Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "yeast evolution" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-1 z 1
Tytuł:
Application of Gillespie algorithm for simulating evolution of fitness of microbial population
Autorzy:
Gil, Jarosław
Polański, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/38433970.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Promocji Wiedzy
Tematy:
clonal evolution
mutation waves
yeast evolution
numerical modelling
Opis:
In this study we present simulation system based on Gillespie algorithm for generating evolutionary events in the evolution scenario of microbial population. We present Gillespie simulation system adjusted to reproducing experimental data obtained in barcoding studies – experimental techniques in microbiology allowing tracing microbial populations with very high resolution. Gillespie simulation engine is constructed by defining its state vector and rules for its modifications. In order to efficiently simulate barcoded experiment by using Gillespie algorithm we provide modification – binning cells by lineages. Different bins define components of state in the Gillespie algorithm. The elaborated simulation model captures events in microbial population growth including death, division and mutations of cells. The obtained simulation results reflect population behavior, mutation wave and mutation distribution along generations. The elaborated methodology is confronted against literature data of experimental evolution of yeast tracking clones sub-generations. Simulation model was fitted to measurements in experimental data leading to good agreement.
Źródło:
Applied Computer Science; 2022, 18, 4; 5-15
1895-3735
2353-6977
Pojawia się w:
Applied Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-1 z 1

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies