Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "protein-protein interaction" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 31
Tytuł:
Identification of candidate genes related to aroma in rice by analyzing the microarray data of highly aromatic and nonaromatic recombinant inbred line bulks
Autorzy:
Zinati, Z.
Delavari, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80716.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
rice
Oryza sativa
aroma
aroma-related gene
gene ontology enrichment analysis
microarray analysis
protein-protein interaction
protein interaction network
inbred line
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2019, 100, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Phosphatidic acid - a simple phospholipid with multiple faces
Autorzy:
Zegarlińska, Jolanta
Piaścik, Magda
Sikorski, Aleksander
Czogalla, Aleksander
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038384.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
phosphatidic acid
protein-lipid interaction
signaling
membrane curvature
membrane model systems
Opis:
Phosphatidic acid (PA) is the simplest glycerophospholipid naturally occurring in living organisms, and even though its content among other cellular lipids is minor, it is drawing more and more attention due to its multiple biological functions. PA is a precursor for other phospholipids, acts as a lipid second messenger and, due to its structural properties, is also a modulator of membrane shape. Although much is known about interaction of PA with its effectors, the molecular mechanisms remain unresolved to a large degree. Throughout many of the well-characterized PA cellular sensors, no conserved binding domain can be recognized. Moreover, not much is known about the cellular dynamics of PA and how it is distributed among subcellular compartments. Remarkably, PA can play distinct roles within each of these compartments. For example, in the nucleus it behaves as a mitogen, influencing gene expression regulation, and in the Golgi membrane it plays a role in membrane trafficking. Here, we discuss how a biophysical experimental approach enabled PA behavior to be described in the context of a lipid bilayer and to what extent various physicochemical conditions may modulate the functional properties of this lipid. Understanding these aspects would help to unravel specific mechanisms of PA-driven membrane transformations and protein recruitment and thus would lead to a clearer picture of the biological role of PA.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2018, 65, 2; 163-171
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ genotypu, środowiska oraz interakcji G×E na skład chemiczny i aktywność alfa-amylazy ziarna pszenżyta ozimego
Influence of genotype, environment and G×E interaction on chemical composition and alpha-amylase activity of triticale grain
Autorzy:
Fraś, Anna
Mańkowski, Dariusz Rafał
Gołębiewski, Damian
Gołębiewska, Kinga
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2147387.pdf
Data publikacji:
2018-12-30
Wydawca:
Instytut Uprawy Nawożenia i Gleboznawstwa – Państwowy Instytut Badawczy
Tematy:
triticale
variety
protein
dietary fibre
environment
G×E interaction
pszenżyto
odmiana
białko
błonnik
środowisko
interakcja G×E
Opis:
Pszenżyto ze względu na korzystny skład chemiczny ziarna i wysokie walory żywieniowe może być wykorzystywane jako surowiec w przemyśle spożywczym. Jest jednak podatne na porastanie oraz zmienne warunki środowiska, które istotnie wpływają na jakość ziarna i wybór kierunku użytkowania. Celem badań było określenie wpływu genotypu (G), środowiska (E) oraz interakcji G×E na zawartość wybranych składników chemicznych ziarna pszenżyta oraz szczegółowa charakterystyka interakcji G×E dla wybranych parametrów. Przebadano ziarno czterech odmian pszenżyta ozimego (Alekto, Fredro, Panteon, Preludio) uprawianych w trzech sezonach wegetacyjnych (2013/2014; 2014/2015; 2015/2016) w tej samej lokalizacji. Oznaczono zawartość podstawowych składników odżywczych: białka, lipidów, skrobi, związków mineralnych oraz bioaktywnych: błonnika pokarmowego (jako sumy nieskrobiowych polisacharydów i ligniny), a także lepkość wodnych ekstraktów ziarna, powiązaną z rozpuszczalną frakcją błonnika pokarmowego i liczbę opadania ziarna. Przeprowadzono analizę wariancji według stałego modelu dwukierunkowego, a wyniki uzupełniono porównaniem wartości średnich dla efektów głównych i efektu interakcyjnego. Dodatkowo, w celu szczegółowego opisu interakcji G×E, dla wybranych zmiennych przeprowadzono analizę z zastosowaniem modelu AMMI. Dla wszystkich analizowanych parametrów wykazano istotne różnice pomiędzy sezonami uprawy, odmianami oraz odmianami w poszczególnych sezonach wegetacyjnych. Największy wpływ warunków środowiska zaobserwowano dla liczby opadania (83,2%), największy wpływ genotypu dla zawartości rozpuszczalnej frakcji nieskrobiowych polisacharydów (76,4%), a interakcji G×E dla zawartości skrobi (49,5%).
Triticale is characterised with valuable chemical composition and high nutritional value, therefore it can be used as a raw material in the food industry. However, it is susceptible to sprouting and to variable environmental conditions, which significantly affects the quality of the grain and the choice of its utilisation. The aim of the study was to determine the effect of genotype (G), environment (E) and G×E interaction on the content of selected chemical components of triticale grains and detailed characteristics of G×E interaction for selected parameters. Material for the study comprised four triticale varieties (Alekto, Fredro, Panteon, Preludio), harvested at the same location, during three growing seasons (2013/2014; 2014/2015; 2015/2016). The content of basic nutrient components: protein, starch, lipids, minerals and bioactive components: dietary fibre (as a sum of nonstarch polysaccharides and lignin) were determined, as well as water extract viscosity of grain, associated with soluble dietary fibre fraction, and falling number. An analysis of variance according to a fixed two-way model was performed, and the results were supplemented by comparison of mean values for the main effects and the interactive effect. Additionally, for a detailed description of the G×E interaction, an analysis using the AMMI model was performed for selected parameters. For all analysed parameters, significantdifferences were found between successive growing seasons,varieties and varieties in years. The highest impact of environmentalconditions was observed for falling number (83.2%), thelargest impact of the genotype for the soluble fraction of non--starch polysaccharides (76.4%) and the interaction of G×E forstarch (49.5%)
Źródło:
Polish Journal of Agronomy; 2018, 35; 3-14
2081-2787
Pojawia się w:
Polish Journal of Agronomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of sparse linear discriminant analysis for prediction of protein-protein interactions
Autorzy:
Stąpor, K.
Fabian, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/95137.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
sparse discriminant analysis
feature selection
protein-protein interaction
Opis:
To understand the complex cellular mechanisms involved in a biological system, it is necessary to study protein-protein interactions (PPIs) at the molecular level, in which prediction of PPIs plays a significant role. In this paper we propose a new classification approach based on the sparse discriminant analysis [10] to predict obligate (permanent) and non-obligate (transient) protein-protein interactions. The sparse discriminant analysis [10] circumvents the limitations of the classical discriminant analysis [4, 9] in the high dimensional low sample size settings by incorporating inherently the feature selection into the optimization procedure. To characterize properties of protein interaction, we proposed to use the binding free energies. The performance of our proposed classifier is 75% ± 5%.
Źródło:
Information Systems in Management; 2016, 5, 1; 109-118
2084-5537
2544-1728
Pojawia się w:
Information Systems in Management
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Docking for drug interface residues of modelled VPS33B of human with PtpA of Mycobacterium tuberculosis CDC1551
Autorzy:
Reddy, K.M.
Pattathil, M.D.
Jayachandra, S.Y.
Parameshwar, A.
Sulochana, M.B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11443.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
antigenicity
protein-protein interaction
network
homology modelling
drug design
interface residue
Mycobacterium tuberculosis
man
protein
biological function
Opis:
VPS33B, a human Vacuolar Protein Sorting (VPS) protein which mediates the phagolysosomal fusion in macrophage of the eukaryotic organisms. This protein has a great role during the mycobacterial infections, which binds with the Mycobacterium protein tyrosine phosphatase A (PtpA). A single functional domain of PtpA has been identified using SMART domain databases, followed by finding the antigenicity of PtpA using CLC main workbench tool. The protein-protein interaction network predicts the interface of biological functions of proteins, built by using Cytoscape 2.8.3 version tool for manual literature survey of protein sets. According to the literature the specific interactivity of PtpA with VPS33B of human lead to pathogenesis, and provided a good platform to find the structure of VPS33B as it lacks the 3 dimensional structure in PDB. Homology Modelling of VPS33B provides a significant properties to design a specific drug through screening the drug databases (eDrug3D). The modelled protein has been validated through SAVES server maintained by NIH and UCLA with the standard Ramachandran plot with accuracy of 90.7 %. From our findings the interface residues are very crucial points which has been found through docking the modelled protein and Mycobacterium protein and interface residues were selected manually using PyMol software.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2014, 11, 2
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Architecture of the exocyst complex in plant cells
Autorzy:
Kasprowicz, A.
Pihan, K.
Ochocki, M.
Kwiatkowski, W.
Wojtaszek, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80552.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
exocytosis
plant cell
eukaryotic cell
plasma membrane
protein-protein interaction
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Are carbonylated proteins involved in plant – mite-pest interactions?
Autorzy:
Szworst-Lupina, D.
Zagdanska, B.
Kielkiewicz, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80463.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
protein carbonylation
protein
maize cultivar
two-spotted spider mite
immunoblotting
mite-pest interaction
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Biochemical and structural studies of plant circadian clock proteins
Autorzy:
Saini, R.
Szpotkowski, K.
Kozak, M.
Jaskolski, M.
Davis, S.J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80840.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
circadian clock
diurnal change
plant circadian clock
protein
multiple feedback loop
crystallization
recombinant fusion protein
early flowering
small angle X-ray scattering
protein-protein interaction
biochemical study
structural study
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Cysteine-rich receptor-like kinases (CRK) in ROS signalling in Arabidopsis thaliana
Autorzy:
Gauthier, A.
Idanheimo, N.
Salojarvi, J.
Wrzaczek, M.
Kangasjarvi, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80229.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
receptor-like kinase
reactive oxygen species
signalling
Arabidopsis thaliana
protein-protein interaction
crk mutant
xanthine oxidase
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of cell cycle proteins interacting with Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen using bimolecular fluorescence complementation assay
Autorzy:
Strzalka, W.
Jakubowska, A.
Bartnicki, F.
Pels, K.
Kowalska, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80766.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
proliferating cell nuclear antigen
bimolecular fluorescence
cell cycle
protein interaction
Arabidopsis thaliana
DNA replication
cyclin dependent kinase inhibitor
cyclin-dependent kinase 2
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Involvement of S-nitrosoglutathione reductase in B. lactucae and O. neolycopersici pathogenesis in Lactuca spp.
Autorzy:
Ticha, T.
Kubienova, L.
Sedlarova, M.
Luhova, L.
Petrivalsky, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80867.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
S-nitrosoglutathione
reactive nitrogen species
nitric oxide
powdery mildew
tomato
Oidium neolycopersici
Bremia lactucae
pathogenesis
enzyme activity
protein level
plant-pathogen interaction
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular interactions between the microRNA biogenesis complex and the spliceosome
Autorzy:
Stepien, A.
Kierzkowski, D.
Raczynska, K.D.
Szweykowska-Kulinska, Z.
Jarmolowski, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80969.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
molecular interaction
microRNA
biogenesis
spliceosome
gene expression
protein-coding gene
nuclear cap-binding protein complex
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Role of spruce respiratory burst oxidase homolog (RBOH) during lignin formation in Norway spruce
Autorzy:
Nickolov, K.
Laitinen, T.
Haggman, H.
Teeri, T.
Karkonen, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80939.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
Norway spruce
respiratory burst
lignin formation
hydrogen peroxide
NADPH oxidase
phosphorylation
protein-protein interaction
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Unraveling protein-protein interactions using fluorescence imaging techniques
Autorzy:
Michalak, M.
Wojtaszek, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/79933.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
protein-protein interaction
imaging technique
fluorescence
physiological process
living cell
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Vps41, a protein involved in lysosomal trafficking, interacts with caspase-8
Autorzy:
Wang, Lu
Pan, Xiao
He, Liangqiang
Zhang, Rong
Chen, Wei
Zhang, Jing
Lu, Min
Hua, Zi-Chun
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039602.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
caspase-8
yeast two-hybrid
Vps41
protein interaction
apoptosis
Opis:
Caspase-8 is a member of the cysteine-aspartic acid protease (caspase) family which plays a central role in apoptosis and development. We screened caspase-8 interacting proteins from mouse T-cell lymphoma and 7.5-day embryo cDNA libraries by yeast two-hybrid system and obtained eleven positive clones, including Vacuolar protein sorting 41 (Vps41), a protein involved in trafficking of proteins from the late Golgi to the vacuole. The interaction of Vps41 with caspase-8 was confirmed by co-immunoprecipitation (co-IP) and co-localization studies in HEK293T cells. Co-IP experiments also showed that Vps41 binds to the p18 subunit of caspase-8 through its WD40 region and RING-finger motif. Furthermore, we found that overexpression of Vps41 promotes Fas-induced apoptosis in A549 human lung adenocarcinoma cells. The cleavage of caspase-3, a caspase-8 downstream effector, was increased when cells were transfected with Vps41-overexpressing plasmid. Together, these results suggest a novel interaction of caspase-8 with Vps41 and provide a potential role of Vps41 beyond lysosomal trafficking.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2013, 60, 1; 37-42
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 31

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies