Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "genetic association" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Using SSR markers for assessment genetic diversity and detection drought escape candidate genes in barley lines (Hordeum vulgare L.)
Autorzy:
Gougerdchi, Vahideh
Dezhsetan, Sara
Ebrahimi, Mohammad Ali
Sadeghzadeh, Behzad
Savari, Sona
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199609.pdf
Data publikacji:
2014-12-18
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
Association analysis
barley
genetic diversity
Microsatellite markers (SSR)
drought escape
Opis:
Assessment of genetic diversity using molecular markers is one of the primary and important steps in breeding programs. In this study, genetic diversity of 52 barley lines evaluated using 68 SSR primer pairs and 47 primer pairs produced clear and polymorphic banding pattern. In general, 153 polymorphic alleles de-tected. The number of observed polymorphic alleles varied from 2 to 9, with an average of 3.26 alleles per locus. Polymorphic Information Content (PIC) ranged from 0.07 to 0.81, with an average of 0.45. In this research, SSR markers differentiated the studied lines efficiently. Using cluster analysis, studied barley lines divided into two groups. Genetic diversity was relatively corresponding with geographical origins, because the lines related to a country somewhat diverged from each other. Two-rowed Iranian and Chinese barleys classified in one subgroup. Also, most six-rowed barleys classified in one subgroup. Association mapping analysis was used to identify candidate genes for drought escape in barley lines and 16 informative markers were identified after which confirmation in other tests could be suitable for marker assisted breeding drought escape.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2014, 70; 3-14
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Strategie molekularne w nowoczesnej hodowli roślin
Molecular strategies in modern plant breeding
Autorzy:
Jarska, Weronika
Niedziela, Agnieszka
Orłowska, Renata
Bednarek, Piotr T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198604.pdf
Data publikacji:
2015-03-31
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
mapowanie genetyczne
mapowanie asocjacyjne
selekcja genomowa
association mapping
genetic mapping
genomic selection
Opis:
Rozwój biologii molekularnej, a w szczególności technologii markerowych oraz narzędzi statystycznych umożliwiających analizę dużej liczby danych uzyskiwanych dla szerokiego typu populacji mapujących sprawia, że zmienia się podejście do selekcji materiałów roślinnych dla potrzeb hodowli. Coraz silniejszy nacisk kładzie się na selekcję wielu cech użytkowych przy jednoczesnym wykorzystaniu elitarnych, zwykle niespokrewnionych ze sobą lecz wyrównanych pod względem genetycznym materiałów roślinnych. Rozwijane obecnie metody umożliwiające prowadzenie selekcji za pomocą markerów DNA w oparciu o złożone populacje mapujące są znane tylko wąskiej grupie specjalistów natomiast metody wykorzystujące ściśle zdefiniowane modele genetyczne, ze względu na ich liczne ograniczenia, zdają się być negowane. Niniejsza praca poświęcona jest omówieniu możliwości metod selekcji wykorzystujących szeroki wachlarz metod biologii molekularnej.
Advances in molecular biology, including the new marker technologies and statistical tools allow analysis of large data sets evaluated for different types of mapping populations and change approaches to selection of breeding materials. The emphasis is put on selecting many traits simultaneously based on elite, usually non-related but genetically uniform, plant materials. Currently available methods for selecting forms via DNA-based marker technologies using complex mapping populations are well known to a limited number of specialists whilst applications involving defined mendelian populations (due to their numerous limitations) are being neglected. Thus, the review is dedicated to describing wide range of selection approaches that could be applied to different breeding programs depending on experimental requirements.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2015, 275; 17-28
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Differentiation and genetic structure of Sclerophoma pythiophila (Corda) v. Hoehn. strains associated with various damage and disease symptoms on Pinus sylvestris L.
Zróżnicowanie i struktura genetyczna szczepów Sclerophoma pythiophila (Corda) v. Hoehn. związanych z różnymi typami objawów chorobowych i uszkodzeń na Pinus sylvestris L.
Autorzy:
Kraj, W.
Kowalski, T.
Zarek, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27447.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
differentiation
genetic structure
Sclerophoma pythiophila
fungal strain
fungi association
damage
plant disease
disease symptom
Pinus sylvestris
Contarinia baeri
Thecodiplosis brachyntera
Opis:
Eighty-three strains of Sclerophoma pythiophila were isolated in the period between 1996 and 2006 from needles and shoots of Pinus sylvestris displaying various types of disease symptoms or damages caused by Contarinia baeri or Thecodiplosis brachyntera. On the basis of fifty-six RAMS markers, very high genetic variability of examined strains was ascertained (mean value of Jaccard’s coefficient 0.58). The highest genetic similarity was shown by strains related with needles damaged by Contarinia baeri (0.65), whereas the lowest by those derived from dead shoot tips (0.53). No monomorphic markers were found for individual groups of strains, yet on the basis of Nei’s genetic distance matrix, it was possible to determine a group of closely related fungus populations which was connected with the damaging of the needles by C. baeri or T. brachyntera (Nei’s coefficient ranging from 0.035 to 0.059) and populations related with the occurrence of necrosis on shoots or decay of their tips (Nei’s coefficient – 0.066). The PCA confirmed genetic similarity of strains related with damaging of the needles by insects and strains isolated from local necroses on shoots and withered shoot tips. A high level of genetic variability between populations was shown by AMOVA analysis. A high level (14.9%) and statistically significant (P=0.001) share of between-population genetic variability were ascertained.
Osiemdziesiąt trzy szczepy Sclerophoma pythiophila były izolowane w okresie 1996 – 2006 z igieł i pędów Pinus sylvestris wykazujących różne typy objawów chorobowych lub uszkodzeń spowodowanych przez Contarinia baeri lub Thecodiplosis brachyntera. Na podstawie 56 uzyskanych markerów RAMS stwierdzono bardzo wysokie zróżnicowanie genetyczne badanych szczepów (średnia wartość wsp. Jaccarda 0.58). Największe podobieństwo genetyczne wykazywały szczepy związane z uszkodzeniem igieł przez Contarinia baeri (0.65), natomiast najmniejsze pochodzące z zamarłych szczytów pędów (0.53). Nie stwierdzono monomorficznych dla poszczególnych grup szczepów markerów, jednak na podstawie macierzy odległości genetycznej Nei wyróżniono grupę blisko spokrewnionych populacji grzyba związanych z uszkodzeniem igieł przez C. baeri lub T. brachyntera (wsp. Nei od 0.035 do 0.059) oraz populacji związanych z występowaniem nekroz na pędach lub zamieraniem ich szczytów (wsp. Nei 0.066). Analiza PCA potwierdziła podobieństwo genetyczne szczepów związanych z uszkodzeniem igieł przez owady oraz szczepów izolowanych z lokalnych nekroz na pędach i zamarłych szczytów pędów. Wysoki stopień zróżnicowania genetycznego między populacjami wykazała analiza AMOVA. Stwierdzono duży (14.9%), wysoce statystycznie istotny (P=0.001) udział miedzypopulacyjnej zmienności genetycznej.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2009, 62, 1
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of the association between rs12917707 and rs11864909 single nucleotide polymorphisms in the region of the uromoduline gene and chronic kidney disease - a family-based study
Autorzy:
Żywiec, Joanna
Kiliś-Pstrusińska, Katarzyna
Tomaszewski, Maciej
Grzeszczak, Władysław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/990841.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
chronic kidney disease
genetic association
family-based study
umod polymorphism
Opis:
Chronic kidney disease (CKD) is an important challange for healthcare systems wordwide because of its high prevalence and serious late complications. The results of recent studies suggest an association between CKD development and genetic variation within the uromodulin gene (UMOD). The aim of this study was to investigate associations between two common single nucleotide polymorphisms – rs12917707 and rs11864909, located in the region of UMOD and chronic renal disease. The study group consisted of 109 patients with chronic kidney disease, caused by chronic renal glomerulonephritis or chronic tubulointerstitial nephritis, and 109 pairs of their biological parents. Genotyping for rs12917707 and rs11864909 was carried out using the TaqMan Pre-designed SNP Genotyping Assay. In the transsmission disequilibrium test, allele C of rs11864909 was preferentialy transmitted from parents to the children with chronic tubulointerstinal nephritis. The rs12917707 was not associated with CKD. Neither of the investigated polymorphisms was associated with the progression of chronic kidney disease. The obtained results suggest an association of rs11864909 with chronic kidney disease secondary to chronic tubulointerstinal nephritis.
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2017, 24, 3
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies