Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "methylation analysis" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-5 z 5
Tytuł:
LBP gene methylation involved in mRNA expression and resistance to E. coli F18 in weaned piglets
Autorzy:
Gan, L.N.
Bao, W.B.
Wu, S.L.
Qin, W.Y.
Sun, L.
Zhao, C.X.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2087872.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
LBP gene
methylation analysis of the LBP region
E.coli F18 strain
weaned piglets
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2017, 4; 643-650
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody określania struktury polisacharydów
Methods for determining polysaccharides structure
Autorzy:
Samaszko-Fiertek, J.
Kuźma, M.
Dmochowska, B.
Ślusarz, R.
Madaj, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/172410.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
polisacharydy
monosacharydy
degradacja oksydacyjna
analiza metylacyjna
acetoliza
NMR
magnetyczny rezonans jądrowy
MS
polysaccharides
monosaccharides
oxidative degradation
methylation analysis
acetolysis
nuclear magnetic resonance (NMR)
Opis:
Sequencing of polysaccharides is difficult to achieve because of the heterogeneous nature of the polysaccharide structure, high molecular weight (the size of a polysaccharide varies between approximately 16,000 and 16,000,000 daltons (Da)), and polydispersity of the polymer chains. The following information is essential to determine the primary structure of a polysaccharide: • monosaccharide composition: nature and molar ratios of the monosaccharide building blocks; • relative configuration of monosaccharides: d or l; • anomeric configuration: α- or β-configuration of the glycosidic linkage; • ring size: presence and distinction of furanosidic and pyranosidic rings; • linkage patterns: linkage positions between the monosugars and branches; • sequences of monosaccharide residues in the repeating units; • substitutions: position and nature of OH–modifications, such as O–phosphorylation, acetylation, O-sulfation, etc.; • molecular weight and molecular weight distribution. A polysaccharide extracted from plant materials or food products is usually purified before being subjected to structural analysis. The first step of characterizing a polysaccharide is the determination of its purity, which is reflected by its chemical composition, including total sugar content, level of uronic acids, proteins, ash, and moisture of the preparation. The second step is the determination of monosaccharide composition, which will unveil structural information such as the number of monosaccharides present in the polysaccharide and how many of each sugar unit. NMR spectroscopy has become the most powerful and noninvasive physicochemical technique for determining polysaccharide structures. It can provide detailed structural information of carbohydrates, including identification of monosaccharide composition, elucidation of α- or β-anomeric configurations, establishment of linkage patterns, and sequences of the sugar units in oligosaccharides and/or polysaccharides. Monosaccharide composition can be determined also by analysis of totally acid hydrolyzed polysacharide using high performance liquid chromatography (HPLC) or gas chromatography (GC). The ring size and glycosidic linkage positions of sugar units in a polysaccharide could be established by methylation analysis and/or cleavage reduction. The anomeric configuration is conventionally determined by oxidation, and this method can be combined with mass spectrometry to obtain more structural information.
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2016, 70, 5-6; 299-318
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Integrated statistical and rule-mining techniques for dna methylation and gene expression data analysis
Autorzy:
Mallik, S.
Mukhopadhyay, A.
Maulik, U.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1396742.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Społeczna Akademia Nauk w Łodzi. Polskie Towarzystwo Sieci Neuronowych
Tematy:
statistical analysis
gene marker
methylation
genetic algorithm
DNA
Opis:
For determination of the relationships among significant gene markers, statistical analysis and association rule mining are considered as very useful protocols. The first protocol identifies the significant differentially expressed/methylated gene markers, whereas the second one produces the interesting relationships among them across different types of samples or conditions. In this article, statistical tests and association rule mining based approaches have been used on gene expression and DNA methylation datasets for the prediction of different classes of samples (viz., Uterine Leiomyoma/class-formersmoker and uterine myometrium/class-neversmoker). A novel rule-based classifier is proposed for this purpose. Depending on sixteen different rule-interestingness measures, we have utilized a Genetic Algorithm based rank aggregation technique on the association rules which are generated from the training set of data by Apriori association rule mining algorithm. After determining the ranks of the rules, we have conducted a majority voting technique on each test point to estimate its class-label through weighted-sum method. We have run this classifier on the combined dataset using 4-fold cross-validations, and thereafter a comparative performance analysis has been made with other popular rulebased classifiers. Finally, the status of some important gene markers has been identified through the frequency analysis in the evolved rules for the two class-labels individually to formulate the interesting associations among them.
Źródło:
Journal of Artificial Intelligence and Soft Computing Research; 2013, 3, 2; 101-115
2083-2567
2449-6499
Pojawia się w:
Journal of Artificial Intelligence and Soft Computing Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structural enzymology at the legume-microbe interface: S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase of rhizobia
Autorzy:
Manszewski, T.
Singh, K.
Imiolczyk, B.
Jaskolski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80810.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase
rhizobia
biological methylation
methyl group
enzymatic hydrolysis
enzymatic process
crystal structure
phylogenetic analysis
biochemical analysis
legume plant
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Konformacyjne właściwości modyfikowanych reszt aminokwasowych
Conformational properties of modified amino acid residues
Autorzy:
Wałęsa, R.
Buczek, A.
Broda, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/143003.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. Zakład Wydawniczy CHEMPRESS-SITPChem
Tematy:
dehydrofenyloalanina
N-metylowanie
analiza konformacyjna
obliczenia DFT
wpływ rozpuszczalnika
dehydrophenylalanine
N-methylation
conformational analysis
DFT calculations
solvent impact
Opis:
Konformacyjnie usztywnione aminokwasy są szeroko stosowane przy konstruowaniu peptydowych analogów o lepszych właściwościach farmako-kinetycznych. Jednym z sposobów modyfikacji peptydów jest wprowadzenie reszt a,b-dehydroaminokwasowych w łańcuch peptydowy. Podwójne wiązanie Ca=Cb usztywnia łańcuch boczny i umożliwia występowanie izomerii geometrycznej Z/E. Innym rodzajem modyfikacji jest zastąpienie amidowej grupy –NH grupą –NCH3, czyli tzw. N-metylowanie. Autorzy określili wpływ tych dwóch modyfikacji strukturalnych na konformację łańcucha peptydowego. Przeprowadzone badania pozwoliły ustalić, że reszta a,b-dehydrofenyloalaniny aminokwasów konformacji H. Wykazano również, że polarny rozpuszczalnik zwiększa wyraźnie udział konfiguracji cis wiązania amidowego w N-metylowanych peptydach.
Conformationally constrained amino acids are widely used in the design of peptide analogues with better pharmacokinetic properties. One of the methods of peptide modification is the introduction of a, b -dehydroamino acid residues into peptide chain. The double bond Ca=Cb constrains side chain and enables occurrence of geometrical isomerism Z/E. The other type of modification is the replacement of amide group –NH with group –NCH3, i.e. so called N-methylation. The Authors have determined the impact of these two structural modifications on peptide chain conformation. Conducted research has lead to the conclusion that -dehydrophenylalanine residue has the ability to exhibit atypical for standard amino acids H conformation. It has also been shown that polar solvent clearly increase percentage of cis configuration of amide bond in N-methylated peptides.
Źródło:
Chemik; 2014, 68, 4; 329-334
0009-2886
Pojawia się w:
Chemik
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-5 z 5

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies