Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "histone methylation" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-7 z 7
Tytuł:
Global quantification of heterochromatin-associated histone methylations in cell lines with differential sensitivity to ionizing radiation
Autorzy:
Cetinkaya, Merve
Özgür, Emre
Dalay, Nejat
Gezer, Ugur
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039084.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
histone methylation
heterochromatin
radiosensitivity
ELISA immunoassay
Opis:
Histone modifications are involved in the DNA damage response (DDR). Here, by utilizing an ELISA immunoassay we assessed the methylation at H3K9 (H3K9me2 and H3K9me3) in two cell lines with differential sensitivity to radiation-induced apoptosis, HeLa (sensitive) and MCF-7 (resistant). We found that DNA damage induction by γ-irradiation leads to considerable accumulation (up to 5-fold) of H3K9me2 and H3K9me3, but not of H4K20me3 (control modification) in MCF-7 cells (p<0.05). Interestingly, a lower dose (2 Gy) was more effective than 5 Gy. In HeLa cells a smaller effect (approx. 1.5-1.8-fold) was evident only at 5 Gy. In conclusion, our findings reveal that DNA damage leads to specific accumulation of H3K9me2 and H3K9me3 in a cell-type specific manner.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 2; 173-176
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
H3K4 histone methylation in oral squamous cell carcinoma
Autorzy:
Mancuso, Marta
Matassa, Danilo
Conte, Mariachiara
Colella, Giuseppe
Rana, Gina
Fucci, Laura
Piscopo, Marina
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1040528.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
oral squamous carcinoma
histone methylation
H3K4
Opis:
Methylation of specific lysine residues in histone tails has been proposed to function as a stable epigenetic marker that directs biological functions altering chromatin structure. Recent findings have implicated alteration in heterochromatin formation as a contributing factor in cancer development. In order to verify whether changes in the overall level of H3K4 histone methylation could be involved in oral squamous carcinoma, the levels of H3K4me1, me2 and me3 were measured in oral squamous carcinoma, leukoplakias and normal tissues. The levels of H3K4me2 and me3 were significantly different in oral squamous cell carcinoma in comparison with normal tissue: the level of H3K4me2 was increased while that of H3K4me3 decreased. No significant differences could be found between the two types of tissues in the level of H3K4me1. A similar trend was found in the leukoplakias that appeared more like the pathological than normal tissue. These results support the idea that alteration of chromatin structure could contribute to oncogenic potential.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2009, 56, 3; 405-410
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Znaczenie epigenetyki w patogenezie czerniaka
The role of epigenetics in the pathogenesis of melanoma
Autorzy:
Chodurek, Ewa
Gołąbek, Karolina
Orchel, Joanna
Orchel, Arkadiusz
Dzierżewicz, Zofia
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038734.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
epigenetyka
czerniak
metylacja dna
acetylacja histonów
epigenetics
melanoma
dna methylation
histone acetylation
Opis:
Epigenetics represents the mechanisms that influence the regulation and modification of the expression of genetic material not related to the alterations in DNA sequences. These mechanisms include both DNA methylation and histone modifications. In the present article, we review current views on the role of aberrations of DNA hyper- and hypomethylation processes and the acetylation of histones, associated with genes that control the cell cycle, cell differentiation, DNA repair, apoptosis, cell signaling, angiogenesis, metabolism of xenobiotics and invasion, in the pathogenesis of melanoma. In addition, new strategies for treatment of melanoma associated with epigenetics are presented.
Przez pojęcie epigenetyka należy rozumieć mechanizmy wpływające na regulację i modyfi kację ekspresji materiału genetycznego, jednocześnie niezmieniające sekwencji nukleotydów. Mechanizmy te obejmują zarówno metylację DNA, jak i modyfikacje histonów. W artykule dokonano przeglądu aktualnych poglądów dotyczących zaburzeń procesów hiperihipometylacji DNA oraz acetylacji histonów w patogenezie czerniaka, związanych z genami kontrolującymi cykl komórkowy, różnicowanie, naprawę DNA, apoptozę, sygnalizację komórkową, angiogenezę, metabolizm ksenobiotyków i powstawanie przerzutów. Ponadto przedstawiono nowe strategie leczenia czerniaka związane z epigenetyką.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2012, 66, 3; 44-56
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Epigenetics is promising direction in modern science
Autorzy:
Fartushok, Tetiana
Kovalyshyn, Orysia
Fedevych, Yuri
Tanchyn, Igor
Zhykovskiy, Volodymyr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2175208.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Towarzystwo Chemii i Inżynierii Ekologicznej
Tematy:
epigenetics
5-methylcytosine
DNA methylation
histone
epigenetyka
5-metylocytozyna
metylacja DNA
histon
Opis:
Epigenetics studies the inherited changes in a phenotype or in expression of genes caused by other mechanisms, without changing the nucleotide sequence of DNA. The most distinguished epigenetic tools are: modifications of histones, enzymatic DNA methylation, and gene silencing mediated by small RNAs (miRNA, siRNA). The resulting m5C residues in DNA substantially affect the cooperation of proteins with DNA. It is organized by hormones and aging-related alterations, one of the mechanisms controlling sex and cellular differentiation. DNA methylation regulates all genetic functions: repair, recombination, DNA replication, as well as transcription. Distortions in DNA methylation and other epigenetic signals lead to diabetes, premature aging, mental dysfunctions, and cancer.
Źródło:
Chemistry-Didactics-Ecology-Metrology; 2021, 26, 1-2; 123--135
2084-4506
Pojawia się w:
Chemistry-Didactics-Ecology-Metrology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The effect of DNA methyltransferase and histone deacetylase inhibitors on αKlotho gene expression in bladder cancer T24 cell line
Wpływ inhibiotorów metylotransferaz DNA oraz deacetylaz białek histonowych na kspresję genu αKlotho w komórkach raka pęcherza moczowego linii T24
Autorzy:
Szymczyk, Agnieszka
Forma, Ewa
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1032842.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Łódzkie Towarzystwo Naukowe
Tematy:
bladder cancer
klotho
dna methylation
histone deacetylation
rak pęcherza moczowego
metylacja dna
deacetylacja histonów
Opis:
Introduction: αKlotho gene was originally identified as a putative agesuppressing gene in mice. Recently it is known that αKlotho gene functions as a tumor suppressor in many types of cancer, including breast, pancreas, gastric, colon, lung and cervical cancer. The downregulation of αKlotho expression was associated with CpG hipermethylation of promoter region and histone deacetylation. Bladder cancer is the most common cancer of the urinary tract in Polish population. The aim of this study was the analysis of the effect of DNA methyltransferase and histone deacetylase inhibitors on αKlotho gene expression in bladder cancer cells. Materials and methods: In this study T24 bladder cancer cell line was used. The analysis of the effect of DNA methyltransferase and histone deacetylase inhibitors on αKlotho gene expression was performed using Real Time PCR method with TaqMan probes. To determine the methylation profile of αKlotho gene promoter region quantitive Methylation-Specific Polymerase Chain Reaction technique was used. Results: The treatment of T24 cells with DNA methyltransferase inhibitor (AZA) restored the expression of αKlotho gene. After AZA treatment, the methylation level of CpG island in the promoter region of αKlotho gene was nearly half lower (p<0.05) than control cells. In case of the treatment of T24 cells with histone deacetylase inhibitor (TSA) we did not observe any changes in αKL gene expression in respect to the control cells. Treatment cells with both the inhibitors led to the significant increase of mRNA αKlotho gene expression level (p<0.001). Conclusions: The changes in αKlotho gene expression on mRNA level are associated with epigenetic changes.
Wstęp: Gen αKlotho pierwotnie zidentyfikowany został u myszy jako gen, którego ekspresja wpływa na długość ich życia. Obecnie wiadomo, że αKlotho spełnia funkcję genu supresorowego w przypadku wielu typów nowotworów, m.in. w raku piersi, trzustki, żołądka, płuc, okrężnicy i raku szyjki macicy. Wykazano, że spadek ekspresji genu αKlotho związany jest z hipermetylacją wysp CpG w obrębie regionu promotorowego oraz deacetylacją histonów. Rak pęcherza moczowego jest najczęściej występującym nowotworem układu moczowego w Polsce. Celem prowadzonych badań była analiza wpływ inhibitorów metylotransferaz DNA oraz deacetylaz białek histonowych na ekspresję genu αKlotho w komórkach raka pęcherza moczowego. Materiały i metody: Materiał do badań stanowiła linia komórek raka pęcherza moczowego T24. Analizę wpływu inhibitorów metylotransferaz DNA oraz deacetylaz białek histonowych na ekspresję genu αKlotho prowadzono techniką Real Time PCR z użyciem sond fluorescencyjnych TaqMan. Ocenę stopnia metylacji regionu promotorowego badanego genu prowadzono przy użyciu techniki ilościowego MSP-PCR (ang. Methylation-Specific Polymerase Chain Reaction). Wyniki: W wyniku traktowania komórek linii T24 inhibitorem metylotransferaz DNA (AZA) obserwowano przywrócenie ekspresji genu αKlotho. W porównaniu do komórek kontrolnych, komórki traktowane 5-aza-2′-deoksycytydyną wykazywały blisko o połowę niższy stopień metylacji wysp CpG w regionie promotorowym genu αKlotho (p<0,05). W wyniku traktowania komórek inhibitorem deacetylaz białek histonowych (TSA) nie obserwowano zmian w ekspresji genu αKL. Zastosowanie obu inhibitorów prowadziło do istotnego wzrostu ekspresji genu αKlotho na poziomie mRNA (p<0,001). Wnioski: Zmiany ekspresji genu αKlotho na poziomie mRNA związane są ze zmianami we wzorze modyfikacji epigenetycznych.
Źródło:
Folia Medica Lodziensia; 2014, 41, 2; 111-119
0071-6731
Pojawia się w:
Folia Medica Lodziensia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Comparative study on tissue culture induced variation identified with metAFLP and RP – HPLC in barley and triticale regenerants
Autorzy:
Machczynska, J.
Orlowska, R.
Ogorek, K.A.
Bednarek, P.T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/951298.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
tissue culture
in vitro culture
plant regeneration
genetic change
DNA methylation
histone modification
high performance liquid chromatography
barley
triticale
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Modyfikacje epigenetyczne a ekspresja genów w nowotworzeniu
Epigenetic modifications and gene expression in cancerogenesis
Autorzy:
Poczęta, Marta
Nowak, Ewa
Bieg, Dominik
Bednarek, Ilona
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1035756.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
zmiany epigenetyczne
nowotwory
metylacja dna
białka histonowe
mikrorna
ekspresja genów
epigenetic modifications
cancers
dna methylation
histone proteins
microrna
gene expression
Opis:
Modyfikacje epigenetyczne są zmianami regulującymi ekspresję genów. Spośród tych modyfikacji metylacja DNA w regionach promotorowych genów jest najlepiej poznaną zmianą. Za metylację DNA odpowiada rodzina metylo-transferaz DNA. Proces ten jest odwracalny w wyniku reakcji demetylacji, w których pośrednią rolę odgrywają białka TET. Hipometylacja DNA oraz hipermetylacja regionów promotorowych genów bogatych w wyspy CpG należy do epigenetycznych mechanizmów powszechnie występujących w wielu typach nowotworów. Epigenetyczny mechanizm transformacji nowotworowej związany jest nie tylko ze zmianami w poziomie metylacji poszczególnych onkogenów czy też genów supresorowych, ale także z potranslacyjnymi modyfikacjami białek histonowych wymuszających zmia-ny w strukturze chromatyny. Określone modyfikacje, takie jak: metylacja, acetylacja, fosforylacja, ubikwitynacja, biotynylacja, ADP-rybozylacja oraz sumoilacja, mogą wpływać na kondensację chromatyny oraz na białka i kom-pleksy enzymatyczne decydujące o dostępności DNA, co z kolei wpływa na upakowanie, replikację, rekombinację, procesy naprawy oraz ekspresję DNA. W mechanizmach modulacji ekspresji genów zaangażowanych w procesy prowadzące do rozwoju nowotworów znaczącą rolę odgrywają dwa główne rodzaje małych interferencyjnych RNA siRNA oraz miRNA. Uzyskiwane dane z prowadzonych badań pokazują, że mechanizmy epigenetyczne uczestniczą w procesach pro- wadzących do rozwoju nowotworów, a poszukiwanie epigenetycznych biomarkerów może być przydatne w terapii nowotworów.
Epigenetic modifications are changes which can regulate gene expression. DNA methylation in gene promoter regions is the most well-known change among epigenetic modifications. The family of DNA methyltransferases is responsible for DNA methylation. Methylation is reversible due to the demethylation reaction, executed by TET proteins. DNA hypomethylation and hypermethylation of gene promoter regions rich in CpG islands belonging to epigenetic mechanisms commonly occur in many tumors. The epigenetic mechanism of malignant transformation is related not only to changes in the level of methylation of oncogenes or tumor suppressor genes, but also to post-translational modifications of histone proteins, forcing changes in the chromatin structure. Certain modifications, such as methy-lation, acetylation, phosphorylation, ubiquitination, biotinylation, ADP–ribosylation, and sumoylation may affect chro-matin condensation, protein and enzyme complexes that determine the availability of DNA, which then affects the condensation, replication, recombination and repair processes, as well as gene expression. Among the modulatory mechanisms of the expression of genes involved in the processes leading to cancer development, two main types of small interfering RNA play an important role: siRNA and miRNA. Research data Show that epigenetic mechanisms are involved in the processes leading to tumor development, and searching for epigenetic biomarkers may be useful in epigenetic cancer therapy.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2018, 72; 80-89
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-7 z 7

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies