Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "isolation of DNA" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-3 z 3
Tytuł:
Wpływ metod izolacji DNA na podobieństwo genetyczne linii pszenicy ozimej (Triticum aestivum L.) przy zastosowaniu techniki RAPD-Pcr
The effect of DNA isolation methods on genetic similarity of winter wheat (Triticum aestivum L.) lines using RAPD-PCR techniques
Autorzy:
Tomkowiak, A.
Kurasiak-Popowska, D.
Weigt, D.
Mikołajczyk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1366472.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Badawczej i Dydaktycznej, COBRABiD
Tematy:
izolacja DNA
pszenica ozima
polimorfizm markerów RAPD
isolation of DNA
winter wheat
polymorphism of RAPD markers
Opis:
Celem badań było porównanie wpływu 4 metod izolacji DNA na wynik analizy markerami molekularnymi RAPD-PCR (ang. Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction) linii pszenicy ozimej. Przeprowadzono izolację DNA metodą Thomsona i Henry'ego, metodą kolumienkową przy pomocy kitu Quiagen DNeasy Plant Kit, przy pomocy kitu Genomic Mini AX Plant firmy A&A Biotechnology oraz zestawu Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit firmy Promega.Po izolacji przeprowadzono analizy molekularne RAPD-PCR, które wykorzystano jako wskaźnik służący do oceny metod izolacji DNA. Najlepszą metodą izolacji okazała się metoda z wykorzystaniem Quiagen DNeasy Plant Kit. Jakość DNA otrzymanego po izolacji tym kitem była najwyższa, a otrzymane elektroforogramy były najbardziej czytelne. Jest to jednak metoda izolacji DNA najdłuższa i najdroższa, co ogranicza jej wykorzystanie przy dużej liczbie badanych genotypów. Dobrą metodą izolacji DNA ze względu na jakość otrzymanych obrazów elektroforetycznych była metoda izolacji kitem Genomic Mini AX Plant. Metodą szybką i tanią okazała się metoda Thomsona i Henry'ego, niestety mniej wydajną w porównaniu do poprzednich. Metodą o największym zróżnicowaniu ilości otrzymanego DNA była izolacja z wykorzystaniem zestawu Maxwell.
The aim of this study was to compare the effect of 4 DNA isolation methods on the results of analyses using molecular markers of Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction (RAPD-PCR) in winter wheat lines. DNA was isolated using the method proposed by Thomson and Henry, the column method with a Quiagen DNeasy Plant Kit, a Genomic Mini AX Plant Kit by A&A Biotechnology and the Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit by Promega. After isolation RAPD-PCR analyses were carried out. The molecular study was an evaluation indicator of the DNA isolation methods. The best isolation method was that using the Quiagen DNeasy Plant Kit. Isolation using this kit provided the best DNA quality and the greatest legibility of electropherograms. However, it is the most time- and cost-intensive method of DNA isolation, which limits its applicability at a large number of tested genotypes. In terms of electrophoretic image quality good DNA isolation was provided by the method using a Genomic Mini AX Plant Kit. A rapid and cheap method was that proposed by Thomson and Henry; unfortunately, it was less efficient than the former ones. The greatest variation in the amounts of obtained DNA was observed for isolation using the Maxwell kit.
Źródło:
Aparatura Badawcza i Dydaktyczna; 2015, 20, 2; 90-109
2392-1765
Pojawia się w:
Aparatura Badawcza i Dydaktyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Skład biocenozy bakteryjnej osadu czynnego na przykładzie miejskiej oczyszczalni ścieków w Zgierzu
Composition of activated sludge biocenosis in the example of municipal wastewater treatment plant for a city of Zgierz
Autorzy:
Liwarska-Bizukojć, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/237251.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Zrzeszenie Inżynierów i Techników Sanitarnych
Tematy:
bacteria
identification
molecular biology
isolation of genomic DNA
DNA sequencing
wastewater treatment plant
activated sludge
oxidoreductive conditions
biocenosis
bakterie
identyfikacja
biologia molekularna
izolacja genomowego DNA
sekwencjonowanie DNA
oczyszczalnia ścieków
osad czynny
warunki tlenowe
biocenoza
Opis:
Molecular biology techniques allow for increasingly more thorough identification and understanding of functionality of microorganisms consortia involved in wastewater treatment or waste degradation processes. In this work, the bacterial community of activated sludge from the wastewater treatment plant in Zgierz (Poland) was identified. As a result, a somewhat limited database of microorganisms living in Polish wastewater treatment plants was supplemented with new data. The composition of bacterial community was identified with molecular biology techniques in two main stages: (1) isolation of genomic DNA, (2) DNA sequencing and bioinformatics analysis of the isolated sequences. The analyses revealed that the most abundant phylum was Proteobacteria with Betaproteobacteria present in highest numbers. Composition of the activated sludge was relatively low in Chloroflexi class bacteria. It is in alignment with macroscopic observations indicating good settlement properties of the activated sludge from the wastewater treatment plant in Zgierz. It was determined that aerobic (redox) conditions in the activated sludge chamber did not influence the composition of bacterial community. They might only cause increase in the contribution of aerobic bacteria in the aerated (oxygenated) part of the chamber or the anaerobic organisms in its anaerobic (deoxygenated) section.
Techniki biologii molekularnej pozwalają w coraz większym stopniu poznać skład i zrozumieć funkcjonowanie konsorcjów mikroorganizmów biorących udział w procesach oczyszczania ścieków czy biodegradacji odpadów. W pracy zidentyfikowano skład biocenozy osadu czynnego w oczyszczalni ścieków komunalnych w Zgierzu, dzięki czemu została poszerzona, jak na razie dość skromna, baza danych o mikroorganizmach w polskich oczyszczalniach ścieków. Skład biocenozy bakteryjnej zidentyfikowano za pomocą technik biologii molekularnej. Analiza składała się z dwóch zasadniczych etapów – izolacji genomowego DNA oraz sekwencjonowania wraz z analizą bioinformatyczną sekwencji. Badania wykazały, że na poziomie typu największy udział w biocenozie osadu czynnego miały Proteobacteria, a wśród nich najwięcej było bakterii należących do klasy Betaproteobacteria. Osad z oczyszczalni ścieków w Zgierzu wyróżniał się stosunkowo małą liczebnością bakterii z klasy Chloroflexi, co pokrywa się z obserwacjami makroskopowymi, wskazującymi na dobre właściwości sedymentacyjne tego osadu. Stwierdzono, że warunki tlenowe panujące w komorze osadu czynnego nie miały znaczącego wpływu na skład bakteryjny osadu czynnego. Mogły one powodować jedynie większy udział bakterii aerofilnych w części napowietrzanej komory (tlenowej) i/lub większy udział beztlenowców w jej części nienapowietrzanej (beztlenowej).
Źródło:
Ochrona Środowiska; 2017, 39, 4; 3-7
1230-6169
Pojawia się w:
Ochrona Środowiska
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ metodyki badań na ocenę struktury zbiorowisk mikroorganizmów w glebie leśnej
Effect of the methodology of studies on the structure of the microorganisms communities in the forest soil
Autorzy:
Behnke-Borowczyk, J.
Kwaśna, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/989286.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
lesnictwo
gleby lesne
mikroorganizmy glebowe
grzyby mikroskopowe
struktura zbiorowisk
metodyka badan
metody klasyczne
metody molekularne
startery NS1
startery NS2
DNA
region 18S
classical method of isolation
fungi
microorganisms
ns1
ns2
18s rdna
soil
Opis:
Two different communities of microorganisms were identified in soils by application of the classical method of fungi isolation (soil dilution, culturing on artificial media, morphotyping) and a molecular method (extraction of the environmental DNA, amplification with universal primers NS1 and NS2, cloning and sequencing of representative clones). No organisms were common to both communities. Apart from rare representatives of the Animalia, communities included single fungus−like Eucarya belonging to the Protista, Class Oomycota, and numerous fungi belonging to Chytridiomycota, Zygomycota, Ascomycota and Basidiomycota orders. In total, 88 species were identified in four soil samples. Fungi were mostly Ascomycota. The classical method was particularly effective in detection of fungi important for creation of phytosanitary conditions of soil, i.e. antagonists (Penicillium, Tolypocladium and Trichoderma) and potential stimulants (dark−pigmented Hormiactis candida, Humicola spp. and Phialophora spp.) of phytopathogens (including the common forest genera Armillaria and Heterobasidion). Application of the classical method allowed the detection of mycorrhizal Ascomycota from the genus Oidiodendron. Application of the molecular method allowed the detection of 13 mycorrhizal Basidiomycota. Although primers NS1 and NS2 were designed from a match with DNA of culturable organisms, they also amplified the DNA of non−culturable organisms. This emphasizes their potential usefulness in studies of the biodiversity of microorganisms in environmental samples. The shortage of reference sequences in the database discourages use of the 18S rDNA region in studies on fungal communities. The studies on the biodiversity of microorganisms need the application of a few independent methods of detection and identification.
Źródło:
Sylwan; 2016, 160, 06; 492-503
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-3 z 3

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies