Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "high-throughput sequencing" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-7 z 7
    Tytuł:
    Bacterial communities in PM2.5 and PM10 in broiler houses at different broiler growth stages in spring
    Autorzy:
    Zhang, J.
    Li, Y.
    Xu, E.
    Jiang, L.
    Tang, J.
    Li, M.
    Zhao, X.
    Chen, G.
    Zhu, H.
    Yu, X.
    Zhang, X.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2087465.pdf
    Data publikacji:
    2019
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    bacterial communities
    broilers
    high-throughput sequencing
    particulate matter
    Źródło:
    Polish Journal of Veterinary Sciences; 2019, 3; 495-504
    1505-1773
    Pojawia się w:
    Polish Journal of Veterinary Sciences
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Composition of norfloxacin-resistant bacteria and isolation of norfloxacin-degrading bacteria in subtropical aquaculture ponds in China
    Autorzy:
    Mao, Lutian
    Chen, Lifen
    Wang, Xirui
    Xu, Zhongbao
    Ouyang, Hui
    Huang, Biyou
    Zhou, Libin
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/4790189.pdf
    Data publikacji:
    2022
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    high-throughput sequencing
    norfloxacin
    antibiotic resistant bacterium
    pond culture
    Opis:
    To analyze the composition of norfloxacin-resistant bacteria and norfloxacin-degrading bacteria in pond water and sediment in subtropical China, the composition of antibiotic resistant bacteria in pond water and sediment enriched with norfloxacin-containing medium was analyzed by high-throughput sequencing. Sediment and water samples were collected from 3 fish ponds in subtropical China, and domesticated with norfloxacin, subsequently norfloxacin-resistant bacteria through high-throughput sequencing of 16S rDNA, and isolated norfloxacin--degrading bacteria. Our results showed that the pond sediment and water contain a variety of norfloxacin-resistant bacteria, mainly from Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Firmicutes, and Chloroflexi. Moreover, we isolated two norfloxacin-degrading bacteria (NorXu-2 and NorXu-3). The norfloxacin-degrading rate by NorXu-2 and NorXu-3 in the culture mediums with 200 μg/mL was the highest, which was up to 49.71% and 35.79%, respectively. When the norfloxacin concentration was 200 μg/mL, NorXu-2 and NorXu-3 had the best norfloxacin- -degrading effect at pH of 6, and the degradation rates were 53.64% and 45.54%, respectively. Moreover, NorXu-3 exhibited a good tolerance to high NaCl concentration. These results not only provided basic data for the follow-up study of the molecular mechanism of antimicrobial microbial degradation, but also provided potential norfloxacin degrading bacteria for norfloxacin removal and bioremediation in aquaculture environment.
    Źródło:
    Archives of Environmental Protection; 2022, 48, 4; 95--101
    2083-4772
    2083-4810
    Pojawia się w:
    Archives of Environmental Protection
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Faeces As an Important Pollution Source of Airborne Pathogens in Traveling from Swine Farm
    Autorzy:
    Liangbin, Zhao
    Wenjin, Zhang
    Dongmei, Jiang
    Lin, Bai
    Xiaoxia, Hao
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/27315760.pdf
    Data publikacji:
    2023
    Wydawca:
    Politechnika Koszalińska. Wydawnictwo Uczelniane
    Tematy:
    air microorganism
    16SrRNA high-throughput sequencing
    manure
    piggery
    swine
    Opis:
    Airborne pathogens are the most important factor causing environmental issues on pig farms. Research on airborne swine-derived microbes has mainly concentrated on several specific microbes or pathogens. The present work was conducted to detect and identify the entire microbial community in piggery air and their dispersion by 16SrRNA sequencing. Fifteen faeces and eighty-four air samples were collected in swine barns and from different distances away from the barns, respectively. The results showed that the faeces and air share the most dominant bacteria. The top 10 genera belonged to Fimicutes, Proteobacteria and Bacteroidetes, and accounted for 54% and 76-84% of the total sequences. Moreover, great higher (P < 0.01) microbial diversity was detected in the faeces. This study indicated that a hygienic interval of 50 m should be set on swine farms to prevent the spreading infectious disease caused by airborne pathogens.
    Źródło:
    Rocznik Ochrona Środowiska; 2023, 25; 55--67
    1506-218X
    Pojawia się w:
    Rocznik Ochrona Środowiska
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Soil microbiomes of reclaimed and abandoned mines of the Yamal region
    Autorzy:
    Pershina, Elizaveta
    Ivanova, Ekaterina
    Kimeklis, Anastasia
    Zverev, Alexey
    Kichko, Arina
    Aksenova, Tatiana
    Andronov, Evgeny
    Abakumov, Evgeny
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2041836.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    Arctic
    Yamal Peninsula
    microbiome
    soil
    high-throughput sequencing
    16S rRNA
    qPCR
    mining
    reclamation
    Źródło:
    Polish Polar Research; 2020, 41, 1; 95-114
    0138-0338
    2081-8262
    Pojawia się w:
    Polish Polar Research
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Bacterial Community of Neutral Mine Drainage of Elizabeth’s Shaft (Slovinky, Slovakia)
    Bakteryjna wspólnota neutralnej kopalni Drenaż szybu Elizabeths (Slovinky, Słowacja)
    Autorzy:
    Kiskova, Jana
    Perhacova, Zuzana
    Vlcko, Ladislav
    Sedlakova-Kadukova, Jana
    Kvasnova, Simona
    Pristas, Peter
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/318369.pdf
    Data publikacji:
    2019
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Przeróbki Kopalin
    Tematy:
    flora bakteryjna
    neutralny drenaż kopalniany
    sekwencjonowanie
    bacterial community
    neutral mine drainage
    high-throughput sequencing
    Opis:
    Neutral mine drainage is the less frequent subject of the interest than acid mine drainage but it can have adverse environmental effects caused mainly by precipitation of dissolved Fe. The aim of the study was to characterize the composition of bacterial population in environment with high concentration of iron and sulfur compounds represented by neutral mine drainage water of Elizabeth’s shaft, Slovinky (Slovakia). The pH value of drainage water decreased from 7.1 to 6.5 during the years 2008–2014. Direct microscopic observations, cultivation methods, and 454 pyrosequencing of the 16S rRNA gene amplicons were used to examine the bacterial population. Microscopic observations identified iron–oxidizing Proteobacteria of the genera Gallionella and Leptothrix which occurrence was not changed during the years 2008–2014. Using 454 pyrosequencing, there were identified members of 204 bacterial genera that belonged to 25 phyla. Proteobacteria (69.55%), followed by Chloroflexi (10.31%) and Actinobacteria (4.24%) dominated the bacterial community. Genera Azotobacter (24.52%) and Pseudomonas (14.15%), followed by iron–oxidizing Proteobacteria Dechloromonas (11%) and Methyloversatilis (8.53%) were most abundant within bacterial community. Typical sulfur bacteria were detected with lower frequency, e.g., Desulfobacteraceae (0.25%), Desulfovibrionaceae (0.16%), or Desulfobulbaceae (0.11%). Our data indicate that the composition of bacterial community of the Elizabeth’s shaft drainage water reflects observed neutral pH, high level of iron and sulfur ions in this aquatic habitat.
    Odciek kopalniany o odczynie obojętnym jest rzadszym przedmiotem zainteresowania niż odciek kopalniany kwaśny, ale może mieć niekorzystne skutki środowiskowe spowodowane głównie przez wytrącanie rozpuszczonego Fe. Celem artykułu jest scharakteryzowanie składu bakterii w środowisku o wysokim stężeniu związków żelaza i siarki reprezentowanych przez obojętne wody drenażowe kopalni szybu Elizabeth, Slovinky (Słowacja). Wartość pH wody drenażowej spadła z 7,1 do 6,5 w latach 2008–2014. Bezpośrednie obserwacje mikroskopowe, metody hodowli i pirosekwencjonowanie amplikonów genu 16S rRNA wykorzystano do zbadania populacji bakterii. Obserwacje mikroskopowe zidentyfikowały proteobakterie utleniające żelazo z rodzajów Gallionella i Leptothrix, których występowanie nie uległo zmianie w latach 2008–2014. Przy użyciu pirosekwencjonowania 454 zidentyfikowano 204 rodzajów bakterii należących do 25 typów. Proteobakterie (69,55%), a następnie Chloroflexi (10,31%) i aktynobakte rie (4,24%) zdominowały społeczność bakteryjną. Rodzaje Azotobacter (24,52%) i Pseudomonas (14,15%), a następnie proeto-bakterie żelazo utleniające Dechloromonas (11%) i Methyloversatilis (8,53%) były najbardziej rozpowszechnione w społeczności bakteryjnej. Typowe bakterie siarkowe wykryto z mniejszą częstotliwością, np. Desulfobacteraceae (0,25%), Desulfovibrionaceae (0,16%) lub Desulfobulbaceae (0,11%). Uzyskane dane wskazują, że skład flory bakteryjnej wody drenażowej szybu Elżbieta odzwierciedla obserwowane neutralne pH, wysoki poziom zawartości jonów żelaza i siarki w środowisku wodnym.
    Źródło:
    Inżynieria Mineralna; 2019, 21, 1; 89-94
    1640-4920
    Pojawia się w:
    Inżynieria Mineralna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Changing Views of Arctic Protists (Marine Microbial Eukaryotes) in a Changing Arctic
    Autorzy:
    Lovejoy, Connie
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/763549.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
    Tematy:
    Polar, marine microbial eukaryotes, protists, water masses, climate change, Subsurface Chlorophyll Maxima, High Throughput Sequencing
    Opis:
    Advances in sequencing technology and the environmental genomic approaches have brought attention to the vastness of protist biodiversity. While over much of the world’s oceans the species and phylotypes making up this diversity are assumed to be something previously hidden and now revealed, the recent rapid changes in the Arctic mean that such assumptions may be a simplification. Historical morphological species data can be used to validate new records provided that more of these species are identified using standard molecular markers. Environmental surveys can also go further by identifying species over regions, seasons and depths. High throughput sequencing and bioinformatics tools provide a means of monitoring and eventually predicting the consequences of change. We give an example of how microbial eukaryote communities differ over pan-arctic scales, emphasizing the need for additional sampling and the need for caution in extrapolating the results of one region to the entire Arctic.
    Źródło:
    Acta Protozoologica; 2014, 53, 1
    1689-0027
    Pojawia się w:
    Acta Protozoologica
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    High throughput protein production
    Autorzy:
    Tworak, A.
    Podkowinski, J.
    Figlerowicz, M.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/80317.pdf
    Data publikacji:
    2011
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    activity
    cloning
    DNA sequencing
    expression
    high throughput
    human genome
    Human Genome Project
    large scale proteomics
    new technology
    protein folding
    protein production
    purification
    Źródło:
    BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 2
    0860-7796
    Pojawia się w:
    BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-7 z 7

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies