Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "markery SSR" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-9 z 9
    Tytuł:
    Identyfikacja markerów SSR przydatnych do konstrukcji mapy genetycznej i mapowania genów odporności na kanciastą plamistość liści ogórka (Cucumis sativus L.)
    Identification of SSR markers useful for construction of genetic map and mapping of angular leaf spot resistance genes in cucumber (Cucumis sativus L.)
    Autorzy:
    Słomnicka, Renata
    Pietluch, Adrianna
    Łęczycka, Justyna
    Doraczyńska, Anna
    Korzeniewska, Aleksandra
    Olczak-Woltman, Helena
    Niemirowicz-Szczytt, Katarzyna
    Bartoszewski, Grzegorz
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2198762.pdf
    Data publikacji:
    2015-06-30
    Wydawca:
    Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Tematy:
    Cucumis sativus
    kanciasta plamistość ogórka
    markery SSR
    Pseudomonas syringae pv. lachrymans
    angular leaf spot
    ALS
    SSR markers
    Opis:
    W pracy podjęto próbę identyfikacji markerów SSR użytecznych do konstrukcji mapy genetycznej ogórka dla populacji mapującej 110 rekombinacyjnych linii wsobnych (RIL). Populację uzyskano z krzyżowania amerykańskiej linii Gy14 wykazującej tolerancję na bakteryjną kanciastą plamistość z polską linią B10 wrażliwą na tę chorobę. Analiza bioinformatyczna zróżnicowania sekwencji loci mikrosatelitarnych pozwoliła wskazać markery SSR potencjalnie przydatne do mapowania w tej populacji. Wytypowano 222 markery SSR, spośród których 160 przetestowano na liniach rodzicielskich i wybranych RIL. Potwierdzono polimorfizm dla 103 markerów SSR (64,4%), zaś dla 52 z nich wykazano przydatność do konstrukcji mapy genetycznej populacji Gy14 × B10 i mapowania genów odporności na kanciastą plamistość liści ogórka. Wstępnie wskazano, że marker SSR00398 zlokalizowany na chromosomie 5 może być sprzężony z genem odporności na tę chorobę.
    The aim of this study was identification of SSR markers useful for construction of genetic map of cucumber population that consists of 110 recombinant inbred lines (RILs). RILs population segregating for angular leaf spot (ALS) resistance was developed by crossing two inbred lines, an American line Gy14 showing tolerance for angular leaf spot and a Polish line B10, susceptible to this disease. A set of SSR markers was preliminary examined for polymorphism using bioinformatic analysis. There were 222 selected SSR markers and 160 of them were further tested on parental lines and chosen RILs. The polymorphism was confirmed for 103 (64.4%) SSR markers. Fifty two SSR markers were found to be useful for construction of genetic map of cucumber population Gy14 × B10 and further mapping of angular leaf spot resistance genes. Preliminary results suggest that SSR00398 located on chromosome 5 may be linked to angular leaf spot resistance gene.
    Źródło:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2015, 276; 93-103
    0373-7837
    2657-8913
    Pojawia się w:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Charakterystyka genetyczna świerka Schrenka (Picea schrenkiana) w gradiencie wysokościowym i geograficznym gór Tien-Szan w Kirgistanie
    Genetic characteristic of Schrenk spruce (Picea schrenkiana) in the altitudal and geographical gradient in Kyrgyz part of Tien-Shan mountains
    Autorzy:
    Magnuszewski, M.
    Nowakowska, J.A.
    Zasada, M.
    Orozumbekov, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/991108.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    Kirgistan
    drzewa lesne
    swierk Schrenka
    Picea schrenkiana
    zmiennosc genetyczna
    polimorfizm DNA
    markery SSR
    zroznicowanie genetyczne
    ssr markers
    genetic differentiation
    genetic distance
    picea schrenkiana
    Opis:
    The study showed the genetic structure of nine Schrenk spruce stands, which represented altitude and geographical variants in the Tien−Shan mountains in Kyrgyzstan. Comparison between genetic structure of stands was based on frequencies of nuclear microsatellite (SSR) alleles occurring in three DNA loci. The total genetic differentiation of Schrenk spruce populations was low (FST=0.0651). Eight main groups of populations were distinguished in the dendrogram defined by Nei's genetic distances based on microsatellite markers.
    Źródło:
    Sylwan; 2014, 158, 05; 361-369
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
    Characteristic of selected molecular markers
    Autorzy:
    Bolc, Paulina
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
    Data publikacji:
    2020-10-22
    Wydawca:
    Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Tematy:
    markery molekularne
    RFLP
    AFLP
    RAPD
    SSR
    ISSR
    SRAP
    SNP
    PCR
    polimorfizm
    różnorodność genetyczna
    molecular markers
    polymorphism
    genetic diversity
    Opis:
    Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
    Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
    Źródło:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
    0373-7837
    2657-8913
    Pojawia się w:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Stan zdrowotny a zróżnicowanie genetyczne wybranych drzewostanów świerkowych na terenie RDLP w Krośnie
    Genetic variability and health of Norway spruce stands in the Regional Directorate of the State Forests in Krosno
    Autorzy:
    Gutkowska, J.
    Borys, M.
    Tereba, A.
    Tkaczyk, M.
    Oszako, T.
    Nowakowska, J.A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1293265.pdf
    Data publikacji:
    2017
    Wydawca:
    Instytut Badawczy Leśnictwa
    Tematy:
    lesnictwo
    RDLP Krosno
    drzewostany swierkowe
    stan zdrowotny lasu
    drzewa lesne
    swierk pospolity
    Picea abies
    zroznicowanie genetyczne
    markery molekularne
    markery mikrosatelitarne
    DNA mitochondrialny
    Norway spruce
    health state
    SSR markers
    mtDNA
    genetic diversity
    Opis:
    The study was conducted in 2015 in six spruce stands situated in different forest districts administratively belonging to the Regional Directorate of Forests State in Krosno. Each spruce population was represented by 30 trees and assessed in terms of their current health status. Genetic analyses were performed based on shoot samples from each tree using nine nuclear DNA markers and one mitochondrial DNA marker (nad1). The health status of the trees was described according to the classification developed by Szczepkowski and Tarasiuk (2005) and the correlation between health classes and the level of genetic variability was computed with STATISTICA (α = 0.05). Nuclear DNA analyses revealed a low level of genetic variability among spruce populations (only 3% of the total genetic variation (FST = 0.028) and a high variability within populations (97%). The total heterozygosity in all stands (HT) was calculated as 0.646. Based on UPGMA analysis, the most genetically similar populations are spruce stands in the Bieszczady National Park and the Ustrzyki Dolne Forest District, which have the smallest genetic divergence of all populations (DN = 0.0165). Our analysis of the mitochondrial gene nad1 revealed the presence of six different haplotypes “a”, “a1”, “b”, “c”, “d” and “d1”. Comprising 56% of all haplotypes, “a” was the most common showing a predominant impact on spruce migration from the Carpathian area. The analysis based on mitochondrial markers (by Nei) revealed a heterozygosity of 0.525. Based on the observations of disease symptoms, 29% of the trees belong to health class 1,30% to class 2,28% to class 3 and class 4 contains 13% of trees. The comparison between health status and the level of genetic variation in the analyzed stands showed a positive correlation. Spruce stands with better health were also characterized by a greater degree of genetic variability. Since most of the investigated spruce populations shared the mitochondrial haplotype “a”, we have ascertained their Hercynian- Carpathian origin. Only one stand (Cisna) had a high frequency (43.3%) of the Nordic haplotype “c” suggesting that this provenance is derived from the Baltic post-glacial refugium of P. abies in Europe.
    Źródło:
    Leśne Prace Badawcze; 2017, 78, 1
    1732-9442
    2082-8926
    Pojawia się w:
    Leśne Prace Badawcze
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Zróżnicowanie genetyczne czereśni ptasiej (Prunus avium L.) w Polsce
    Genetic diversity of wild cherry (Prunus avium L.) in Poland
    Autorzy:
    Szyp-Borowska, I.
    Zawadzka, A.
    Zajaczkowski, K.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/972788.pdf
    Data publikacji:
    2012
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    drzewa lesne
    czeresnia ptasia
    Prunus avium
    zroznicowanie genetyczne
    metody badan
    metoda RFLP
    markery mikrosatelitarne
    wild populations
    cpDNA and SSR diversity
    Prunus avium L.
    Opis:
    The purpose of our study was to estimate genetic diversity of Prunus avium in natural populations. Genetic studies were carried out in 27 wild cherry populations sampled from several Polish tree stands. Chloroplast DNA variation was assessed and two haplotypes were identified. Theirs distribution divided populations into two groups. Haplotype H1 was present in 11 of 27 populations and H2 in 16 populations. The PCR− −SSR technique was used to detect nuclear DNA diversity. Three highly polymorphic SSR (microsatellite) primer pairs were used to describe the genetic variation. Heterozygosity values ranged from 0.500 to 0.633, while gene diversity (PIC) from 0.75 to 0.79. This study demonstrated that SSR fingerprinting with cpDNA diversity, can be used for preliminary characterization of Prunus avium populations.
    Źródło:
    Sylwan; 2012, 156, 07; 502-510
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Zastosowanie markerow DNA [RAPD, SSR, PCR-RFLP i STS] w genetyce drzew lesnych, entomologii, fitopatologii i lowiectwie
    Molecular markers [RAPD, SSR, PCR-RFLP and STS] in forest-tree genetics, entomology, phytopathology and game management
    Autorzy:
    Nowakowska, J.A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/45939.pdf
    Data publikacji:
    2006
    Wydawca:
    Instytut Badawczy Leśnictwa
    Tematy:
    lowiectwo
    zastosowanie
    genetyka roslin
    markery genetyczne
    entomologia lesna
    metody badan
    genetyka zwierzat
    lesnictwo
    zwierzeta lowne
    metoda SSR
    metoda RAPD
    metoda PCR-RFLP
    metoda STS
    drzewa lesne
    fitopatologia lesna
    DNA
    Źródło:
    Leśne Prace Badawcze; 2006, 1; 73-101
    1732-9442
    2082-8926
    Pojawia się w:
    Leśne Prace Badawcze
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Określenie pochodzenia wyłączonych drzewostanów nasiennych sosny rychtalskiej (Pinus sylvestris L.) z wykorzystaniem markerów mikrosatelitarnych
    Determination of the origin of the rychtal Scots pine (Pinus sylvestris L.) seed tree stands using microsatellite markers
    Autorzy:
    Wójkiewicz, B.
    Żukowska, W.B.
    Urbaniak, L.
    Kowalczyk, J.
    Litkowiec, M.
    Lewandowski, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/985719.pdf
    Data publikacji:
    2019
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    hodowla lasu
    sosna zwyczajna
    Pinus sylvestris
    sosna rychtalska
    drzewostany nasienne
    pochodzenie roslin
    zmiennosc genetyczna
    analiza DNA
    markery mikrosatelitarne
    scots pine
    genetic variation
    gene pool
    genetic structure
    ssr markers
    Opis:
    The rychtal pine is one of the most valuable ecotypes of Scots pine (Pinus sylvestris L.) approved for the breeding purposes in Poland. However, it occupies stands typical for oaks and beeches as shown by the compatibility analysis of species composition in relation to the habitat type in which they occur. Such result raises some doubts in terms of the naturalness of the rychtal pine and calls its history and origin into question. In the present study, we used the set of nuclear microsatellite markers to characterize and compare the gene pool composition of the selected seed tree stands of the rychtal pine with 200−year−old pine trees which grow at the Syców Forest District (SW Poland). We aimed to know to what extent the set of alleles specified for the group of the oldest trees from natural habitats is represented in the younger forest tree stands of the rychtal pine. The analysis of molecular variance (AMOVA) and clustering analysis showed that the gene pool of the studied pine populations was homogenous (FST=0,02%, K=1). The parameters of genetic variation were similar for all populations except for the mean number of alleles. On average, 25 new alleles were found in two rychtal pine seed tree stands as compared to the set of alleles found in the group of old pine trees. However, all alleles defined for old pines were also present in the gene pool of younger rychtal pine forest stands. The differences in the gene pool richness result most likely from quite high differences in the number of individuals analyzed from each population. In conclusion, our results indicate the common origin of the studied Scots pine populations.
    Źródło:
    Sylwan; 2019, 163, 08; 637-644
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Zmiany w strukturze genetycznej naturalnego odnowienia dębu (Quercus petraea [Matt.] Liebl.) w odniesieniu do drzew matecznych
    Changes in genetic structure of sessile oak (Quercus petraea [Matt.] Liebl.) natural regeneration in relation to maternal trees
    Autorzy:
    Nowakowska, J.A.
    Michalska, A.
    Zachara, T.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/990023.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    drzewa lesne
    badania genetyczne
    dab bezszypulkowy
    Quercus petraea
    odnowienia naturalne
    struktura genetyczna
    markery DNA
    drzewa potomne
    drzewa mlode
    zroznicowanie genetyczne
    drzewa mateczne
    zmiennosc genetyczna
    ssr markers
    genetic differentiation
    natural regeneration
    Opis:
    The genetic variability of sessile oak (Quercus petraea L.) mature stand and its natural progeny was investigated. Comparison between genetic structure of parental and progeny trees was based on frequencies of nuclear microsatellite (SSR) alleles occurring in three DNA loci. A slight (4%) increase of gene pool between oak mature and progeny trees was revealed by heterozygosity level estimation, maintaining 86.3% of genetic similarity between generations. Also allele richness, partition probability of basic clustering and inbreed coefficient proved the high genetic similarity between parental and progeny of investigated oak trees. The gene flow occurred within the stands as far as rare alleles were transmitted or new ones appeared in the progenies. The results highlight the necessity of such a study for silvicultural measures taken in order to proceed natural or artificial regeneration in forest tree stand.
    Źródło:
    Sylwan; 2014, 158, 02; 83-89
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Porównanie zmienności genetycznej pokolenia matecznego i sztucznie wyhodowanego potomstwa sosny zwyczajnej na podstawie analiz DNA
    Comparison of the genetic variability of Scots pine trees and their progeny from nursery production based on DNA analyses
    Autorzy:
    Konecka, A.
    Tereba, A.
    Bieniek, J.
    Nowakowska, J.A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/985843.pdf
    Data publikacji:
    2018
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    hodowla lasu
    sosna zwyczajna
    Pinus sylvestris
    zmiennosc genetyczna
    analiza DNA
    markery mikrosatelitarne
    drzewa mateczne
    drzewa potomne
    sadzonki z zakrytym systemem korzeniowym
    genetic diversity
    ssr markers
    forest nursery production
    pinus sylvestris l.
    Opis:
    The production of forest tree species in forest nurseries is performed via two main breeding systems: i) the traditional (conventional) way with the seedlings grown in soil, and ii) plants cultivated in the containers. The aim of the study was to assess the level of genetic variability in the populations of the mother stands and the progeny populations of Scots pine cultured with traditional way (in soil) and in containers in two nurseries in Olsztynek (N Poland) and Oleszyce (S Poland) forest districts. Four polymorphic microsatellite markers (SPAG 7.14, SPAC 11.6, SPAC 12.5 and SsrPt_ctg4363) were used to evaluate the genetic variability of the studied populations. The basic hypothesis assumed that higher gene pool characterizes the seedlings grown in the containers comparing to the seedlings grown in the ground. The results confirmed that. Seedlings from containerized breeding had larger gene pool and were more diverse than plants with conventional breeding, both in Olsztynek and Oleszyce. Our study revealed a significant human impact on shaping the pool of forest genetic resources of Polish forests at the early stage of nursery production and showed the need for a broader study on further stages of cultivation of forests.
    Źródło:
    Sylwan; 2018, 162, 01; 32-40
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-9 z 9

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies