Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "pathogen detection" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-10 z 10
Tytuł:
Badanie i analiza czynników determinujących proces tworzenia powłoki bioreceptorowej na powierzchni kontaktów Au w konstrukcji biosensorów wykrywających obecność patogenów w akwakulturze
Study and analysis of factors determining a process of bioreceptor layer formation on a surface of AU contacts in biosensors detecting pathogens in aquaculture
Autorzy:
Prządka, Marcin Paweł
Wojcieszak, Damian
Pala, Katarzyna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27323994.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Wojskowa Akademia Techniczna im. Jarosława Dąbrowskiego
Tematy:
kontakty Au
elektrochemiczna spektroskopia impedancyjna
biosensor
detekcja patogenów
gold substrate
electrochemical impedance spectroscopy
biosensors
pathogen detection
Opis:
Czujniki zyskują coraz więcej zastosowań, szczególnie w obszarach takich jak opieka zdrowotna, diagnostyka medyczna i weterynaryjna oraz kontrola jakości żywności, której bezpieczeństwo staje się coraz większym problemem na całym świecie. w ramach pracy zbadano czynniki determinujące proces tworzenia powłoki bioreceptorowej na polach kontaktowych biosensorów w postaci warstw au oraz ich odpowiedź impedancyjną do zastosowania w detekcji patogenów w akwakulturze. w wyniku badań z użyciem podłoży biosensorowych o różnej chropowatości zauważono zależność między stopniem rozwinięcia powierzchni elektrod au a formowaniem się prawidłowej warstwy bioreceptorowej. Zmiany te zaobserwowano na podstawie analizy kąta zwilżania dla wybranych podłoży. Przeprowadzone pomiary z użyciem elektrochemicznej spektroskopii impedancyjnej wykazały, że złote elektrody z mniejszą chropowatością podłoża pozwalają uzyskać lepszą odpowiedź impedancyjną.
Sensors are becoming increasingly important every day, especially in applications such as healthcare, medical and veterinary diagnostics, and food quality control, the safety of which is becoming a more important issue worldwide. The present study investigated the critical aspects of the formation of the bioreceptor layer on biosensors and their impedance response for use in pathogen detection in aquaculture. as a result of the studies, conducted with gold substrates of different roughness, a correlation was observed between the degree of development of the au electrode surfaces and formation of the correct bioreceptor layer. These changes were observed on the basis of a wetting angle analysis for selected substrates. Measurements using electrochemical impedance spectroscopy showed that gold electrodes with lower substrate roughness obtained a better impedance response (nyquist plot). On the basis of a comprehensive analysis of the results, an innovative criterion was developed to evaluate the quality of biosensors at an early stage of their production.
Źródło:
Biuletyn Wojskowej Akademii Technicznej; 2023, 72, 1; 47--57
1234-5865
Pojawia się w:
Biuletyn Wojskowej Akademii Technicznej
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detection of Potato Virus Y (PVY) by Reverse-Transcription Loop-mediated Nucleic Acid Amplification (RT-lamp)
Autorzy:
Treder, Krzysztof
Chołuj, Joanna
Zacharzewska, Bogumiła
Mielczarek, Mateusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199694.pdf
Data publikacji:
2017-06-20
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
detection
plant pathogen
RT-LAMP
Opis:
Potato virus Y (PVY), a type member of the genus Potyvirus (family Potyviridae), is currently the most important virus infecting the potato crop. PVY is also a dangerous pathogen of the tomato, pepper, and tobac-co. The reverse transcription loop-mediated amplification (RT-LAMP) is gaining recognition as a good alter-native to RT-PCR in diagnosing plant viruses. Here, we provide a detailed description of a simple protocol for fast and sensitive detection of PVY by the RT-LAMP assay, which can be easily adapted to detect other plant pathogens, harboring both RNA and DNA genomes.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2017, 75; 77-85
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Relationship between source of water, occurrence, and pathogenicity of Phytophthora plurivora
Współzależność pomiędzy źródłem wody a występowaniem i patogenicznością Phytophthora plurivora
Autorzy:
Orlikowski, L.B.
Trzewik, A.
Ptaszek, M.
Orlikowska, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/67009.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
relationship
water source
occurrence
pathogenicity
Phytophthora plurivora
soil-borne pathogen
bait
detection
pathogen
Opis:
Phytophthora plurivora was the most often detected species from water using rhododendron baits. The species was isolated from water of two rivers, Jasieniec and Korabiewka, a water pond and a drainage canal from March to November, 2008 (in Korabiewka river also in December). The highest population density of P. plurivora was observed in March and April in water pond and canal, and in May in both analysed rivers. In laboratory trials all tested isolates colonized rhododendron and poplar leaves. Isolates from drainage canal were the most pathogenic for rhododendron. Isolates detected in March from water pond and two rivers caused the quickest spread of necrosis on leaf blades. On poplar leaves the fastest development of necrotic spots was observed when isolates obtained in June and November were used for inoculation, while the isolate from September sample was less pathogenic.
Phytophthora plurivora izolowano od marca do listopada 2008 roku z dwóch rzek Jasieniec (RJ) i Korabiewka (RK), zbiornika wodnego (S1) zlokalizowanego na terenie szkółki oraz kanału (C1) odprowadzającego nadmiar wody z kontenerowni. Największą liczbę izolatów uzyskano w marcu i kwietniu z kanału i zbiornika, a w maju z obu rzek. W warunkach laboratoryjnych wszystkie testowane kultury kolonizowały blaszki liściowe różanecznika i topoli. Izolaty z kanału okazały się najbardziej patogenicznymi dla różanecznika. Kultury z marca, uzyskane z trzech źródeł wody (S1, RJ, RK), powodowały szybszy rozwój nekrozy niż pochodzące z prób z innych miesięcy. Najszybsze tempo zasiedlania tkanek liści topoli obserwowano po inokulacji kulturami uzyskanymi z prób z lipca i listopada, a najwolniejsze w przypadku izolatu z września.
Źródło:
Acta Mycologica; 2012, 47, 1
0001-625X
2353-074X
Pojawia się w:
Acta Mycologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zagrożenie drzewostanów dębowych przez Cryphonectria parasitica
Threat to the oak stands caused by Cryphonectria parasitica
Autorzy:
Bieniek, P.
Oszako, T.
Pusz, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/979289.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
cryphonectria parasitica
oak stands
identification
detection
pathogen control
Opis:
Cryphonectria parasitica is a pathogen that causes chestnut blight – a disease that has decimated chestnut trees Castanea dentata in North America and C. sativa in Europe. C. parasitica also infects other tree species, including oaks. Although the disease on oaks progresses and develops in a milder way, it can pose a threat to them. The main purpose of the work is to investigate the risk of C. parasitica occurring in oak stands. The work is based on a review of the available literature taking into account an analysis of pathogen detection and identification methods, current distribution of disease in Europe, distribution of potential host plants, favourable climatic conditions, and ways of spreading (pathways).
Źródło:
Sylwan; 2020, 164, 07; 576-582
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The use reverse transcription and polymerase chain reaction [RT-PCR] for the detection of hop latent viroid [HLVd]
Autorzy:
Cajza, M
Wypijewski, K.
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65773.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
hop latent viroid
reverse transcription
viroid
hop
plant pathogen
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
Opis:
The simple method of nucleic acids extraction, based on guanidine thiocyanate extraction buffer, was sufficient for obtaining a good templates for RT-PCR. The RT-PCR reactions were performer from the start to the end (both the reverse transcription and the HLVd-cDNA amplification) in the same reaction mixture and in the very small volume of reaction (10 μI). Both pairs of primers designed by authors were good for reverse transcription and later for amplification of the HLVd-cDNA. The presence of gelatin as a stabilizer of DNA polymerase was indispensable for successful performance of RT-PCR.
Wiroidy, najmniejsze obecnie znane patogeny roślin, zbudowane z pojedynczej nici kolistego RNA, nie zawierające w swej budowie i nie kodujące żadnych białek, są groźnymi patogenami roślin wyższych, rozpowszechnionymi we wszystkich rejonach świata, szczególnie w uprawach roślin rozmnażanych wegetatywnie. Wiroid latentny chmielu (ang. hop latent viroid - HLVd) został wykryty dopiero w 1988 roku w chmielu. Do tej pory odnotowano go w rejonach uprawy chmielu na całym świecie. Chmiel, jedyny znany żywiciel tego patogena, ulega tylko infekcjom utajonym (latentnym). HLVd powoduje zarówno spadek masy plonu szyszek jak i zawartości alfa-kwasów w szyszkach. Bezobjawowe infekcje oraz brak białek strukturalnych i innych produktów translacji powodują, że obecnie patogena tego można wykrywać tylko przy pomocy elektroforezy (metoda bardzo zawodna, wymagająca wysokiego stężenia RNA patogena w tkance), sond hybrydyzacyjnych i rozwijanej w ostatnich latach metody RT-PCR. Podczas opracowywania RT-PCR do wykrywania HLVd w ekstraktach kwasów nukleinowych wykorzystywano dwie pary primerów specyficznych dla sekwencji nukleotydowej HLVd, charakteryzujących się różnymi temperaturami topnienia produktu. Wiroida wykrywano w ekstraktach kwasów nukleinowych z blaszek liściowych i z ogonków liściowych chmielu. Uproszczona metoda guanidynowa do izolacji totalnych kwasów nukleinowych okazała się wystarczająca do przeprowadzenia reakcji RT-PCR. Opracowana metoda charakteryzowała się bardzo dużą czułością, specyficznością (produkty amplifikacji cDNA-HLVd uzyskiwano tylko z próbek materiału roślinnego pochodzącego z roślin zawierających tego wiroida) i szybkością wykonania (dwa dni łącznie z ekstrakcją kwasów nukleinowych). Ponadto w zastosowanej metodzie opracowano warunki do przeprowadzenia zarówno odwrotnej transkrypcji i następnie amplifikacji powstałego cDNA wiroida w jednej probówce, w tej samej mieszaninie reakcyjnej . Oprócz tego wszystkie reakcje RT-PCR prowadzono w bardzo małej objętości równej 10 μl (2 μl zawiesiny kwasów nukleinowych i 8 μl mieszaniny reakcji RT-PCR). Maksymalne uproszczenie metody, wielokrotne obniżenie kosztów reakcji oraz charakterystyczna dla RT-PCR czułość, specyficzność i szybkość przeprowadzenia testu sprawiają, że może być ona wykorzystywana do rutynowego wykrywania nie tylko HLVd ale również innych wiroidów, wirusoidów i wirusów RNA.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis by the polymerase chain reaction [PCR]
Autorzy:
Cajza, M
Rezler, A.
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65945.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
tomato seed
pathogen
Clavibacter michiganensis
plant protection
bacteria
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
seed
identification
Opis:
The PCR offers the possibility of specific and very sensitive detection and/or identification of Cl. m. subsp. michiganensis in seeds. The described PCR method for identification of this pathogen is very fast (one day) and economical, because of the very small volume (10 μI) of the PCR reaction mixture. The method based on amplification of the bacterial plasmid DNA fragment may be very useful in routine identification of Cl. m. subsp. michiganensis from all other bacteria isolated from tomato seeds and may be an alternative tool in diagnostics, especially for the quarantine services.
Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis jest bardzo groźnym patogenem kwarantannowym pomidora, wywołującym chorobę zwaną bakteryjnym rakiem pomidora. Bakteria ta łatwo przenosi się z zakażonymi nasionami i sadzonkami. Pomimo opracowania różnych technik diagnostycznych do jej wykrywania, nadal stanowi duży problem w diagnozowaniu chorób pomidora. Powszechnie stosowane w Polsce wykrywanie tej bakterii, bazujące na testach enzymoimmunologicznych (ELISA), immunofluorescencyjnych, hodowli na pożywkach półselektywnych i testach biologicznych, jest często zawodne ze względu na duże serologiczne zróżnicowanie poszczególnych szczepów tej bakterii, obecność wielu bakterii saprofitycznych, tworzących kolonie nie różniące się morfologicznie od kolonii właściwych dla Cl. m. subsp. michiganensis, czy też mało przydatne ze względu na długi czas trwania testu i obecność infekcji latentnych. Jedną z nowoczesnych metod wykrywania i identyfikacji bakterii jest amplifikacja fragmentów DNA charakterystycznych dla jej genomu przy pomocy reakcji PCR. Metoda ta dopiero zaczyna być powszechnie stosowana w diagnostyce bakterii (nieliczne doniesienia, w większości z ostatnich trzech lat). Opracowana metoda identyfikacji Cl. m. subsp. michiganensis spośród różnych bakterii saprofitycznych obecnych na nasionach pomidora, charakteryzuje się bardzo dużą czułością (do wykrycia Cl. m. subsp. michiganensis wystarczy 200-300 bakterii / 1 ml), specyficznością (produkty amplifikacji DNA bakteryjnego o oczekiwanej długości 614 bp, uzyskiwano tylko w próbkach, w których znajdował się DNA z Cl. m. subsp. michiganensis) oraz szybkością (jeden dzień, wraz z izolacją DNA bakteryjnego). Ponadto opracowana metoda charakteryzuje się bardzo niskimi kosztami, gdyż cala reakcja amplifikacji DNA zachodzi w objętości 10 μI (4 μI zawiesiny DNA i 6 μI mieszaniny reakcyjnej), co sprawia, że stosowanie tej metody w powszechnej diagnostyce chorób bakteryjnych będzie coraz częstsze i będzie ona coraz bardziej konkurencyjna w stosunku do innych, obecnie stosowanych.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular detection of Ehrlichia canis, Hepatozoon canis and Babesia canis vogeli in stray dogs in Mahasarakham province, Thailand
Autorzy:
Piratae, S.
Pimpjong, K.
Vaisusuk, K.
Chatan, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/5810.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
molecular detection
Ehrlichia canis
Hepatozoon canis
Babesia canis vogeli
stray dog
dog
tick-borne pathogen
Mahasarakham province
Thailand
Opis:
Canine tick borne diseases showing distribution worldwide have caused morbidity and mortality in dogs. This study observed the mainly tick borne pathogens described for dogs in Thailand, Ehrlichia canis, Hepatozoon canis and Babesia canis vogeli. From May to July 2014, blood samples were collected from 79 stray dogs from 7 districts of Mahasarakham province to molecular surveyed for 16s rRNA gene of E. canis and 18s rRNA gene of H. canis and B. canis vogeli. Twenty eight (35.44%) of stray dogs showed the infection with tick borne pathogens. The prevalence of E. canis infection was the highest with 21.5% (17/79). DNA of H. canis and B. canis vogeli were detected at the prevalence of 10.1% (8/79) and 6.3% (5/79), respectively. Co-infection between E. canis and B. canis vogeli were identified in 2 (2.5%) dogs. The results indicated that a wide range of tick borne pathogens are circulation in the canine population in Mahasarakham province. This study is the first report on prevalence of E. canis, H. canis and B. canis vogeli in stray dogs in Mahasarakham, a province in northern part of Thailand. This data providing is important to understand the prevalence of E. canis, H. canis and B. canis vogeli infection in stray dogs in this region, which will assist in the management of these blood parasite.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2015, 61, 3
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detection of Russian olive witches’-broom disease and its insect vector in Northwestern Iran
Autorzy:
Hajizadeh, A.
Khakvar, R.
Bashir, N.S.
Zirak, L.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/66149.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Russian olive
Elaeagnus angustifolia
tree
pathogen
phytoplasma
witches' broom
plant disease
detection
polymerase chain reaction
insect vector
Candidatus Phytoplasma asteris
Macropsis infuscate
Iran
Opis:
Recently, Russian olive trees showing witches’-broom and little leaf symptoms have been widely observed in northwestern and central Iran. Polymerase chain reaction (PCR) and nested PCR assays using phytoplasma universal primer pairs confirmed phytoplasma symptomatic infection of trees. Sequence analyses showed that ‘Candidatus Phytoplasma asteris’ was the causal agent of the disease in these regions. However, RFLP results using restriction enzymes HpaII, EcoRI, HinfI and AluI indicated that the collected isolates in these regions are genetically different. In addition, leafhopper Macropsis infuscata was recognized as a possible insect vector of the disease for the first time.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2017, 57, 3
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Enhancement of fungal DNA templates and PCR amplification yield by three types of nanoparticles
Autorzy:
Al-Dhabaan, F.A.
Yousef, H.
Shoala, T.
Shaheen, J.
El Sawi, Y.
Farag, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65369.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
plant pathology
detection
identification
plant pathogen
toxigenic fungi
improvement
specificity
efficiency
polymerase chain reaction
Alternaria alternata
DNA extraction
nanoparticle
Rhizoctonia solani
nanobiotechnology
Opis:
Nanodiagonastic methods in plant pathology are used for enhancing detection and identification of different plant pathogens and toxigenic fungi. Improvement of the specificity and efficiency of the polymerase chain reaction (PCR) by using some nanoparticles is emerging as a new area of research. In the current research, silver, zinc, and gold nanoparticles were used to increase the yield of DNA for two plant pathogenic fungi including soil-borne fungus Rhizoctonia solani and toxigenic fungus Alternaria alternata. Gold nanoparticles combined with zinc and silver nanoparticles enhanced both DNA yield and PCR products compared to DNA extraction methods with ALB buffer, sodium dodecyl sulfate, ALBfree from protinase K, ZnNPs and AgNPs. Also, by using ZnNPs and AgNPs the DNA yield was enhanced and the sensitivity of random amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR products was increased. Application of nanomaterials in the PCR reaction could increase or decrease the PCR product according to the type of applied nanometal and the type of DNA template. Additions of AuNPs to PCR mix increased both sensitivity and specificity for PCR products of the tested fungi. Thus, the use of these highly stable, commercially available and inexpensive inorganic nano reagents open new opportunities for improving the specificity and sensitivity of PCR amplicon, which is the most important standard method in molecular plant pathology and mycotoxicology.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2018, 58, 1
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Sensitive and specific detection of Xanthomonas hortorum pv. pelargonii in geranium by real-time PCR
Autorzy:
Farahani, A.S.
Taghavi, S.M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/66354.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
detection
bacterial blight
Xanthomonas hortorum pv.pelargonii geranium
real-time polymerase chain reaction
pathogen
Botrytis cinerea
Puccinia pelargonii-zonalis
Pythium
Rhodococcus fascians
Ralstonia solanacearum
Opis:
Xanthomonas hortorum pv. pelargonii is the causal agent of bacterial blight of geranium. A specific and rapid real-time PCR assay for detecting the bacterium in plant was developed in this study. We compared sensitivity of conventional and real-time PCR for detection of the pathogen in inoculated plants. For application to disease management programs, PCR amplification must be able to detect latent infections of asymptomatic geraniums. Our results displayed that conventional PCR lacks sufficient sensitivity to be used as diagnostic tools for detection of X. hortorum pv. pelargonii in latent infections. On the other hand, real-time PCR is suitable method for detection of latent infection of the bacterium in planting materials and can be considered in management programs. The ability for accurate and reliable detection of X. hortorum pv. pelargonii in asymptomatic tissue is a significant step in setting up “pathogen free” certification programs for bacterial blight of geranium.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2016, 56, 3
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-10 z 10

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies