Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "single nucleotide polymorphism." wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 25
Tytuł:
Genetic diversity in Vernonia amygdalina Delile accessions revealed by random amplified polymorphic DNAs (RAPDs)
Autorzy:
Aikpokpodion, P.
Abebe, J.
Igwe, D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/79809.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
genetic diversity
Vernonia amygdalina
random amplified polymorphic DNA
polymorphism
molecular characteristics
single-nucleotide polymorphism
geographic differentiation
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2018, 99, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular identification of blast resistance genes in rice genotypes using gene-specific markers
Autorzy:
Al-Daej, M.I.
Ismail, M.
Rezk, A.A.
El-Malky, M.M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80189.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
molecular identification
resistance gene
rice genotype
Oryza sativa
DNA marker
single-nucleotide polymorphism
simple sequence repeat
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2019, 100, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A comprehensive in silico prediction of the most deleterious missense variants in the bovine LEP gene
Autorzy:
Al-Shuhaib, M.B.S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80824.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
LEP gene
leptin
biological activity
bovine gene
single nucleotide polymorphism
coding sequence
cattle
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2019, 100, 4
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The mRNA sequence polymorphisms of flowering key genes in bolting sensitive or tolerant sugar beet genotypes
Autorzy:
Alimirzaee, M.
Mirzaie-Asl, A.
Abdollahi, M.R.
Kolaei, H.E.
Fasahat, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/79841.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
sugar-beet
Beta vulgaris ssp.maritima
mRNA
polymorphism
flowering
single nucleotide polymorphism
genetic control
RNA extraction
protein structure prediction
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2017, 98, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Association of XRCC6 C1310G and LIG4 T9I polymorphisms of NHEJ DNA repair pathway with risk of colorectal cancer in the Polish population
Autorzy:
Balinska, Kinga
Wilk, Damian
Filipek, Beata
Mik, Michal
Zelga, Piotr
Skubel, Pawel
Dziki, Łukasz
Dziki, Adam
Mucha, Bartosz
Kabziński, Jacek
Majsterek, Ireneusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1391955.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Index Copernicus International
Tematy:
Colorectal Neoplasms/genetics
DNA-Binding Proteins/genetics
Genetic Predisposition to Disease/genetics
Genotype
Polymorphism
Single Nucleotide
Opis:
Introduction: Colorectal cancer is the second most common cancer worldwide. DNA double strand breaks (DSBs) are the most dangerous lesions which can lead to carcinogenesis. Nonhomologous end joining (NHEJ) is an important pathway, that allows for recovering DNA by direct end joining. The XRCC6 and LIG4 genes encode respectively Ku70 protein and human ATP-dependent DNA ligase, which are the components of the NHEJ repair pathway. The aim of our study was to evaluate the influence of XRCC6 C1310G and LIG4 T9I genes polymorphisms on colorectal cancer risk among Polish population. Materials and method: Genotyping was performed using TaqMan probes based on analysis of PCR products amplified in Real Time PCR. The research has been carried out on the material obtained from 100 patients with colorectal cancer and 100 cancer-free individuals who were age and sex-matched as a control group. The results were developed using the chi – squer test and odds ratio (OR). Results: Odd ratio analysis indicates reduced risk of colorectal cancer for LIG4 T9I polymorphism in heterozygotus model C/T (OR= 0.2717 95% CI= 0.1247-0,5918) and homozygous model T/T (OR= 0.3593 95% CI= 0.1394-0.9266). Similar situation we observed for XRCC6 C1310G gene polymorphism, which indicated on heterozygotus variant C/G (OR= 0.1181 95% CI= 0.0145-0.964) and homozygotus variant G/G (OR= 0.0972 95% CI= 0.0097-0.9713) to decrease the risk of colorectal cancer. Conslusions: Our research revealed XRCC6 C1310G and LIG4 T9I polymorphisms are associated with diminished risk of colorectal cancer. However, to confirm obtained results, a further investigations should be carried out.
Źródło:
Polish Journal of Surgery; 2019, 91, 3; 15-20
0032-373X
2299-2847
Pojawia się w:
Polish Journal of Surgery
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Doubled haploids as a material for biotechnological manipulation and as a modern tool for breeding oilseed rape (Brassica napus L.)
Autorzy:
Cegielska-Taras, T.
Szala, L.
Matuszczak, M.
Babula-Skowronska, D.
Mikolajczyk, K.
Poplawska, W.
Sosnowska, K.
Hernacki, B.
Olejnik, A.
Bartkowiak-Broda, I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80477.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Brassica napus
oilseed rape
doubled haploid
marker-assisted selection
gene mapping
transformation
breeding
amplified fragment length polymorphism
random amplified polymorphic DNA
restriction fragment length polymorphism
recombinant inbred line
single nucleotide polymorphism
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Prediction of indels and SNP’s in coding regions of glutathione peroxidases - an important enzyme in redox homeostasis of plants
Autorzy:
Ganguli, S.
Datta, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11303.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
prediction
indel
single nucleotide polymorphism
coding region
glutathione peroxidase
enzyme
redox
homeostasis
plant
genotype
stress tolerance
Opis:
Plant glutathione peroxidases are an important class of enzymes which play key roles in the stress adaptability of plants both in context of biotic and abiotic stress pathways. They have been over the years much studied in animals since the catalytic residues are comprised of selenocysteine a variant amino acid which is ribosomally encoded with the help of an RNA structural element known as SECIS. Various workers over the years have shown that plant glutathione peroxidases play active roles in ROS sequestration, lipid hydroperoxidation as well as regulate glutathione levels. However, each plant has various patterns of glutathione peroxidase expression and action and in some plants certain isoforms have not been detected at all. This work focuses on the prediction and identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and INDELs in the coding regions of plant glutathione peroxidases, with the help of a Bayesian based algorithm subsequently validated. A large number of informative sites were detected 279 of which had variant frequency of ≥ 50 %. This data should be beneficial for future studies involving genetic manipulation and population based breeding experiments.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2014, 02
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of single nucleotide polymorphism within bactencin-5 and bactencin-7 coding genes in association with milk production traits
Identyfikacja polimorfizmów pojedynczego nukleotydu w obrębie genów kodujujących baktencynę-5 i baktencynę-7 w powiązaniu z cechami produkcji mleka
Autorzy:
Hiller, S.
Kowalewska, I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/29433590.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Tematy:
bactensins
bactencin-5
bactencin-7
coding gene
CATHL2
CATHL3
dairy cattle
single-nucleotide polymorphism
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2022, 21, 4; 17-22
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Czy „cichy” polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) C1236T genu ABCB1 jest związany z predyspozycją do rozwoju depresji i skutecznością jej leczenia? - badanie wstępne
Is the „silent” single nucleotide polymorphism (SNP) C1236T of ABCB1 gene associated with predisposition to depression development and efficiency of therapy? – preliminary study
Autorzy:
Jeleń, Agnieszka
Koziróg, Anna
Sałagacka, Aleksandra
Balcerczak, Ewa
Talarowska, Monika
Gałecki, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1032546.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Łódzkie Towarzystwo Naukowe
Tematy:
abcb1
polimorfizm pojedynczego nukleotydu
c1236t
glikoproteina p
depresja
farmakogenomika
podatność
single nucleotide polymorphism
p-glycoprotein
depression
pharmacogenomics
susceptibility
Opis:
Introduction: According to the World Health Organization about 350 million people around the world are affected by depression. Despite the high prevalence of this disease the mechanism of depression origination as well as the causes of the resistance to therapy are still not fully understood. ABCB1 gene encode P glycoprotein which is one of the components of blood-brain barrier. The main function of this protein is the efflux of many toxic compounds, including drugs, which may indicate potential association between the proper functioning of P glycoprotein and the susceptibility to the development of depressive disorders or the failure of antidepressant therapy. The objective of this study was to evaluate single nucleotide polymorphism (SNP) C1236T of the ABCB1 gene in the group of patients with recurrent depressive disorder (rDD) and to estimate the possible association of this polymorphism with the response to antidepressant therapy. Material and methods: C1236T was evaluated in 30 patients with rDD. Genotyping was performed using automated sequencing (the Sanger method). The results were compared with those obtained from the control group which consisted of 96 blood donors from the local blood bank. Results: No statistically significant difference in the frequency of genotypes (p=0.0665) and allele (p=0.1489) for the SNP C1236T of ABCB1 gene was found between the patients with rDD and the control group. No correlation between C1236 and the age when the disease was stated (p=0.0807). Neither the association between genotypes and the severity of depressive symptoms before treatment (p=0.7956) nor the association with effectiveness of the therapy (p=0.2051) were found. Conclusions: On the basis of the results of the preliminary study, C1236T of ABCB1 gene have no influence on the predisposition to rDD, the severity of depressive symptoms and the efficiency of antidepressant therapy have not been stated, either.
Streszczenie Wstęp: Według danych Światowej Organizacji Zdrowia depresja dotyka około 350 milionów osób na całym świecie. Jednak pomimo powszechnego występowania, zarówno etiologia tej choroby, jak i przyczyny oporności na leczenie w dalszym ciągu nie są w pełni poznane. Gen ABCB1 koduje glikoproteinę P, która jest jednym z elementów bariery krew-mózg. Główną funkcją białka jest usuwanie związków toksycznych, w tym także leków, co może wskazywać na potencjalny związek między prawidłowym działaniem glikoproteiny P a predyspozycją do rozwoju zaburzeń depresyjnych czy niepowodzeniem terapii lekami przeciwdepresyjnymi. Celem pracy była ocena polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (ang. single nucleotide polymorphism - SNP) C1236T genu ABCB1 wśród chorych na zaburzenia depresyjne nawracające (ang. recurrent depressive disorder - rDD) oraz oszacowanie potencjalnego związku tego polimorfizmu z odpowiedzią na terapię lekami przeciwdepresyjnymi. Materiał i metody: Polimorfizm C1236T oceniono w grupie 30 pacjentów, u których zdiagnozowano rDD. Genotyp określono wykorzystując technikę automatycznego sekwencjonowania metodą Sangera. Otrzymane wyniki porównano z wynikami grupy kontrolnej, którą stanowiło 96 dawców krwi z lokalnego banku krwiodawstwa. Wyniki: Nie stwierdzono istotnych statystycznie różnic w częstości występowania poszczególnych genotypów (p=0,0665) i alleli (p=0,1489) polimorfizmu C1236T genu ABCB1 między grupą pacjentów z rDD a grupą kontrolną. Nie wykazano również zależności pomiędzy C1236T a wiekiem w chwili diagnozy rDD (p=0,0807), nasileniem objawów depresji przed rozpoczęciem terapii (p=0,7956) czy skutecznością leczenia przeciwdepresyjnego (p=0,2051). Wnioski: Na podstawie wyników badania wstępnego, stwierdzono brak wpływu polimorfizmu C1236T genu ABCB1 na predyspozycję do rozwoju rDD, nasilenie objawów depresji w chwili diagnozy czy skuteczność terapii przeciwdepresyjnej.
Źródło:
Folia Medica Lodziensia; 2014, 41, 1; 5-15
0071-6731
Pojawia się w:
Folia Medica Lodziensia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Association between UBE2E2 variant rs7612463 and type 2 diabetes mellitus in a Chinese Han Population
Autorzy:
Kazakova, Elena
Wu, Yanhui
Zhou, Zhongyu
Chen, Meijun
Wang, Tongtong
Tong, Huixin
Zhuang, Tianwei
Sun, Lulu
Qiao, Hong
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039098.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Type 2 diabetes mellitus
UBE2E2
rs7612463
Single nucleotide polymorphism
SNPscan
Opis:
UBE2E2 encodes ubiquitin-conjugating enzyme E2E2, which plays an important role in the synthesis and secretion of insulin. Two previous studies indicated that SNPs in UBE2E2 were associated with risk for type 2 diabetes mellitus (T2DM) in the Japanese and Korean populations, respectively. We examined the association of one SNP in this gene, rs7612463, with the risk of T2DM in 1957 Han participants in northeastern China, using an SNPscanTM Kit. rs7612463 genotype was significantly associated with risk for T2DM under various genetic models, including an additive model (P = 0.004), a dominant model (P = 0.024), and a recessive model (P = 0.008). The AA genotype was associated with a significantly decreased risk for T2DM (P = 0.004, OR = 0.513, 95% CI = 0.325-0.810) after adjustment for age, gender, and BMI. The heterozygous genotype, AC, was associated with increased risk for total cholesterol (mmol l-1; P = 0.031) and triglycerides (mmol l-1; P = 0.039) in control individuals. Our results show that rs7612463 is associated with T2DM, with homozygotes of the AA genotype at decreased risk for T2DM in the Chinese population. Additionally, heterozygotes may have decreased risk of T2DM due to insulin resistance.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 2; 241-245
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Farmakogenetyczne uwarunkowania lekooporności w padaczce
Pharmacogenetic determinants of drug resistance in epilepsy
Autorzy:
Kozera-Kępniak, Alicja
Jastrzębski, Karol
Klimek, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1053516.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Medical Communications
Tematy:
cytochrome P450
drug transporter proteins
drug-resistant epilepsy
farmakogenetyka
pharmacogenetics
single nucleotide polymorphism – SNP
padaczka lekooporna
cytochrom p450
białka transportujące leki
polimorfizm
polimorfizm pojedynczych nukleotydów (single nucleotide polymorphism snp)
Opis:
Epilepsy is one of the most common CNS disorders occurring in approximately 1% of the world population. It is characterized by the occurrence of recurrent attacks of varying symptomatology. It is estimated that 30% of patients, despite the appropriate antiepileptic treatment, still experiencing seizures. In this case we are dealing with so-called the phenomenon of drug resistance. In Poland, this problem concerns about 100–120 thousand patients. Predisposing factors for epilepsy include: onset of symptoms before 1 year of age, high frequency of seizures before treatment and structural changes of the brain, including cortical malformations. Uncontrolled seizures affect the patients quality of life, increasing the risk of injury, affecting the physical well-being and psychosocial functioning. Despite knowing these presumable risk factors for epilepsy, it remains unknown why in the two patients with the same type of epilepsy or the same type of seizure, efficacy of antiepileptic drugs can be extremely different. Potential reasons for this may be genetic factors, changing the pharmacodynamic and pharmacokinetic attributes of antiepileptic drugs. Among these factors is mentioned genetically determined polymorphism of some microsomal enzymes (CYP2C9, CYP2C19), P-glycoprotein, a protein MRP (multidrug resistance-associated protein) and pharmacodynamic malfunction of GABA (GABAA) and ion channels. It seems that research on the mechanisms of drug resistance may lead to the introduction of new therapeutic strategies This article aims to show the impact of genetic factors to the lack of treatment efficacy in epilepsy.
Padaczka jest jedną z najczęstszych chorób ośrodkowego układu nerwowego, występującą u około 1% populacji na świecie. Charakteryzuje się występowaniem nawracających napadów o różnej symptomatologii. Szacuje się, że u 30% pacjentów mimo prowadzonego właściwego leczenia przeciwpadaczkowego nadal występują napady drgawkowe. Jest to tak zwane zjawisko lekooporności. W Polsce problem ten dotyczy około 100 000–120 000 chorych. Czynnikami predysponującymi do wystąpienia padaczki lekoopornej są: ujawnienie się choroby przed 1. rokiem życia, duża częstotliwość napadów przed rozpoczęciem leczenia oraz zmiany strukturalne mózgu, w tym wady rozwojowe kory mózgowej. Niekontrolowane napady padaczkowe pogarszają jakość życia chorych, zwiększając ryzyko urazów, wpływając negatywnie na samopoczucie fizyczne oraz funkcjonowanie psychospołeczne. Chociaż znane są potencjalne czynniki ryzyka, to nadal nie wiadomo, dlaczego u dwóch pacjentów z tym samym rodzajem padaczki lub tym samym typem napadów skuteczność leczenia lekami przeciwpadaczkowymi może być skrajnie różna. Wśród możliwych przyczyn tego zjawiska wymienia się czynniki genetyczne, zmieniające właściwości farmakodynamiczne i farmakokinetyczne stosowanych leków. Do grupy tych czynników zalicza się: genetycznie uwarunkowany polimorfizm niektórych enzymów mikrosomalnych (CYP2C9, CYP2C19), glikoproteiny P, białka MRP (multidrug resistance-associated protein) oraz zaburzenia funkcji farmakodynamicznych receptorów GABA (GABAA) i kanałów jonowych. Wydaje się, że badania nad mechanizmami lekooporności mogą skutkować wprowadzeniem nowych strategii terapeutycznych. Niniejszy artykuł ma na celu przedstawienie wpływu powyżej wymienionych czynników genetycznych na brak skuteczności leczenia w padaczce.
Źródło:
Aktualności Neurologiczne; 2013, 13, 2; 96-102
1641-9227
2451-0696
Pojawia się w:
Aktualności Neurologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Różnice genetyczne i psychologiczne w percepcji bólu u zawodników sportów walki
Genetic and psychological differences in pain perception in martial arts athletes
Autorzy:
Leźnicka, K.
Pierzchlińska, A.
Starkowska, A.
Machoy-Mokrzyńska, A.
Białecka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/135816.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Wyższa Szkoła Techniczno-Ekonomiczna w Szczecinie
Tematy:
percepcja bólu
próg bólu
tolerancja na ból
sportowcy
polimorfizm pojedynczego nukleotydu
stres
metody radzenia sobie ze stresem
temperament
pain perception
pain threshold
pain tolerance
athletes
single nucleotide polymorphism
stress coping methods
Opis:
Wstęp i cel: Wielu autorów podkreśla fakt zmniejszonego progu bólowego, a także tolerancji na ból u sportowców. Wciąż jednak nie wiadomo, w jakim stopniu mają w tym udział czynniki genetyczne, a w jakim psychologiczne i psychospołeczne. Celem niniejszej pracy jest przedstawienie możliwych mechanizmów wpływających na różnice w percepcji bólu. Materiał i metody: Na podstawie dostępnego piśmiennictwa autorzy opisali metody pomiaru natężenia bólu oraz przedstawili możliwe źródła różnic w percepcji bólu u zawodników sportów walki w stosunku do osób nieuprawiających zawodowo sportu. Wyniki: Opracowano poszczególne czynniki mogące wpływać na percepcję bólu u sportowców. Wniosek: Mimo braku różnic genetycznych w polimorfizmach pojedynczych nukleotydów genów OPRM1 i COMT, zanotowano istotne różnice w metodach radzenia sobie ze stresem oraz w natężeniu cech temperamentu między zawodnikami sportów walki a grupami kontrolnymi. Prawdopodobne, że cechy temperamentu wpływają na wypracowanie określonych strategii radzenia sobie z bólem.
Introduction and aim: Many authors emphasise lower pain threshold and pain tolerance among athletes. Though, it is not known to what degree genetic, psychological and psychosocial factors are involved. The aim of this paper is to present possible mechanisms affecting the differences in pain perception. Material and methods: On the grounds of the available literature, the authors describe the pain measure methods and present the possible source of the pain perception differences in martial arts athletes compared to non-athletes. Results: Several factors likely to be involved in pain perception among athletes has been elaborated. Conclusion: Although, there have been no differences in single nucleotide polymorphisms in genes OPRM1 and COMT, significant differences in stress coping strategies and temperament traits between martial arts athletes and control groups have been found. Presumably, temperament traits influence the development of particular pain coping strategies.
Źródło:
Problemy Nauk Stosowanych; 2017, 7; 183-190
2300-6110
Pojawia się w:
Problemy Nauk Stosowanych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Association between polymorphisms in CHRNA3 and PHACTR2 gene and environment and NSCLC risk in Chinese population
Autorzy:
Lou, Guangyuan
Zhang, Yongjun
Bao, Wenlong
Deng, Dehou
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039210.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Non-small cell lung cancer
phosphatase and actin regulator 2 (PHACTR2)
cholinergic receptor
nicotinic
alpha 3 (CHRNA3)
single-nucleotide polymorphism
Opis:
Aims. This study aimed to investigate CHRNA3 (rs8040868) and PHACTR2 (rs9390123) single-nucleotide polymorphisms (SNPs) for association with non-small-cell lung cancer (NSCLC) risk in a Chinese population, and whether the environment affects the genetic polymorphisms. Methods. This case and control study included 500 NSCLC patients and 500 age-matched healthy controls. CHRNA3 (rs8040868) and PHACTR2 (rs9390123) SNPs were genotyped and associated for NSCLC risk by computing the odds ratio and 95% confidence interval from multivariate unconditional logistic regression analyses with adjustment of age. Results. The minor allele frequency (MAF) of CHRNA3 (rs8040868) and PHACTR2 (rs9390123) was 0.350 (C) and 0.397 (C), respectively. The frequencies of genotype and allele in CHRNA3 (rs8040868) and PHACTR2 (rs9390123) were not significantly different between the cases and controls, or between either of the subgroups. Conclusion. Although rs8040868 and rs9390123 SNPs are not associated with NSCLC risk in Chinese population, the results strongly suggest that geographical agents interact with human genetic polymorphism independent of ethnic background.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 4; 765-768
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Computational study of ACE and AGT gene of RAAS pathway
Autorzy:
Nisha, Nisha
Kaur, Satbir
Kaur, Sumanpreet
Kumar, Sandeep
Galhna, Kiranjeet Kaur
Kaur, Kamaljeet
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1112240.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
Angiotensin converting enzyme
Angiotensinogen
Hypertension
Renin angiotensin aldosterone system
Single nucleotide polymorphism
Opis:
Renin angiotensin aldosterone system (RAAS) is a hormone regulatory hormone system that regulate blood pressure. The two major genes ACE and AGT are the players of RAAS pathway. These genes codes for angiotensin convertase enzyme and angiotensinogen protein respectively. The angiotensin convertase enzyme convert inactive angiotensinogen into active angiotensin which further helps in the regulation of blood pressure. Due to imbalance in this pathway may cause hypertension. So in the present study we decided to perform the computational study of ACE and AGT gene. We evaluated the deleterious/damaging effect of SNPs of ACE and AGT gene by SIFT and I-Mutant2.0. The total number of SNPs predicted to be deleterious by both tools were 5 (1.83%) and 22 (6.07%) for AGT and ACE genes respectively. We also studied subcellular location of ACE and AGT genes and drugs targeting these genes from database GeneCards. Further the result output of both the softwares were also compared.
Źródło:
World News of Natural Sciences; 2018, 19; 65-77
2543-5426
Pojawia się w:
World News of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SNP panel for evaluation of genetic variability and relationship in roe deer (Capreolus capreolus)
Autorzy:
Oleński, K.
Zalewski, D.
Kamiński, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16647455.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
Capreolus capreolus
genetic diversity
roe deer
Single Nucleotide Polymorphism marker
Opis:
Blood samples from forty-six roe deer (Capreolus capreolus) acquired during officially approved hunting in six hunting divisions throughout Poland were used to isolate the genomic DNA. All individuals were genotyped by MD_Bovine BeadChip (Illumina) for 46.750 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. SNPs of inappropriate clusters, with a marker call rate lower than 90% and with a minor allele frequency (MAF) lower than 0.01, located on sex chromosomes and mitochondrial DNA, were removed. Altogether, 21.033 SNP markers were included for further analysis. Observed and expected heterozygosity amounted to 0.098 and 0.119, respectively. Among 21.033 markers, a panel of 148 SNPs were selected for relationship analysis. They were unlinked and had a MAF higher than 0.2. This set of SNPs showed a probability of parentage exclusion of 1.29x10 -6 and 2.37x10 -19 for one, and two known parents, respectively. The probability of identity was estimated at 1.8x10 -40. The probabilities obtained in this study are sufficient for the monitoring and effective management of the genetic diversity of roe deer in Poland and is a cost-effective complementary tool for forensic applications.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2023, 26, 1; 29-37
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 25

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies