Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "SNP genotyping" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-3 z 3
Tytuł:
Nowoczesne metody genotypowania DArT i GBS w hodowli gatunków roślin użytkowych
Modern methods of genotyping DArT and GBS in agriculture important crops
Autorzy:
Pachota, Katarzyna
Niedziela, Agnieszka
Orłowska, Renata
Bednarek, Piotr T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199126.pdf
Data publikacji:
2016-06-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
genotypowanie
DArT
Technika Diversity Array
GBS
SNP
genotyping
Diversity Array Technology
Genotyping-by-sequencing
Opis:
Rozwój nowoczesnych metod genotypowania sprawił, że konieczne staje się ich zaprezentowanie i pokazanie potencjału, jaki niosą generowane przez nie markery DNA dla badań nad roślinami. Niniejsza praca została poświęcona omówieniu markerów DArT i SNP, przy czym w ostatnim przypadku skupiono się na markerach wykorzystujących sekwencjonowanie nowej generacji. Przedstawiono metody uzyskania w/w markerów oraz ich zastosowania w genetyce roślin użytkowych. Nacisk położono na identyfikację markerów cech użytkowych w połączeniu z mapowaniem cech ilościowych, mapowaniem asocjacyjnym i selekcją genomową.
Advances in modern genotyping methods make it necessary to present them and their value for plant research. Thus, the review is dedicated to describing technologies allowing evaluation of high throughput markers such as DArTs or SNPs based on new generation sequencing approach. Various applications of these markers in plant research are discussed. Particular emphasis was put on the possibilities of using them for the identification of markers for agronomical traits using either QTL or association mapping methods. The opportunity of using them in genomic selection was also discussed.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2016, 279; 3-18
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Markery molekularne w badaniach rzepaku (Brassica napus L.). I. Przegląd stosowanych technik
Molecular markers for study of oilseed rape (Brassica napus L.) I. The review of marker techniques
Autorzy:
Matuszczak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833585.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
markery genetyczne
markery molekularne
genotypowanie
hodowla roslin
metody wykrywania
markery izoenzymatyczne
markery RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
markery RAPD
markery AFLP-RGA
markery AFLP
markery DArT
mikrosatelity
markery ISSR
markery ACGM
markery SCAR
markery CAPS
markery SNP
rape
genetic marker
molecular marker
genotyping
plant breeding
detection method
isoenzyme marker
RFLP marker
polymerase chain reaction
RAPD marker
AFLP-RGA marker
AFLP marker
DArT marker
microsatellite
ISSR marker
ACGM marker
SCAR marker
CAPS marker
SNP marker
Opis:
Współczesna biologia molekularna dostarcza wciąż nowych metod pozwalających na opracowywanie markerów genetycznych, w tym przede wszystkim markerów molekularnych (markerów DNA). Znajdują one zastosowanie w różnych badaniach dotyczących rzepaku. Ich wykorzystanie w hodowli znacznie przyspiesza uzyskiwanie nowych odmian. Markery molekularne umożliwiają postęp w badaniach genomu. Istotne jest także znaczenie markerów molekularnych w badaniach pokrewieństwa oraz identyfikacji odmian. W pracy dokonano przeglądu technik poszukiwania markerów, które już znalazły lub mogą znaleźć zastosowanie w badaniach nad rzepakiem. Omówiono zarówno metody, które były stosowane na wczesnym etapie rozwoju tej dziedziny, jak i te, które stosowane są obecnie. Zasygnalizowano także prawdopodobne kierunki rozwoju nowych technologii dla pozyskiwania markerów w przyszłości.
Modern molecular biology is the continuous source of new techniques that can be applied to obtain genetic markers, including, first of all, molecular (DNA) markers. Such markers are widely used for study of oilseed rape. Their application in breeding can speed up the formation of new varieties. Molecular markers can generate the progress in study of various genomes. There are many cases of their use for relationship analysis or variety identification. The review of marker techniques, both those already applied and as yet not applied for study on oilseed rape, is presented here. In this review past and present methods are described according to the sequence of their invention and use. The prospects of new technologies that may be used for marker development in the near future are also mentioned.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 2
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analysis of susceptibility loci for juvenile idiopathic arthritis in the extended MHC region using high resolution SNP and HLA allele typing
Autorzy:
Biesiada, J.
Sudman, M.
Wagner, M.
Rupert, A.
Hollenbach, J.
Haas, J. P.
Meller, J.
Thompson, S. D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1935824.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
HLA
MHC region
autoimmunology
Juvenile Idiopathic Arthritis
HLA independent association
SNP genotyping
HLA alleles
Opis:
Juvenile idiopathic arthritis ( JIA ) spans several pediatric arthropathies that involve autoimmune responses. Primary genetic risk factors for JIA have been mapped to Major Histocompatibility Complex ( MHC ) class I and class II genes. Recent genome-wide association studies using SNP arrays have shown that the nonHLA genetic component of JIA involves multiple low-risk loci, reinforcing the notion that JIA is a complex genetic trait with a strong HLA component. In this work, with the goal of detailed mapping and analysis of lin kage disequilibrium ( LD ) patterns and associations with JIA in the extended MHC (x MHC ) region, we combined SNP data from Affymetrix SNP Array 6.0 and Immunochip ( IC ) platforms with high resolution typing of 8 classical HLA genes. A cohort of about 800 affected individuals and about 500 ethnically matched controls from the Cincinnati region, as well as secondary validation cohorts of affected individuals and matched controls from Germany were used to perform the analysis, and to assess reproducibility of the results across different platforms and p opulations. Accurate high resolution maps of linkage with classical HLA genes and association with individual HLA alleles were generated. High concordance of results obtained using Affymetrix SNP Array 6.0 and IC was observed, with an additional resolution and improved mapping of associat ions provided by the latter in some regions. Several new peaks of statistically signific ant and reproducible association with JIA outside the regions of strong LD with classical HLA genes were observed, including one peak in the class III region, and one in the telomeric end of x MHC . Conditional analysis provided further evidence that these associations appear to be independent of classical HLA genes studied here. The results and observed association patterns are further discussed in the context of other recent studies on autoimmune diseases, including the role of HLA DRB 1 in adult Rheumatoid Arthritis.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2014, 18, 4; 305--320
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-3 z 3

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies