Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "ekspresja genow" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 27
Tytuł:
Biologia molekularna nerwiaków osłonkowych z uwzględnieniem zmian genetycznych i epigenetycznych
Autorzy:
Makuszewska, Maria
Litwiniuk-Kosmala, Małgorzata
Bartoszewicz, Robert
Niemczyk, Kazimierz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1399257.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Index Copernicus International
Tematy:
biologia molekularna
ekspresja genów
merlina
mikroRNA
nerwiak osłonkowy
Opis:
Wprowadzenie: Nerwiaki osłonkowe nerwu przedsionkowego (VS) są łagodnymi guzami rozwijającymi się z wytwarzających mielinę komórek Schwanna, otaczających gałązki przedsionkowe nerwu słuchowego. Ogromna większość z nich występuje sporadycznie, a niewielka część jest związana z neurofibromatozą typu 2 (NF2). Większość VS charakteryzuje się powolnym wzrostem, jednak niektóre: posiadają torbielowatą strukturę, wykazują szybkie tempo wzrostu, większą ilość porażeń nerwu twarzowego oraz mogą prowadzić do kompresji pnia mózgu. Inaktywacja genu supresorowego NF2, zwanego także genem merliny, jest uważana za główną przyczynę występowania VS, zarówno sporadycznych, jak i związanych z NF2. Cel: W poniższej pracy przedstawiamy obecny stan wiedzy na temat biologii molekularnej VS, w tym: informacje dotyczące aberracji genetycznych i epigenetycznych, zmiany ekspresji genów oraz specyficznych profili ekspresji mikroRNA.
Źródło:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny; 2020, 9, 3; 23-29
2084-5308
2300-7338
Pojawia się w:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Patogeneza przewlekłego zapalenia ucha środkowego z perlakiem w świetle badań wykorzystujących wysokoprzepustowe techniki biologii molekularnej
Autorzy:
Makuszewska, Maria
Bartoszewicz, Robert
Niemczyk, Kazimierz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1399672.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Index Copernicus International
Tematy:
analiza proteomiczna
biologia molekularna
ekspresja genów
mikromacierze
nabyty perlak
patogeneza
Opis:
Perlakiem określa się torbielowaty twór zbudowany z nabłonka wielowarstwowego płaskiego rogowaciejącego, wypełniony masami keratyny, otoczony zmienioną zapalnie tkanką łączną, rozrastający się w przestrzeniach ucha środkowego i niszczący okoliczne struktury kostne. W niniejszej publikacji przedstawiamy przegląd istniejących hipotez, wyjaśniających jego powstawanie w świetle nowych badań wykorzystujących wysokoprzepustowe techniki biologii molekularnej. Mimo istnienia licznych teorii, starających się wyjaśnić etiologię perlaka, takich jak: teoria migracji, metapalzji, wgłobienia, wrastania w głąb komórek warstwy podstawnej nabłonka, żadna z nich nie wyjaśnia w pełni wszystkich patologicznych procesów, do jakich dochodzi w tkance perlaka. Dotyczy to również nowych hipotez tłumaczących powstawanie perlaka nabytego mechanizmami, mającymi na celu ograniczenie stanu zapalnego, podobnymi do obserwowanych w obrębie jamy brzusznej, wpływem błony śluzowej ucha na przesuwanie się przylegającej kieszeni bądź mechanizmem gojenia ran, który uruchamiany byłby przez mikrouszkodzenia błony podstawnej nabłonka wyścielającego kieszeń retrakcyjną. Wprowadzenie nowych wysokoprzepustowych technik biologii molekularnej pozwoliło na ocenę zarówno całego genomu, jak i proteomu perlaka. Potwierdzają one w większości znane już wcześniej procesy patologiczne zachodzące w tkance perlaka, takie jak: wysoka aktywność proliferacyjna, zaburzenia sygnalizacji komórkowej, aktywna odpowiedź immunologiczna, zmiany w obrębie macierzy zewnątrzkomórkowej, wzrost ekspresji cytokin prozapalnych, neowaskularyzacja i wiele innych. Pozwalają również na bardzo dokładny i całościowy wgląd w mechanizmy molekularne tych procesów. Nadal jednak nie uzyskujemy odpowiedzi na pytania o przyczynę wywołującą hyperplazję nabłonka i zaburzenia migracji komórek nabłonkowych czy przyczynę utrzymywania się procesu zapalnego w obrębie istniejącej kieszeni retrakcyjnej.
Źródło:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny; 2019, 8, 3; 14-19
2084-5308
2300-7338
Pojawia się w:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Opracowanie metod globalnej analizy polimorfizmów w genomie buraka cukrowego
Development of methods for global analysis of polymorphisms in the genome of sugar beet
Autorzy:
Grzebelus, Dariusz
Machaj, Gabriela
Macko-Podgórni, Alicja
Kwolek, Kornelia
Barański, Rafał
Wesołowski, Wojciech
Wajdzik, Marcelina
Szlachtowska, Anna
Domnicz, Beata
Gierski, Przemysław
Szklarczyk, Marek
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199515.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
BNYVV
cytoplazmatyczna męska sterylność
ekspresja genów
genotypowanie
markery molekularne
rizomania
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 271-276
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analiza zmian w ekspresji genów cyklu komórkowego w komórkach osteoblastów hodowanych na powierzchniach stopów tytanu
Analysis of changes in cell cycle gene expression in osteoblasts cultured on the surfaces of titanium alloys
Autorzy:
Walkowiak-Przybyło, M.
Komorowski, P.
Jakubowski, W.
Klimek, L.
Walkowiak, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/970913.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie. Polskie Towarzystwo Biominerałów
Tematy:
stopy tytanu
osteoblasty
ekspresja genów
titanium alloy
osteoblasts
gene expression
Źródło:
Engineering of Biomaterials; 2012, 15, no. 116-117 spec. iss.; 46-48
1429-7248
Pojawia się w:
Engineering of Biomaterials
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja zmienności genetycznej pszenicy korelującej z potencjałem plonotwórczym i wybranymi cechami systemu korzeniowego
Identification of genetic variation of wheat correlating with grain yield and development of root system
Autorzy:
Nadolska-Orczyk, Anna
Barchacka, Karolina
Gasparis, Sebastian
Ogonowska, Hanna
Kała, Maciej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199464.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
aktywność enzymu CKX
ekspresja genów TaCKX
masa korzenia
produktywność
pszenica
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 21-25
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Probiotyki jako immunostymulatory w weterynarii i medycynie
Probiotics as immunostimulators in veterinary and human medicine
Autorzy:
Glinski, Z.
Grzegorczyk, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/860563.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Krajowa Izba Lekarsko-Weterynaryjna
Tematy:
weterynaria
medycyna
immunostymulatory
probiotyki
zastosowanie
ekspresja genow
synteza bialek
szlaki sygnalowe
pszczoly
Źródło:
Życie Weterynaryjne; 2017, 92, 12
0137-6810
Pojawia się w:
Życie Weterynaryjne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The induction of bcl-2 gene expression in human lymphocytes in vitro
Indukcja ekspresji genu bcl-2 w limfocytach czlowieka hodowanych in vitro
Autorzy:
Kocki, J
Rozynkowa, D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/68508.pdf
Data publikacji:
1994
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Genetyki Roślin PAN
Tematy:
gen bcl2
limfocyty
ekspresja genow
genetyka czlowieka
cykl komorkowy
hodowla in vitro
Źródło:
Genetica Polonica; 1994, 35, 1-2; 115-125
0016-6715
Pojawia się w:
Genetica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ ftalanu dibutylu (DBP) na poziom metylacji i ekspresji genu p53 w wątrobie szczurów Wistar
The effect of dibutyl phthalate (DBP) on the methylation and expression level of p53 gene in the liver of Wistar rats
Autorzy:
Urbanek-Olejnik, K
Liszewska, M
Kostka, G
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/872276.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego. Państwowy Zakład Higieny
Tematy:
ftalan dibutylu
dzialanie rakotworcze
toksycznosc
szczury
watroba
metylacja
ekspresja genow
gen p53
Opis:
Wprowadzenie. Indukowane niegenotoksycznymi kancerogenami (NGCs) zmiany metylacji DNA rozpatrywane są jako mechanizm ich toksycznego, w tym rakotwórczego działania. Cel badań. Celem podjętych badań była ocena statusu metylacji rejonu promotorowego i ekspresji genu p53 na poziomie mRNA oraz białka w wyniku oddziaływania ftalanu dibutylu (DBP). Badania zmierzały do oceny zależności pomiędzy ekspresją genu p53 a poziomem metylacji jego rejonu promotorowego. Materiał i metody. Samce szczurów szczepu Wistar otrzymywały DBP w dawce 1800 mg/kg m.c. x dzień-1 jednorazowo, 3-krotnie i 14-krotnie. Ocenę stopnia zmian metylacji badanych sekwencji CpG rejonu promotorowego genu p53 dokonano metodą MSRA (ang. Methylation-Sensitive Restriction Enzyme Analysis). Analizę względnego poziomu transkryptów badanego genu przeprowadzano metodą PCR w czasie rzeczywistym natomiast ocenę ekspresji genu na poziomie białka - techniką Western Blot. Wyniki. W wyniku oddziaływania DBP wykazano wzrost metylacji genu p53 po jednorazowym narażeniu zwierząt badanym związkiem. Nie stwierdzono bezpośredniej zależności pomiędzy poziomem ekspresji genu p53 a metylacją badanych sekwencji rejonu promotorowego genu p53. Obniżony poziom białka p53 obserwowano przez cały okres doświadczalny. Wnioski. Wykazano brak zależność pomiędzy poziomem ekspresji genu p53 a zmianami metylacji jego rejonu promotorowego. Obniżony poziom białka p53, był prawdopodobnie efektem represyjnego oddziaływania białka c-myc, uczestniczącego w tych samych szlakach transdukcji sygnału.
Background. Currently, nongenotoxic carcinogens-induced changes in DNA methylation profile are considered as mechanism of their toxicity, including carcinogenic action. Objective. The aim of the study was to determine the effect of dibutyl phthalate (DBP) on the methylation levels of the p53 promoter region, as well as mRNA and protein level of this gene. Material and method. Male Wistar rats received DBP in one, three or fourteen daily oral doses (at 24-h intervals) of 1800 mg/kg b.w. x day-1. The methylation level of c-myc gene was determined by PCR-based methylation sensitive restriction enzyme analysis (MSRA). The expression of gene was assessed by Real-Time PCR (at mRNA level) and Western blot (at protein level) analysis. Results. There was observed the hypermethylation of p53 promoter region after short (1 day) exposure of the animals to DBP. No correlation was found between mRNA expression and methylation level of p53 gene. The present study showed decreased level of p53 protein, during the whole period of study. Conclusions. No direct correlation was observed between the methylation and expression level of p53. The decreased protein level might be a consequence of the repressive effect of c-myc, which was involved in signal transduction pathways, the same as p53 protein.
Źródło:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny; 2012, 63, 4
0035-7715
Pojawia się w:
Roczniki Państwowego Zakładu Higieny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
An Extension of TSP-family Algorithms for Microarray Classification
Rozszerzenie metod z rodziny TSP w klasyfikacji mikromacierzy DNA
Autorzy:
Czajkowski, M.
Krętowski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/341039.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Politechnika Białostocka. Oficyna Wydawnicza Politechniki Białostockiej
Tematy:
klasyfikacja par genów zależnych
analiza mikromacierzy
reguły decyzyjne
ekspresja genów
pairwise classification
decision rules
microarray
gene expression
Opis:
Classification of microarray data and generation of simple and efficient decision rules may be successfully performed with Top Scoring Pair algorithms. TSP-family methods are based on pairwise comparisons of gene expression values. This paper presents a new method, referred as Linked TSP that extends previous approaches kˇTSP and Weight kˇTSP algorithms by linking top pairwise mRNA comparisons of gene expressions in different classes. Opposite to existing TSP-family classifiers, the proposed approach creates decision rules involving single genes that most frequently appeared in top scoring pairs. Motivation of this paper is to improve classification accuracy results and to extract simple, readily interpretable rules providing biological insight as to how classification is performed. Experimental validation was performed on several human microarray datasets and obtained results are promising.
Klasyfikacja danych mikromacierzowych a także późniejsza interpretacja reguł decyzyjnych może być skutecznie przeprowadzona za pomocą metod z rodziny Top Scoring Pair, polegających na analizie par genow o przeciwstawych poziomach ekspresji w róźnych klasach. W poniższym artykule zaprezentowano nową metodę: Linked TSP, ktora rozszerza działanie klasyfikatorów k-TSP i Weight k-TSP. W przeciwieństwie do algorytmow z rodziny TSP proponowane rozwiązanie tworzy reguły decyzyjne zbudowane z pojedynczych genów, co znacznie ułatwia ich późniejszą interpretację medyczną. W algorytmie wykorzystywane są pary genow uzyskane z algorytmow TSP z których następnie, wybierane są pojedyncze, najczęściej powtarzające się geny. Testy algorytmu Linked TSP przeprowadzone zostająy na rzeczywistych zbiorach danych pacjentow a uzyskane wyniki są obiecujące.
Źródło:
Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka; 2009, 4; 31-45
1644-0331
Pojawia się w:
Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Aktyna i miozyny w jądrze komórkowym
Actins and myosins in the nucleus
Autorzy:
Nowak, Jolanta
Rędowicz, Maria
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1033936.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tematy:
actin
gene expression
myosin
nucleus
nucleolus
polymerase
transcription
aktyna
ekspresja genów
miozyna
jądro
jąderko
polimeraza
transkrypcja
Opis:
Aktyna i miozyna to białka kojarzone przede wszystkim z ich kluczową rolą w generacji skurczu mięśni. Natomiast poza izoformami charakterystycznymi dla mięśni są również izoformy aktyny i miozyny, które występują we wszystkich typach komórek i tkanek (patrz artykuł Suszek i współaut. w tym zeszycie KOSMOSU). Badania prowadzone w ostatnich dwóch dekadach wykazały niezbicie, że zarówno aktyna (i szereg białek wiążących aktynę) oraz liczne miozyny (przedstawiciele rodzin I, II, V, VI, XVI i XVIII) lokalizują się w jądrze komórkowym gdzie są zaangażowane w procesy transkrypcji i naprawy DNA, transport w nukleoplazmie oraz import i eksport jądrowy, a także w utrzymywanie architektury jądra. Niniejszy artykuł opisuje dotychczasowy stan wiedzy o roli układu akto-miozynowego w jądrze komórkowym.
Actin and myosins are the proteins mainly known from their key roles in muscle contraction. However, besides typical muscle isoforms there are actins and myosins that are present in all cell and tissue types. Studies performed within the last two decades have irrefutably shown that both the cytoplasmic actin isoforms (along with numerous actin-binding proteins) as well as many myosins (representing class I, II, V, VI, XVI and XVIII) are present within the nucleus. They play important roles in nuclear processes as they are involved in transcription and DNA repair, intranuclear transport as well as nuclear import and export, and in maintenance of nuclear architecture. This article describes the current knowledge on the acto-myosin system in this biggest cellular compartment.
Źródło:
Kosmos; 2018, 67, 1; 75-93
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Przegląd badań nad regulacją ekspresji genów głównych odporności roślin na patogeny
Studies review of gene expression regulation of the plant major resistance genes against pathogens
Autorzy:
Świątek, Mariusz
Śliwka, Jadwiga
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198190.pdf
Data publikacji:
2011-12-29
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
ekspresja genów
geny R
odporność roślin
patogeny roślin
gene expression
plant pathogens
plant resistance
R genes
Opis:
Rośliny, podobnie jak zwierzęta, wykształciły wielopoziomowe mechanizmy obronne, które nadają im odporność na szkodniki i patogeny. Pierwotna odpowiedź obronna nie zawsze jednak zapewnia wystarczający poziom odporności na patogeny, które dysponują szerokim wachlarzem mechanizmów przystosowawczych. Inny typ odporności jest warunkowany przez geny główne odporności — geny R. Kodowane przez nie białka, pełniące rolę receptorów, oddziałują z produktami genów awirulencji patogenów i uruchamiają szlak transdukcji sygnału, który prowadzi do reakcji nadwrażliwości, co zapobiega szerzeniu się infekcji. W związku z wysokimi zdolnościami adaptacyjnymi patogenów, poszukuje się nowych genów odporności w dzikich gatunkach roślin, które zapewniłyby roślinom uprawnym trwałą odporność. Mimo dużej liczby zidentyfikowanych i sklonowanych genów R, badaniami ekspresji objęto jak dotąd niewiele z nich. Geny R, pomimo podobieństw budowy, wykazują różny wzór ekspresji pod wpływem działania czynników biotycznych i abiotycznych. Większość genów R ulega konstytutywnej ekspresji, lecz obserwowane są także przypadki wzmacniania lub indukcji ekspresji w wyniku kontaktu z patogenem. Badania molekularne dotyczące ekspresji genów R mogą mieć w niedalekiej przyszłości zastosowanie aplikacyjne w selekcji roślin do hodowli odpornościowej, na co wskazują wyniki dotychczasowych doświadczeń. Celem przeglądu jest usystematyzowanie informacji uzyskanych z dotychczasowych badań nad ekspresją genów odporności roślin na patogeny.
Plants, like animals, have developed multi-layered defense mechanisms that make them resistant to pests and pathogens. Innate basal defense response do not always provide a sufficient level of resistance to pathogens that use a wide range of adaptive mechanisms. Another type of resistance is that conferred by the major resistance genes — R genes. Proteins coded by those genes act as receptors that interact with the corresponding products of avirulence genes of the pathogens. They trigger then signal transduction pathway that leads to hypersensitive reaction, thus preventing the spreading of infection. Due to the high adaptability of pathogens, scientists are forced to search for new resistance genes in wild species of plants that would provide more durable resistance in crops. Despite the fact that the large number of R genes has been identified and cloned up to date, the expression surveys were performed only on a few of them. The R genes have structural similarities but often show different pattern of expression under the influence of biotic and abiotic factors. Most of the R genes are constitutively expressed, but there are also cases of enhancing or inducing the expression as a result of interaction with the pathogen. Molecular research including gene expression issue may have an application aspect in the near future in selection of plants for resistance breeding programs, as was demonstrated in the some experiments. The objective of this review is to pool the information obtained from previous studies on gene expression of plant resistance genes to pathogens.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 262; 89-101
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ toksycznego stężenia jonów Cu2+ na ekspresję genu MnSOD w roślinach pszenicy zwyczajnej, pszenżyta i żyta
The influence of toxic concentration of Cu2+ ions on the MnSOD gene expression in common wheat, triticale and rye plants
Autorzy:
Nowak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11236528.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:
pszenica zwyczajna
pszenzyto
zyto
stezenie jonow
toksycznosc
genetyka
stres abiotyczny
mitochondrialna manganowa dysmutaza ponadtlenkowa
ekspresja genow
Źródło:
Annales Universitatis Mariae Curie-Skłodowska. Sectio E. Agricultura; 2012, 67, 3; 31-38
0365-1118
Pojawia się w:
Annales Universitatis Mariae Curie-Skłodowska. Sectio E. Agricultura
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ chromu (III) na metabolizm kwasów tłuszczowych oraz ekspresję genów szlaku insulinowego w komórkach mięśniowych myszy linii C2C12
The effect of chromium (III) on fatty acid metabolism and insulin path related gene expression in mouse myocytes cell line C2C12
Autorzy:
Lewicki, S.
Rattman, D.
Kuryl, T.
Snochowski, M.
Debski, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/825955.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Technologów Żywności
Tematy:
chlorek chromu
chrom
czlowiek
ekspresja genow
jony chromu
komorki zwierzece
kwasy tluszczowe
metabolizm
miesnie
myszy
pikolinian chromu
zwierzeta
Opis:
Jony chromu (III) mają istotny wpływ na przemianę węglowodanowo-lipidową ludzi i zwierząt, powodując u chorych na cukrzycę wzrost wrażliwości komórek na insulinę, zwiększenie przemian kwasów tłuszczowych, spadek masy ciała i poziomu wolnych kwasów tłuszczowych w surowicy. Celem pracy było zbadanie działania chromu na proces beta-oksydacji kwasów tłuszczowych oraz zmiany ekspresji genów szlaku insulinowego w tkance mięśniowej. Do badań użyto mysich komórek mięśniowych linii C2C12 poddanych 4-dniowemu różnicowaniu. Chrom dodawano do medium w postaci chlorku lub pikolinianu chromu a aktywność β-oksydacji mierzono po 1, 3, 6 lub 48 godzinnej inkubacji. Suplementacja chromem w stężeniu 1 μgCr³⁺/L spowodowała wzrost (p < 0,001) aktywności procesu spalania kwasów tłuszczowych w 1, 3 godzinie inkubacji z pikolinianem oraz w 1, 3, i 6 godzinie inkubacji z chlorkiem chromu. Po 48 godzinnej inkubacji z jonami chromu obserwowano obniżenie aktywności tego procesu. Wpływ chlorku chromu 10 μgCr³⁺/L na ekspresję genów zaangażowanych w szlak przekazywania sygnału od insuliny określono z wykorzystaniem mikromacierzy SuperArray. Chrom po 4 godz. inkubacji spowodował wzrost ekspresji 22 genów natomiast po 24 godzinach wzrost dwóch i spadek ekspresji dwóch genów w porównaniu z kontrolą. Uzyskane wyniki wskazują na pozytywny wpływ suplementacji chromem na zwiększenie aktywności β-oksydacji. Dane uzyskane techniką mikromacierzy wskazują na interakcję jonów chromu ze szlakiem przewodzenia sygnału insulinowego również na poziomie transkrypcyjnym. Wzrost ekspresji genów związanych z metabolizmem lipidów i genów docelowych dla PPAR sugerują trwałe efekty wywołane przez jony chromu.
Chromium (III) ions influence significantly carbohydrate-lipid metabolism causing in diabetic subjects an optimalisation of insulin action, increase of lipid alteration, decrease body weight and free fatty acids plasma level. The aim of the present study was to describe changes in β-oxidation of fatty acids and gene expression following chromium supplementation. The experiments were performed in mouse myoblast C2C12 cell line over 4 days differentiation. Chromium was added to medium (DMEM), as chromium chloride (CrCl₃) or chromium picolinate, in 1 and 10 μgCr³⁺/L concentrations. Beta-oxidation of fatty acids activity was measured after 1, 3, 6, or 48 h. incubations. Introduction of chromium 1 μgCr³⁺/L to cell culture resulted intensification of fatty acids oxidation after 1 and 3 h (picolinate, p < 0,001) and 1, 3, and 6 h (chloride, p < 0,001) incubation. We observed higher stimulation effect along chromium chloride administration (about 50% of control value) than chromium picolinate (25% of control value). After 48h incubation decrease of fatty acids oxidation were noticed. The influence of chromium chloride (10 μgCr³⁺/L) supplementation on gene expression was examined using microarray SuperArray technique. Chromium added caused increase in 22 genes expression over 4h while only 2 increase and 2 decrease over 24h incubation in compare with control. The results in these studies showed positive effect of chromium supplementation on activity of β-oxidation. Results from microarray analysis indicate chromium interaction on signaling insulin pathway, also on transcription level. Increased expression of genes engaged in lipid metabolism and genes activated by peroxisome proliferator-activated receptor PPAR suggest permanent effect caused by chromium ions.
Źródło:
Żywność Nauka Technologia Jakość; 2009, 16, 4
1425-6959
Pojawia się w:
Żywność Nauka Technologia Jakość
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Data mining methods for gene selection on the basis of gene expression arrays
Autorzy:
Muszyński, M.
Osowski, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/329803.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
gene expression array
gene ranking
feature selection
clusterization measures
fusion
SVM classification
ekspresja genów
selekcja cech
klasyfikacja SVM
Opis:
The paper presents data mining methods applied to gene selection for recognition of a particular type of prostate cancer on the basis of gene expression arrays. Several chosen methods of gene selection, including the Fisher method, correlation of gene with a class, application of the support vector machine and statistical hypotheses, are compared on the basis of clustering measures. The results of applying these individual selection methods are combined together to identify the most often selected genes forming the required pattern, best associated with the cancerous cases. This resulting pattern of selected gene lists is treated as the input data to the classifier, performing the task of the final recognition of the patterns. The numerical results of the recognition of prostate cancer from normal (reference) cases using the selected genes and the support vector machine confirm the good performance of the proposed gene selection approach.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2014, 24, 3; 657-668
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of dynamics of gene exspression using singular value decomposition
Autorzy:
Simek, K.
Kimmel, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/332865.pdf
Data publikacji:
2002
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
wielokrotna ekspresja genów
dynamiczny model danych ekspresji genów
pojedynczy rozkład wartości
multiple gene expression
dynamic model of gene expression data
singular value decomposition
Opis:
Recently, data on multiple gene expression at sequential time points were analyzed, using Singular Value Decomposition (SVD) as a means to capture dominant trends, called characteristic modes, followed by fitting of a linear discrete-time dynamical model in which the expression values at a given time point are linear combinations of the values at a previous time point. We attempt to address several aspects of the method. To obtain the model we formulate a nonlinear optimization problem and present how to solve it numerically using standard MATLAB procedures. We use publicly available data to test the approach. Then, we investigate the sensitivity of the method to missing measurements and its possibilities to reconstruct missing data. Summarizing we point out that approximation of multiple gene expression data preceded by SVD provides some insight into the dynamics but may also lead to unexpected difficulties.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2002, 3; MI31-40
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 27

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies