autorzy:
Kamińska, M.
Śliwa, H.
Malinowski, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11364520.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:
identification
plant disease
cucumber mosaic virus
honeysuckle
virus isolate
Lonicera caprifolium
plant infection
Opis:
Plants of honeysuckle (Lonicera caprifolium L.) from commercial nursery, showing stunted growth and severe leaf and flower malformation were found to be naturally infected with Cucumber mosaic virus (CMV). The virus was identified on the basis of its host range and in vitro and serological properties. It was mechanically transmitted onto therteen herbaceous test plants and induced local or local and systemic symptoms. The isolated virus had a TIP of 65–70°C, a LIV of 4–5 h and DEP of 10⁻⁴–10⁻⁵. It reacted positively in DAS-ELISA with CMV-ToRS (II) commercial antibodies but not with antibodies against CMV-DTL (I). Rabbit antiserum was produced, and it showed the titre at least 128 000 in F(ab’)₂ -ELISA with homologous isolate, as well as with isolate CMV-M belonging to serogroup DTL.
Stwierdzono obecność wirusa mozaiki ogórka (CMV) w naturalnie porażonych roślinach wiciokrzewu (Lonicera caprifolium L.) wykazujących zahamowanie wzrostu oraz silną deformację liści i kwiatów. Wirusa zidentyfikowano na podstawie reakcji testowych roślin zielnych, jego właściwości w warunkach in vitro oraz właściwości serologicznych. Wirusa przeniesiono w sposób mechaniczny na trzynaście gatunków roślin zielnych, u których wywoływał objawy lokalne lub lokalne i systemiczne. TIP wirusa określono na 65-70º C, LIV 4-5 godzin a DEP 10⁻⁴ do 10⁻⁵. W teście DAS-ELISA wirus reagował pozytywnie z przeciwciałami na CMV-ToRS (II), a nie reagował z przeciwciałami na CMV- DTL (I). Przygotowano surowicę króliczą, której miano w teście F(ab')₂ ELISA wynosiło co najmniej 128 000, zarówno w reakcji z izolatem homologicznym jak i z izolatem M, należącym do serogrupy DTL.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2005, 04, 2; 3-10
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification and binomial computerization of plant species
Autorzy:
Karthik, K.
Pugalenthi, M.
Sharavanan, P.S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11186.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
identification
binomial computerization
plant species
new technology
computerization process
Opis:
The binomial computerization method is comparison of certain similarities and differences of plants identification system. The ultimate purpose of the plants identification process is method of using digital tools of database and creating new version of plants identification for constructing the digital keys. The present study of plant identification system is based on computerization processes. The plants species characters are constructing basis on taxonomical literature and followed by suitable classification system and binomial rules.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2014, 14
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of medicinal plant Schisandra chinensis using a potential DNA barcode ITS2
Autorzy:
Li, X.-K.
Wang, B.
Han, R.-C.
Zheng, Y.-C.
Yin, H.-B.
Xu, L.
Zhang, J.-K.
Xu, B.-L.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/56996.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
identification
internal transcribed spacer
medicinal plant
Schisandra chinensis
DNA barcode
Opis:
To test whether the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region is an effective marker for using in authenticating of the Schisandra chinensis at the species and population levels, separately. And the results showed that the wild populations had higher percentage of individuals that had substitution of C→A at site 86-bp than the cultivated populations. At sites 10-bp, 37-bp, 42-bp and 235-bp, these bases of the Schisandra sphenanthera samples differed from that of S. chinensis. Two species showed higher levels of inter-specific divergence than intra-specific divergence within ITS2 sequences. However, 24 populations did not demonstrate much difference as inter-specific and intra-specific divergences were concerned. Both S. chinensis and S. sphenanthera showed monophyly at species level, yet the samples of different populations shown polyphyly at population level. ITS2 performed well when using BLAST1 method. ITS2 obtained 100% identification success rates at the species level for S. chinensis, with no ambiguous identification at the genus level for ITS2 alone. The ITS2 region could be used to identify S. chinensis and S. sphenanthera in the “Chinese Pharmacopoeia”. And it could also correctly distinguish 100% of species and 100% of genera from the 193 sequences of S. chinensis. Hence, the ITS2 is a powerful and efficient tool for species identification of S. chinensis.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2013, 82, 4
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Isolation and identification of elite phosphate solubilizing bacteria from soil under paddy cultivation
Autorzy:
Gandhi, A.
Muralidharan, G.
Sudhakar, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11092.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
isolation
identification
phosphate
phosphate solubilizing bacteria
soil
paddy
plant cultivation
Bacillus
rhizobacteria
Opis:
A considerable number of bacterial species are able to exert a beneficial effect upon plant growth. Mostly they are associated with the plant rhizosphere, so they are called as rhizobacteria. Phosphorus is an essential element for plant development and growth making up about 0.2 % of plant dry weight. Several scientists have reported the ability of different bacterial species to solubilize insoluble inorganic phosphate compounds, such as tricalcium phosphate, dicalcium phosphate, hydroxyapatite, and rock phosphate. Detection and estimation of the phosphate solublization ability of microorganisms have been possible using plate screening methods. Phosphate solubilizers produce clearing zones around the microbial colonies in growth media. In the present investigation a total number of fifteen phosphate solubilizing bacterial colonies isolated from different paddy soils in Cuddalore district of Tamilnadu, India. The isolated PSB were identified and characterized for effective use in the field. All the PSB isolates were identified as Bacillus species and designated as P with serial number from 1 to 15. Among the fifteen isolates, the PSB isolate P6 showed highest amount of phosphate solubilization. The quantity of available phosphorus estimated in the P6 grown Sperber broth culture medium on 7th day was maximum of 321.7 μg/ml which was the highest value compared to other PSB isolates.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2014, 11, 1
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A comparative and experimental study on gradient and genetic optimization algorithms for parameter identification of linear MIMO models of a drilling vessel
Autorzy:
Bańka, S.
Brasel, M.
Dworak, P.
Jaroszewski, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/329756.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
MIMO dynamic plant
identification
nonlinear system
system MIMO
identyfikacja parametryczna
układ nieliniowy
Opis:
The paper presents algorithms for parameter identification of linear vessel models being in force for the current operating point of a ship. Advantages and disadvantages of gradient and genetic algorithms in identifying the model parameters are discussed. The study is supported by presentation of identification results for a nonlinear model of a drilling vessel.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2015, 25, 4; 877-893
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of genetic diversity among Arnica montana L. genotypes using RAPD markers
Analiza zróżnicowania genetycznego wśród genotypów Arnica montana L. za pomocą markerów RAPD
Autorzy:
Okoń, S.
Paczos-Grzęda, E.
Łoboda, M.
Sugier, D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11542962.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:
DNA polymorphism
identification
genetic diversity
Arnica montana
genotype
RAPD marker
medicinal plant
molecular analysis
Opis:
Arnica montana L. is one of the most important herbal plants used in medicine, pharmaceutical and cosmetic industry. The number of studies performed with molecular markers on arnica genotypes is very limited. Because of this fact the aims of presented examination were optimization of protocols DNA isolation from fresh leaves of A. montana and identification of genetic diversity among this plant genotypes. In presented study to obtain pure DNA Plant & Fungi DNA Purification Kit (EURx) were used. To clean obtained DNA long and slow electrophoresis and isolation DNA from gels were used. A. montana genotypes were analyzed using 40 RAPD primers (Operon Technologies), out of which 12 produced high number of polymorphic and repeatable fragments. In total, selected primers produced 120 fragments, among them 111 (92.5%) were polymorphic. The genetic similarity matrices were produced based on RAPD using the Dice’s coefficient. RAPD based genetic similarity was estimated between 0.535 and 0.945. The highest genetic similarity was estimated among GA17 and GA18 genotypes, which are closely located on the obtained dendrogramme.
Arnica montana L. jest jedną z najcenniejszych roślin zielarskich wykorzystywanych w medycynie, farmacji i przemyśle kosmetycznym. W dostępnej literaturze liczba doniesień związanych z analizą molekularną arniki jest znikoma, dlatego też celem prezentowanych badań była optymalizacja procesu izolacji DNA ze świeżych liści oraz identyfikacja zróżnicowania genetycznego oparta na markerach RAPD. W prezentowanej pracy w celu uzyskania czystego DNA do izolacji wykorzystano zestaw DNA Plant & Fungi DNA Purification Kit (Euro) oraz oczyszczanie za pomocą długiej elektroforezy w żelu agarozowym. Spośród testowanych 40 starterów RPAD do analiz wybrano 12 generujących stabilne i polimorficzne wzory prążków. Wyselekcjonowane startery amplifikowały 120 fragmentów, spośród których 111 (92,5%) było polimorficznych. Wykorzystujac markery RAPD utworzono matryce podobieństwa genetycznego. średnia wartość podobieństwa analizowanych genotypów wynosiła 0.886. Najwyższy współczynnik podobieństwa genetycznego oszacowano pomiędzy genotypami GA17 i GA18, które ulokowały się blisko siebie na uzyskanym dendrogramie.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2014, 13, 4; 63-71
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Diversity of Pseudomonas species associated with soft rot of plants in Poland
Autorzy:
Zolobowska, L
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65211.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Pseudomonas fluorescens
Polska
Pseudomonas
polymerase chain reaction
occurrence
Pseudomonas putida
heterogeneity
identification
plant
Opis:
A total of 94 pectolytic and 60 nonpectolytic Pseudomonas isolates were obtained from 250 samples of rotted vegetable specimens representing various economically important vegetables. The isolates were identified on the basis of standard biochemical tests. Pseudomonas fluorescens biovar V and II and Pseudomonas putida were the most abundant species among pectolytic isolates and Pseudomonas fluorescens biovar I among nonpectolytic ones. Only 3 Pseudomonas viridiflava isolates were identified and all of them were obtained from potato. Isolates of pectolytic phenotype were scattered among nonpectolytic ones irrespective of their taxonomical status. Isolates identified biochemically, as Pseudomonas marginalis were also present in nonpectolytic group. PCR method is unsuitable for identification and differentiation of bacteria belonging to pectolytic fluorescens Pseudomonas group due to great diversity of species. However, the results of PCR amplification of the genes encoding pectate lyase suggest that genes responsible for production of this enzyme may also be present in isolates of nonpectolytic phenotype.
Z 250 prób, z różnych gatunków roślin warzywnych z objawami mokrej zgnilizny wyodrębniono 94 izolaty pektynolitycznych i 60 izolatów nie pektynolitycznych bakterii z rodzaju Pseudomonas. Identyfikację i różnicowanie izolatów przeprowadzono przy zastosowaniu standardowych testów fizjologiczno-biochemicznych. Spośród izolatów z grupy pektolitycznych Pseudomonas najliczniej występował gatunek P. fluorescens, który był reprezentowany przez 4 biowary (oprócz czwartego), przy czym dominowały biowary II i V. Mniej licznie występował gatunek P. putida, a P. viridiflava był reprezentowany jedynie przez 3 izolaty, pochodzące z ziemniaka. Podobna była struktura populacji izolatów z grupy niepektolitycznych Pseudomonas. Metoda PCR okazała się być mało przydatna do wykrywania i różnicowania izolatów z grupy pektolitycznych Pseudomonas ze względu na duże ich zróżnicowanie. Amplifikacja DNA metodą PCR wykazała, że geny kodujące enzym liazy pektynowej występują także w izolatach niepektolitycznych rodzaju Pseudomonas.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2001, 41, 1
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
9alpha-hydroxyparthenolide in Zoegea leptaurea subsp. mesopotamica (Czerep.) Rech. (Asteraceae)
9alfa-hydroksypartenolid w Zoegea leptaurea subsp. mesopotamica (Czerep.) Rech. (Asteraceae)
Autorzy:
Nawrot, J.
Dawid-Pac, R.
Kaczerowska-Pietrzak, K.
Urbanska, M.
Nowak, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/72392.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Instytut Włókien Naturalnych i Roślin Zielarskich
Tematy:
9-alpha-hydroxyparthenolide
isolation
identification
spectral analysis
plant material
Zoegea leptaurea ssp.mesopotamica
Compositae
chemotaxonomy
Opis:
From the aerial parts of Zoegea leptaurea subsp. mesopotamica (Czerep.) Rech. (syn Zoegea mesopotamica Czerep.), 9α-hydroxyparthenolide was isolated. This compound was identified by spectral methods (1H NMR and 13C NMR). This research confirmed earlier indications about the presence of 4,5-epoxygermacranolides in the Zoegea L. genus. Thus, distinctive chemistry feature of plants in this taxon has chemotaxonomic implications.
Z ziela Zoegea leptaurea subsp. mesopotamica (Czerep.) Rech. (syn Zoegea mesopotamica Czerep.) wyizolowano 9α-hydroksypartenolid. Związek ten zidentyfikowano za pomocą analiz spektralnych (1H NMR i 13C NMR). Potwierdzono tym samym wcześniejsze doniesienia o występowaniu 4,5-epoksygermakranolidów w rodzaju Zoegea L. Uzyskane dane mają walor chemotaksonomiczny.
Źródło:
Herba Polonica; 2015, 61, 2
0018-0599
Pojawia się w:
Herba Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A brief history of rose cultivation in Lithuania in the 18th–19th centuries. The legacy of old garden roses and their identification
Krótka historia uprawy róż na Litwie w XVIII i XIX w. Spuścizna dawnych róż ogrodowych i ich identyfikacja
Autorzy:
Ryliene, D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/888485.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Dendrologiczne
Tematy:
history
plant cultivation
rose
Lithuania
18th century
19th century
old garden rose
identification
Źródło:
Rocznik Polskiego Towarzystwa Dendrologicznego; 2018, 66
2080-4164
2300-8326
Pojawia się w:
Rocznik Polskiego Towarzystwa Dendrologicznego
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Incidence of seed-borne fungi on Lupinus mutabilis depending on a plant morphotype, sowing date and plant density
Autorzy:
Pszczolkowska, A.
Okorski, A.
Kotecki, A.
Gas, M.
Kulik, T.
Reczek, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/961386.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie / Polskie Towarzystwo Magnezologiczne im. Prof. Juliana Aleksandrowicza
Tematy:
seed-borne fungi
Lupinus mutabilis
plant
seed health
seed yield
Andean lupin
macronutrient
morphotype
sowing date
plant density
Colletotrichum
identification
Opis:
Seeds of the Andean lupine are characterised by high nutritional value, and the plant could become an important crop in the production of food and forage. This legume continues to attract growing interest around the world. A field experiment was carried out in in Lower Silesia, Poland, in 2011-2012. Two Andean lupine morphotypes (indeterminate and determinate) were analysed. Andean lupine was grown in treatments characterised by different sowing dates and plant density per m2. Seed yield, macronutrient content, protein content and health were evaluated at harvest. Seed yield was determined by the interaction of all experimental factors. The indeterminate form produced a significantly higher yield than the determinate form, regardless of the sowing date. The factors had little influence on the mineral content of seeds and total protein content. Andean lupine seeds were colonised mostly by saprotrophic fungi of the genera Alternaria, Cladosporium, Epicoccum and Rhizopus and pathogenic fungi of the genera Botrytis, Colletotrichum and Fusarium. Delayed sowing contributed to seed colonisation by fungi of the genus Colletotrichum. The determinate form was more susceptible to infection than the indeterminate form. Molecular analysis showed that the Colletotrichum isolates found in the study belong to the Colletotrichum acutatum species complex. The pathogen causing lupine anthracnose, isolated from the seeds of Andean lupine in the present study, was identified as Colletotrichum lupini (within C. acutatum complex) in a molecular analysis, and its DNA sequence was compared with those of the isolates deposited in the GenBank.
Źródło:
Journal of Elementology; 2016, 21, 2
1644-2296
Pojawia się w:
Journal of Elementology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification and characterization of Pseudomonas syringae pv. syringae strains from various plants and geographical regions
Autorzy:
Khezri, M.
Mohammadi, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65669.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
identification
Pseudomonas syringae pv.syringae
plant
phenotype
polymerase chain reaction
protein profile
plasmid
syringomycin
geographic region
Opis:
Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) constitutes a diverse group of bacterial strains that cause canker of stone fruits, blight of cereals and red streak of sugarcane. The purpose of this study was to determine how diverse Iranian strains of Pss are when they come from different hosts. We compared a total of 32 Pss strains isolated from stone fruits, barley, wheat and sugarcane from different geographical regions of Iran based on their phenotypic and molecular properties. Strains showed some variation regarding carbon and nitrogen utilization. Pss strains were similar in their protein banding patterns. Additional bands were found in sugarcane strains. Most strains showed one indigenous plasmid DNA and a few had two and some none. The genes of syrB and syrD encoding syringomycin synthesis and secretion, respectively, were amplified using specific primers in polymerase chain reaction. Syringomycin, producing strains amplified two DNA fragments of 752 and 446 bp representing syrB and syrD genes, respectively. Primer specificity was shown for Pss using various genera. Based on the results of this study, it is suggested that Pss strains from different hosts and geographical regions show diversity in phenotypic and molecular characters. It is thought that phenotypic variation is due to adaptation to specific hosts and niches for survival and pathogenicity.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2018, 58, 4
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis by the polymerase chain reaction [PCR]
Autorzy:
Cajza, M
Rezler, A.
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65945.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
tomato seed
pathogen
Clavibacter michiganensis
plant protection
bacteria
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
seed
identification
Opis:
The PCR offers the possibility of specific and very sensitive detection and/or identification of Cl. m. subsp. michiganensis in seeds. The described PCR method for identification of this pathogen is very fast (one day) and economical, because of the very small volume (10 μI) of the PCR reaction mixture. The method based on amplification of the bacterial plasmid DNA fragment may be very useful in routine identification of Cl. m. subsp. michiganensis from all other bacteria isolated from tomato seeds and may be an alternative tool in diagnostics, especially for the quarantine services.
Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis jest bardzo groźnym patogenem kwarantannowym pomidora, wywołującym chorobę zwaną bakteryjnym rakiem pomidora. Bakteria ta łatwo przenosi się z zakażonymi nasionami i sadzonkami. Pomimo opracowania różnych technik diagnostycznych do jej wykrywania, nadal stanowi duży problem w diagnozowaniu chorób pomidora. Powszechnie stosowane w Polsce wykrywanie tej bakterii, bazujące na testach enzymoimmunologicznych (ELISA), immunofluorescencyjnych, hodowli na pożywkach półselektywnych i testach biologicznych, jest często zawodne ze względu na duże serologiczne zróżnicowanie poszczególnych szczepów tej bakterii, obecność wielu bakterii saprofitycznych, tworzących kolonie nie różniące się morfologicznie od kolonii właściwych dla Cl. m. subsp. michiganensis, czy też mało przydatne ze względu na długi czas trwania testu i obecność infekcji latentnych. Jedną z nowoczesnych metod wykrywania i identyfikacji bakterii jest amplifikacja fragmentów DNA charakterystycznych dla jej genomu przy pomocy reakcji PCR. Metoda ta dopiero zaczyna być powszechnie stosowana w diagnostyce bakterii (nieliczne doniesienia, w większości z ostatnich trzech lat). Opracowana metoda identyfikacji Cl. m. subsp. michiganensis spośród różnych bakterii saprofitycznych obecnych na nasionach pomidora, charakteryzuje się bardzo dużą czułością (do wykrycia Cl. m. subsp. michiganensis wystarczy 200-300 bakterii / 1 ml), specyficznością (produkty amplifikacji DNA bakteryjnego o oczekiwanej długości 614 bp, uzyskiwano tylko w próbkach, w których znajdował się DNA z Cl. m. subsp. michiganensis) oraz szybkością (jeden dzień, wraz z izolacją DNA bakteryjnego). Ponadto opracowana metoda charakteryzuje się bardzo niskimi kosztami, gdyż cala reakcja amplifikacji DNA zachodzi w objętości 10 μI (4 μI zawiesiny DNA i 6 μI mieszaniny reakcyjnej), co sprawia, że stosowanie tej metody w powszechnej diagnostyce chorób bakteryjnych będzie coraz częstsze i będzie ona coraz bardziej konkurencyjna w stosunku do innych, obecnie stosowanych.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Proteomics of E.coli Nissle 1917 in response to Cocos nucifera sap and wine
Autorzy:
Chandrasekhar, K
Pramoda Kumari, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11862.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
proteomics
Escherichia coli
plant response
coconut palm
Cocos nucifera
sap
wine
protein
probiotic
identification
scanning
Opis:
In the present study, we described the protein profile experimentally by 2D-PAGE and MALDI analysis to understand the stress mechanisms of cocoti sap and wine on E.coli Nissle 1917. We isolated one newly expressed protein from cocoti wine treated gel which is not present in both control and cocoti sap treated sample i.e. P21 prophage-derived head-stabilizing proteinVG03_ECOL6 (3n1) also called as Head protein gp3. This protein mainly activities related to the viral life cycle. It helps to attach the viral gene into host. The growth rate was delayed in cocoti wine treated E.coli Nissle 1917 when compared to control and cocoti sap treated samples. Stress mechanism induce many proteins they are involved in metabolic process, hydrolase activity, lyase activity, quinone binding, phosphotransferase system, carbohydrate metabolism, DNA binding, DNA repair, transferase activity, oxidoreductase, purine metabolism, transcription antitermination, transcription regulation and other related activities. We proved that the predicted protein structure quality, resolution, density and error plot values by QMEAN analysis. Based on these results, only two differentially expressed proteins under sap stress showed that the significant results, which were N-acetylgalactosamine-specific phosphotransferase enzyme IIB component 1, PTPB1_ECOLI and DinI-like protein Z3305/ECs2939 in prophage CP-933VDINI1_ECO57. In case of wine stress, the differentially expressed proteins were Transcription anti-termination protein RFAH- ECO57 NusA and PUR7- eco24- phosphoribosylamidazole-succinocarboxamide synthase showed significant results. ProtParam analysis indicating that the multiple physico-chemical characters of differentially expressed proteins were differed and compared. The phylogenetic tree represents the relationship in-between the differentially expressed proteins, were showed siblings (related) as well as monophytic clade.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2015, 41
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification and pathogenicity of Botryosphaeria parva associated with grapevine decline in Kurdistan region - Iraq
Identyfikacja i patogeniczność grzybów Botryosphaeria parva związanych z zamieraniem winorośli w regionie Kurdystanu w Iraku
Autorzy:
Haleem, R.A.
Abdullah, S.K.
Jubrael, J.M.S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/28424.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
identification
pathogenicity
Botryosphaeria parva
grapevine
Kurdistan region
Iraq
fungi
plant cultivar
pathogen isolate
canker
green shoot
field condition
black dead arm
plant disease
Opis:
During a survey on fungi associated with decline symptoms on grapevine cultivars growing in Kurdistan region of Iraq, several isolates of Botryosphaeria species were encountered. All isolates were identified as Botryosphaeria parva Pennycook and Samuels. Pathogenicity test for isolate DKI 1 was performed on two cultivars, Taefi and Rashmew. Under greenhouse conditions, one-year grape rooted cuttings were inoculated with the pathogen isolate by two methods, injecting the spore suspension into the green shoots and by artificial inoculation of wounded shoots with mycelial mat. The highest canker length (15.0 mm) was produced after four months on the shoots of the Taife cultivar artificially inoculated with mycelial mat of the pathogen. Under field conditions, two methods of inoculation were adopted, wounding the green shoots and drilling a hole in the arms of mature vine, followed by inoculation with mycelial mat. The highest canker length (11.17 mm) was obtained after 5 months on wounded shoots of the Rashmew cultivar and with a significant difference from the Taefi cultivar. The pathogen caused a reduction in fresh and dry weight of green shoots and roots compared with the non-inoculated control. This is the first report on B. parva in Iraq.
W trakcie prowadzenia badań nad grzybami związanymi z symptomami zamierania gatunków winorośli rosnących w regionie Kurdystan w Iraku natrafiono na kilka izolatów gatunków z rodzaju Botryosphaeria. Wszystkie izolaty oznaczono jako Botryosphaeria parva Pennycook i Samuels. Na dwóch odmianach, ‘Taefi’ i ‘Rashmew’, wykonano test patogeniczności dla izolatu DKI 1. W warunkach szklarniowych jednoroczne ukorzenione sadzonki winorośli inokulowano izolatem patogena przy użyciu dwóch metod: wstrzykując zawiesinę zarodników grzyba w zielone pędy oraz poprzez sztuczną inokulację naciętych pędów za pomocą grzybni. Nekroza o największej długości (15,0 mm) powstała po czterech miesiącach na pędach odmiany Taife sztucznie inokulowanych grzybnią patogena. W warunkach polowych przyjęto dwie metody inokulacji: nacięcie zielonych pędów oraz wywiercenie dziurki w gałęziach dojrzałej winorośli, po czym dokonano inokulacji grzybnią. Nekrozę o największej długości (11,17 mm) uzyskano po 5 miesiącach na naciętych pędach odmiany Rashmew, przy czym różnica w stosunku do odmiany Taefi była istotna. Patogen spowodował zmniejszenie świeżej i suchej masy pędów zielonych i korzeni w porównaniu z nieokulowaną kontrolą. Jest to pierwsze doniesienie na temat grzyba B. parva w Iraku.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2012, 65, 1
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Enhancement of fungal DNA templates and PCR amplification yield by three types of nanoparticles
Autorzy:
Al-Dhabaan, F.A.
Yousef, H.
Shoala, T.
Shaheen, J.
El Sawi, Y.
Farag, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65369.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
plant pathology
detection
identification
plant pathogen
toxigenic fungi
improvement
specificity
efficiency
polymerase chain reaction
Alternaria alternata
DNA extraction
nanoparticle
Rhizoctonia solani
nanobiotechnology
Opis:
Nanodiagonastic methods in plant pathology are used for enhancing detection and identification of different plant pathogens and toxigenic fungi. Improvement of the specificity and efficiency of the polymerase chain reaction (PCR) by using some nanoparticles is emerging as a new area of research. In the current research, silver, zinc, and gold nanoparticles were used to increase the yield of DNA for two plant pathogenic fungi including soil-borne fungus Rhizoctonia solani and toxigenic fungus Alternaria alternata. Gold nanoparticles combined with zinc and silver nanoparticles enhanced both DNA yield and PCR products compared to DNA extraction methods with ALB buffer, sodium dodecyl sulfate, ALBfree from protinase K, ZnNPs and AgNPs. Also, by using ZnNPs and AgNPs the DNA yield was enhanced and the sensitivity of random amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR products was increased. Application of nanomaterials in the PCR reaction could increase or decrease the PCR product according to the type of applied nanometal and the type of DNA template. Additions of AuNPs to PCR mix increased both sensitivity and specificity for PCR products of the tested fungi. Thus, the use of these highly stable, commercially available and inexpensive inorganic nano reagents open new opportunities for improving the specificity and sensitivity of PCR amplicon, which is the most important standard method in molecular plant pathology and mycotoxicology.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2018, 58, 1
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies