Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "mikromacierze" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-12 z 12
Tytuł:
Przegląd analiz stosowanych w eksperymencie mikromacierzowym
Microarray data analysis - review
Autorzy:
Siatkowski, I.
Zyprych, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/9669.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Katedra Zastosowań Matematyki i Informatyki
Tematy:
mikromacierze
mikromacierze cDNA
analiza statystyczna
normalizacja
klasteryzacja
analiza danych
Źródło:
Colloquium Biometricum; 2008, 38
1896-7701
Pojawia się w:
Colloquium Biometricum
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mikromacierze DNA i ich wykorzystanie w parazytologii i medycynie
DNA microarrays in parasitology and medical sciences
Autorzy:
Jaros, S
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/837997.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
mikromacierze DNA
parazytologia
wykorzystanie
medycyna
Opis:
The article presents the current knowledge on the microarray technique and its applications in medical sciences and parasitology. The first part of the article is focused on the technical aspects (microarray preparation, different microarray platforms, probes preparation, hybridization and signal detection). The article also describes possible ways of proceeding during laboratory work on organism of which the genome sequence is not known or has been only partially sequenced. The second part of the review describes how microarray technique have been, or possibly will be, used for better understanding parasite life cycles and development, host-parasite relationship, comparative genomics of virulent organisms, develpoment vaccines against the most virulent parasites and host responses to infection.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2006, 52, 1; 13-29
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mikromacierze DNA i ich wykorzystanie w parazytologii i medycynie
DNA microarrays in parasitology and medical sciences
Autorzy:
Jaros, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2144085.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
mikromacierze DNA
parazytologia
wykorzystanie
medycyna
Opis:
The article presents the current knowledge on the microarray technique and its applications in medical sciences and parasitology. The first part of the article is focused on the technical aspects (microarray preparation, different microarray platforms, probes preparation, hybridization and signal detection). The article also describes possible ways of proceeding during laboratory work on organism of which the genome sequence is not known or has been only partially sequenced. The second part of the review describes how microarray technique have been, or possibly will be, used for better understanding parasite life cycles and development, host-parasite relationship, comparative genomics of virulent organisms, develpoment vaccines against the most virulent parasites and host responses to infection.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2006, 52, 1; 13-29
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie mikromacierzy DNA w badaniach dzikich zwierząt
The use of DNA microarray in the study of the wild animal species
Autorzy:
Wojciechowska, M.
Olech, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/881119.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Leśny Zakład Doświadczalny. Centrum Edukacji Przyrodniczo-Leśnej w Rogowie
Tematy:
zwierzeta dziko zyjace
genetyka zwierzat
markery genetyczne
mikromacierze DNA
Źródło:
Studia i Materiały Centrum Edukacji Przyrodniczo-Leśnej; 2013, 15, 3[36]
1509-1414
Pojawia się w:
Studia i Materiały Centrum Edukacji Przyrodniczo-Leśnej
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Patogeneza przewlekłego zapalenia ucha środkowego z perlakiem w świetle badań wykorzystujących wysokoprzepustowe techniki biologii molekularnej
Autorzy:
Makuszewska, Maria
Bartoszewicz, Robert
Niemczyk, Kazimierz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1399672.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Index Copernicus International
Tematy:
analiza proteomiczna
biologia molekularna
ekspresja genów
mikromacierze
nabyty perlak
patogeneza
Opis:
Perlakiem określa się torbielowaty twór zbudowany z nabłonka wielowarstwowego płaskiego rogowaciejącego, wypełniony masami keratyny, otoczony zmienioną zapalnie tkanką łączną, rozrastający się w przestrzeniach ucha środkowego i niszczący okoliczne struktury kostne. W niniejszej publikacji przedstawiamy przegląd istniejących hipotez, wyjaśniających jego powstawanie w świetle nowych badań wykorzystujących wysokoprzepustowe techniki biologii molekularnej. Mimo istnienia licznych teorii, starających się wyjaśnić etiologię perlaka, takich jak: teoria migracji, metapalzji, wgłobienia, wrastania w głąb komórek warstwy podstawnej nabłonka, żadna z nich nie wyjaśnia w pełni wszystkich patologicznych procesów, do jakich dochodzi w tkance perlaka. Dotyczy to również nowych hipotez tłumaczących powstawanie perlaka nabytego mechanizmami, mającymi na celu ograniczenie stanu zapalnego, podobnymi do obserwowanych w obrębie jamy brzusznej, wpływem błony śluzowej ucha na przesuwanie się przylegającej kieszeni bądź mechanizmem gojenia ran, który uruchamiany byłby przez mikrouszkodzenia błony podstawnej nabłonka wyścielającego kieszeń retrakcyjną. Wprowadzenie nowych wysokoprzepustowych technik biologii molekularnej pozwoliło na ocenę zarówno całego genomu, jak i proteomu perlaka. Potwierdzają one w większości znane już wcześniej procesy patologiczne zachodzące w tkance perlaka, takie jak: wysoka aktywność proliferacyjna, zaburzenia sygnalizacji komórkowej, aktywna odpowiedź immunologiczna, zmiany w obrębie macierzy zewnątrzkomórkowej, wzrost ekspresji cytokin prozapalnych, neowaskularyzacja i wiele innych. Pozwalają również na bardzo dokładny i całościowy wgląd w mechanizmy molekularne tych procesów. Nadal jednak nie uzyskujemy odpowiedzi na pytania o przyczynę wywołującą hyperplazję nabłonka i zaburzenia migracji komórek nabłonkowych czy przyczynę utrzymywania się procesu zapalnego w obrębie istniejącej kieszeni retrakcyjnej.
Źródło:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny; 2019, 8, 3; 14-19
2084-5308
2300-7338
Pojawia się w:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie metod optymalizacyjnych do budowania ukrytych modeli Markowa w analizie danych z mikromacierzy DNA
Application of optimization methods for hidden Markov models in analysis of DNA microarrays data
Autorzy:
Walawender, P.
Ćmielowski, Ł.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/261582.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
Tematy:
mikromacierze DNA
ukryte modele Markova
optymalizacja
DNA microarrays
hidden Markov models
optimization
Opis:
Techniki mikromacierzy DNA umożliwiły pomiar ekspresji genów i obserwowanie zależności między tkankami z różnych próbek. W artykule omówiono zastosowanie algorytmów opartych na ukrytych modelach Markowa (ang. Hidden Markov Models) do analizy danych z mikromacierzy DNA. Zaprezentowane podejście porównano z innymi, opisanymi w podobnych opracowaniach. Zaproponowane algorytmy składają się z dwóch części: odkrywczej i klasyfikacyjnej. Za pomocą zbioru danych treningowych stworzono uniwersalny klasyfikator, którego efektywność i inne parametry będą mierzone za pomocą danych testowych.
DNA microarray technologies make possible measurement of genes expression and observation the differences between various tissue samples. The application of hidden Markov models for analyzing DNA microarrays gene expression data, will be reported. A new approach will be compared with similar approaches used in other publications. The proposed algorithms will be composed of two parts: discovery and classification. By means of training data an universal classifier will be created, which efficiency as well as other parameters will be measured by testing data.
Źródło:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2009, 15, 1; 11-13
1234-5563
Pojawia się w:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Changes in expression of genes related to caspases and BCL-2 family in RPTEC treated with amphotericin B and its modified forms
Zmiany w ekspresji genów kodujących białka związane z aktywnością kaspaz oraz białka z rodziny BCL-2 w komórkach RPTEC traktowanych amfoterycyną B i jej modyfikowanymi formami
Autorzy:
Gola, Joanna M.
Simka, Klaudia
Strzałka-Mrozik, Barbara
Kruszniewska-Rajs, Celina
Gagoś, Mariusz
Mazurek, Urszula
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1035842.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
caspases
bcl-2
amphotericin b
copper complexes
oligonucleotide microarrays
kaspazy
amfoterycyna b
kompleksy miedzi
mikromacierze oligonukleotydowe
Opis:
INTRODUCTION: The main limitation of the use of amphotericin B (AmB) – effective in the treatment of systemic fungal infections – is its high toxicity to human cells. The mechanism of AmB toxicity is not clear. Caspase-related and BCL-2 proteins participate in the regulation of apoptosis. Thus, they may be involved in drug toxicity. In this study we evaluated the influence of AmB on the transcriptional activity of genes related to caspases and the BCL-2 family. We also tested the influence of modified forms of AmB: AmB-Cu2+ (the complex with copper(II) ions) and the AmB-ox (oxidized form). MATERIAL AND METHODS: Human RPTECs (Renal Proximal Tubule Epithelial Cells) were treated with AmB, AmB-Cu2+ and AmB-ox. Total RNA was extracted using the phenol-chloroform method. The expression profiles of genes related to caspase activity and BCL-2 were determined using oligonucleotide microarrays (HG-U133A 2.0, Affymetrix). Analysis included 67 ID related to caspases and 32 ID associated with BCL-2, according to the Affymetrix database. RESULTS: The analysis revealed upregulation of the BCL-2 and BCL2L1genes in the cells treated with AmB-Cu2+, in comparison to the control. In both the AmB and AmB-Cu2+ -treated cells, differentiating genes were associated with inflammation and mitophagy activated by intrinsic signals. In the cells treated with AmB-ox, the BCL-2 genes were downregulated. CONCLUSIONS: The results suggest that AmB and AmB-Cu2+ activate genes involved in the regulation of inflam-mation and autophagy induced by intrinsic signals, but overexpression of BCL-2 and BCL2L1 may protect AmB-Cu2+--treated cells from death. In the cells treated with AmB-ox extrinsic signals prevail, indicating the distinct molecular mechanism of its cytotoxicity.
WSTĘP: Głównym ograniczeniem stosowania amfoterycyny B (AmB) – skutecznej w leczeniu grzybic układowych – jest jej wysoka toksyczność wobec komórek ludzkich. Mechanizm cytotoksyczności nie został wyjaśniony. Białka związane z aktywnością kaspaz oraz białka należące do rodziny BCL-2 uczestniczą w regulacji apoptozy, mogą być zatem zaangażowane w procesy odpowiedzialne za toksyczność leku. W pracy oceniono wpływ AmB na aktywność transkrypcyjną genów kodujących białka związane z aktywnością kaspaz oraz białka z rodziny BCL-2. Zbadano również wpływ modyfikowanych form AmB: AmB-Cu2+ (kompleks z jonami miedzi (II)) i AmB-ox (formy utlenione). MATERIAŁ I METODY: Ludzkie komórki RPTECs (Human Renal Proximal Tubule Epithelial Cells) inkubowano z AmB, AmB-Cu2+ i AmB-ox. Całkowity RNA wyekstrahowano metodą fenolowo-chloroformową. Profil ekspresji genów wyznaczono techniką mikromacierzy oligonukleotydowych (HG-U133A 2.0, Affymetrix). Analiza obejmowała 67 ID genów związanych z aktywnością kaspaz i 32 ID geny kodujące białka z rodziny BCL-2, zaproponowane przez bazę Affymetrix. WYNIKI: Analiza wykazała nadekspresję genów BCL-2 i BCL2L1 w komórkach traktowanych AmB-Cu2+, w porównaniu z kontrolą. Zarówno w komórkach traktowanych AmB, jak i AmB-Cu2+ geny różnicujące związane były z za-paleniem i mitofagią aktywowanymi w odpowiedzi na sygnały wewnątrzkomórkowe. W komórkach traktowanych AmB-ox geny z rodziny BCL-2 były wyciszone. WNIOSKI: Wyniki sugerują, że AmB i AmB-Cu2+ aktywują geny zaangażowane w regulację zapalenia i mitofagii aktywowanych sygnałami wewnątrzkomórkowymi, jednak nadekspresja genów BCL-2 i BCL2L1 może chronić komórki traktowane AmB-Cu2+ przed śmiercią. W komórkach traktowanych AmB-ox przeważa sygnał zewnątrzkomórkowy, co wskazuje na odrębny mechanizm cytotoksyczności tej formy antybiotyku.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2018, 72; 62-68
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mikrofluidyka - technologia miniaturyzacji laboratorium
Autorzy:
Laskowski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/274256.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Roble
Tematy:
mikrofluidyka
technologie mikrocieczowe
mikromacierze DNA
lab-on-a-chip
droplet-on-demand
peroksydaza
microfluidics
DNA microarrays
peroxidase
Źródło:
LAB Laboratoria, Aparatura, Badania; 2011, 16, 1; 41-43
1427-5619
Pojawia się w:
LAB Laboratoria, Aparatura, Badania
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of the adaptive noise removal technique to the enhancement of cDNA microarray images
Autorzy:
Smolka, B.
Bieda, R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333786.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
wzmocnienie obrazu kolorowego
impulsywne usuwanie szumów
mikromacierze
odtworzenie obrazu
colour image enhancement
impulsive noise removal
microarray
image restoration
Opis:
In this paper a novel class of filters designed for the removal of impulsive noise in colour images is presented. The proposed filter family is based on the kernel function which controls the noise suppression properties of the new filtering scheme. The comparison of the new filtering method with the standard techniques used for impulsive noise removal indicates its superior noise removal capabilities and excellent structure preserving properties. The proposed filtering scheme has been successfully applied to the denoising of the cDNA microarray images. Experimental results proved that the new filter is capable of removing efficiently the impulses present in multichannel images, while preserving their textural features.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2005, 9; 131-142
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detekcja ekspresji genów drzew leśnych za pomocą mikromacierzy DNA
Gene-expression in forest-tree species assessed with microarrays as a tool
Autorzy:
Nowakowska, J.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/972859.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
mRNA
ekspresja genow
genetyka roslin
mikromacierze DNA
sekwencja ESTs
lesnictwo
wykrywanie
drzewa lesne
microarray
gene−expression
forest−tree specie
ESTs
Opis:
DNA microarray technology is a powerful tool in functional genomics study of many organisms, the forest−trees included. This method allow to examine simultaneously the changes in expression of thousands of genes and it is based on specific hybridization of cDNA probes from an organism with the DNA library immobilized in an array. The power of this method consists in miniaturization, automation and parallel study of large−scale genome from multiple samples. In forest science, the microarray technology has already been applied in some study of gene−expression in Populus, Pinus and Picea species and the number of new reports is still increasing every year. Since far, some gene−expression have been studied among woody plants in regard of development and growth processes (xylem, adventious−root and zygotic embryo formation, flowering, ripening, shooting of leaves), resistance mechanisms against biotic (fungi, viruses) and abiotic factors (drought, NaCl, elevated CO2 and O3 concentrations). Many practical applications of the microarray technique may concern the early selection in nursery of trees for morphologically valuable traits, the sustainable forest regeneration and the production of genetically transformed species for the chosen trait.
Źródło:
Sylwan; 2006, 150, 04; 33-43
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Polymers for peptide/protein arrays
Polimery w macierzach peptydowych/białkowych
Autorzy:
Szweda, R.
Lipowska, D.
Silberring, J.
Dworak, A.
Trzebicka, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/945832.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Chemii Przemysłowej
Tematy:
peptide arrays
protein arrays
polymeric surfaces
microarrays
polymeric linkers
poly(ethylene glycol)
dendrimers
macierze peptydowe
macierze białkowe
powierzchnie polimerowe
mikromacierze
łączniki (linkery) polimerowe
poli(glikol etylenowy)
dendrymery
Opis:
Peptide and protein arrays have gained increasing attention due to their potential application in many areas of research, clinical diagnosis, and pharmacy. A typical array consists of asupport containing immobilized peptides or proteins positioned in an addressable format. The greatest advantage of the arrays is the possibility for miniaturization, which relies on dividing the surface into miniature spots, thus allowing for hundreds/thousands of analyses to be simultaneously performed using minimal amounts of aprecious biological material. The quality of assays with the use of peptide and protein arrays depends on the surface properties, e.g., hydrophilicity, homogeneity, density of functional groups, surface morphology, etc. In recent years, it was shown that the quality of the assays might be improved by introducing polymers acting as spacers between the peptide and the solid support. This approach causes changes in the surface properties, e.g., it reduces the undesirable non-specific adsorption of biomolecules, increases the density of functional groups, or can improve the biological activity of biomolecules attached to the surface. In this review, various types of polymers that are used for peptide and protein arrays and their impact on the assay quality are discussed.
Peptydy lub białka naniesione w regularnych, uporządkowanych pozycjach na nośnik stały tworzą tzw. macierze. Układy takie wzbudzają coraz większe zainteresowanie, ponieważ można je wykorzystywać do prowadzenia analiz w biochemii, diagnostyce klinicznej czy farmacji. Największą zaletą macierzy jest możliwość miniaturyzacji. Podział powierzchni macierzy na mikroplamki (mikrospoty) pozwala na wykonywanie do kilkuset analiz jednocześnie z wykorzystaniem minimalnej ilości cennego materiału biologicznego. Jakość analiz przeprowadzanych przy użyciu macierzy peptydowych i białkowych zależy od takich właściwości powierzchni, jak: hydrofilowość, jednorodność, gęstość obsadzenia grupami funkcyjnymi, morfologia, itp. W ostatnich latach wykazano, że można poprawić jakość analiz w wyniku wprowadzenia polimerów między peptyd/białko a podłoże. Polimery zmieniają właściwości powierzchni macierzy, np. redukują niepożądaną adsorpcję biocząsteczek, zwiększają gęstość obsadzenia powierzchni grupami funkcyjnymi lub poprawiają dostępność biocząsteczek związanych z powierzchnią. W niniejszej pracy omówiono różne typy polimerów stosowane do otrzymywania macierzy peptydowych i białkowych oraz ich wpływ na jakość przeprowadzanych analiz.
Źródło:
Polimery; 2015, 60, 2; 75-86
0032-2725
Pojawia się w:
Polimery
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody analizy ekspresji genów w badaniach nad rzepakiem
Methods for gene expression analysis in studies of oilseed rape
Autorzy:
Olejnik, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833939.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
hodowla roslin
genetyka roslin
ekspresja genow
metody analizy
mikromacierze DNA
seryjna analiza ekspresji genow
odwrotna transkrypcja
biotechnologia
badania molekularne
rape
plant breeding
plant genetics
gene expression
analysis method
transcription
biotechnology
molecular study
Opis:
W pracy przedstawiono przegląd metod analizy ekspresji genów z zastosowaniem technik: mikromacierzy DNA, seryjnej analizy ekspresji genów (SAGE), jak również odwrotnej transkrypcji – RT-PCR oraz qRT-PCR. Zaprezentowano możliwości wykorzystania poszczególnych technik wraz z przykładami ich praktycznego zastosowania w badaniach molekularnych rzepaku.
This paper presents an overview of gene expression analysis methods, including: DNA microarrays, SAGE (Serial Analysis of Gene Expression), as well as reverse transcription techniques: RT-PCR and qRT-PCR. It also includes some examples of application of the methods in molecular studies on oilseed rape genome and transcriptome.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 1
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-12 z 12

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies