Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "microbial diversity" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-7 z 7
Tytuł:
Non-lipophilic mycobiota of human skin
Autorzy:
Talaga, K.
Krzysciak, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/67510.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
mycobiota
yeast
skin
human skin
microbial diversity
mold
Opis:
The human skin is inhabited by many species of bacteria and fungi, which are its natural microbiota. Fungi colonizing the skin, including those causing disease, characterized by great variety and variability, can be influenced by various factors. The purpose of this study was to investigate the composition of the non-lipiddependent fungal microbiota of skin, including the presence of species potentially pathogenic for humans. Fifty-six volunteers of both sexes aged 22–78 were subjected to the study. Swabs were taken from the face, chest, back and interdigital spaces of hands. Mycobiota isolated proved to vary both in terms of the location of occurrence and gender of patients. Interdigital spaces of hands, dominated by yeasts, constitute a location on human skin most contaminated with fungi. Molds were more often isolated from the face and chest. The back was the least contaminated location. There was no difference in fungal incidence in relation to sex.
Źródło:
Acta Mycologica; 2015, 50, 2
0001-625X
2353-074X
Pojawia się w:
Acta Mycologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of molecular techniques for the assessment of microorganism diversity on cultural heritage objects
Autorzy:
Otlewska, Anna
Adamiak, Justyna
Gutarowska, Beata
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039279.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
molecular techniques
microbial diversity
metagenomics
genetic fingerprinting
cultural heritage
biodeterioration
Opis:
As a result of their unpredictable ability to adapt to varying environmental conditions, microorganisms inhabit different types of biological niches on Earth. Owing to the key role of microorganisms in many biogeochemical processes, trends in modern microbiology emphasize the need to know and understand the structure and function of complex microbial communities. This is particularly important if the strategy relates to microbial communities that cause biodeterioration of materials that constitute our cultural heritage. Until recently, the detection and identification of microorganisms inhabiting objects of cultural value was based only on cultivation-dependent methods. In spite of many advantages, these methods provide limited information because they identify only viable organisms capable of growth under standard laboratory conditions. However, in order to carry out proper conservation and renovation, it is necessary to know the complete composition of microbial communities and their activity. This paper presents and characterizes modern techniques such as genetic fingerprinting and clone library construction for the assessment of microbial diversity based on molecular biology. Molecular methods represent a favourable alternative to culture-dependent methods and make it possible to assess the biodiversity of microorganisms inhabiting technical materials and cultural heritage objects.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 2; 217-225
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Problematic Biases in the Availability of Molecular Markers in Protists: The Example of the Dinoflagellates
Autorzy:
Gómez, Fernando
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763541.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
Alveolate, Dinophyceae, Dinophyta, DNA barcoding, microbial diversity, molecular phylogeny, unicellular eukaryotes
Opis:
Dinoflagellates (Alveolata, Dinophyceae) are protists with a truly remarkable diversity in lifestyles (free-living, parasites and mutualistic symbionts), habitats (marine, freshwater, plankton, benthos), and trophic modes (heterotrophic, plastid-containing). Here dinoflagellates are used to evaluate biases in the availability of molecular markers in relation to the variety of functional and ecological characteristics of protists. A large number of dinoflagellate sequences are available in GenBank, at least one for 56% of the 264 described genera. The most common marker is the small ribosomal subunit ribosomal DNA (49%). At the species level, SSU rDNA or the large subunit rDNA are available for 15% of the 2,386 described species. Availability of sequences of the internal transcribed spacers (ITS) and cytochrome oxidase I (COI) show a strong bias towards cultivable species. Relative to trophic mode, while about half of the known dinoflagellates are heterotrophic, only 12% of them have been sequenced compared to 29% of the plastid-containing species. For the COI marker availability is 10 times greater for plastid-containing compared to heterotrophic species. Freshwater species are underrepresented (13%) relative to the marine forms (22%). A high proportion of benthic species have been sequenced (46%) reflecting interest in Symbiodinium and harmful epiphytic taxa. Most of the relatively few described mutualistic species have been sequenced (> 80%). In contrast, only 17% of the described parasitic species have been sequenced, and most of the available sequences were not identified at the species level. In recent years, new species have been described mostly from coastal blooms or cultures. These studies are favored by the availability of abundant material for detailed studies of ultrastructure and multi-gene molecular phylogenies. Many methods are difficult to apply for the scarce specimens available from the open ocean. The requirement of these protocols, easy to apply with cultured species, is an obstacle in our knowledge of the open ocean diversity because it discourages studies based on sparse material. Consequently, in recent years descriptions of new species from the open ocean have declined considerably.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2014, 53, 1
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Microbial diversity of sewage sludge
Różnorodność mikrobiologiczna osadów ściekowych
Autorzy:
Błaszczyk, K.
Krzyśko-Łupicka, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/125947.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Towarzystwo Chemii i Inżynierii Ekologicznej
Tematy:
sewage sludge
microbiological determination
microbial diversity
osad ściekowy
ocena mikrobiologiczna
różnorodność mikrobiologiczna
Opis:
Sewage sludge may be a cluster of different groups of microorganisms, including potential pathogenic, therefore processing of sludge should be conducted in a manner that protects workers and the environment from the sanitary risks. The aim of the study was to assess quantitatively and qualitatively the microbial diversity of the municipal sewage sludge, from the food industry and from the coke after the treatment, with the addition of flocculant and/or lime. Research material consisted of samples taken directly from the wastewater treatment plant. Quantitative and qualitative assessment of mesophilic and psychrophilic bacteria, yeasts, filamentous fungi and potentially pathogenic microorganisms was performed by a culture method. Techniques for treatment sewage sludge towards their hygenisation and reduce the amount of sediment by supporting flocculants and/or liming affect the quantitative and qualitative microorganisms composition. In the studied sewage sludge dewatered using a flocculant, with the exception of sediments from the food industry, there was the highest total number of microorganisms, both meso- and psychrophilic bacteria, yeast, filamentous fungi and potentially pathogenic bacteria. However, in the sediments of the food industry increase in the number of bacteria was observed only after simultaneous application of liming. Among the isolated microorganisms, depending on the origin of the sludge there was a domination of gram negative rods, with the exception of coke sediments without a flocculant. The municipal and from the food industry sediments were dominated by fungi: Aspergillus niger and Cladosporium sp., in coke sediments Aspergillus amstelodami, Paecilomyces javanicus and Acremonium sp. In these latter was also observed the greatest diversity of yeasts.
Osady ściekowe mogą być skupiskiem różnych grup mikroorganizmów, w tym potencjalnie chorobotwórczych, dlatego ich przeróbka powinna być prowadzona w sposób chroniący pracowników i środowisko przed zagrożeniem sanitarnym. Celem badań była mikrobiologiczna ocena ilościowa i jakościowa osadów ściekowych komunalnych i pochodzących z przemysłu spożywczego oraz koksowni po przeróbce z dodatkiem flokulantu i/lub wapna palonego. Materiał badawczy stanowiły próbki pobrane bezpośrednio z oczyszczalni ścieków. Ocenę ilościową i jakościową bakterii mezofilnych i psychrofilnych, drożdży, grzybów strzępkowych oraz mikroorganizmów potencjalnie chorobotwórczych przeprowadzono metodą hodowlaną. Techniki przeróbki osadów ściekowych w kierunku ich higienizacji oraz zmniejszenia ilości osadów poprzez wspomaganie flokulantami i/lub wapnowanie miały wpływ na skład ilościowy i jakościowy mikroorganizmów. W badanych osadach ściekowych odwadnianych flokulantem, z wyjątkiem osadów z przemysłu spożywczego, występowała najwyższa ogólna liczba mikroorganizmów, zarówno bakterii mezo-, jak i psychrofilnych, drożdży i grzybów strzępkowych oraz bakterii potencjalnie chorobotwórczych. Natomiast w osadach przemysłu spożywczego wzrost liczebności bakterii obserwowano dopiero po równoczesnym zastosowaniu wapnowania. Wśród wyizolowanych mikroorganizmów, w zależności od pochodzenia osadu ściekowego, stwierdzono dominację pałeczek gram-ujemnych z wyjątkiem osadów koksowniczych bez flokulantu. W osadach komunalnych i pochodzenia spożywczego dominowały grzyby: Aspergillus niger oraz Cladosporium sp., a w osadach koksowniczych Aspergillus amstelodami, Paecilomyces javanicus i Acremonium sp. W tych ostatnich obserwowano również największą różnorodność drożdży.
Źródło:
Proceedings of ECOpole; 2013, 7, 2; 461-466
1898-617X
2084-4557
Pojawia się w:
Proceedings of ECOpole
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Morphology analysis and microbial diversity in novel anaerobic baffled reactor treating recycled paper mill wastewater
Autorzy:
Zwain, Haider M.
Al-Marzook, Farah A.
Nile, Basim K.
Jeddoa, Zuhair Mohammed Ali
Atallah, Aqeel H.
Dahlan, Irvan
Hassan, Waqed Hammed
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2073763.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
anaerobic digestion
AD
novel anaerobic baffled reactor
NABR
recycled paper mill wastewater
RPMW
microbial diversity
microbial morphology
Opis:
The profile of microbial diversity in a NABR digesting RPMW was investigated using phylogenetic analysis of partial 16S rRNA sequences by a neighbor-joining-tree, supported by microbial morphology analysis by SEM. The results showed that microorganism inside NABR consisted of dominant Bacillus (25 strains) and Bacterium (1 strain) which were isolated from the settled sludge at the bottom of the reactor, whilst Bacillus (2 strains), Pseudomonas (2 strain) and Chryseobacterium (2 strain) were isolated from the biofilm formed on the packing material. It revealed that the microbial community strains, function, and structure changed simultaneously throughout the reactor system. The microscopic results showed rich biofacies, while the dominant microorganisms have various morphologies in every compartment of the system. It consisted of a long rod-shaped and filamentous bacterium composed majorly of bacilli of different sizes. Although the study successfully analyzed the microbial diversity and morphology in the system, the microbial communities reported in this study were different from other similar studies. This may be caused by the application of a culture-based technique that usually provides limited information due to the number of barely cultivated or uncultured strains.
Źródło:
Archives of Environmental Protection; 2021, 47, 4; 9--17
2083-4772
2083-4810
Pojawia się w:
Archives of Environmental Protection
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Optimization of activated sludge storage before RNA isolation
Autorzy:
Cydzik-Kwiatkowska, A.
Wnuk, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81045.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
activated sludge
biomass
degradation
microbial activity
molecular technique
optimization
population diversity
RNA isolation
RNA molecule
total suspended solid
waste water treatment plant
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Activity and functional diversity of microbial communities in long-term hydrocarbon and heavy metal contaminated soils
Aktywność i bioróżnorodność funkcjonalna zespołów mikroorganizmów w glebach długotrwale skażonych węglowodorami oraz metalami ciężkimi
Autorzy:
Markowicz, A.
Płaza, G.
Piotrowska-Seget, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/205111.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
polycyclic aromatic hydrocarbons
heavy metals
microbial activity
functional diversity
community level physiological profiles
CLPPs
policykliczne węglowodory aromatyczne
metale ciężkie
aktywność mikrobiologiczna
bioróżnorodność funkcjonalna
profil fizjologiczny zespołów mikroorganizmów
Opis:
The impacts of long-term polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and heavy metal pollution on soil microbial communities functioning were studied in soils taken from an old coke plant. The concentrations of PAHs in the tested soils ranged from 171 to 2137 mg kg-1. From the group of tested heavy metals, concentrations of lead were found to be the highest, ranging from 57 to 3478 mg kg-1, while zinc concentrations varied from 247 to 704 mg kg-1 and nickel from 10 to 666 mg kg-1. High dehydrogenase, acid and alkaline phosphatase activities were observed in the most contaminated soil. This may indicate bacterial adaptation to long-term heavy metal and hydrocarbon contamination. However, the Community Level Physiological Profiles (CLPPs) analysis showed that the microbial functional diversity was reduced and influenced to a higher extent by some metals (Pb, Ni), moisture and conductivity than by PAHs.
Celem pracy było zbadanie wpływu wieloletniego skażenia gleb metalami ciężkimi oraz wielopierścieniowymi węglowodorami aromatycznymi (WWA) na funkcjonowanie zespołów mikroorganizmów. Do badań pobrano gleby z terenu koksowni, gdzie produkcja koksu trwa od 1884 roku. Stężenia WWA w badanych glebach wahały się w przedziale od 171 do 2137 mg kg-1. Wśród badanych metali zawartość ołowiu wynosiła od 57 do 3478 mg kg-1, niklu od 10 do 666 mg kg-1, a stężenie cynku od 247 do 704 mg kg-1. W najsilniej skażonej glebie zaobserwowano wysoką aktywność dehydrogenazy, fosfatazy kwaśnej i zasadowej. Wyniki takie mogą wskazywać na adaptację zespołów mikroorganizmów do długoletniego zanieczyszczenia metalami i WWA. Jednocześnie analiza profili fizjologicznych zespołów mikroorganizmów (CLPPs) wykazała obniżenie indeksu bioróżnorodności funkcjonalnej. Zaobserwowano również, że obecność metali (Pb, Ni) oraz parametry glebowe takie jak wilgotności i przewodności wywierały istotniejszy wpływ na bioróżnorodność metaboliczną niż WWA.
Źródło:
Archives of Environmental Protection; 2016, 42, 4; 3-11
2083-4772
2083-4810
Pojawia się w:
Archives of Environmental Protection
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-7 z 7

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies