Temat: oligonucleotide - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: An introduction to DNA chips: principles, technology, applications and analysis.
Autorzy:: Gabig, Magdalena
Węgrzyn, Grzegorz
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1044090.pdf
Data publikacji:: 2001
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: gene expression
DNA array
oligonucleotide array
hybridisation
Opis:: This review describes the recently developed GeneChip technology that provides efficient access to genetic information using miniaturised, high-density arrays of DNA or oligonucleotide probes. Such microarrays are powerful tools to study the molecular basis of interactions on a scale that would be impossible using conventional analysis. The recent development of the microarray technology has greatly accelerated the investigation of gene regulation. Arrays are mostly used to identify which genes are turned on or off in a cell or tissue, and also to evaluate the extent of a gene's expression under various conditions. Indeed, this technology has been successfully applied to investigate simultaneous expression of many thousands of genes and to the detection of mutations or polymorphisms, as well as for their mapping and sequencing.
Źródło:: Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 3; 615-622
0001-527X
Pojawia się w:: Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Non-nucleosidic analogs of nucleic acids
Autorzy:: Brzezinska, J.
Adrych-Rozek, K.
Jahnz-Wechmann, Z.
Boryski, J.
Markiewicz, W.T.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/80212.pdf
Data publikacji:: 2012
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: nucleic acid
oligonucleotide
oligonucleotide analogue
non-nucleosidic nucleic acid
glycerol nucleic acid
natural nucleobase
ring system
hydrolysis
biological membrane
non-radioactive probe
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2012, 93, 4
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Segmented hybridization probes: modulating target affinity and base pairing selectivity
Autorzy:: Egetenmeyer, S.
Geiger, E.
Richert, C.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/81071.pdf
Data publikacji:: 2012
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: oligonucleotide
DNA
RNA
hybridization
base pairing
molecular biology
polymerase chain reaction
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2012, 93, 3
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: Epi-genes potentiate plant biodiversity
Autorzy:: Szopa, J.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/951285.pdf
Data publikacji:: 2015
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: biodiversity
oligonucleotide
DNA methylation
gene expression
protein
methylase
polymerase
RNA polymerase
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 5.

Tytuł:: Application of epoxy functional silanes in the preparation of DNA microarrays
Autorzy:: Frydrych-Tomczak, E.
Uszczynska, B.
Ratajczak, T.
Markiewicz, W.T.
Figlerowicz, M.
Nowicki, M.
Maciejewski, H.
Chmielewski, M.K.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/80900.pdf
Data publikacji:: 2014
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: DNA microarray
gene expression
organofunctional silane
oligonucleotide
atomic force microscopy
goniometer
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2014, 95, 1
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 6.

Tytuł:: Comparison of epigenetic changes induced by particular phytohormones and oligonucleotide sequences in flax
Autorzy:: Dzialo, M.
Zuk, M.
Szopa-Skorkowski, J.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/951289.pdf
Data publikacji:: 2015
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: conference
epigenetic change
phytohormone
oligonucleotide
flax
Linum usitatissimum
DNA sequence
methylation
flavonoids
chalcone synthase
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 7.

Tytuł:: The role of dopamine D2 receptor in the behavioral effects of imipramine - study with the use of antisense oligonucleotides
Autorzy:: Dziedzicka-Wasylewska, M.
Kolasiewicz, W.
Rogoz, Z.
Margas, W.
Maj, J.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/70213.pdf
Data publikacji:: 2000
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Fizjologiczne
Tematy:: antisense oligonucleotide
locomotor activity
drug
mRNA
dopamine D2 receptor
limbic forebrain
antidepressant drug
imipramine
Źródło:: Journal of Physiology and Pharmacology; 2000, 51, 3
0867-5910
Pojawia się w:: Journal of Physiology and Pharmacology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 8.

Tytuł:: Changes in expression of genes related to caspases and BCL-2 family in RPTEC treated with amphotericin B and its modified forms
Zmiany w ekspresji genów kodujących białka związane z aktywnością kaspaz oraz białka z rodziny BCL-2 w komórkach RPTEC traktowanych amfoterycyną B i jej modyfikowanymi formami
Autorzy:: Gola, Joanna M.
Simka, Klaudia
Strzałka-Mrozik, Barbara
Kruszniewska-Rajs, Celina
Gagoś, Mariusz
Mazurek, Urszula
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1035842.pdf
Data publikacji:: 2018
Wydawca:: Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:: caspases
bcl-2
amphotericin b
copper complexes
oligonucleotide microarrays
kaspazy
amfoterycyna b
kompleksy miedzi
mikromacierze oligonukleotydowe
Opis:: INTRODUCTION: The main limitation of the use of amphotericin B (AmB) – effective in the treatment of systemic fungal infections – is its high toxicity to human cells. The mechanism of AmB toxicity is not clear. Caspase-related and BCL-2 proteins participate in the regulation of apoptosis. Thus, they may be involved in drug toxicity. In this study we evaluated the influence of AmB on the transcriptional activity of genes related to caspases and the BCL-2 family. We also tested the influence of modified forms of AmB: AmB-Cu2+ (the complex with copper(II) ions) and the AmB-ox (oxidized form). MATERIAL AND METHODS: Human RPTECs (Renal Proximal Tubule Epithelial Cells) were treated with AmB, AmB-Cu2+ and AmB-ox. Total RNA was extracted using the phenol-chloroform method. The expression profiles of genes related to caspase activity and BCL-2 were determined using oligonucleotide microarrays (HG-U133A 2.0, Affymetrix). Analysis included 67 ID related to caspases and 32 ID associated with BCL-2, according to the Affymetrix database. RESULTS: The analysis revealed upregulation of the BCL-2 and BCL2L1genes in the cells treated with AmB-Cu2+, in comparison to the control. In both the AmB and AmB-Cu2+ -treated cells, differentiating genes were associated with inflammation and mitophagy activated by intrinsic signals. In the cells treated with AmB-ox, the BCL-2 genes were downregulated. CONCLUSIONS: The results suggest that AmB and AmB-Cu2+ activate genes involved in the regulation of inflam-mation and autophagy induced by intrinsic signals, but overexpression of BCL-2 and BCL2L1 may protect AmB-Cu2+--treated cells from death. In the cells treated with AmB-ox extrinsic signals prevail, indicating the distinct molecular mechanism of its cytotoxicity.
WSTĘP: Głównym ograniczeniem stosowania amfoterycyny B (AmB) – skutecznej w leczeniu grzybic układowych – jest jej wysoka toksyczność wobec komórek ludzkich. Mechanizm cytotoksyczności nie został wyjaśniony. Białka związane z aktywnością kaspaz oraz białka należące do rodziny BCL-2 uczestniczą w regulacji apoptozy, mogą być zatem zaangażowane w procesy odpowiedzialne za toksyczność leku. W pracy oceniono wpływ AmB na aktywność transkrypcyjną genów kodujących białka związane z aktywnością kaspaz oraz białka z rodziny BCL-2. Zbadano również wpływ modyfikowanych form AmB: AmB-Cu2+ (kompleks z jonami miedzi (II)) i AmB-ox (formy utlenione). MATERIAŁ I METODY: Ludzkie komórki RPTECs (Human Renal Proximal Tubule Epithelial Cells) inkubowano z AmB, AmB-Cu2+ i AmB-ox. Całkowity RNA wyekstrahowano metodą fenolowo-chloroformową. Profil ekspresji genów wyznaczono techniką mikromacierzy oligonukleotydowych (HG-U133A 2.0, Affymetrix). Analiza obejmowała 67 ID genów związanych z aktywnością kaspaz i 32 ID geny kodujące białka z rodziny BCL-2, zaproponowane przez bazę Affymetrix. WYNIKI: Analiza wykazała nadekspresję genów BCL-2 i BCL2L1 w komórkach traktowanych AmB-Cu2+, w porównaniu z kontrolą. Zarówno w komórkach traktowanych AmB, jak i AmB-Cu2+ geny różnicujące związane były z za-paleniem i mitofagią aktywowanymi w odpowiedzi na sygnały wewnątrzkomórkowe. W komórkach traktowanych AmB-ox geny z rodziny BCL-2 były wyciszone. WNIOSKI: Wyniki sugerują, że AmB i AmB-Cu2+ aktywują geny zaangażowane w regulację zapalenia i mitofagii aktywowanych sygnałami wewnątrzkomórkowymi, jednak nadekspresja genów BCL-2 i BCL2L1 może chronić komórki traktowane AmB-Cu2+ przed śmiercią. W komórkach traktowanych AmB-ox przeważa sygnał zewnątrzkomórkowy, co wskazuje na odrębny mechanizm cytotoksyczności tej formy antybiotyku.
Źródło:: Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2018, 72; 62-68
1734-025X
Pojawia się w:: Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 9.

Tytuł:: Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. I. The technology for the preparation of the primers
Autorzy:: Borowicz, B P
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65836.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: phosphorylation
plant protection
I-18 C gene
purification
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
oligonucleotide
Opis:: The above mentioned technology in a case of the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene is described i.e. the primers design, purification and phosphorylation of the oligonucleotide primers.
Dla określonego w tytule pracy, celu badań przedstawiono technologię przygotowywania starterów, w przypadku DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C Chironomus tentans. Technologia ta obejmowała zaprojektowanie starterów dla PCR oraz oczyszczenie i fosforylację zsyntetyzowanych oligonukleotydowych starterów.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 10.

Tytuł:: A primary attempt of Leptinotarsa decemlineata control using contact DNA insecticide based on short antisense oligonucleotide of its CYP6B gene
Autorzy:: Oberemok, V.
Laikova, K.
Shumskykh, M.
Kenyo, I.
Kasich, I.
Deri, K.
Seidosmanova, E.
Krasnodubets, A.
Bekirova, V.
Gal'chinsky, N.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/66808.pdf
Data publikacji:: 2018
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: Leptinotarsa decemlineata
pest control
DNA insecticide
insecticide
antisense oligonucleotide
cytochrome P450
CYP6B gene
potato
Opis:: Effective control of Leptinotarsa decemlineata remains an urgent problem for agriculture worldwide. Minimization of the use of non-selective neonicotinoid insecticides, such as thiomethoxam, is an actual vector of development of potato cultivation. In this rapid communication, we show the prospect of the topical use of short unmodified antisense fragment of L. decemlineata CYP6B gene as a DNA insecticide. Investigated parameters, namely, number of larvae per plant, aboveground biomass, yield and number of potatoes produced per plant indicate the possibility of this post-genomic approach as a safe and effective method of L. decemlineata control.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 2018, 58, 1
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 11.

Tytuł:: Transcriptome sequencing: next generation approach to RNA functional analysis
Autorzy:: Zmienko, A.
Jackowiak, P.
Figlerowicz, M.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/81137.pdf
Data publikacji:: 2011
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: RNA molecule
functional analysis
RNA sequence
transcriptome
isoform
DNA microarray
qualitative change
quantitative change
gene expression
hybridization
oligonucleotide probe
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 4
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 12.

Tytuł:: Manipulation of vanillin synthesis genes in flax
Autorzy:: Pastor, M.
Boba, A.
Zuk, M.
Szopa-Skorkowski, J.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/951296.pdf
Data publikacji:: 2015
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: vanillin synthesis
flax
secondary metabolite
antifungal property
antibacterial property
antiinflammatory property
antioxidant property
oligonucleotide synthesis
DNA fragment
homologous gene
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 13.

Tytuł:: Synteza modyfikowanych oligonukleotydów zawierających stereozdefiniowane internukleotydowe wiązania tiofosforanowe
Synthesis of modified oligonucleotides containing stereodefined internucleotide phosphorothioate bonds
Autorzy:: Radzikowska, E.
Kaczmarek, R.
Baraniak, J.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/172219.pdf
Data publikacji:: 2015
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:: oligonukleozydotiofosforany
oligonukleotydy antysensowe
synteza modyfikowanych oligonukleotydów
synteza stereospecyficzna
oligo(deoxy)ribonucleoside phosphorothioates
antisense oligonucleotides
synthesis of modified oligonucleotide
stereospecific synthesis
Opis:: Synthetic oligonucleotides constitute an important class of compounds which can exhibit biological activity. As potential drugs they could be employed in antisense strategy by acting on the pathogenic mRNA, causing inactivation of the target molecules during the translation process [1]. Ideal antisense agent (ASO) should be resistant to exo and/or endonucleases, exhibit a suitable pharmacological and pharmacokinetic profile and exhibits high binding affinity towards the target mRNA. To improve some properties of the ASO plethora of the chemical modifications introduced within the nucleobase, sugar unit and internucleotide linkage are investigated [3]. Among them, phosphorothioate oligonucleotides (PS-oligo), created by replacing one of the nonbridging oxygen atoms with a sulfur atom, are the major representatives of DNA analogs. PS-oligo display several attractive features like nuclease resistance, activation of RNase H, and good pharmacokinetic properties [1]. Replacement of one of two nonbridging oxygens at phosphorus by sulfur induces asymmetry at the phosphorus atom. Hence, the synthesized oligo(nucleoside phosphorothioate) is a mixture of 2n diastereomers (where n is the number of internucleotide phosphorothioate functions). Therefore the actual biological activity of the P-chiral oligonucleotide analogues, (e.g., interactions with proteins or nucleic acids) may depend on stereochemical factors [7]. One has to keep in mind that the phosphoramidite [5] and H-phosphonate [32] methodologies (commonly used to prepare PS-oligo) are nonstereospecific and give a mixture of 2n diastereomers. Thus, various methods have been elaborated to synthesize these P-chiral oligonucleotide analogs in a stereocontrolled manner [15, 17], among them the oxathiaphospholane method developed by Stec et al. [18], the method utilizing nucleoside 3’-O-(3-N-acyl)oxazaphospholidine derivatives as monomer units [19], and the method based on a stereoselective synthesis of nucleoside 3’-O-oxazaphospholidine monomers [21, 22] are the most significant.
Źródło:: Wiadomości Chemiczne; 2015, 69, 11-12; 957-981
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:: Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 14.

Tytuł:: Analysis of correlation between transcription activity of estrogen-dependent genes of cytochrome P450 and profile of estrogen receptor in endometrial adenocarcinoma
Analiza zależności pomiędzy aktywnością transkrypcyjną estrogenozależnych genów cytochromu P450 a profilem receptorów estrogenowych w gruczolakoraku endometrium
Autorzy:: Jęda-Golonka, Agnieszka
Witek, Andrzej
Paul-Samojedny, Monika
Kruszniewska-Rajs, Celina
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1035490.pdf
Data publikacji:: 2020
Wydawca:: Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:: endometrial cancer
estrogen receptors
estrogen-dependent genes
cytochrome p450
oligonucleotide microarray
posttranscription modifications
rak endometrium
receptory estrogenowe
estrogenozależne geny
cytochrom p450
mikromacierz oligonukleotydowa
modyfikacje potranskrypcyjne
Opis:: INTRODUCTION: Studies show that the development of endometrial cancer is associated with the activity of estrogen-dependent genes, whose action is conditioned by the presence of estrogen receptors (ER). Analysis of the transcriptional activity of the genes which code ERs as well as the concentration profile of their isoforms could help to understand the mechanism of estrogen activity on the risk of endometrial cancer occurrence, as well as the mechanisms involved in its development and spread. The aim of the conducted studies was to compare the transcriptional activity of the genes coding ER-alpha and ER-beta estrogen receptors, determine the types of post-transcription modifications of ER mRNA in endometrial adenocarcinoma and normal endometrium as well as determine the transcriptome of estrogen-dependent genes of cytochrome P450. MATERIAL AND METHODS: Extraction of the total RNA from 47 endometrium samples was performed with the TRIzol reagent (Invitrogen). The expression profile of the estrogen-dependent genes of cytochrome P450 was determined using the HG-U133A (Affymetrix) oligonucleotide microarray technique from among 22,283 IDs of mRNA IDs. The QRT-PCR reaction for quantification of the mRNA of estrogen receptors was performed using an ABI PRISMTM 7700 (TaqMan) sequence detector. For the QRT-PCR reaction, oligonucleotide starter sequences to detect the ER-alpha and ER-beta mRNA isoforms were designed using Primer ExpressTM Version 1.0 software. RESULTS: In the presented work, it was found that estrogen receptor gene expression occurs in normal endometrium as well as in endometrial adenocarcinoma, and the dominating type is ER-alpha. The transcriptional activity of the ER-alpha and ER-beta genes decreases in adenocarcinoma with a simultaneous increase in the transcriptional activity ratio. The ER-alpha/delta5 isoform dominates in endometrial cancer. Statistical analysis conducted in the GeneSpring 11.5 programme showed that from the group of 91 mRNA IDs of the genes of cytochrome P450, 5 mRNA IDs differentiate, for p <0.5 and FC(log2) > 1.5. In the presented work, it was found that the expression of estrogen receptor genes occurs in normal endometrium and endometrial adenocarcinoma, and the dominant type is ER-alpha. The transcriptional activity of the ER-alpha and ER-beta genes decreases in adenocarcinoma, while the transcriptional activity index increases. In endometrial cancer, the ER-alpha/delta5 isoform dominates. Statistical analysis conducted in GeneSpring 11.5 showed that from the group 91 ID mRNA of cytochrome P450 genes, 5 ID mRNA is differentiating, for p < 0.5 and FC (log2) > 1.5. CONCLUSIONS: The presence of such a transcriptional profile of the studied genes in endometrial adenocarcinoma may indicate that post-transcriptional modifications of estrogen receptors are associated with changes triggering carcinogenesis.
WSTĘP: Badania wskazują, że wzrost raka endometrium ma związek z aktywnością genów estrogenozależnych, których działanie jest uwarunkowane obecnością receptorów estrogenowych (ER). Analiza aktywności transkrypcyjnej genów kodujących ERs oraz profilu stężeń ich izoform mogłaby pomóc w zrozumieniu mechanizmów wpływu estrogenów na ryzyko wystąpienia raka endometrium, a także mechanizmów zaangażowanych w jego rozwój i rozprzestrzenianie. Celem prowadzonych badań było porównanie aktywności transkrypcyjnej genów kodujących receptory estrogenowe ER-alfa i ER-beta, wyznaczenie typów modyfikacji potranskrypcyjnych mRNA ERs w gruczolakoraku endometrium i endometrium prawidłowym oraz wyznaczenie transkryptomu estrogenozależnych genów cytochromu P450. MATERIAŁ I METODY: Ekstrakcję całkowitego RNA z 47 próbek endometrium przeprowadzono przy użyciu odczyn-nika TRIzol (Invitrogen). Techniką mikromacierzy oligonukleotydowych HG-U133A (Affymetrix) spośród 22 283 ID mRNA wyznaczono profil ekspresji estrogenozależnych genów cytochromu P450. Reakcję QRT-PCR w celu oznaczenia ilościowego mRNA receptorów estrogenowych wykonano z zastosowaniem detektora sekwencji ABI PRISMTM 7700 (TaqMan). Do reakcji QRT-PCR zaprojektowano sekwencje oligonukleotydowych starterów do detekcji izoform mRNA ER-alfa i ER-beta, wykorzystując program komputerowy Primer ExpressTM Version 1.0. WYNIKI: W przedstawionej pracy stwierdzono, że ekspresja genów receptorów estrogenowych występuje w endometrium prawidłowym oraz gruczolakoraku endometrium, a dominującym typem jest ER-alfa. Aktywność transkrypcyjna genów ER-alfa i ER-beta zmniejsza się w gruczolakoraku, przy równoczesnym wzroście wskaźnika aktywności transkrypcyjnej. W raku endometrium dominuje izoforma ER-alfa/delta5. Analiza statystyczna przeprowadzona w programie GeneSpring 11.5 wykazała, że z grupy 91 ID mRNA genów cytochromu P450 różnicujących jest 5 ID mRNA, dla p < 0,5 i FC(log2) > 1,5. WNIOSKI:Obecność takiego profilu transkrypcyjnego badanych genów w gruczolakoraku endometrium może wskazywać na związek modyfikacji potranskrypcyjnych receptorów estrogenowych ze zmianami uruchamiającymi karcinogenezę.
Źródło:: Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2020, 74; 24-39
1734-025X
Pojawia się w:: Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 15.

Tytuł:: Wykorzystanie reakcji 1,3-dipolarnej cykloaddycji Huisgena do modyfikacji nukleozydów i ligonukleotydów
An application of the Huisgen 1,3-dipolar cycloaddition to modify nukleosides and oligonucleotides
Autorzy:: Radzikowska, E.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/171872.pdf
Data publikacji:: 2011
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:: 1,3-dipolarna cykloaddycja
analogi nukleozydów
chemia click
synteza modyfikowanych oligonukleotydów
1,2,3-triazole
biokoniugaty
1,3-dipolar cycloaddition
analogues of nucleosides
click chemistry
synthesis of modified oligonucleotide
bioconjugates
Opis:: The 1,3-dipolar cycloaddition reaction between azides and terminal alkynes, known as the Huisgen reaction, constitutes a powerful tool for the synthesis of versatile molecules containing carbon – heteroatom bond. The use of a copper(I) salt in this reaction allowed Sharpless to develop the concept of „click chemistry” [1]. This strategy is based on reactions between small units characterized by mild reaction conditions, versatility, high yields and stereospecificity. The chemistry of nucleic acids and nucleoside analogues is undergoing rapid developments and numerous compounds from these classes of compounds are used in medicinal treatment. Analogues of nucleoside constitute a class of drugs that possesses either anticancer or/and antiviral activity (against HIV, HSV, VZV or HCV viruses) [3]. Many modified oligonucleotides show biological activity. As potential drugs oligonucleotides are employed in antisense, antigen and aptamer strategies. An antisense therapeutic agent acts on the pathogenic mRNA causing inactivation of the target whereas an antigen agent acts on DNA and aptamer on unwanted protein. It is not surprising that number of research groups are trying to join the concept of click chemistry with nucleic acids chemistry. In this way, it is possible to obtain new molecules like base- or sugar-modified nucleosides, nucleosides, bioconjugates and olignucleotides. The copper-catalyzed 1,3-dipolar cycloaddition CuAAC allows to functionalize DNA, for example by labelling it through attaching small molecules to DNA. Two general strategies have been developed for this purpose: presynthetic and postsynthetic labelling. In the presynthetic method nucleotide monomers are labelled before DNA synthesis and purification. In the postsynthetic strategy DNA containing small reactive groups is synthesized first and then it is conjugated with the desired molecules. CuAAC is also a convenient method for the synthesis of modified oligonucleotides in which phosphodiester linkage is replaced by 1,2,3- -triazole or for a solid phase synthesis. Such molecules appear to be useful in medicine, molecular diagnostic (e.g. fluorescent dyes) or mechanistic molecular model in the future.
Źródło:: Wiadomości Chemiczne; 2011, 65, 3-4; 207-234
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:: Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "oligonucleotide" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język