Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "selekcja genów" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Stability of gene selection methods for multiclass clssification
Autorzy:
Student, S.
Fujarewicz, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333948.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
selekcja genów
metoda cząstkowych najmniejszych kwadratów
klasyfikacja wieloklasowa
gene selection
partial least squares
stability selection
bootstrap .632+
multiclass classification
BBFR
Opis:
A big problem in applying DNA microarrays for classification is dimension of the dataset. Recently we proposed a gene selection method based on Partial Least Squares (PLS) for searching best genes for classification. The new idea is to use PLS not only as multiclass approach, but to construct more binary selections that use one versus rest and one versus one approaches. Ranked gene lists are highly instable in the sense, that a small change of the data set often leads to big change of the obtained ordered list. In this article, we take a look at the assessment of stability of our approaches. We compare the variability of the obtained ordered lists from proposed methods with well known Recursive Feature Elimination (RFE) method and classical t-test method. This paper focuses on effective identification of informative genes. As a result, a new strategy to find small subset of significant genes is designed. Our results on real cancer data show that our approach has very high accuracy rate for different combinations of classification methods giving in the same time very stable feature rankings.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2010, 15; 101-107
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of the recursive feature elimination and the relaxed linear separability feature selection algorithms to gene expression data analysis
Rekurencyjna eliminacja cech z walidacją oraz relaksacja liniowej separowalności jako metody selekcji cech do analizy zbiorów danych zawierających wartości ekspresji genów
Autorzy:
Gościk, J.
Łukaszuk, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/88402.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Politechnika Białostocka. Oficyna Wydawnicza Politechniki Białostockiej
Tematy:
gene expression analysis
feature selection
classification
analiza ekspresji genów
selekcja cech
klasyfikacja
Opis:
Most of the commonly known feature selection methods focus on selecting appropriate predictors for image recognition or generally on data mining issues. In this paper we present a comparison between widely used Recursive Feature Elimination (RFE) with resampling method and the Relaxed Linear Separability (RLS) approach with application to the analysis of the data sets resulting from gene expression experiments. Different types of classification algorithms such as K-Nearest Neighbours (KNN), Support Vector Machines (SVM) and Random Forests (RF) are exploited and compared in terms of classification accuracy with optimal set of genes treated as predictors selected by either the RFE or the RLS approaches. Ten-fold cross-validation was used to determine classification accuracy.
Zdecydowana większość znanych metod selekcji cech skupia się na wyborze odpowiednich predyktorów dla takich zagadnień jak rozpoznawanie obrazów czy też ogólnie eksploracji danych. W publikacji prezentujemy porównanie pomiędzy powszechnie stosowaną ˛metodą˛ Rekurencyjnej Eliminacji Cech z walidacja˛ (ang. Recursive Feature Elimination - RFE) a metodą stosującą ˛podejście Relaksacji Liniowej Separowalności (ang. Relaxed Linear Separability - RLS) z zastosowaniem do analizy zbiorów danych zawierających wartości ekspresji genów. W artykule wykorzystano różne algorytmy klasyfikacji, takie jak K-Najbliższych Sąsiadów (ang. K-Nearest Neighbours - KNN), Maszynę˛ Wektorów Wspierających (ang. Support Vector Machines - SVM) oraz Lasy Losowe (ang. Random Forests -RF). Porównana została jakość klasyfikacji uzyskana przy pomocy tych algorytmów z optymalnym zestawem cech wygenerowanym z wykorzystaniem metody selekcji cech RFE bądź RLS. W celu wyznaczenia jakości klasyfikacji wykorzystano 10-krotną walidację˛ krzyżową.
Źródło:
Advances in Computer Science Research; 2013, 10; 39-52
2300-715X
Pojawia się w:
Advances in Computer Science Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Selekcja i zachowanie najwartosciowszych genotypow w programie Karpackiego Regionalnego Banku Genow
Autorzy:
Sabor, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/822764.pdf
Data publikacji:
1996
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
Regionalny Bank Genow Karpaty
zasoby genowe
selekcja
drzewostany
hodowla lasu
Karpaty
populacje roslin
lesnictwo
drzewa lesne
Źródło:
Sylwan; 1996, 140, 11; 45-60
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Data mining methods for gene selection on the basis of gene expression arrays
Autorzy:
Muszyński, M.
Osowski, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/329803.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
gene expression array
gene ranking
feature selection
clusterization measures
fusion
SVM classification
ekspresja genów
selekcja cech
klasyfikacja SVM
Opis:
The paper presents data mining methods applied to gene selection for recognition of a particular type of prostate cancer on the basis of gene expression arrays. Several chosen methods of gene selection, including the Fisher method, correlation of gene with a class, application of the support vector machine and statistical hypotheses, are compared on the basis of clustering measures. The results of applying these individual selection methods are combined together to identify the most often selected genes forming the required pattern, best associated with the cancerous cases. This resulting pattern of selected gene lists is treated as the input data to the classifier, performing the task of the final recognition of the patterns. The numerical results of the recognition of prostate cancer from normal (reference) cases using the selected genes and the support vector machine confirm the good performance of the proposed gene selection approach.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2014, 24, 3; 657-668
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies