Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "gene variant" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-3 z 3
Tytuł:
Gene pool variation of Fragaria × ananassa (Duch.) and Fragaria vesca (L.)
Zmienność w obrębie zasobów genowych Fragaria × ananassa (Duch.) i Fragaria vesca (L.)
Autorzy:
Dziadczyk, E.
Dziadczyk, P.
Tyrka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11543047.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:
gene variant
Fragaria ananassa
Fragaria vesca
gene pool
hybrid
interspecific hybrid
Opis:
Gene pool variation of twenty varieties and breeding clones of Fragaria × ananassa, nine varieties and breeding lines of Fragaria vesca, and one new interspecific hybrid designated Fragaria × anavesca was analysed with three DNA marker systems. ISSR reactions with four primers produced 45 polymorphic markers. Similarly, RAPD analyses with three primers produced 26 markers and SSR method with three primer pairs revealed 28 different alleles. The total number of 99 polymorphic markers allowed distinguishing clearly a group of F. × ananassa genotypes from that of F. vesca genotypes with F. × anavesca in between of these two. RAPD markers proved to be more informative than ISSRs as 3 of 26 were specific to F. × ananassa only and one exclusively to F. vesca and F. × anavesca. Thus, the presumed hybrid nature of F. × anavesca was effectively confirmed by RAPD markers. Especially important was the 1100bp long PCR product of the B104 primer present in all F. vesca genotypes as well as in F. × anavesca but absent in F. × ananassa. Presence of F. vesca DNA in the hybrid F. × anavesca was additionally corroborated by the 223bp product of the UDF017 primer pair and the 185bp-long band generated with the UDF006 primer pair.
Analizowano zmienność w puli genów dwudziestu odmian i klonów hodowlanych Fragaria × ananassa, dziewięciu odmian i linii hodowlanych Fragaria vesca i nowego prawdopodobnego mieszańca międzygatunkowego nazwanego Fragaria × anavesca przy zastosowaniu trzech systemów markerów DNA. Cztery startery ISSR wygenerowały 45 markerów polimorficznych. Trzy startery RAPD dały 26 markerów, natomiast trzy startery SSR – 28 markerów polimorficznych. 99 uzyskanych markerów polimorficznych pozwoliło na jednoznaczne odróżnienie grupy genotypów należących do gatunku F. × ananassa od grupy genotypów należących do gatunku F. vesca z mieszańcem F. × anavesca sytuującym się pomiędzy nimi. Markery RAPD okazały się lepszym źródłem informacji niż ISSR, ponieważ 3 spośród 26 były specyficzne tylko dla F. × ananassa, a jeden wyłącznie dla F. vesca i F. × anavesca. W ten sposób, za pomocą markerów RAPD, potwierdzona została przypuszczalna wcześniej mieszańcowość F. × anavesca. Szczególnie istotny okazał się produkt reakcji PCR ze starterem B104 o długości 1100pz obecny we wszystkich genotypach F. vesca oraz F. × anavesca, a niewystępujący u F. × ananassa. Obecność DNA pochodzącego z F. vesca w mieszańcu F. × anavesca została dodatkowo potwierdzona poprzez produkt pary starterów UDF017 o długości 223pz i produkt pary starterów UDF006 o długości 185pz.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2015, 14, 2; 41-50
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Semantic-enabled hybrid genetic disease diagnostics in Next-Generation Sequenced data
Autorzy:
Zawadzka-Gosk, E.
Wołk, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/305569.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie. Wydawnictwo AGH
Tematy:
gene prioritization
variant prioritization
semantical text analysis
Opis:
Next Generation Sequencing is a technology for genome sequencing used in genetics for the diagnosis of disease. NGS provides a list of all mutations in a genome, so identifying the one that causes a disease is not trivial. A number of applications for variant prioritization were developed, but the data they provide is a suggestion rather than a diagnosis; moreover, they sufer from issues such as identifying a nonpathogenic variant as a causal one or the inability to identify a causal gene. These issues inspired us to create a strategy for variant prioritization, which includes the use of the Exomiser and OMIM Explorer result sets improved by semantic analysis of abstracts and articles freely available from the PubMed and PubMed Central databases. For the wider scope of scientific articles, the Google Scholar repository will be used. The described approach enables us to present the latest and most accurate information about potential pathogenic variants.
Źródło:
Computer Science; 2018, 19 (2); 179-199
1508-2806
2300-7036
Pojawia się w:
Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of Polish RHDVa subtype strains based on the analysis of a highly variable part VP60 gene
Autorzy:
Fitzner, A.
Niedbalski, W.
Paprocka, G.
Kesy, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/31138.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
identification
RHD virus
genetic variability
Polska
virus subtype strain
genetic variant
sequence analysis
VP60 gene
rabbit
nucleotide sequence
phylogenetic analysis
hemorrhagic disease
virus strain
Opis:
In order to determine the genetic variability of Polish RHD virus strains and to confirm the presence of genetic variant (RHDVa) subtype the partial nucleotide sequences of capsid protein gene, including two highly variable regions C and E, were examined. Phylogenetic analyses of 15 viral strains obtained over 18 years revealed the presence of three genetic groups. The oldest RHDV strains exhibit very close amino acid sequence similarity (98-99%) to the German FRG89 reference strain and most of European strains of the same period, as well as Chinese isolate from 1984. The HA-negative strains and isolates with variable reactivity in the HA test belong to the second subgroup and exhibit an intermediate level of variability (about 3%) in the analysed VP60 gene fragment. The most genetically variable strains (6-7%) clustered to RHDVa subtype. The analysis of nucleotides and amino acid sequences demonstrated three pairs of well conserved RHDV strains, isolated over 3, 6 and 10-year period.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2012, 15, 1
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-3 z 3

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies