Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "protein analysis" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Identification of candidate genes related to aroma in rice by analyzing the microarray data of highly aromatic and nonaromatic recombinant inbred line bulks
Autorzy:
Zinati, Z.
Delavari, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80716.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
rice
Oryza sativa
aroma
aroma-related gene
gene ontology enrichment analysis
microarray analysis
protein-protein interaction
protein interaction network
inbred line
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2019, 100, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Applying NIR spectroscopy to evaluate quality of whey protein supplements available on the Polish market
Zastosowanie spektroskopii w bliskiej podczerwieni do oceny jakości odżywek białkowych dostępnych na polskim rynku
Autorzy:
Wojcicki, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/827095.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Technologów Żywności
Tematy:
human nutrition
supplemented diet
protein
whey protein
determination
near infrared spectroscopy
protein quality
protein content
principal component analysis
partial least squares regression
Opis:
The objective of the research study was to apply near infrared (NIR) spectroscopy to evaluate the quality of protein supplements available in the Polish shops and gyms. The evaluation was performed on the basis of the determination of the protein quantity contained in the individual samples by a Kjeldahl method and then the evaluation results were correlated with the measured NIR spectra using an appropriate chemometric method. The research material consisted of fifteen protein supplement samples for athletes, which included the following types: WPI (protein isolate), WPC (protein concentrate), WPH (protein hydrolysate), and mixtures thereof. The obtained NIR spectra of protein supplements were characterized by a similar shape of the bands. Depending on the type of protein, a different intensity of absorption of individual bands could be observed. A Principal Component Analysis (PCA) was used to distinguish the samples based on the spectra measured. Unfortunately, owing to the varying composition of the protein mixtures, it was not possible to find characteristic arrangement of the samples depending on their types. The spectra were correlated with the protein contents determined in the samples using a Partial Least Squares regression method (PLS regression) and various mathematic transformations of the NIR spectral data. The obtained regression models were analysed and the analysis results confirmed that it was possible to apply NIR spectra to estimate the content of proteins in protein supplements. The best result was obtained in a spectrum region between 9401 and 5448 cm⁻¹ and after the first derivative was applied with Multiplicate Scatter Correction (MSC) as a mathematical pre-treatment. On the basis of the results obtained, it was proved that the NIR spectra applied together with the chemometric analysis could be used to quickly evaluate the products studied.
Celem pracy było zastosowanie spektroskopii w zakresie bliskiej podczerwieni (NIR) do oceny jakości odżywek białkowych dostępnych w polskich sklepach i siłowniach. Oceny tej dokonano na podstawie wyznaczenia zawartości protein w poszczególnych odżywkach metodą Kjeldahla, a następnie skorelowaniu jej ze zmierzonymi widmami NIR, stosując odpowiednią metodę chemometryczną. Materiał do badań stanowiło piętnaście białkowych odżywek dla sportowców różnego typu: WPI (izolat białka), WPC (koncentrat białka) i WPH (hydrolizat białka) oraz ich mieszanki. Otrzymane widma NIR odżywek białkowych charakteryzowały się zbliżonym do siebie kształtem pasm. W zależności od rodzaju odżywki można było zaobserwować różną intensywność absorpcji poszczególnych pasm. Przeprowadzona analiza głównych składowych (PCA) wykorzystana została do rozróżnienia próbek na podstawie zmierzonych widm. Niestety ze względu na różny skład mieszanek białkowych nie udało się zaobserwować charakterystycznego rozmieszczenia próbek w zależności od ich rodzaju. Korelację widm z wyznaczoną zawartością protein w próbkach przeprowadzono stosując metodę regresji najmniejszych kwadratów (PLS) oraz różne przekształcenia matematyczne danych spektralnych. Analiza otrzymanych modeli regresji wykazała, że możliwe jest wykorzystane widm w bliskiej podczerwieni do przewidywania zawartości protein w odżywkach białkowych. Najlepszy rezultat otrzymano w zakresie widma 9401 ÷ 5548 cm⁻¹ oraz po zastosowaniu pierwszej pochodnej wraz z multiplikatywną korektą rozproszenia (MSC) jako przekształcenie matematyczne. Na podstawie otrzymanych wyników udowodniono, że zastosowanie widm NIR wraz z chemometryczną analizą pozwala na szybką ocenę jakości omawianych produktów.
Źródło:
Żywność Nauka Technologia Jakość; 2018, 25, 2
1425-6959
Pojawia się w:
Żywność Nauka Technologia Jakość
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
In silico and in vitro cytotoxic effect of prodigiosin-conjugated silver nanoparticles on liver cancer cells (HepG2)
Autorzy:
El-Batal, A.I.
El-Hendawy, H.H.
Faraag, A.H.I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80210.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
silver nanoparticle
liver cancer
cancer cell line
HepG2 cell
Serratia marcescens
cytotoxic activity
in silico analysis
mitogen-activated protein kinase
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2017, 98, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A novel approach for identifying DNA repair pathways proteins using an evolutionary approach: Plasmodium falciparum case study
Autorzy:
Milanowska, K.
Wojtczak, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80413.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
DNA repair
pathway
ortholog
pipeline
Plasmodium falciparum
proteomics
protein
profile analysis
Hidden Markov model
multiple sequence alignment
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2016, 97, 4
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of sparse linear discriminant analysis for prediction of protein-protein interactions
Autorzy:
Stąpor, K.
Fabian, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/95137.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
sparse discriminant analysis
feature selection
protein-protein interaction
Opis:
To understand the complex cellular mechanisms involved in a biological system, it is necessary to study protein-protein interactions (PPIs) at the molecular level, in which prediction of PPIs plays a significant role. In this paper we propose a new classification approach based on the sparse discriminant analysis [10] to predict obligate (permanent) and non-obligate (transient) protein-protein interactions. The sparse discriminant analysis [10] circumvents the limitations of the classical discriminant analysis [4, 9] in the high dimensional low sample size settings by incorporating inherently the feature selection into the optimization procedure. To characterize properties of protein interaction, we proposed to use the binding free energies. The performance of our proposed classifier is 75% ± 5%.
Źródło:
Information Systems in Management; 2016, 5, 1; 109-118
2084-5537
2544-1728
Pojawia się w:
Information Systems in Management
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Phylogenetic analysis of PDV movement protein compared to Bromoviridae members as justification of possible intercellular movement
Autorzy:
Koziel, E..
Otulak, K.
Garbaczewska, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/19748.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
phylogenetic analysis
prune dwarf virus
protein
Bromoviridae
justification
movement protein
amino acid sequence
Źródło:
Acta Biologica Cracoviensia. Series Botanica; 2015, 57, 2
0001-5296
Pojawia się w:
Acta Biologica Cracoviensia. Series Botanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structural analyses of AC4 protein of Sri Lankan cassava mosaic virus
Autorzy:
Gupta, S.
Ganguli, S.
Basu, P.
Datta, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11568.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
structural analysis
AC4 protein
cassava mosaic virus
RNA silencing
viral infection
viral suppressor
geminivirus
post transcriptional gene silencing
Opis:
RNA silencing is one of the important phenomenon in plant defense mechanism, it actively protect host plants against viral infections. Existing viruses must have developed counter defense strategies to survive this arms race. Such counter defense strategy is the viral silencing suppressor (VSRs) which have been reported to directly interfere with the various steps leading to the interference of viral RNAs. Most identified VSRs are multifunctional, besides being RNA-silencing suppressors, they often perform essential roles by functioning as coat proteins, helper components for viral transmission, replicases and movement proteins, proteases or transcriptional regulators. One such identified VSR is AC4 of Sri Lankan cassava mosaic virus strain. Trivial knowledge about the structure –function relationship of this VSR leads to this work, where we focus on the structure generation by modelling to identify the mode of interactions with the various effector molecules of the silencing pathways. Structural analyses have been performed to screen interacting residues. Results indicate conserved structural features which signify propensity of functional interactions and further shows that this VSR can be a potent tool for the analysis of RNA silencing mechanisms and the relationships between different silencing pathways and VSRs.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2015, 06
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Study of Abies somatic embryogenesis and its application
Autorzy:
Vookova, B.
Kormutak, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41461.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Dendrologii PAN
Tematy:
Abies
fir
protein analysis
chlorophyll content
macroelement
microelement
incompatible crossing
somatic embryogenesis
application
Opis:
This paper provides results of somatic embryogenesis study in our laboratory. General description of somatic embryogenesis (SE) induction, maturation of somatic embryos and plantlets regeneration of the Abies species, followed by a comparisons of some characteristics of zygotic and somatic embryos, seedlings and emblings (somatic seedlings). Own results are supplemented with some literature data. Also aplication of SE for improving of plantlet regeneration of elite fir trees from Dobroč primeval is described as well as initiation of the SE from seeds of incompatible crossings of firs where zygotic embryos abort usually several weeks after pollination
Źródło:
Dendrobiology; 2014, 71
1641-1307
Pojawia się w:
Dendrobiology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Contribution of phytocystatins to the processes of seed development and germination
Autorzy:
Siminska, J.
Sitnicka, D.
Bielawski, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80772.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
seed development
germination
storage protein
cysteine proteinase
cystatin
phytocystatin
gene encoding
phylogenetic analysis
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Differential dynamic proteome analysis of the oxidative stress response in Arabidopsis wild type and catalase mutants
Autorzy:
Jaques, S.
Gevaert, K.
Van Breusegem, F.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80125.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
protein expression
plant
wild type
hydrogen peroxide
catalase
proteomic analysis
oxidative stress
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Drought responsive changes in barley leaf proteome
Autorzy:
Rodziewicz, P.
Stobiecki, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/79847.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
barley
drought
abiotic stress
water deficit
gene expression
signal transduction
proteomic analysis
leaf protein
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Electron tomography technique – useful tool for plasmodesmata ultrastructure analysis in maize leaves
Autorzy:
Bilska, A.
Suski, S.
Sowinski, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80747.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
plasmodesma
cytoplasmic microchannel
plant cell
protein-lipid membrane
ultrastructure analysis
maize
leaf
electron tomography technique
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification, phylogenetic analyses and subcellular localization of protein phosphatases 2c type (PP2Cs) in Populus trichocarpa
Autorzy:
Betlinski, B.
Vashutina, K.
Gawronski, P.
Karpinski, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/79950.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
protein phosphatase 2C
protein kinase
mitogen-activated protein kinase
subcellular localization
Populus trichocarpa
phylogenetic analysis
identification
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structural analyses of Shigella invasion proteins reveals non-conserved; intrinsically unstructured regions
Autorzy:
Chakrabarti, S.
Ganguli, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11240.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
structural analysis
Shigella
invasion protein
intrinsically unstructured region
bacterial pathogen
diarrhea
pathogenesis
Opis:
Shigella is one of the most common bacterial pathogens that are isolated from patients with diarrhea. Various attempts are being made worldwide with encouraging observations; still the emergence of multidrug-resistant Shigella strains and a continuous high disease incidence imply that shigellosis is an unsolved global health problem which can probably be solved only by developing a proper vaccine and a vaccine regime for the disease. The need of the hour is to foster the development of an effective vaccine which should not only serve to improve hygiene but also should be able to curb infections by the pathogen. This goal can only be achieved by gaining proper detailed knowledge underlying Shigella pathogenesis. The analyses of the Shigella invasion proteins which have been long been targeted to be potential candidate vaccines remains an open ended problem and forms the core of this present computational study which identifies the fact that long regions in the structure of the proteins are disordered having no distinct structural conformation; multiple alignments however, did not show any conserved stretches in the disordered regions. The results probably explain the ability of these proteins to interact with multiple cellular proteins and perform a diverse array of functions leading to successful pathogenesis.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2013, 05
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The crosstalk between splicing of protein-coding genes and processing of microRNAs located within their introns
Autorzy:
Skorupa, K.
Sobkowiak, L.
Jarmolowski, A.
Szweykowska-Kulinska, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80242.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
splicing
protein-coding gene
processing
microRNA
biogenesis
non-coding RNA
intron
bioinformatic analysis
protein complex
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies