Temat: molecular polymorphism - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Genetic diversity in Vernonia amygdalina Delile accessions revealed by random amplified polymorphic DNAs (RAPDs)
Autorzy:: Aikpokpodion, P.
Abebe, J.
Igwe, D.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/79809.pdf
Data publikacji:: 2018
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: genetic diversity
Vernonia amygdalina
random amplified polymorphic DNA
polymorphism
molecular characteristics
single-nucleotide polymorphism
geographic differentiation
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2018, 99, 2
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Molecular identification of blast resistance genes in rice genotypes using gene-specific markers
Autorzy:: Al-Daej, M.I.
Ismail, M.
Rezk, A.A.
El-Malky, M.M.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/80189.pdf
Data publikacji:: 2019
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: molecular identification
resistance gene
rice genotype
Oryza sativa
DNA marker
single-nucleotide polymorphism
simple sequence repeat
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2019, 100, 3
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Comparative stability analysis of D23N mutated Aβ
Autorzy:: Alred, E. J.
Scheele, E. G.
Berhanu, W. M.
Hansmann, U. H. E.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1935815.pdf
Data publikacji:: 2014
Wydawca:: Politechnika Gdańska
Tematy:: Aβ
structural polymorphism
molecular dynamics
parallel and anti-parallel β sheets
Iowa mutant
Opis:: Amyloid β (Aβ) is the subject of numerous studies due to its link to the devastating Alzheimer’s disease and it exists in a parallel structure in fibril aggregate. The Iowa mutant (D 23 N) Aβ posses a unique antiparallel fibril aggregate structure and can also form parallel structure. This structural difference, coupled with the fact that occurrence of the Iowa mutant is correlated with early onset Alzheimer’s, suggests to use these peptides as candidates for computational studies of the structural determinants of the toxicity of Alzheimer’s disease. In order to compare the two observed Aβ structural motifs, we designed a computational study to probe the factors that affect the stability of parallel and antiparallel aggregates. Since the structural changes may occur on a timescale beyond that sampled in traditional molecular dynamics (MD), we employed a techniques of scaling the mass to reduce the solution ’s viscosity and compared the results to regular molecular dynamics. The knowledge gained from this study could provide insight into the mechanism of selection for antiparallel and parallel two fold structures.
Źródło:: TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2014, 18, 4; 365--371
1428-6394
Pojawia się w:: TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: Charakterystyka samosiewów rzepaku ozimego (Brassica napus L.) za pomocą markerów RAPD
Characteristics of winter oilseed rape (Brassica napus L.) volunteers with the use of RAPD markers
Autorzy:: Bocianowski, Jan
Lieesch, Alina
Bartkowiak-Broda, Iwona
Popławska, Wiesława
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/41491656.pdf
Data publikacji:: 2008
Wydawca:: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:: markery molekularne RAPD
polimorfizm DNA
rzepak ozimy (Brassica napus L.)
samosiewy
molecular marker RAPD
polymorphism DNA
winter oilseed rape (Brassica napus L.)
volunteers
Opis:: Celem pracy była ocena podobieństwa genetycznego (GS) pomiędzy samosiewami oraz odmianami rzepaku i rzepiku, a także określenie związku markerów molekularnych z cechami fenotypowymi i genotypem. Badania obejmowały potomstwo 31 samosiewów pobranych z plantacji rzepaku ozimego podwójnie ulepszonego w sezonie 2005/2006 w trzech województwach Polski północnej. Jako wzorce wybrano odmiany rzepaku uprawiane na plantacjach, z których pobrano samosiewy: Californium, Castille, Lisek i Rasmus oraz odmianę rzepiku ozimego (B. campestris) Ludowy. Charakterystykę samosiewów rzepaku wykonano za pomocą 431 markerów molekularnych typu RAPD. Dendrogram utworzony w oparciu o miarę GS Nei i Li (1979) rozdzielił badane genotypy na dwie zasadnicze grupy: samosiewy o morfotypie rzepaku i odmiany wzorcowe rzepaku oraz grupę obejmującą rośliny o morfotypie rzepiku i odmianę rzepiku Ludowy. Stwierdzono także istotny związek pomiędzy grupami markerów RAPD a cechami fenotypowymi i poziomem ploidalności. Otrzymano 21 markerów RAPD występujących wyłącznie w roślinach rzepiko¬podobnych o podwyższonej zawartości kwasu erukowego oraz 59 markerów charakterystycznych dla roślin w typie rzepaku o niskiej zawartości kwasu erukowego.
This study aimed to estimate genetic similarity (GS) and relationships between molecular markers and phenotypic traits and between molecular markers and genotype. The investigations included progenies of 31 volunteers collected from winter oilseed rape fields in the growing season 2005/2006. The plantations were selected in three Voivodships in northern Poland. Winter oilseed rape cultivars Californium, Castille, Lisek, Rasmus, cultivated in the fields of origin of volunteers, and winter turnip rape (B. campestris) Ludowy were chosen as standards. The volunteers of winter oilseed rape have been investigated through 431 RAPD markers. Dendrogram based on Nei and Li (1979) coefficient grouped genotypes in two clusters. The first one was represented by oilseed rape-like plants and standard oilseed rape cultivars; the second group consisted of turnip rape-like plants and turnip rape cultivar Ludowy. Significant associations between molecular markers, phenotypic traits and genotypes were found. Twenty-one of the molecular markers were specific for the turnip rape-like plants with high erucic acid content, and 59 markers were specific for oilseed rape-like plants with low erucic acid content.
Źródło:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 249; 183-192
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 5.

Tytuł:: Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
Characteristic of selected molecular markers
Autorzy:: Bolc, Paulina
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
Data publikacji:: 2020-10-22
Wydawca:: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:: markery molekularne
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
ISSR
SRAP
SNP
PCR
polimorfizm
różnorodność genetyczna
molecular markers
polymorphism
genetic diversity
Opis:: Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
Źródło:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 6.

Tytuł:: The influence of OLA-DRB1 [MHC class II] gene polymorphism on lamb body weight and weight gain in Polish Heath Sheep
Autorzy:: Gruszczynska, J
Charon, K.M.
Kitlinska, J.
Szydlowski, M.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2043157.pdf
Data publikacji:: 2000
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: statistical analysis
polymorphism
sheep
molecular analysis
OLA-DRB1 gene
body weight
Polish Heath Sheep
heterozygosity
lamb
Źródło:: Journal of Applied Genetics; 2000, 41, 2; 101-112
1234-1983
Pojawia się w:: Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 7.

Tytuł:: Silver nanoparticles in isotactic polypropylene. Part II. Molecular modelling of polypropylene chains arrangement on the surface of silver nanoparticles
Nanocząstki srebra w izotaktycznym polipropylenie. Cz. II. Modelowanie ułożenia łańcuchów polipropylenu na powierzchni nanocząstek srebra
Autorzy:: Hybiak, D.
Chmielewska, S.
Garbarczyk, J.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/947446.pdf
Data publikacji:: 2015
Wydawca:: Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Chemii Przemysłowej
Tematy:: polymorphism
epitaxy
molecular modelling
polimorfizm
epitaksja
modelowanie molekularne
Opis:: Molecular modelling (MM) was used to explain the mechanism of formation of polymorphic form of isotactic polypropylene (iPP) at the surface of the silver nanoparticles (nAg). Geometrical optimization of iPP chains and unit cell of Ag systems was made with the use of MM+force field in vacuum. According to the results, the arrangement of methyl groups in the (110) contact plane implies a lateral packing of helices with a periodicity α ≈ 19 Å, which is a characteristic feature of the complicated packing of helices in β iPP. Partial charges calculated on the basis of the hybrid potential BLYP revealed the possibility of electrostatic interactions between hydrogens from methyl groups and silver atoms at the edge of unit cell. Analysis of the optimized iPP/Ag system confirmed that the formation of the polymorphic β iPP can be explained by the epitaxial mechanism.
W celu wyjaśnienia mechanizmu tworzenia się formy β izotaktycznego polipropylenu (iPP) na powierzchni nanocząstek srebra (nAg) wykorzystano modelowanie molekularne (MM). Wykonano optymalizacje geometryczne układów iPP z nAg przy użyciu pola siłowego MM+ w próżni. Stwierdzono, że ustawienie grup metylowych w płaszczyźnie kontaktu (110) ujawnia boczne upakowanie helis z okresowością α ≈ 19 Å. Jest to cecha charakterystyczna dla upakowania helis w formie β iPP. Wyniki obliczeń ładunków cząstkowych przy użyciu potencjału hybrydowego BLYP wskazują na możliwość występowania oddziaływań elektrostatycznych między wodorami z grup metylowych łańcuchów iPP i atomami srebra leżącymi na krawędziach komórki elementarnej. Analiza optymalizowanych układów potwierdziła, że oddziaływanie atomów srebra z makrocząsteczką iPP może się przyczyniać do tworzenia polimorficznej formy β na drodze mechanizmu epitaksjalnego.
Źródło:: Polimery; 2015, 60, 11-12; 700-704
0032-2725
Pojawia się w:: Polimery
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 8.

Tytuł:: Phenotypic and Marker Assisted Evaluation for Pathogenicity and Aggressiveness of Romanian Fusarium Isolates Vs. Wheat
Autorzy:: Ittu, M.
Cana, L.
Ciuca, M.
Voaides, C.
Cornea, P.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2199565.pdf
Data publikacji:: 2011-06-21
Wydawca:: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:: aggressiveness
Fusarium graminearum
F. culmorum
molecular polymorphism
TRI 5 gene
Opis:: Pathogenicity and aggressiveness vs. wheat of 30 new Fusarium accessions, primarily F. graminearum, obtained from random naturally infected grain samples of bread wheat, durum wheat and triticale collected across Romania, phenotypically and by molecular tools has been investigated. A large variation of this trait, expressed as reduction of coleoptiles length (% of control), in seedling stage, on average over three varieties, ranging from 2.1 to 30.9 % was registered. Point field inoculations at anthesis of 90 Fusarium isolate x wheat varieties combinations, revealed also the variability of several components of aggressiveness: severity (14.4-64.8%), AUDPC (104.9-527.1), and FDK 8.1-43.7%, respectively.Molecular techniques allowed identification of Fusarium species and the analysis of polymorphism within fungal isolates. Moreover, the presence of TRI 5 gene involved in DON biosynthesis was detected in the majority of isolates.Similarity between records obtained in seedling and adult stage for the most aggressive of Fusarium isolates, suggests that phenotypic selection in conjunction with molecular tools could be a reliable method to select the appropriate pathogen strains for breeding of resistance.
Źródło:: Plant Breeding and Seed Science; 2011, 63; 77-86
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:: Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 9.

Tytuł:: Stan mezomorficzny i rodzaje mezofaz
Mesomorphic state and types of mesophases
Autorzy:: Kłosowicz, Stanisław
Zieliński, Jerzy
Raszewski, Zbigniew
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2203158.pdf
Data publikacji:: 2022
Wydawca:: Wojskowa Akademia Techniczna im. Jarosława Dąbrowskiego
Tematy:: ciekłe kryształy
mezofaza
polimorfizm
mezogeny
budowa molekularna
liquid crystals
mesophase
polymorphism
mesogens
molecular structure
Opis:: W artykule omówiono podstawowe rodzaje faz ciekłokrystalicznych, biorąc pod uwagę sposób ich otrzymywania oraz uporządkowanie nadmolekularne wewnątrz fazy. Przedyskutowano charakterystyczne cechy budowy molekularnej substancji mogących występować w fazie ciekłokrystalicznej oraz ich wpływ na właściwości ciekłokrystaliczne. Podano przykłady wpływu oddziaływań międzymolekularnych na sytuację fazową ciekłego kryształu.
The paper presents basic types of liquid-crystalline phases obtained in different ways and supermolecular arrangement in those phases. characteristic features of molecular structure of mesogens are discussed, moreover their influence on liquid-crystalline properties are described too. Examples of the effect of intermolecular interactions on the phase situation of a liquid crystal are given.
Źródło:: Biuletyn Wojskowej Akademii Technicznej; 2022, 71, 1; 115--135
1234-5865
Pojawia się w:: Biuletyn Wojskowej Akademii Technicznej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 10.

Tytuł:: Molecular studies in osteogenesis imperfecta [OI] II. Evaluation of intragenic polymorphic sites in COL1A1 and COL1A2 loci
Autorzy:: Kostyk, E
Sucharski, P.
Pietrzyk, J.J.
Kruczek, A.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2044212.pdf
Data publikacji:: 1998
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: intragenic polymorphic site
polymorphism
haplotype
DNA isolation
COL1A1 gene
electrophoresis
collagen
COL1A2 gene
molecular marker
osteogenesis imperfecta
Opis:: The goal of the study was to evaluate intragenic polymorphic sites in COL1A1 and COL1A2 loci. For COL1A1 the following intragenic markers were used: PCR-RFLP (COL1A1), G/A polymorphism in exon 45 of COL1A1 and C/T polymorphism in +88 position of COL1A1 non-translatable 3’ end. For COL1A2 PCR-VNTR was analyzed. 17 families were examined (6 of the "simplex" type and 11 of the "multiple" type). In 8 out of 11 "multiplex" families the segregation of the markers revealed correlation with OI, whereas the other 3 were non-informative. The method was not useful in "simplex" families.
Źródło:: Journal of Applied Genetics; 1998, 39, 4; 349-365
1234-1983
Pojawia się w:: Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 11.

Tytuł:: Identification of genetic diversity among Arnica montana L. genotypes using RAPD markers
Analiza zróżnicowania genetycznego wśród genotypów Arnica montana L. za pomocą markerów RAPD
Autorzy:: Okoń, S.
Paczos-Grzęda, E.
Łoboda, M.
Sugier, D.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/11542962.pdf
Data publikacji:: 2014
Wydawca:: Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:: DNA polymorphism
identification
genetic diversity
Arnica montana
genotype
RAPD marker
medicinal plant
molecular analysis
Opis:: Arnica montana L. is one of the most important herbal plants used in medicine, pharmaceutical and cosmetic industry. The number of studies performed with molecular markers on arnica genotypes is very limited. Because of this fact the aims of presented examination were optimization of protocols DNA isolation from fresh leaves of A. montana and identification of genetic diversity among this plant genotypes. In presented study to obtain pure DNA Plant & Fungi DNA Purification Kit (EURx) were used. To clean obtained DNA long and slow electrophoresis and isolation DNA from gels were used. A. montana genotypes were analyzed using 40 RAPD primers (Operon Technologies), out of which 12 produced high number of polymorphic and repeatable fragments. In total, selected primers produced 120 fragments, among them 111 (92.5%) were polymorphic. The genetic similarity matrices were produced based on RAPD using the Dice’s coefficient. RAPD based genetic similarity was estimated between 0.535 and 0.945. The highest genetic similarity was estimated among GA17 and GA18 genotypes, which are closely located on the obtained dendrogramme.
Arnica montana L. jest jedną z najcenniejszych roślin zielarskich wykorzystywanych w medycynie, farmacji i przemyśle kosmetycznym. W dostępnej literaturze liczba doniesień związanych z analizą molekularną arniki jest znikoma, dlatego też celem prezentowanych badań była optymalizacja procesu izolacji DNA ze świeżych liści oraz identyfikacja zróżnicowania genetycznego oparta na markerach RAPD. W prezentowanej pracy w celu uzyskania czystego DNA do izolacji wykorzystano zestaw DNA Plant & Fungi DNA Purification Kit (Euro) oraz oczyszczanie za pomocą długiej elektroforezy w żelu agarozowym. Spośród testowanych 40 starterów RPAD do analiz wybrano 12 generujących stabilne i polimorficzne wzory prążków. Wyselekcjonowane startery amplifikowały 120 fragmentów, spośród których 111 (92,5%) było polimorficznych. Wykorzystujac markery RAPD utworzono matryce podobieństwa genetycznego. średnia wartość podobieństwa analizowanych genotypów wynosiła 0.886. Najwyższy współczynnik podobieństwa genetycznego oszacowano pomiędzy genotypami GA17 i GA18, które ulokowały się blisko siebie na uzyskanym dendrogramie.
Źródło:: Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2014, 13, 4; 63-71
1644-0692
Pojawia się w:: Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki