Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "cell segmentation" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-7 z 7
Tytuł:
An improved diffusion driven watershed algorithm for image segmentation of cells
Autorzy:
Tarnawski, W.
Kurzyński, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333900.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
segmentacja obrazu
dyfuzja nieliniowa
segmentacja wododziałowa
wykrywanie komórek
image segmentation
nonlinear diffusion
watershed segmentation cell detection
Opis:
The image segmentation is one of the most crucial steps in automated analysis of medical and biological images. The segmentation process allows for a detection of object contours. Due to specificity of imaging technique, a correct detection of cell contours is problematic because of the fuzzy and broken edges. Moreover, the cells are very often connected. The modified watershed algorithm based on the diffusion model presented in this paper has been successfully applied to segmentation of cells where the mentioned difficulties appear. The method was tested in contact endoscopy, a novel technique in the diagnosis of the larynx.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2007, 11; 213-220
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Automatic segmentation of corneal endothelial cells using active contours
Automatyczna segmentacja komórek śródbłonka rogówki oka przy pomocy aktywnych konturów
Autorzy:
Charłampowicz, K.
Reska, D.
Bołdak, C.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1203409.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Politechnika Białostocka. Oficyna Wydawnicza Politechniki Białostockiej
Tematy:
przetwarzanie obrazów
segmentacja komórki
kontur aktywny
image processing
cell segmentation
active contour
Opis:
We present a new method for segmenting the corneal endothelial cells from microscopic images. It uses multiple active contours initialized by adaptive thresholding and limited with their growing to not overlap. Thanks to the inherent characteristics of the active contour both outcomes can be achieved: cell quantity and delimitation. The tool implementing this approach is built within the MESA framework - an environment for developing and evaluating segmentation techniques. The accuracy is estimated on the base of real microscopic cell images segmented manually.
W artykule zaprezentowano autorską automatyczną metodę segmentacji komórek śródbłonka rogówki oka z obrazów mikroskopowych. Metoda używa wielu aktywnych konturów zainicjalizowanych wewnątrz komórek za pomocą adaptacyjnego progowania i ograniczonych w swoim rozroście tak, aby nie pokrywać się. Metoda został zaimplementowana w środowisku MESA przeznaczonym do rozwoju i ewaluacji technik segmentacji. Jakość segmentacji została oszacowana na rzeczywistych obrazach mikroskopowych w odniesieniu do ręcznie zaznaczonych konturów komórek.
Źródło:
Advances in Computer Science Research; 2014, 11; 47-60
2300-715X
Pojawia się w:
Advances in Computer Science Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Bacilli bacterial cell image analysis using active contour segmentation with SVM classifier
Autorzy:
Bannigidad, Parashuram
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1062913.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
Active contour method
Bacillus
Bacillus subtilis
Bacterial cell image analysis
Cell classification
Cocobacilli
Diplobacilli
Palisades
SVM
Segmentation
Streptobacilli
Opis:
The main aim of the present study is to develop an automatic method to identify and classify the different cell types of bacilli bacterial cells in digital microscopic cell images using active contour method. Snakes, or active contours, are used widely in computer vision and machine learning applications, particularly to locate object boundaries. GLCM, HOG and LBP features are used to identify the arrangement of bacilli bacterial cells, namely, bacillus, cocobacilli, diplobacilli, palisades and streptobacilli using SVM classifier. The current methods rely on the subjective reading of profiles by a human expert based on the various manual staining methods. In this paper, it is proposed a method for bacilli bacterial cell classification by segmenting digital bacterial cell images using active contour model and extracting GLCM, HOG and LBP features. The experimental results proves that, the SVM classifier has yielded an overall accuracy of 97.2% with GLCM features, HOG features has yielded an accuracy of 74.8% and LBP features yielded 91.2% accuracy. The GLCM features with SVM classifier has got good classification results compared to HOG and LBP feature sets for bacilli bacteria cell types.
Źródło:
World Scientific News; 2019, 127, 3; 369-376
2392-2192
Pojawia się w:
World Scientific News
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Constructing software for analysis of neuron, glial and endothelial cell numbers and density in histological Nissl-stained rodent brain tissue
Autorzy:
Kołodziejczyk, A.
Ładniak, M.
Piórkowski, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333525.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
cell segmentation
cell-counting
image processing
image analysis
segmentacja komórki
zliczanie komórek
przetwarzanie obrazu
analiza obrazu
Opis:
Cell number, density and volume of white and gray matter in brain structures are not constant values. Cellular alterations in brain areas might coincide with neurological and psychiatric pathologies as well as with changes in brain functionality during selection experiments, pharmacological treatment or aging. Several softwares were created to facilitate quantitative analysis of brain tissues, however results obtained from these softwares require multiple manual settings making the computing process complex and time-consuming. This study attempts to establish half automated software for fast, ergonomic and an accurate analysis of cellular density, cell number and cellular surface in morphologically different brain areas: cerebral cortex, pond and cerebellum. Images of brain sections of bank voles stained with standard cresyl-violet technique (Nissl staining), were analyzed in designed software. Results were compared with other commercially available tools regarding number of steps to be done by user and number of parameters possible to measure.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2014, 23; 77-85
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Grafowa metoda segmentacji obiektów w postaci skupisk na przykładzie obrazów kometowych
Graph-based aggregate object image segmentation method on example of comet assay images
Autorzy:
Bal, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/154889.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich
Tematy:
analiza obrazów
obiekty w postaci skupisk
minimalne drzewo rozpinające
test kometowy
jednokomórkowa elektroforeza żelowa
image analysis
image segmentation
aggregate objects
minimum spanning tree
comet assay
single cell gel electrophoresis
Opis:
W pracy przedstawiono propozycję metody segmentacji obiektów będących skupiskami - przykładem takich obiektów są tzw. komety, które są wynikiem jednokomórkowej elektroforezy żelowej. Opracowana metoda działa dwuetapowo: etap 1. to segmentacja służąca wyznaczeniu elementów składowych należących do obiektów, etap 2 wykorzystuje minimalne drzewo rozpinające do określenia zbioru elementów tworzących poszczególne obiekty, obszar poszczególnych obiektów wyznaczany jest jako otoczka wypukła odpowiedniego drzewa rozpinającego.
This paper deals with a problem of segmentation of aggregate objects, that is objects which are formed by a set of unconnected elements smaller than the object itself. Images of such a type of objects are very difficult for segmentation. An example of this type of objects are "comets" (Fig. 1, left column) from Single Cell Gel Electrophoresis images (also called comet assay images). In comet assay images the comet region is formed by unconnected fragments of DNA. Because of not satisfying results of comet segmentation with use of the standard methods, a new method for segmentation of such images was developed. The new method works in two stages. The first stage is the image segmentation-for comets the Bernsen binarization method (Eqs. (1) and (2)) with median filtering of the obtained results was chosen-the result of this stage is a set of comet elements ei which represent DNA fragments (Fig. 1, the 2nd column). In the second stage the minimum spanning trees Tp are created (Fig. 1, 3th column)-graph vertexes vi represent elements ei, and length dij of edge eij between vertexes vi and vj is equal to the closest distance between pixels of elements ei and ej-then for each connected tree Tp its convex hull which defines the region of comet Kp (Fig. 1, the 4th column) is created. In case of defects appearing in comet images, the incorrect region can be rejected e.g. by use of geometrical or photometrical features of the regions.
Źródło:
Pomiary Automatyka Kontrola; 2012, R. 58, nr 4, 4; 313-315
0032-4140
Pojawia się w:
Pomiary Automatyka Kontrola
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Selected aspects of corneal endothelial segmentation quality
Autorzy:
Piorkowski, A.
Nurzynska, K.
Boldak, C.
Reska, D.
Gronkowska-Serafin, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333738.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
corneal endothelial
cell segmentation
binarization
śródbłonek rogówki
segmentacja komórki
binaryzacja
Opis:
The number and shape of cells in endothelium layer is highly correlated with the quality of vision. Therefore, its precise and automatic description plays an important role in medicine. This work presents several aspects of image processing of endothelium layer acquired by specular microscope. The comparison of cell selection accuracy is discussed using two different approaches to solve this problem: convolution filtering methods, and snake-based method. Moreover, for verification results generated by dedicated software, supplied with the microscope, were utilized. Next, the precise segmentation method is applied to improve the segmentation. The results are inspected visually, but also CV, H, and CVSL parameters, used in medicine, are calculated. The research concludes that general visual outcomes achieved by all segmentation approaches give similar results, however deep insight into cell outline position reveals some differences, which were partially removed after precise segmentation application. The analysis of parameter values show high stability of CV and CVSL parameters.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2015, 24; 155-163
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Selected issues of corneal endothelial image segmentation
Autorzy:
Piórkowski, A.
Gronkowska-Serafin, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333407.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
śródbłonek rogówki
segmentacja komórki
binaryzacja
corneal endothelial
cell segmentation
binarization
Opis:
This article concerns the analysis of corneal endothelial image. The basic problems of binarization and segmentation of these images are discussed. Preprocessing methods are proposed, consisting of median and convolution filtration, to remove noise. An algorithm of normalization of the average brightness of the vertical and horizontal is presented. The problem of binarization is discussed. At the end the proposal of segmentation algorithm is reported.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2011, 17; 239-245
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-7 z 7

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies