Temat: gene promoter - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: WRKY transcription factors in response to ROS
Autorzy:: Vaahtera, L.
Koskela, M.
Jolma, A.
Nurkkala, H.
Varjosalo, M.
Brosche, M.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/81134.pdf
Data publikacji:: 2013
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: conference
Arabidopsis
reactive oxygen species
WRKY transcription factors
protein-protein interaction
protein-DNA interaction
gene promoter
Źródło:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 2
0860-7796
Pojawia się w:: BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Influence of erythropoietin gene promoter polymorphism rs 1617640 on the incidence and progression of chronic kidney disease; a family-based study
Wpływ polimorfizmu rs 1617640 promotora genu erytropoetyny na występowanie i progresję przewlekłej choroby nerek; badania rodzinne
Autorzy:: Żywiec, Joanna
Kiliś-Pstrusińska, Katarzyna
Grzeszczak, Władysław
Gumprecht, Janusz
Trautsolt, Wanda
Górczyńska-Kosiorz, Sylwia
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1038897.pdf
Data publikacji:: 2012
Wydawca:: Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:: chronic kidney disease
erythropoietin gene promoter polymorphism
family-based study
przewlekła choroba nerek
badania rodzinne
polimorfizm promotora genu dla erytropoetyny
Opis:: INTRODUCTION The aetiology of chronic kidney disease (CKD) and its progression are multifactorial in nature. A number of reports have demonstrated the nonhaematological local protective properties of erythropoietin in diff erent tissues, including those in the kidneys. The primary goal of the reported, family-based study was to assess the influence of rs 1617640 erythropoietin gene promoter polymorphism on the incidence and progression of CKD. MATERIAL AND METHODS For that purpose, 109 patients with CKD (72.5% with chronic interstitial nephritis and 27.5% with chronic glomerulonephritis) and their parents were examined. At the time of the study, the mean glomerular filtration rate was 28.2 ml/min and 53.2% patients were maintained on renal replacement therapy. Fluorescence labelled probes of the TaqMan Pre-designed SNP Genotyping Assay (Applied Biosystems Company) were used for rs1617640 polymorphism investigation. RESULTS The genome distribution of rs 1617640 polymorphism of the erythropoietin gene promoter was: 48.6% AC, 25.7% AA and 25.7% CC patients. Based on Transmission Disequilibrium Test results, the bordeline statistical significance of preferential C allele transfer from parents to their affected children with glomerulonephritis was observed. CONCLUSIONS No influence of rs 1617640 promoter polymorphism of the erythropoietin gene on the incidence of CKD in the course of chronic interstitial nephritis was observed. The bordeline signifi cance of preferential C allele transfer in patients with glomerulonephritis suggests association between rs1617640 and CKD of this aethiology.
WSTĘP Etiologia przewlekłego uszkodzenia nerek oraz jego progresji jest wieloczynnikowa. Prace ostatnich lat dowodzą znaczenia pozaszpikowego miejscowego działania ochronnego erytropoetyny w wielu tkankach, w tym także w nerkach. Celem pracy była ocena w modelu rodzinnym wpływu polimorfizmu rs1617640 promotora genu dla erytropoetyny na rozwój i progresję przewlekłej choroby nerek. MATERIAŁ I METODY Badania przeprowadzono w grupie 109 chorych na przewlekłą chorobę nerek w przebiegu przewlekłego śródmiąższowego zapalenia nerek (72,5%) i przewlekłego kłębuszkowego zapalenia nerek (27,5%) oraz u 218 ich biologicznych rodziców. W momencie prowadzenia badania średnia filtracja kłębuszkowa (GFR) wynosiła 28,2 ml/min, a 53,2% chorych było leczonych nerkozastępczo. Genotypowanie polimorfizmu rs1617640 w promotorze genu erytropoetyny wykonano, wykorzystując znakowane fluorescencyjnie sondy z zestawu TaqMan Pre-designed SNP Genotyping Assay firmy Applied Biosystems. WYNIKI Analizując rozkład genotypów badanego polimorfizmu, stwierdzono: u 48,6% chorych genotyp AC, a u pozostałych chorych w równym procencie (po 25,7%) genotyp AA i CC. W teście TDT (Transmission Disequilibrium Test) wykazano na granicy istotności statystycznej przekazywanie preferencyjne allelu C w grupie chorych z przewlekłym kłębuszkowym zapaleniem nerek. WNIOSKI Nie obserwowano wpływu polimorfizmu rs1617640 genu promotora dla erytropoetyny na występowanie przewlekłego uszkodzenia nerek w przebiegu przewlekłego środmiąższowego zapalenia nerek. Stwierdzone na granicy istotności statystycznej, preferencyjne przekazywanie allelu C w grupie chorych na przewlekłe kłębuszkowe zapalenie nerek, sugeruje związek rs1617640 z przewlekłą chorobą nerek o tej etiologii.
Źródło:: Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2012, 66, 4; 17-23
1734-025X
Pojawia się w:: Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Isolation and preliminary sequence characterization of beta-amylase gene promoters in rye [Secale cereale L.]
Autorzy:: Sadowski, J
Rorat, T
Cooke, R
Delseny, M
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2046684.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: beta-amylase
rye
gene promoter
homology
amino acid
DNA cloning
prolamin
Secale cereale
mRNA
embryogenesis
endosperm
cDNA
inverse polymerase chain reaction
Opis:: The isolation of rye ß-Amy1 and ß-Amy2 gene promoters from nuclear DNA using the inverse polymerase chain reaction (IPCR) technique and characterization of their sequences are presented. The conservation of ß-amylasc coding sequences allowed for simultaneous IPCR amplification of two different promoters with primers designed on the basis of the single known cDNA sequence. Two ß-amylasc gene promoters display a low sequence similarity (47%). Beside consensus TATA and CCAAT boxes, other sequence motives common to both promoters were found. In addition, the homology of amino acid sequences of plant ß-amylases available in the database is discussed.
Źródło:: Journal of Applied Genetics; 1997, 38, 3; 241-251
1234-1983
Pojawia się w:: Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: Uwarunkowania genetyczne rozszczepu wargi górnej i/lub podniebienia - czy polimorfizm genu MMP2 ma znaczenie w rozwoju tej wady?
Cleft lip and/or palate genetic conditioning - is MMP2 gene polymorphism important for this defect development?
Autorzy:: Zalewska-Ziob, Marzena
Adamek, Brygida
Kasperczyk, Jolanta
Łyko, Dorota
Płachetka, Anna
Rokicki, Marek
Machorowska-Pieniążek, Agnieszka
Baron, Stefan
Niedzielska, Iwona
Wiczkowski, Andrzej
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1033402.pdf
Data publikacji:: 2014
Wydawca:: Medical Communications
Tematy:: MMP2 gene promoter polymorphism
cleft lip and/or palate
matrix metalloproteinase 2
rozszczep wargi i/lub podniebienia
metaloproteinaza macierzy zewnątrzkomórkowej 2
polimorfizm
promotora genu mmp2
Opis:: Introduction: Cleft lip/palate is one of the most common congenital malformations. In Poland, approximately 500 children with an orofacial cleft are born every year. Matrix metalloproteinases are involved in periodontal tissue remodelling and degradation. Polymorphisms in the promoter region of the MMP2 gene may affect transcription and activity of the protein produced by this gene. The aim of the study was to examine 1306 C/T MMP2 gene promoter polymorphisms in the group of children with cleft lip/palate and in the control group as well as to determine the frequency of individual genotypes in different types of orofacial clefts. Material and methods: The study was conducted in the group of 150 children with cleft lip/palate and 102 children without an orofacial cleft. Genomic DNA was obtained from oral mucosa epithelium. The MMP2 gene promoter polymorphism was genotyped by tetra-primer ARMS-PCR. Results: There are no significant differences in the frequency of individual alleles in different types of orofacial clefts. The occurrence of the CC genotype was significantly higher in the group with cleft lip and palate than in the healthy group (p = 0.005). Conclusion: Determining the polymorphism of matrix metalloproteinase gene promoter sequence can contribute to the elucidation of cleft lip/palate aetiopathogenesis.
Wstęp: Rozszczep wargi górnej i/lub podniebienia jest jedną z najczęściej występujących wad rozwojowych. W Polsce każdego roku przychodzi na świat około 500 dzieci z rozszczepem w okolicy twarzoczaszki. W proces tworzenia struktur twarzoczaszki zaangażowane są metaloproteinazy macierzy zewnątrzkomórkowej, odpowiedzialne za przebudowę i degradację podłoża łącznotkankowego. Polimorfizm w regionie promotorowym genu kodującego MMP2 może mieć wpływ na efektywność transkrypcji, a tym samym na aktywność produktu białkowego tego genu. Celem niniejszej pracy była ocena polimorfizmu 1306 C/T promotora genu MMP2 w grupie dzieci z rozszczepem wargi i/lub podniebienia oraz w grupie kontrolnej, a także ocena częstości występowania poszczególnych genotypów w różnych typach rozszczepów. Materiał i metoda: Badanie przeprowadzono w grupie 150 dzieci z rozpoznanym rozszczepem wargi i/lub podniebienia oraz w grupie 102 dzieci bez wady rozszczepowej twarzoczaszki. Genomowe DNA uzyskano z komórek nabłonkowych błony śluzowej jamy ustnej. Polimorfizm promotora genu MMP2 oznaczono metodą tetra-primer ARMS-PCR. Wyniki: Nie stwierdzono istotnych różnic w częstości występowania poszczególnych alleli w różnych typach rozszczepów. Częstość występowania genotypu CC w grupie dzieci z rozszczepem wargi i podniebienia była znacząco wyższa w porównaniu z grupą kontrolną (p = 0,005). Wniosek: Określenie polimorfizmu sekwencji promotorowych genów kodujących metaloproteinazy macierzy zewnątrzkomórkowej może przyczynić się do wyjaśnienia etiopatogenezy rozszczepu wargi i/lub podniebienia.
Źródło:: Pediatria i Medycyna Rodzinna; 2014, 10, 3; 306-314
1734-1531
2451-0742
Pojawia się w:: Pediatria i Medycyna Rodzinna
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 5.

Tytuł:: CEA-negative glioblastoma and melanoma cells are sensitive to cytosine deaminase/5-fluorocytosine therapy directed by the carcinoembryonic antigen promoter.
Autorzy:: Dąbrowska, Anna
Szary, Jarosław
Kowalczuk, Małgorzata
Szala, Stanisław
Ugorski, Maciej
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1041550.pdf
Data publikacji:: 2004
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: CEA promoter
E. coli cytosine deaminase
gene-directed enzyme prodrug therapy
Opis:: Recent studies have suggested that carcinoembryonic antigen (CEA)-promoter sequences are active only in CEA-positive cells, filing in the criteria for tumor specific targeting of suicide genes. However, the present study on gene therapy of colon cancer and cell-specificity of CEA promoter, provide evidence that CEA-positive and CEA-negative cells transfected with E. coli cytosine deaminase (CD) gene under the control of CEA promotor sequence are sensitive to enzyme/pro-drug therapy with 5-fluorocytosine (5-FC). Individual clones derived from the CEA-negative cell lines: melanoma Hs294T and glioblastoma T98G after transfection with CD differed profoundly in their sensitivity to 5-FC. The IC50 values for several clones of the CEA-negative cells were almost the same as for CEA-positive colon cancer cells. Such 5-FC-sensitive clones derived from the population of CEA-negative cells, present even in small number, because of the very effective bystender effect of this enzyme/pro-drug system can cause severe problems during therapy by efficiently killing surrounding normal cells. Safety is the major issue in gene therapy. Our data suggest that the safety of gene-directed enzyme pro-drug therapy (GDEPT) with CEA promoter driven expression of therapeutic genes is not so obvious as it has originally been claimed.
Źródło:: Acta Biochimica Polonica; 2004, 51, 3; 723-732
0001-527X
Pojawia się w:: Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 6.

Tytuł:: A common cis-element in promoters of protein synthesis and cell cycle genes
Autorzy:: Wyrwicz, Lucjan
Gaj, Paweł
Hoffmann, Marcin
Rychlewski, Leszek
Ostrowski, Jerzy
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1041116.pdf
Data publikacji:: 2007
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: gel shift assay
regulation of transcription
comparative genomics
gene expression
promoter
bioinformatics
Opis:: Gene promoters contain several classes of functional sequence elements (cis elements) recognized by protein agents, e.g. transcription factors and essential components of the transcription machinery. Here we describe a common DNA regulatory element (tandem TCTCGCGAGA motif) of human TATA-less promoters. A combination of bioinformatic and experimental methodology suggests that the element can be critical for expression of genes involved in enhanced protein synthesis and the G1/S transition in the cell cycle. The motif was identified in a substantial fraction of promoters of cell cycle genes, like cyclins (CCNC, CCNG1), as well as transcription regulators (TAF7, TAF13, KLF7, NCOA2), chromatin structure modulators (HDAC2, TAF6L), translation initiation factors (EIF5, EIF2S1, EIF4G2, EIF3S8, EIF4) and previously reported 18 ribosomal protein genes. Since the motif can define a subset of promoters with a distinct mechanism of activation involved in regulation of expression of about 5% of human genes, further investigation of this regulatory element is an emerging task.
Źródło:: Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 1; 89-98
0001-527X
Pojawia się w:: Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 7.

Tytuł:: Structural and functional characteristics of two novel members of pathogensis-related multigene family of class 10 from yellow lupine+
Autorzy:: Handschuh, Luiza
Femiak, Iwona
Kasperska, Alina
Figlerowicz, Marek
Sikorski, Michał
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1040870.pdf
Data publikacji:: 2007
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: pathogensis-related genes and proteins
gene silencing
salicylic acid
promoter analysis
yellow lupine
hydrogene peroxide
Opis:: PR-10 proteins (pathogensis-related), ubiquitous within the plant kingdom, are usually encoded by multigene families. To date we have identified 10 homologous pr-10 genes in a yellow lupine cDNA library. Here, the structure and expression of two newly identified yellow lupine pr-10 genes (LlYpr10-2b and LlYpr10-2f) are presented. Many potential regulatory sites were found in both gene promoters including common ones as well as those unique for each gene. However, promoter deletion analysis in transgenic tobacco plants revealed similar patterns of reporter gene (gus) expression. Shortened fragments of both gene promoters studied caused high GUS activity in leaves (along vascular bundles), stamen stigma, anthers and pollen grains. When conjugated with longer LlYpr-10.2 promoter fragments, GUS was additionally present in petal edges. Only a long fragment of the LlYpr10-2b gene promoter caused GUS expression in the stem. In yellow lupine the pr-10.2 genes are present in all studied organs, but their level of expression depends on the stage of development and is affected by wounding, oxidative stress and salicylic acid treatment. Silencing of the Llpr-10.2b gene in 4-week-old yellow lupine plants did not lead to any visible symptoms, which suggests that the function of the silenced gene is supplemented by its close homologues, still present in the studied plants.
Źródło:: Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 4; 783-796
0001-527X
Pojawia się w:: Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 8.

Tytuł:: Associations between bovine beta-lactoglobulin polymorphism within coding and regulatory sequences and milk performance traits
Autorzy:: Kaminski, S
Zabolewicz, T.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2043147.pdf
Data publikacji:: 2000
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: chromosome
polymorphism
promoter
haplotype
beta-lactoglobulin gene
mutation
cattle breeding
amino acid
milk
dairy cattle
protein content
Źródło:: Journal of Applied Genetics; 2000, 41, 2; 91-99
1234-1983
Pojawia się w:: Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 9.

Tytuł:: Cloning of the DNA fragments reflecting the open reading frame I and II of the I-18 C gene of Chironomus tentans. I. Preparation of the bacterial cells, transformation and isolation of the bluescript plasmid
Autorzy:: Borowicz, B P
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/66849.pdf
Data publikacji:: 1999
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: transformation
promoter system
gene expression
cloning
I-18 C gene
isolation
T7 RNA polymerase
plasmid
Chironomus tentans
bacterial cell
polymerase chain reaction
DNA fragment
Opis:: The technology applied for the cloning of the open reading frame (ORF) I and II reflecting DNA fragments of the I-18 C gene of Chironomus tentans in regard to the preparation of the competent E. coli cells of the XL-1 strain needed for the transformation with the ligation reaction products, is presented. Also the transformation of these bacterial cells with the bluescript plasmid and its isolation for these cloning experiments, are described.
Opisano technologię, którą zastosowano do klonowania fragmentów DNA odzwierciedlających translacyjną otwartą ramę odczytu I i II genu I-18 C Chironomus tentans w zakresie: przygotowania kompetentnych komórek E. coli szczepu XL-1, poddawanych następnie transformacji produktami reakcji ligacji. Przedstawiono także zastosowaną technologię transformacji wymienionych komórek bakteryjnych przy użyciu plazmidu - blueskrypt oraz izolację tego plazmidu, w celu jego zastosowania w wymienionych eksperymentach klonowania.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1999, 39, 1
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 10.

Tytuł:: Cloning and expression of the two DNA fragments of the I-18 C region of Chironomus tentans. II. The effects of the applied technology
Autorzy:: Borowicz, B P
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/66157.pdf
Data publikacji:: 1998
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: promoter system
cloning
I-18 C gene
T7 RNA polymerase
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
Opis:: The chromosomal I-18 C region of Chironomus tentans contains the I-18 C gene. Two different open reading frames (i.e. the ORF I and II) of two different transcripts (i.e. the 1.8 kb and 4.6 kb RNA) of the I-18 C gene of Chironomus tentans were isolated, at the DNA level, by the Polymerase Chain Reaction, then were cloned into the bluescript vector and finally were cloned into the pET-3a vector in order to translate them in T7 RNA polymerase / promoter system of E. coli. It was possible to obtain the ORF I overexpressed. In a case of the ORF II the low molecular weight polypeptide was detected, however it was not overexpressed, but still this polypeptide was strongly visible on the SDS-polyacrylamide gel.
Region chromosomalny I-18 C Chironomus tentans zawiera gen I-18 C. Dwie odrębne otwarte ramy odczytu (tj. ORF I i II) genu I-18 C Chironomus tentans zostały wyizolowane, na poziomie DNA, przy użyciu Reakcji Łańcuchowej Polimerazy (PCR), a następnie zostały wklonowane do wektora blueskrypt i ostatecznie zostały wklonowane do wektora pET-3a w celu ich translacji w systemie promotora T7 RNA polimerazy w E. coli. Uzyskano bardzo dużą ekspresję ORF I. W przypadku ORF II wykryto obecność polipeptydu o niskiej masie cząsteczkowej i chociaż nie uzyskano jego bardzo dużej ekspresji, tym niemniej polipeptyd ten był silnie widoczny w żelu poliakryloamidowym z SDS.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1998, 38, 1
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "gene promoter" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język