Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "genotyping" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Genotyping of Giardia duodenalis human isolates using PCR-RFLP in Zabol City, East of Iran
Autorzy:
Abedi, M.
Dabirzadeh, M.
Ghasemian, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/6472.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
genotyping
Giardia duodenalis
protozoan parasite
parasite
human disease
isolation
PCR-RFLP method
Zabol city
Iran
Źródło:
Annals of Parasitology; 2016, 62, Suppl.
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod biologii molekularnej w ocenie narażenia zawodowego na szkodliwe czynniki biologiczne
Molecular biology methods in assessing occupational exposure to harmful biological agents
Autorzy:
Bakal, A.
Górny, R.
Ławniczek-Wałczyk, A.
Cyprowski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/137930.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Centralny Instytut Ochrony Pracy
Tematy:
szkodliwe czynniki biologiczne
ryzyko zawodowe
biologia molekularna
PCR
diagnostyka molekularna
genotypowanie drobnoustrojów
molekularny odcisk palca
harmful biological agents
occupational risk
molecular biology
molecular diagnostics
microorganisms genotyping
Opis:
Obowiązkiem każdego pracodawcy jest zapewnienie pracownikom bezpiecznych warunków w miejscu zatrudnienia. W tym celu niezbędna jest identyfikacja i eliminacja możliwych do usunięcia zagrożeń oraz zapewnienie odpowiednich środków ochrony zarówno zbiorowej, jak i indywidualnej. Wśród szkodliwych czynników środowiska pracy, jednymi z bardziej istotnych są czynniki biologiczne. Stanowią one częstą przyczynę chorób zawodowych w Polsce. Mogą oddziaływać na organizm człowieka, powodując dolegliwości o charakterze: alergicznym, drażniącym, zakaźnym, toksycznym oraz rakotwórczym. Do tych czynników biologicznych zaliczamy: mikroorganizmy (bakterie, grzyby), wirusy, pasożyty człowieka oraz aktywne biologicznie substancje chemiczne będące produktami metabolizmu drobnoustrojów (np. mykotoksyny).W laboratoryjnej identyfikacji zagrożeń biologicznych najczęściej są obecnie wykorzystywane metody: hodowlane, mikroskopowe i biochemiczne. Mimo niewątpliwych zalet i rozpowszechnienia, mają one jednak swoje ograniczenia. Większość z nich pozwala na identyfikację jedynie mikroorganizmów żywych, zdolnych do wzrostu w warunkach laboratoryjnych. Jak wskazują wyniki badań, takie drobnoustroje stanowią jedynie niewielki odsetek w ekstremalnych przypadkach zaledwie 1%) społeczności występującej w danym środowisku. W artykule zostały przedstawione metody biologii molekularnej (wykorzystujące analizę DNA) pozwalające na: identyfikację jakościową i ilościową drobnoustrojów, określenie ich cech biochemicznych oraz uzyskanie profilu gatunkowego mikroorganizmów występujących w danym środowisku, bez konieczności ich hodowli w warunkach laboratoryjnych. Zastosowanie tych metod pozwala na dokładniejszą identyfikację drobnoustrojów występujących w środowisku pracy, umożliwiając bardziej precyzyjną ocenę narażenia na szkodliwe czynniki biologiczne.
All employers are responsible for ensuring safe working conditions for employees in their workplace. It is necessary to accurately identify and eliminate all hazards that are possible to remove and to ensure proper collective and personal protective measures. Among occupational hazards, biological agents are one of the most important. They are considered as the most frequent cause of occupational diseases in Poland. They can affect human body and cause various adverse health outcomes such as allergies, irritations, infections, toxicoses or even a cancer. Among them we can distinguish harmful microorganisms (bacteria, viruses, fungi), human parasites and biologically active chemical compounds produced by microorganisms (e.g., fungal mycotoxins). Currently, the most frequent used laboratory procedures to identify biological hazards are culture-based, microscopic and biochemical methods. Despite their unquestionable advantages and widespread presence, these techniques have also important limitations. They only enable identification of microorganisms which are viable and capable to grow in laboratory conditions. As the studies have shown, such microorganisms constitute (in extreme cases) merely 1% of their population present in the environment. This paper presents an overview of molecular biology methods (based on DNA analysis) which allow the qualitative and quantitative identification of microorganisms, determining their biochemical features and enabling to obtain their environmental species profile without the need for their culturing in laboratory conditions. Application of these methods provides more accurate identification of microorganisms present in occupational environment, allowing more precise analysis of potential health risks derived from exposure to harmful biological agents.
Źródło:
Podstawy i Metody Oceny Środowiska Pracy; 2017, 3 (93); 5-16
1231-868X
Pojawia się w:
Podstawy i Metody Oceny Środowiska Pracy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Genetic comparison of Campylobacter jejuni isolated from different cattle farms
Autorzy:
Bednarski, M.
Wieliczko, A.
Mazurkiewicz, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/31410.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
genetic comparison
Campylobacter jejuni
isolation
cattle
animal farm
genotyping
ERIC-PCR method
Opis:
To compare the genotypes of Campylobacter jejuni, isolates of cattle origin were collected from 9 Polish farms and genotyped by ERIC-PCR. We identified 28 genotypes among the 43 C. jejuni isolates, and demonstrated high genomic diversity. The highest level of diversity was observed in strains isolated from stanchion-barn animals in opposition to those from the loose-housing system.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2011, 14, 2
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of susceptibility loci for juvenile idiopathic arthritis in the extended MHC region using high resolution SNP and HLA allele typing
Autorzy:
Biesiada, J.
Sudman, M.
Wagner, M.
Rupert, A.
Hollenbach, J.
Haas, J. P.
Meller, J.
Thompson, S. D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1935824.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
HLA
MHC region
autoimmunology
Juvenile Idiopathic Arthritis
HLA independent association
SNP genotyping
HLA alleles
Opis:
Juvenile idiopathic arthritis ( JIA ) spans several pediatric arthropathies that involve autoimmune responses. Primary genetic risk factors for JIA have been mapped to Major Histocompatibility Complex ( MHC ) class I and class II genes. Recent genome-wide association studies using SNP arrays have shown that the nonHLA genetic component of JIA involves multiple low-risk loci, reinforcing the notion that JIA is a complex genetic trait with a strong HLA component. In this work, with the goal of detailed mapping and analysis of lin kage disequilibrium ( LD ) patterns and associations with JIA in the extended MHC (x MHC ) region, we combined SNP data from Affymetrix SNP Array 6.0 and Immunochip ( IC ) platforms with high resolution typing of 8 classical HLA genes. A cohort of about 800 affected individuals and about 500 ethnically matched controls from the Cincinnati region, as well as secondary validation cohorts of affected individuals and matched controls from Germany were used to perform the analysis, and to assess reproducibility of the results across different platforms and p opulations. Accurate high resolution maps of linkage with classical HLA genes and association with individual HLA alleles were generated. High concordance of results obtained using Affymetrix SNP Array 6.0 and IC was observed, with an additional resolution and improved mapping of associat ions provided by the latter in some regions. Several new peaks of statistically signific ant and reproducible association with JIA outside the regions of strong LD with classical HLA genes were observed, including one peak in the class III region, and one in the telomeric end of x MHC . Conditional analysis provided further evidence that these associations appear to be independent of classical HLA genes studied here. The results and observed association patterns are further discussed in the context of other recent studies on autoimmune diseases, including the role of HLA DRB 1 in adult Rheumatoid Arthritis.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2014, 18, 4; 305--320
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Association Analysis of GDF5 and Contributing Factors in Developmental Dysplasia of the Hip in Infants
Autorzy:
Harsanyi, Stefan
Zamborsky, Radoslav
Krajciova, Lubica
Bohmer, Daniel
Kokavec, Milan
Danisovic, Lubos
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/28409369.pdf
Data publikacji:
2021-10-25
Wydawca:
Fundacja Edukacji Medycznej, Promocji Zdrowia, Sztuki i Kultury Ars Medica
Tematy:
DDH
hip joint
genotyping
GDF5
rs143383
Opis:
Background. Developmental dysplasia of the hip (DDH) is a developmental disorder which is reported to be associated with hip instability. When untreated, it can lead to irreversible joint damage. DDH is known to be a multifactorial disease involving genetic, mechanical and environmental factors. The greatest causative potential is attributed to the genetic component. Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) is among the most studied genes associated with processes of regeneration and maintenance of joints. The aim of this work was to analyse the association of SNP rs143383 in the GDF5 gene and the occurrence of DDH, along with association with various contributing factors in the Caucasian population. Material and methods. A total of 118 samples were analysed for the presence of the mutation. DNA was isolated from all individuals from peripheral blood. SNP rs143383 in the GDF5 gene was genotyped using the TaqMan assay. A standard chi-square test was used to compare allele and genotype distributions in patients and healthy controls. Results. The association analysis of genotypes of DDH and rs143383 revealed a significant association. Also, the association of GDF5 and selected contributing factors was statistically significant in female gender (p=0.002), family history (p<0.001), count of pregnancy (p=0.009), laterality of hip involvement and initial US examination. Conclusions. 1. The results indicate an important effect of rs143383 polymorphism in the GDF5 gene on DDH development. 2. However, our results also suggest that rs143383 is not the only contributing factor in the genetic component of DDH.
Źródło:
Ortopedia Traumatologia Rehabilitacja; 2021, 23(5); 335-339
1509-3492
2084-4336
Pojawia się w:
Ortopedia Traumatologia Rehabilitacja
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Usefulness of PCR/RFLP and ERIC PCR techniques for epidemiological study of Haemophilus parasuis infections in pigs
Autorzy:
Jablonski, A.
Zebek, S.
Kolacz, R.
Pejsak, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/30649.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
animal disease
pig
animal infection
epidemiology
Haemophilus parasuis
genotyping
polymerase chain reaction
virulence
diagnosis
microorganism
DNA fragment
electrophoretic separation
environmental factor
molecular method
Opis:
Haemophilus parasuis belongs to opportunistic microorganisms of undefined virulence. The purpose of the studies was to compare suitability of PCR/RFLP in our modification and ERIC PCR for epidemiological study of domestic strains of H. parasuis. The results were evaluated taking into account two different aspects: suitability of the tests for isolating the highest possible number of clone groups and subjective evaluation of the method judged with respect to the following criteria: difficulty, availability of equipment and reagents as well as time and cost of the study. The results obtained in the present study show that the two methods used for typing of H. parasuis had high discriminatory power. Taking into account this parameter it can be concluded that ERIC PCR is more suitable than PCR/RFLP. This justifies the use of ERIC PCR for routine epidemiological analyses of mentioned pathogen. Taking into account the complexity of method used, ERIC-PCR based on random amplification of DNA, proved to be comparable to PCR/RFLP. The last mentioned technique is relatively less expensive and labour-consuming, especially when diagnostic PCR method is used for the epidemiological studies.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2011, 14, 1
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular characterization of Polish Prototheca zopfii mastitis isolates and first isolation of Prototheca blaschkeae in Poland
Autorzy:
Jagielski, T.
Lassa, H.
Ahrholdt, J.
Roesler, U.
Malinowski, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/30577.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Prototheca zopfii
mastitis
isolate
isolation
Prototheca blaschkeae
Polska
alga
bovine mastitis
genotyping
protothecosis
Opis:
Bovine mastitits caused by the colorless, yeast-like alga Prototheca zopfii is a serious and complex condition that results in heavy economic losses in the dairy industry, both through a substantial reduction in milk production and culling of infected animals. Based on the 18S rDNA sequence analysis, genotype-specific PCR assays have recently been developed to differentiate within the species P. zopfii three distinct P. zopfii genotypes (1-3), of which P. zopfii genotype 3 has been considered a new species P. blaschkeae sp. nov. The purpose of this study was to employ the newly-devised molecular approach for the detection of the two P. zopfii genotypes and P. blaschkeae sp. nov. among bovine mastitis isolates from Poland. This study is the first to provide molecular characterization of Polish P. zopfii mastitis isolates. It also gives the first description of bovine mammary protothecosis due to P. blaschkeae in Poland, as evidenced by genotypical, microbiological, and electron microscopy findings.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2010, 13, 4
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of the High Resolution Melting analysis for genetic mapping of Sequence Tagged Site markers in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.)
Autorzy:
Kamel, Katarzyna
Kroc, Magdalena
Święcicki, Wojciech
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039001.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
HRM
molecular markers
genotyping
narrow-leafed lupin
Opis:
Sequence tagged site (STS) markers are valuable tools for genetic and physical mapping that can be successfully used in comparative analyses among related species. Current challenges for molecular markers genotyping in plants include the lack of fast, sensitive and inexpensive methods suitable for sequence variant detection. In contrast, high resolution melting (HRM) is a simple and high-throughput assay, which has been widely applied in sequence polymorphism identification as well as in the studies of genetic variability and genotyping. The present study is the first attempt to use the HRM analysis to genotype STS markers in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). The sensitivity and utility of this method was confirmed by the sequence polymorphism detection based on melting curve profiles in the parental genotypes and progeny of the narrow-leafed lupin mapping population. Application of different approaches, including amplicon size and a simulated heterozygote analysis, has allowed for successful genetic mapping of 16 new STS markers in the narrow-leafed lupin genome.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 3; 533-540
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Isolation and identification of plant growth promoting rhizobacteria from maize (Zea mays L.) rhizosphere and their plant growth promoting effect on rice (Oryza sativa L.)
Autorzy:
Karnwal, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65251.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
isolation
identification
plant growth
genotyping
phytohormone
indoleacetic acid
promoting rhizobacteria
rhizobacteria
maize
Zea mays
rhizosphere
rice
Oryza sativa
Opis:
The use of plant growth promoting rhizobacteria is increasing in agriculture and gives an appealing manner to replace chemical fertilizers, pesticides, and dietary supplements. Th e objective of our research was to access the plant growth promotion traits of Pseudomonas aeruginosa, P. fl uorescens and Bacillus subtilis isolated from the maize (Zea mays L.) rhizosphere. In vitro studies showed that isolates have the potential to produce indole acetic acid (IAA), hydrogen cyanide, phosphate solubilisation, and siderophore. RNA analysis revealed that two isolates were 97% identical to P. aeruginosa strain DSM 50071 and P. aeruginosa strain NBRC 12689 (AK20 and AK31), while two others were 98% identical to P. fl uorescens strain ATCC 13525, P. fl uorescens strain IAM 12022 (AK18 and AK45) and one other was 99% identical to B. subtilis strain NCDO 1769 (AK38). Our gnotobiotic study showed signifi cant diff erences in plant growth variables under control and inoculated conditions. In the present research, it was observed that the isolated strains had good plant growth promoting eff ects on rice.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 2017, 57, 2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A novel method of Mycobacterium tuberculosis complex strain differentiation using polymorphic GC-rich gene sequences
Autorzy:
Kotłowski, Roman
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039112.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Mycobacterium tuberculosis complex
PGRS
genotyping
Opis:
Tuberculosis is one of the leading infectious diseases. In this work, a new genotyping method of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) complex strain is presented. 27 Mtb genomes were analyzed for the presence of length polymorphism within polymorphic GC-rich gene sequences. Four genes, Rv3345c, Rv3507, Rv0747 and Rv3511, showing variation in length depending on the Mtb strain were selected for designing primer sequences flanking variable regions for the PCR method. Identification of 16 genotypes among 27 analyzed genomes demonstrated usefulness of our genotyping method in differentiation of Mtb genomes based on sequence polymorphism in the four PGRS genes.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 2; 317-322
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
Autorzy:
Krawczyk, Beata
Kur, Józef
Stojowska-Swędrzyńska, Karolina
Śpibida, Marta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038839.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
rapid methods
molecular epidemiology
genotyping
microbial phylogenetics
PCR (polymerase chain reaction)
Opis:
A significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms' characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before DNA amplification by PCR, known as Ligation-Mediated PCR methods (LM PCR), have been successfully applied for the typing of microorganisms below the species level. These molecular methods include: Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites (ADSRRS), PCR Melting Profiles (PCR MP), Ligation Mediated PCR/Shifter (LM PCR/Shifter), Infrequent-Restriction-Site Amplification (IRS PCR), double digestion Ligation Mediated Suppression PCR (ddLMS PCR). These techniques are now applied more and more often because they involve less time, are comparably inexpensive, and require only standard lab equipment. Here, we present a general review of this group of methods showing their possibilities and limitations. We also identify questions and propose solutions which may be helpful in choosing a particular LM PCR method for the achievement of the required goal.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2016, 63, 1; 39-52
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Genetic diversity of local cattle
Autorzy:
Kukučková, Veronika
Moravčíková, Nina
Curik, Ino
Simčič, Mojca
Mészáros, Gábor
Kasarda, Radovan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038372.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
admixture
clustering
gene flow
genotyping array
Pinzgau cattle
Opis:
The Slovak Pinzgau breed faces the bottleneck effect and the loss of diversity due to unequal use of founders and a significant population decline. Further population size reduction can lead to serious problems. Information obtained here and in other studies from high-throughput genotyping of 179 individuals was used to characterise genetic diversity and differentiation of Slovak Pinzgau, Austrian Pinzgau, Cika and Piedmontese cattle by Bayesian clustering algorithm. A gene flow network for the clusters estimated from admixture results was produced. The low estimate of genetic differentiation (FST) in Pinzgau cattle populations indicated that differentiation among these populations is low, particularly owing to a common historical origin and high gene flow. Changes in the log marginal likelihood indicated Austrian Pinzgau as the most similar breed to Slovak Pinzgau. All populations except the Piedmontese one displayed two ways of gene flow among populations, indicating that Piedmontese cattle was involved in producing of the analysed breeds while these breeds were not involved in creation of Piedmontese. Genetic evaluation represents an important tool in breeding and cattle selection. It is more strategically important than ever to preserve as much of the livestock diversity as possible, to ensure a prompt and proper response to the needs of future generations. Information provided by the fine-scale genetic characterization of this study clearly shows that there is a difference in genetic composition of Slovak and Austrian populations, as well as the Cika and Piedmontese cattle. Despite its population size, the Slovak Pinzgau cattle have a potential to serve as a basic gene reserve of this breed, with European and world-wide importance.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2018, 65, 3; 421-424
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Markery molekularne w badaniach rzepaku (Brassica napus L.). I. Przegląd stosowanych technik
Molecular markers for study of oilseed rape (Brassica napus L.) I. The review of marker techniques
Autorzy:
Matuszczak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833585.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
markery genetyczne
markery molekularne
genotypowanie
hodowla roslin
metody wykrywania
markery izoenzymatyczne
markery RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
markery RAPD
markery AFLP-RGA
markery AFLP
markery DArT
mikrosatelity
markery ISSR
markery ACGM
markery SCAR
markery CAPS
markery SNP
rape
genetic marker
molecular marker
genotyping
plant breeding
detection method
isoenzyme marker
RFLP marker
polymerase chain reaction
RAPD marker
AFLP-RGA marker
AFLP marker
DArT marker
microsatellite
ISSR marker
ACGM marker
SCAR marker
CAPS marker
SNP marker
Opis:
Współczesna biologia molekularna dostarcza wciąż nowych metod pozwalających na opracowywanie markerów genetycznych, w tym przede wszystkim markerów molekularnych (markerów DNA). Znajdują one zastosowanie w różnych badaniach dotyczących rzepaku. Ich wykorzystanie w hodowli znacznie przyspiesza uzyskiwanie nowych odmian. Markery molekularne umożliwiają postęp w badaniach genomu. Istotne jest także znaczenie markerów molekularnych w badaniach pokrewieństwa oraz identyfikacji odmian. W pracy dokonano przeglądu technik poszukiwania markerów, które już znalazły lub mogą znaleźć zastosowanie w badaniach nad rzepakiem. Omówiono zarówno metody, które były stosowane na wczesnym etapie rozwoju tej dziedziny, jak i te, które stosowane są obecnie. Zasygnalizowano także prawdopodobne kierunki rozwoju nowych technologii dla pozyskiwania markerów w przyszłości.
Modern molecular biology is the continuous source of new techniques that can be applied to obtain genetic markers, including, first of all, molecular (DNA) markers. Such markers are widely used for study of oilseed rape. Their application in breeding can speed up the formation of new varieties. Molecular markers can generate the progress in study of various genomes. There are many cases of their use for relationship analysis or variety identification. The review of marker techniques, both those already applied and as yet not applied for study on oilseed rape, is presented here. In this review past and present methods are described according to the sequence of their invention and use. The prospects of new technologies that may be used for marker development in the near future are also mentioned.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 2
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Markery molekularne w badaniach rzepaku (Brassica napus L.). II. Przegląd praktycznych zastosowań w hodowli
Molecular markers for study of oilseed rape (Brassica napus L.). II. The review of markers used for breeding programs
Autorzy:
Matuszczak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/834299.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
hodowla roslin
markery molekularne
wykorzystanie
nowe metody
genotypowanie
rape
plant breeding
molecular marker
use
new method
genotyping
Opis:
Konkurencja na rynku nasion wymusza na hodowcach rzepaku znaczne przyspieszenie prac mających na celu uzyskiwanie nowych lepszych odmian o różnych cechach. Aby sprostać takim wyzwaniom niezbędne jest zastosowanie nowych metod wykorzystujących markery molekularne. W pracy wskazano na korzyści i trudności związane z ich stosowaniem w hodowli rzepaku oraz omówiono potencjał wybranych technik dla praktycznych zastosowań. Opisano podstawowe strategie badawcze, które pozwalają na wyszukanie markerów sprzężonych z określonymi cechami. Omówiono także metody poszukiwania markerów poprzez analizę całego genomu, które mają istotne znaczenie dla analizy cech wielogenowych. Na koniec podano liczne przykłady praktycznych zastosowań markerów molekularnych w hodowli rzepaku wspomaganej markerami molekularnymi (MAS), jak również przykłady innych zastosowań użytecznych dla hodowli tej rośliny.
To withstand the present competition on the seed market, the breeders must speed up their efforts to obtain new varieties better in various characteristics. It is hard to cope with such a challenge without using new methods, including the use of molecular markers. Both advantages and difficulties related to these methods as well as their usability in rapeseed breeding are presented here. Basic strategies of searching for molecular markers linked with selected traits of plants are described. The article includes some remarks on the analysis of the whole genome, which is the method of choice in case when the markers linked with multigenic features are to be found. Finally, the review of markers used for marker assisted selection (MAS) and other applications of these techniques in oilseed rape breeding programs are presented.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 2
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Prevalence of the factor V Leiden mutation in patients susceptible to venous thromboembolism
Częstość występowania mutacji czynnika V Leiden u pacjentów ze skłonnością do żylnej choroby zakrzepowo-zatorowej
Autorzy:
Mitrus, J.M.
Wierszyło, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2048961.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Akademia Bialska Nauk Stosowanych im. Jana Pawła II w Białej Podlaskiej
Tematy:
hypercoagulability
Leiden mutation
genotyping techniques
Real-Time PCR
nadkrzepliwość
mutacja Leiden
genotypowanie
Opis:
Background. A tendency to venous thromboembolism is otherwise called hypercoagulability or thrombophilia. This disease can be acquired or have a genetic background, and may lead to pulmonary embolism. The basis for analysis and selection of treatment is genetic diagnosis, which detects the G1691A mutation in the factor V gene (factor V Leiden) – the best known congenital thrombophilia marker. Material and methods. The study was carried out in the years 2015-2017 on samples taken from patients (462 men and 1284 women) with a tendency to venous thromboembolism. Real-Time PCR was used to detect G1691A mutation in factor V gene. The analyses were performed in the Hematology Laboratory of the Center of Laboratory Medicine at the Medical University of Gdańsk. Results. Significant differences in the frequency of Leiden mutation were shown. This mutation predominated in men (25%), while in women G1691A mutation was detected with a 15% frequency (p=0.04). All possible genotypes were found among the subjects and the percentage of heterozygotes and homozygotes in both genders was similar. Conclusions. Congenital t hrombophilia a ssociated w ith G1691A mutation of f actor V Leiden gene was found to be more common in men than in women. All possible genotypes were determined in the pool of test subjects. The mutation was most frequently detected in patients between 30 and 40 years of age, and rarely after 70 years of age.
Wprowadzenie. Nadkrzepliwość (trombofilia) jest to skłonność do żylnej choroby zakrzepowozatorowej. Choroba ta może być nabyta lub mieć podłoże genetyczne i może prowadzić do zatorowości płucnej. Podstawą analizy i doboru leczenia jest diagnostyka genetyczna. Celem tej diagnostyki jest wykrycie mutacji G1691A w genie czynnika V (czynnik V Leiden) – najlepiej poznanego markera trombofilii wrodzonej. Materiał i metody. Badania zostały przeprowadzone w latach 2015-2017 na próbkach pobranych od pacjentów (462 mężczyzn i 1284 kobiet) ze skłonnością do żylnej choroby zakrzepowozatorowej. W celu wykrycia mutacji G1691A w genie czynnika V zastosowano metodę Real-Time PCR. Analizy zostały wykonane w Laboratorium Hematologii Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Laboratoryjnej przy Gdańskim Uniwersytecie Medycznym. Wyniki. Wykazano istotne statystycznie różnice w częstości występowania mutacji Leiden. Mutację częściej występowała w grupie mężczyzn (25%), zaś u kobiet mutację G1691A wykrywano z częstością 15% (p=0,04). Wśród osób badanych stwierdzono wszystkie możliwe genotypy, a procentowy udział heterozygot i homozygot u obu płci był zbliżony. Wnioski. Trombofilia wrodzona związana z mutacją G1691A w genie czynnika V Leiden częściej występowała u mężczyzn niż kobiet. W puli osób poddanych testom oznaczono wszystkie możliwe genotypy. Mutację najczęściej wykrywano u pacjentów w przedziale wiekowym 30-40 lat, a najrzadziej po 70 roku życia.
Źródło:
Health Problems of Civilization; 2020, 14, 2; 83-93
2353-6942
2354-0265
Pojawia się w:
Health Problems of Civilization
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies