Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "serum" wg kryterium: Temat


Tytuł:
A comparative study on translational diffusion coefficient for some mammalian serum albumins
Porównanie współczynnika dyfuzji translacyjnej dla albumin surowicy kilku ssaków
Autorzy:
Monkos, Karol
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039603.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
viscosity
stokes-einstein equation
serum albumin
translational diffusion coefficient
Opis:
BACKGROUND The aim of the present paper is investigation of the volume fraction dependence of the translational diffusion coefficient for some mammalian serum albumins in aqueous solutions. MATERIAL AND METHODS The viscosity of bovine, equine, ovine and rabbit serum albumin aqueous solutions was measured at temperatures ranging from 5oC to 45oC and in a wide range of concentrations. The measurements were performed with an Ubbelohde-type capillary microviscometer. RESULTS Translational diffusion coefficient at infinitely dilute solutions Do(T) can be calculated from generalized Stokes-Einstein equation if the hydrodynamic radius of albumin is known. It gives Do(T) in the range from 3.5×10-11 m2 /s (at 5oC) to 10.2 10-11 m2 /s (at 45oC) for bovine serum albumin, from 3.59×10-11 m2 /s (at 5oC) to 10.4 10-11 m2 /s (at 45oC) for equine serum albumin, from 3.42×10-11 m2 /s (at 5oC) to 9.92×10-11 m2 /s (at 45oC) for ovine serum albumin, and from 3.36×10-11 m2 /s (at 5oC) to 9.74×10-11 m2 /s (at 45oC) for rabbit serum albumin. Translational diffusion coefficient for higher concentrations D(T,φ) can be obtained from the relation: D(T,φ) = Do(T)Ηo(T)/Η(T,φ), where φ denotes volume fraction and Ηo(T) and Η(T,φ) are viscosities of water and solution, respectively, at temperature T. CONCLUSIONS The obtained results show that the translational diffusion coefficient decreases linearly with increasing volume fraction, when φ does not exceed the value of about 0.1. The dependence of the translational diffusion coefficient on volume fraction in a broader range of φ, i.e. from dilute to concentrated solutions, is nonlinear and can be described by a stretched exponential function.
WSTĘP Celem niniejszej pracy jest zbadanie zależności współczynnika dyfuzji translacyjnej od ułamka objętościowego dla albumin surowicy kilku ssaków w roztworach wodnych. MATERIAŁ I METODY Lepkość wodnych roztworów albuminy surowicy wołowej, końskiej, owczej i króliczej zmierzono w zakresie temperatur od 5oC do 45oC i w szerokim zakresie stężeń. Pomiary wykonano przy pomocy kapilarnego mikrowiskozymetru typu Ubbelohde’a. WYNIKI Współczynnik dyfuzji translacyjnej dla roztworów rozcieńczonych Do(T) można obliczyć z uogólnionego równania Stokesa-Einsteina, jeżeli znany jest promień hydrodynamiczny albuminy. Daje to Do(T) w zakresie od 3.5×10-11 m2 /s (w 5oC) do 10.2×10-11 m2 /s (w 45oC) dla albuminy surowicy wołowej, od 3.59×10-11 m2 /s (w 5oC) do 10.4×10-11 m2 /s (w 45oC) dla albuminy surowicy końskiej, od 3.42×10-11 m2 /s (w 5oC) do 9.92×10-11 m2 /s (w 45oC) dla albuminy surowicy owczej i od 3.36×10-11 m2 /s (w 5oC) do 9.74×10-11 m2 /s (w 45oC) dla albuminy surowicy króliczej. Współczynnik dyfuzji translacyjnej dla wyższych stężeń D(T,φ) można otrzymać z relacji: D(T,φ) = Do(T)Ηo(T)/Η(T,φ), w której φ oznacza ułamek objętościowy a Ηo(T) i Η(T,φ) są, odpowiednio, lepkością wody i roztworu w temperaturze T. WNIOSKI Otrzymane wyniki pokazują, że współczynnik dyfuzji translacyjnej maleje liniowo wraz ze wzrostem ułamka objętościowego, jeżeli φ nie przekracza wartości około 0.1. Zależność współczynnika dyfuzji translacyjnej od ułamka objętościowego w szerszym zakresie φ , tzn. dla roztworów od rozcieńczonych do stężonych, jest nieliniowa i można ją opisać rozciągniętą funkcją wykładniczą.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2010, 64, 5-6; 43-53
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A novel approach to computer aided analysis of human serum proteins chromatoelectrophoresis
Autorzy:
Waśko, M.
Orzechowski, P.
Wnuk, N.
Krzych, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333481.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
elektroforeza chromatografia
białka surowicy
przełom algorytmów
przetwarzanie obrazu
chromatoelectrophoresis
serum proteins
watershed algorithms
image processing
Opis:
Chromatoelectrophoresis is a laboratory technique which depicts changes in multiple protein fractions inclusively. The combined, simultaneous analysis based on two key protein features (charge and molecular weight) offers a unique opportunity for better understanding of serum protein composition as well as it indicates the fraction which needs more thorough investigation. Because of those promising features, the chromatoelectrophoresis with automated analysis is expected to be a valuable laboratory test, aiding the process of medical diagnosis. However, without information technology support, analyzing the results of chromatoelectrophoresis would be tedious and time-consuming. For better optimization, both an algorithm for output image analysis and application with user-friendly interface were developed. Planning, development and testing were conducted at AGH University of Science and Technology and Jagiellonian University, Medical College in Cracow, Poland. With this article, we present the results of the first year of cooperation, code-named ChromSee.org project. The algorithm for distinguishing, naming and analyzing the content of fractions, the application and their utility in real-life settings are described, as well as potential future developments.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2008, 12; 129-135
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A simple method for the determination of the cholesterol esterase activity
Autorzy:
Stępień, Agnieszka
Gonchar, Mykhailo
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039538.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
cholesterol esterase
cholesterol
activity determination
human serum
Opis:
The proposed method determines the activity of cholesterol esterase (CEH) and takes advantage of its ability to catalyze the hydrolysis of cholesterol esters naturally present in human serum. The assay is based on Allain's method of spectrophotometric determination of cholesterol by means of cholesterol oxidase, peroxidase, but using 3,5-dichloro-dihydroxybenzenesulfonic acid (DHBS) as phenolic chromogen and human serum as a source of substrate for the CEH as a novelty. Furthermore, it is characterized by low costs and high precision. It can be employed to control the activity of CE preparations used for the preparation of enzymatic kits for the determination of cholesterol or for screening of potential bacterial enzyme producers.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2013, 60, 3; 401-403
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Activity of alpha-fucosidase and beta-glucuronidase in serum and urine of patients administered parenteral nutrition
Autorzy:
Raczkowska, K.
Szajda, S.D.
Raczkowski, K.
Zasadowska, W.
Chojnowska, S.
Kepka, A.
Zalewska-Szajda, B.
Waszkiewicz, N.
Knas, M.
Snarska, J.
Zwierz, K.
Ladny, J.R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/874170.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego. Państwowy Zakład Higieny
Tematy:
alpha-fucosidase
beta-glucuronidase
serum
urine
patient
parenteral nutrition
malnutrition
enzyme activity
Opis:
Background. In hospital patients suffering from adverse clinical and biochemical symptoms of malnutrition, it is often necessary to employ parenteral nutrition to avoid the body’s tissue becoming broken down by being metabolised. Thus, the patient’s welfare and survival can be supported throughout any periods of medical crisis. Two of the enzymes responsible for metabolising glycoconjugates are a-fucosidase (FUC) and p-glucuronidase (GLU), present in lysosomes. They release fucose or glucuronic acid from the non-reducing end of oligosaccharide chains. Objective. To determine the effect of parenteral nutrition administered to ill patients, on glycoconjugate metabolism, by measuring serum and urinary activities of FUC and GLU. Material and methods. Blood samples and the daily urine collection were taken from 23 patients’ who had been undergoing parenteral nutrition for either 5 or 10 days, as well as from a baseline sample. Enzyme activities in serum and urine were determined by the method of Zwierz et al. Results. Serum FUC activities were significantly lower after 10 days compared to 5, (p< 0.0172), whereas GLU activities were significantly lower after both 5 and 10 days, (p< 0.0007 and p< 0.0208 respectively), compared to levels before starting parenteral nutrition. GLU activities were however higher after 10 days than those after 5 days, (p< 0.0023). In urine, FUC activities were significantly decreased after 10 days compared to 5 days after starting parenteral nutrition, (p< 0.0245). Urine GLU activities were unaffected by parenteral nutrition nor was any effect seen on FUC or GLU activities when calculated per 1mg creatinine. Conclusions. Serum FUC and GLU activities can be used for assessing the effect of parenteral nutrition on glycoconjugate metabolism. The significant decreases of serum GLU activity observed after 5 and 10 days, may serve to indicate that the components of parental nutrition are appropriate and that the body has become suitably adapted to this form of nutrition.
Wprowadzenie. Kliniczne lub biochemiczne objawy niedoborów pokarmowych stwarzają konieczność wdrożenia żywienia pozajelitowego w celu ograniczenia katabolizmu własnych tkanek i stworzenia warunków umożliwiających choremu przetrwanie krytycznego okresu, a-fukozydaza (FUC) i P-glukuronidaza (GLU) są enzymami lizosomalnymi uczestniczącymi w katabolizmie glikokoniugatów. Odcinają fukozę (FUC) lub kwas glukuronowy (GLU) od nieredukującego końca łańcuchów oligosacharydowych. Cel . Celem badań było zbadanie wpływu żywienia pozajelitowego na katabolizm glikokoniugatów poprzez ocenę aktywności FUC i GLU w surowicy krwi i moczu chorych żywionych pozajelitowo. Materiał i metody. Krew z żyły łokciowej oraz mocz z dobowej zbiórki pobrano od 23 pacjentów żywionych pozajelitowo trzykrotnie: przed rozpoczęciem żywienia pozajelitowego, w piątej oraz dziesiątej dobie alimentacji dożylnej. Aktywność FUC i GLU w surowicy krwi i moczu oznaczano metodą kolorymetryczną Zwierza i wsp. Wyniki. W trakcie żywienia pozajelitowego, stężenie aktywności FUC w surowicy krwi uległo istotnemu obniżeniu w dziesiątej dobie (p<0,0172), w porównaniu do doby piątej, żywienia pozajelitowego. Stężenie aktywności GLU istotne obniżyło się (p<0,0007) w piątej oraz (p<0,0208) dziesiątej dobie, w porównaniu do aktywności przed zastosowaniem żywienia pozajelitowego. Stężenie aktywności GLU istotnie rosło (p<0,0023) w dziesiątej dobie, w porównaniu do piątej doby żywienia pozajelitowego. Stężenie aktywności FUC w moczu uległo istotnemu obniżeniu (p<0,0245) w dziesiątej dobie, w porównaniu do piątej doby żywienia pozajelitowego. Żywienie pozajelitowe nie wpływa istotnie na stężenie aktywności GLU w moczu oraz moczowe aktywności FUC i GLU przeliczane na 1 mg kreatyniny. Wnioski. Stężenia aktywności FUC i GLU w surowicy mogą być użyte do oceny wpływu żywienia pozajelitowego na katabolizm glikokoniugatów. Istotne obniżenie aktywności GLU w surowicy krwi w 5 i 10 dniu pozajelitowego żywienia, może świadczyć o prawidłowym doborze składników i adaptacji organizmu do żywienia pozajelitowego.
Źródło:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny; 2013, 64, 3
0035-7715
Pojawia się w:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Adipokines and parameters of peritoneal membrane transport in newly started peritoneal dialysis patients
Autorzy:
Golembiewska, Edyta
Safranow, Krzysztof
Ciechanowski, Kazimierz
Bober, Joanna
Bogacka, Anna
Stepniewska, Joanna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039455.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
peritoneal dialysis
serum adiponectin
serum leptin
solute transport
Opis:
Aim: Adiponectin and leptin are two adipokines playing important roles in the regulation of body weight, appetite, carbohydrate and lipid metabolism. In patients with chronic kidney disease (CKD) adipokines accumulate in serum due to reduced renal clearance. Since adipokines have pleiotropic actions, the adipokine balance may have an impact on peritoneal membrane transport. The aim of this study was to assess whether serum adiponectin and leptin levels were related to peritoneal transport and residual renal function (RRF) in newly started peritoneal dialysis patients. Methods: 25 clinically stable patients, 4 to 6 weeks after the onset of PD, were included in the study. For each patient clinical and laboratory data were reviewed and standard PET test was performed. Serum adiponectin and leptin concentrations were determined and leptin/adiponectin (L/A) ratio was calculated. Results: Serum adiponectin correlated negatively with weight, BMI and glucose concentration. Serum leptin and L/A ratio correlated positively with BMI. Serum adiponectin correlated positively with dialysate to plasma (D/P) creatinine ratio and ultrafiltration in PET test. Serum leptin level and L/A ratio correlated strongly negatively with peritoneal creatinine clearance. Conclusions: Serum adiponectin concentration is positively associated with baseline solute transport. Leptin concentration and L/A ratio are negatively associated with dialysis adequacy in newly started PD patients.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2013, 60, 4; 617-621
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
An attempt to use the serum concentration of the phosphate (Pi) and the Ca x P productas markers of the progression of chronic kidney disease in cats
Autorzy:
Sławuta, P.
Kumiega, E.
Sikorska-Kopyłowicz, A.
Sapikowski, G.
Kurosad, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2087386.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
chronic kidney disease (CKD)
serum phosphate concentration
serum Ca x Pproduct
cats
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2019, 4; 647-652
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Antioxidants and environmental stress: effect of low-molecular compounds on molecule of protein
Antyutleniacze i ich aktywność środowiskowa. Wpływ zwiążków drobnomolekularnych na proteinę
Autorzy:
Trnková, L.
Ortová, I.
Dršata, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/127525.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Towarzystwo Chemii i Inżynierii Ekologicznej
Tematy:
environmental oxidative stress
antioxidant
tea catechin
serum albumin
protein-ligand binding
środowiskowy stres oksydacyjny
antyutleniacze
katechiny herbaty
albuminy surowicy
wiązanie białko-ligand
Opis:
The aim of this study was to evaluate the relationships between the chemical structure of tea catechins and their binding affinities to HSA (Human Serum Albumin) by fluorescence quenching method at pH 7.4 and 37°C. The quenching constants (Kq), binding constants (Kb), and free energy changes (∆G0) were determined for the tested systems. The presented study contributes to the current knowledge in the area of protein-ligand binding, particularly tea catechin-HSA interactions.
Celem pracy była ocena zależności między strukturą chemiczną katechin herbaty i ich powinowactwem do HSA (albumina ludzkiej surowicy) za pomocą metody wygaszania fluorescencji przy pH 7,4 i w temperaturze 37°C. Dla badanych układów wyznaczono stałą szybkości wygaszania (Kq), stałą wiązania (Kb) i zmiany entalpii swobodnej (∆G0). Prezentowana praca poszerza aktualny stan wiedzy na temat wiązania białko - ligand, zwłaszcza interakcji katechiny - HSA.
Źródło:
Proceedings of ECOpole; 2010, 4, 2; 291-296
1898-617X
2084-4557
Pojawia się w:
Proceedings of ECOpole
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Antioxidants and environmental stress: spectroscopic study on stability of natural compounds and their interaction with a molecule of protein in an in vitro model
Antyoksydanty a stres środowiskowy, badania spektralne stabilności substancji naturalnych i ich oddziaływanie z molekułą białka
Autorzy:
Trnková, L.
Boušová, I.
Ryšánková, L.
Vrabcová, P.
Dršata, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/126139.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Towarzystwo Chemii i Inżynierii Ekologicznej
Tematy:
oxidative stress
antioxidant
hydroxycinnamic acid
serum albumin
protein-ligand binding
stres oksydacyjny
antyoksydant
kwas hydrooksycynamonowy
albumina (BSA)
wiązanie białka z ligandem
Opis:
The stability of eight hydroxycinnamic acids (HCAs) during long-term incubation under physiological conditions was studied by UV-VIS absorption spectroscopy and their possibility of binding to a model protein (bovine serum albumin, BSA) under physiological conditions was investigated by tryptophan fluorescence quenching method. The obtained results suggest that the stability of hydroxycinnamic acids is dependent upon its individual structure and duration of incubation. The monosubstituted derivatives (coumaric acids) were stable within the course of long-term incubation, while di- and trisubstituted derivatives decomposed easily. It was found out that all studied compounds changed fluorescence emission spectrum of BSA. The Stern-Volmer analysis was employed in order to explore binding of HCAs to BSA in details. The binding constants (Kb), number of binding sites (n) and the free energy changes (∆G0) were determined. The binding affinity was strongest for rosmarinic acid and ranked in the following order rosmarinic acid > chlorogenic acid > sinapic acid > caffeic acid > ferulic acid > o-coumaric acid > p-coumaric acid > m-coumaric acid. All free energy changes (∆G0) possessed negative sign indicating the spontaneity of HCAs binding to BSA.
Badano trwałość ośmiu kwasów hydrooksycynamonowych, HCAs, podczas inkubacji długoterminowej w warunkach fizjologicznych i możliwość ich wiązania się z modelowym białkiem (albuminą, BSA). Uzyskane wyniki pokazały, że trwałość tych kwasów zależy od ich indywidualnej budowy oraz czasu inkubacji. Wyznaczono stałe trwałości (Kb), liczbę miejsc wiązania (n) oraz zmianę wartości energii Gibbsa (∆G0) wiązania HCAs do BSA, który to proces przebiegał samorzutnie.
Źródło:
Proceedings of ECOpole; 2009, 3, 1; 27-34
1898-617X
2084-4557
Pojawia się w:
Proceedings of ECOpole
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Antisense hairpin loop oligonucleotides as inhibitors of expression of multidrug resistance-associated protein 1: Their stability in fetal calf serum and human plasma.
Autorzy:
Rębowski, Grzegorz
Wójcik, Marzena
Boczkowska, Małgorzata
Gendaszewska, Edyta
Soszyński, Mirosław
Bartosz, Grzegorz
Niewiarowski, Wojciech
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044049.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
human plasma
3' -exonuclease activity
multidrug resistance-associated protein
fetal calf serum
antisense hairpin loop oligonucleotides
Opis:
Multidrug resistance-associated protein (MRP1) is a transmembrane pump protein responsible for the efflux of chemotherapeutic drugs, an important cause of anticancer treatment failure. Trying to circumvent MRP-mediated resistance we designed and synthesized hairpin loops forming antisense oligodeoxyribonucleotides (ODNs), both phosphodiesters (PO-ODNs) and their phosphorothioate analogues (PS-ODNs), to reduce the protein expression by targeting its mRNA in a sequence specific manner. Melting temperature measurements as well as polyacrylamide gel electrophoresis supported the preferential formation of a secondary structure, which was expected to protect ODNs against 3'-exonuclease degradation. ODNs and PS-ODNs designed in this work were successfully tested as antisense inhibitors of the expression of MRP1 in the leukaemia HL60/ADR cell line. Foreseeing the necessity to perform clinical studies with such ODNs we investigated their stability against the 3'-exonuclease activity of fetal calf serum and human plasma. Under the conditions, corresponding to physiological ones, we observed high stability of hairpin loop forming ODNs, especially those containing longer (e.g. 7 base pair) stems. Comparative studies on the stability of chemically unmodified hairpin loop forming ODNs and their PS-counterparts indicated that endonuclease activity did not play any important role in the process of their nucleolytic degradation. Our studies provide strong evidence for high stability of chemically unmodified hairpin loop ODNs, making them an attractive alternative to phosphorothioate analogues commonly used in antisense strategy.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 4; 1061-1076
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of molecular docking to study 6-Mercaptopurine-binding to human serum albumin
Zastosowanie dokowania molekularnego w badaniu wiązania 6-Merkaptopuryny z albuminą surowicy krwi ludzkiej
Autorzy:
Sochacka, Jolanta
Pawełczak, Bartosz
Sobczak, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038307.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
molecular docking
human serum albumin
6-mercaptopurine
dokowanie molekularne
albumina surowicy krwi ludzkiej
6-merkaptopuryna
Opis:
Albumina surowicy krwi ludzkiej pełni ważną rolę w transporcie i rozmieszczeniu w organizmie substancji endogennych i egzogennych, w tym również leków. Znajomość mechanizmu oddziaływania leków z albuminą może być pomocna w przewidywaniu potencjalnych interakcji z innymi lekami i substancjami chemicznymi na etapie wiązania z albuminą, zapewniając bezpieczną terapię, szczególnie w terapii wielolekowej. Symulacja tego oddziaływania metodą dokowania molekularnego pozwala na opisanie zależności między strukturą i aktywnością biologiczną i może być alternatywą lub uzupełnieniem badań in vitro. W pracy przedstawiono możliwość wykorzystania techniki dokowania molekularnego do oceny oddziaływania 6-Merkaptopuryny (6-MP), leku stosowanego w terapii przeciwnowotworowej i immunosupresyjnej, z albuminą surowicy krwi ludzkiej. Procedurę dokowania 6-MP do cząsteczki albuminy przeprowadzono za pomocą programu komputerowego Molegro Virtual Docker (MVD). Strukturę rentgenowską HSA opisaną kodem 1AO6 pobrano z bazy białek Protein Data Bank (PDB.org). Układ przestrzenny cząsteczki 6-MP o zminimalizowanej energii opracowano za pomocą programu CS Chem3D Ultra CambridgeSoft v.7.0.0. Cząsteczkę 6-MP, ze względu na fakt, że w roztworze wodnym o fi zjologicznym pH występuje w mieszaninie formy zdysocjowanej i niezdysocjowanej dokowano jednocześnie w obu formach. Uzyskane wyniki wskazują, że 6-MP może wiązać się do albuminy w co najmniej dwóch miejscach wiążących. W przypadku cząsteczki niezdysocjowanej oddziaływania wiążące mają charakter hydrofobowy, natomiast cząsteczka zdysocjowana oddziałuje z albuminą głównie poprzez wiązania wodorowe oraz oddziaływanie elektrostatyczne z dodatnio naładowaną resztą lizyny, które stabilizuje powstający kompleks.
Human serum albumin (HSA) is a major protein component of blood plasma and due to its endogenous and exogenous ligand binding properties, plays an important role in the distribution and therapeutic eff ectiveness of drug. The studies of interaction of ligands with HSA by molecular docking are important from a theoretical viewpoint as they attempt to explain the relationship between the structure of ligand and the function of protein and also in terms of practical applications in medicine. In the work, the interaction of HSA with 6-Mercaptopurine (6-MP) used as anticancer and immunosuppressive drug was examined by molecular docking. The docking procedure was performed with the program Molegro Virtual Docker (MVD). The initial 6-MP conformation was energy-minimized using semiempirical (AM1) method implemented in CS Chem3D Ultra CambridgeSoft v.7.0.0 software and then imported to MVD. The X-ray structure of HSA (1AO6) was obtained from the Protein Data Bank (PDB). The potential binding sites (cavities) were identifi ed automatically using the cavities detection algorithm. The 6-MP molecules in solution at pH 7.4 occur as a mixture of neutral and anionic forms, therefore both forms of 6-MP were docked one at a time. Docking experiment uncovered at least two binding sites of 6-MP in HSA structure. It was found that in case of neutral form of 6-MP the binding force was mainly hydrophobic interaction, while the electrostatic interaction and hydrogen bond were involved in the binding process of anionic form of 6-MP.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2011, 65, 3; 41-48
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Bacterial recognition of thermal glycation products derived from porcine serum albumin with lactose
Autorzy:
Sarabia-Sainz, Andre-i
Ramos-Clamont, Gabriela
Winzerling, Joy
Vázquez-Moreno, Luz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039957.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
neoglycans
bacterial recognition
E. coli K88 adhesion
glycation of serum albumin
Opis:
Recently, glyco-therapy is proposed to prevent the interaction of bacterial lectins with host ligands (glycoconjugates). This interaction represents the first step in infection. Neoglycans referred to as PSA-Lac (PSA-Glu (β1-4) Gal) were obtained by conjugation of porcine serum albumin (PSA) with lactose at 80 °C, 100 °C and 120 ºC. Characterization studies of the products showed that PSA could contain 1, 38 or 41 added lactoses, depending on the reaction temperature. These neoglycans were approximately 10 times more glycated than PSA-Lac obtained in previous work. Lactose conjugation occurred only at lysines and PSA-Lac contained terminal galactoses as confirmed by Ricinus communis lectin recognition. Furthermore, Escherichia coli K88+, K88ab, K88ac and K88ad adhesins showed affinity toward all PSA-Lac neoglycans, and the most effective was the PSA-Lac obtained after 100 ºC treatment. In vitro, this neoglycan partially inhibited the adhesion of E. coli K88+ to piglet mucin (its natural ligand). These results provide support for the hypothesis that glycated proteins can be used as an alternative for bioactive compounds for disease prevention.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 1; 95-100
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Barwniki skwaryliowe jako sondy fluorescencyjne do oznaczania biocząsteczek
Skwarylium dyes as fluorescence probes for biomolecules determination
Autorzy:
Jurek, K.
Kabatc, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/159602.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Elektrotechniki
Tematy:
sondy fluorescencyjne
barwniki skwaryliowe
serum albuminy wołowej
squarylium dyes
fluorescent probes
bovine serum albumin
Opis:
Chemiczna modyfikacja struktury barwników skwaryliowych daje nowe układy chromoforowe o szerokim zakresie właściwości optycznych, takich jak absorpcja światła i emisja fluorescencji, z zakresu światła od widzialnego do bliskiej podczerwieni. Otrzymano nowe funkcjonalne barwniki, w których pod wpływem bodźca zewnętrznego lub oddziaływań chemicznych, zachodzą zmiany w rozmieszczeniu ładunku elektronowego w chromoforze skwaryliowym. Z uwagi na wyraźne zmiany ich właściwości spektroskopowych pod wpływem połączenia z substancją analizowaną, mogą zaleźć praktyczne zastosowanie, jako markery fluorescencyjne do oznaczania biocząsteczek.
Chemical modification of the structure of squarylium dyes gives a new chromophoric systems that have a wide range of optical properties, such as the light absorption and fluorescence emission in the range from the visible light to the near infrared one. The new functional dyes in which the changes of the electron charge distribution in chromophore under the influence of an external stimulus or chemical undergo have been obtained. The interaction between dye and analyte leads to the significant changes of their spectroscopic properties. It can give the possibility of practical application of these new dyes as the fluorescent markers for biomolecules labeling.
Źródło:
Prace Instytutu Elektrotechniki; 2015, 268; 57-64
0032-6216
Pojawia się w:
Prace Instytutu Elektrotechniki
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Białka surowicze mięsa czerwonego jako przyczyna anafilaksji u dorosłych
Red meat serum albumins as a trigger of anaphylaxis in adults
Autorzy:
Rymarczyk, Barbara
Glück, Joanna
Gawlik, Radosław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2215733.pdf
Data publikacji:
2023-03-01
Wydawca:
Oficyna Wydawnicza Mediton
Tematy:
anafilaksja
alergia pokarmowa
diagnostyka oparta na komponentach
mięso
białka surowicze
anaphylaxis
food allergy
component resolved diagnostics
red meat
serum albumins
Opis:
Wprowadzenie: Wzrost częstości reakcji anafilaktycznych w ostatnich 20 latach dotyczy zarówno dorosłych jak i dzieci, jednak jego dokładna skala nie została dotychczas określona. Jedną z ważnych rodzin białek alergenowych mogących odpowiadać za wywołanie anafilaksji stanowią albuminy surowicze zwierząt charakteryzujące się wysoką reaktywnością krzyżową nawet z białkami surowicy odległych gatunkowo zwierząt. Cel: Celem pracy była ocena częstości występowania alergii na białka surowicze mięsa czerwonego z zastosowaniem diagnostyki molekularnej opartej na komponentach u osób po przebytej reakcji anafilaktycznej o nieustalonej etiologii oraz charakterystyka kliniczna osób uczulonych. Materiał i metoda: Badanie miało charakter prospektywno-obserwacyjny. Kryteria włączenia objęły chorych po przebyciu przynajmniej jednej reakcji anafilaktycznej, u których na podstawie przeprowadzonych badań (wywiad, punktowe testy skórne z alergenami pokarmowymi i wziewnymi, diagnostyka internistyczna) wykluczono inne przyczyny dolegliwości. U wszystkich badanych przeprowadzono diagnostykę komponentową (FABER) umożliwiającą ocenę obecności przeciwciał skierowanych przeciwko 244 ekstraktom i molekułom alergenowym. oraz ocenę tolerancji spożycia mięsa czerwonego. Wyniki: Do badania włączono 28 chorych (22 kobiety i 6 mężczyzn, średnia wieku 39 ± 14,6 lat), którzy przebyli przynajmniej jedną reakcję anafilaktyczną o nieznanej przyczynie. U 12 (43%) chorych wystąpił więcej niż jeden epizod reakcji anafilaktycznej. U 11 (39%) osób współistniały cechy innej choroby alergicznej. Żadna z badanych osób nie zgłaszała w wywiadzie związku wystąpienia anafilaksji ze spożyciem mięsa. U 2 osób (8%) stwierdzono przeciwciała przeciwko albuminom surowiczym zwierząt. Wszyscy badani tolerowali mięso pieczone, gotowane i wędzone. Wnioski: Białka surowicze stanowią rzadką przyczynę uczulenia u osób dorosłych, ale ze względu na dużą reaktywność krzyżową tej grupy białek i dużą aktywność biologiczną należy rozważać ich udział we wszystkich przypadkach anafilaksji pokarmowej o nieustalonej dotychczas etiologii.
Background: Red meat allergy is reported as a possible reason of allergic reactions in adults and children as well, however, the epidemiological data are biased by various factors. One of the most important group of meat proteins involved are serum proteins characterised by high cross-reactivity to serum proteins with remote animal species origin. Aim: Assessment of frequency of red meat allergy with the use of component resolved diagnostics in adults with a history of anaphylaxis and clinical characteristics of sensitized individuals. Material and methods: A prospective-observational study was designed for adults. The inclusion criteria were: at least one anaphylaxi in the past and lack of clear reason of that reaction after a detailed medical history, skin prick tests with food allergens. Other internal disorders mimicking anaphylaxis were considered as exclusion criteria. In all patients component resolved diagnostics (CRD) with the FABER test which enables an assessment of the presence of allergen- specific IgE against 244 extracts and allergen components, and the assessment of tolerance of red meat consumption was performed. Results: 28 adults (22 women and 6 men) at the mean age of 39 ± 14,6 yrs were enrolled into the study. Twelve (43%) survived more than one episode of anaphylaxis and 11 (39%) suffered from other allergic disorders. None of the enrolled patients showed a clear relationship of allergic symptoms with the red meat consumption. Specific IgE against multiple serum proteins were found in two patients (8%). All participants tolerated cooked, fried, and smoked red meat. Conclusions: Although red meat serum proteins seem to be a rare reason of sensitization in adults their high cross-reactivity and high biological and multifunctional potential must be seriously taken into account in all cases of idiopathic anaphylaxis.
Źródło:
Alergia Astma Immunologia - przegląd kliniczny; 2023, 28, 1; 25-30
1427-3101
Pojawia się w:
Alergia Astma Immunologia - przegląd kliniczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Biochemical indexes of the liver functioning at the acute stage of opisthorchiasis
Autorzy:
Bakshtanovskaya, I.
Stepanova, T.
Shonin, A.
Ponomareva, O.
Terekhina, V.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/837329.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
bilirubin
gamma-glutamyltransferase
glucose
alanine aminotransferase
aspartate aminotransferase
concentration
alkaline phosphatase
opistchorchiasis
alpha-amylase
cholesterol
liver function
serum activity
Źródło:
Annals of Parasitology; 1998, 44, 3
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Biochemical investigations of the dynamics of proteinase activity at different stages of trichinellosis in mice
Autorzy:
Hadas, E
Derda, M.
Boczon, K.
Wandurska-Nowak, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/839657.pdf
Data publikacji:
1994
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
Trichinella pseudospiralis
mice
blood serum
proteinase activity
enzyme activity
enzymatic change
mouse
muscle
man
trichinellosis
Trichinella spiralis
dynamics
tissue
Opis:
In the literature available hitherto there are many reports on enzymatic changes in tissues and a correlated rise in enzymatic activity in blood serum during experimental and human trichinellosis. In this study we were characterised proteinase activity in crude extracts from muscles of mice infected with Trichinella spiralis and T. pseudospiralis and the dynamics of their changes in different stages of disease. The activity of proteinase in muscle of mice infected with T. spiralis showed an increase in the 1 st- 5th week post infection, and then a slight decrease. The biggest proteinase activity was observed in 5th- 6th week post infection. In the muscle of mice infected with T. pseudospiralis the increase of proteinase activity was observed in 1st-4th week post infection. In the 4th week the activity reached its maximum and in the 5th- 10th week post infection there was a decrease of the activity in comparison with the control. As we could see, the dynamics of the changes of proteinase activity in mice is similar in the case of the disease with other biochemical and immunological indices observed in trichinellosis and with the increase of regeneration and transformation processes observed in histopathological studies.
Źródło:
Annals of Parasitology; 1994, 40, 4
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies