Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "RAPD-PCR" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-13 z 13
Tytuł:
Molecular Diagnostic of Streptococcus thermophilus
Diagnostyka molekularna Streptococcus thermophilus
Autorzy:
Vanatkova, Z.
Okenkova, E.
Bunkova, L.
Drab, V.
Hrabe, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/388393.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Towarzystwo Chemii i Inżynierii Ekologicznej
Tematy:
Streptococcus thermophilus
PCR
RAPD
SDS-PAGE
Opis:
Streptococcus thermophilus is one of the most important lactic acid bacteria in the dairy industry. Despite the wide use of Streptococcus thermophilus in the industry, data on the phenotypic and genetic strain variations within the species are still limited. Genetic techniques are very useful for molecular discrimination of complex mixtures of starter and probiotic cultures in research laboratories. Detection and identification of various lactic acid bacteria species with rapid methods is often important for quality control of dairy products. This work deals with characterization and differentiation of strains Streptococcus thermophilus by PCR, RAPD and SDS-PAGE techniques. Fifteen strains of Streptococcus thermophilus from Czech Collection of Dairy Microorganisms (CCDM) and a strain of Streptococcus thermophilus from Czech Collection of Microorganisms (CCM) were used. Particular strains were confirmed with primer set THI/THII by PCR method. Consequently, their identities were examined by RAPD and SDS-PAGE techniques. Whereas, primers OPP-7 and RAPD-4, RAPD were used. It can be claimed that mentioned methods are good means for identification and characterization of streptococci.
Streptococcus thermofilus jest jednym z najważniejszych przedstawicieli bakterii kwasu mlekowego. Pomimo powszechnego zastosowania tego gatunku w przemyśle mleczarskim nadal nieliczne są dane na temat jego zróżnicowania fenotypowego i genetycznego Streptococcus thermofilus. Szybka identyfikacja różnych gatunków bakterii kwasu mlekowego ma duże znaczenie dla kontroli jakości produktów mleczarskich. Niniejsza praca dotyczy charakterystyk i różnic występujących między różnymi liniami Streptococcus thermofilus. Badania zostały przeprowadzone przy użyciu technik PCR, RAPD i SDS-PAGE. Do badań użyto 15 linii Streptococcus thermofilus z Czeskiego Zbioru Mikroorganizmów Mleczarskich oraz jednej linii Streptococcus thermofilus z Czeskiego Zbioru Mikroorganizmów. Dokonano porównania primerów THI/THII między poszczególnymi liniami bakterii za pomocą techniki PCR. Następnie próbki były badane i identyfikowane przy użyciu technik RAPD i SDS-PAGE. Natomiast primery OPP-7 i RAPD-4 zbadano techniką RAPD. Badania wykazały, że zastosowane techniki mogą być skutecznie wykorzystywane do identyfikacji i charakterystyki bakterii z rodzaju Streptococcus.
Źródło:
Ecological Chemistry and Engineering. A; 2009, 16, 12; 1627-1635
1898-6188
2084-4530
Pojawia się w:
Ecological Chemistry and Engineering. A
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Diversity of Armillaria ostoyae in Scots pine plantations in Poland
Autorzy:
Szewczyk, W.
Kwasna, H.
Bocianowski, J.
Behnke-Borowczyk, J.
Ratajczak, A.
Swietlik, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41365.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Dendrologii PAN
Tematy:
diversity
Armillaria ostoyae
Scotch pine
plantation
RAPD-PCR method
rhizomorph
Polska
Opis:
Incidence of Armillaria root disease and the population structure of associated Armillaria spp. were studied in 5-17-year-old Scots pine plantations in west-central Poland. Two infection centres (1.14– 9.30 ha) in each of three forest districts (Siemianice, Zielonka and Złotów) were intensively sampled. Root collars were examined for mycelial fans, decayed wood, and rhizomorphs. Twenty two isolates of Armillaria ostoyae collected from epiphytic rhizomorphs from 20 living and two dead trees in the six infection centres were identified with somatic incompatibility group. Only one somatic incompatibility group for A. ostoyae was found. Twenty one isolates produced rhizomorphs on oak-wood discs submerged in a sand-forest soil substrate. Isolates from Siemianice formed the smallest rhizomorph networks and those from Złotów the most abundant. There were 16 different genets among 22 isolates of A. ostoyae distinguished by RAPD analysis. Genetic similarity among genets was 25.6–97.5%. The large diversity in A. ostoyae suggests that sexual reproduction may occur in nature more often than expected.
Źródło:
Dendrobiology; 2014, 72
1641-1307
Pojawia się w:
Dendrobiology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie markerow DNA [RAPD, SSR, PCR-RFLP i STS] w genetyce drzew lesnych, entomologii, fitopatologii i lowiectwie
Molecular markers [RAPD, SSR, PCR-RFLP and STS] in forest-tree genetics, entomology, phytopathology and game management
Autorzy:
Nowakowska, J.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45939.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
lowiectwo
zastosowanie
genetyka roslin
markery genetyczne
entomologia lesna
metody badan
genetyka zwierzat
lesnictwo
zwierzeta lowne
metoda SSR
metoda RAPD
metoda PCR-RFLP
metoda STS
drzewa lesne
fitopatologia lesna
DNA
Źródło:
Leśne Prace Badawcze; 2006, 1; 73-101
1732-9442
2082-8926
Pojawia się w:
Leśne Prace Badawcze
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody oparte o amplifikację DNA techniką PCR wykorzystywane w ocenie bioróżnorodności mikroorganizmów glebowych
Methods based on DNA PCR-amplification for evaluation of the soil microbial diversity
Autorzy:
Łyszcz, Małgorzata
Gałązka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1034148.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tematy:
soil microorganism
genetic diversity
molecular markers
PCR based methods
ARDRA
PCR-RFLP
RAPD
REP-PCR
TRFLP
Opis:
Mikroorganizmy glebowe, pod względem cech genomowych i fenotypowych, stanowią wysoce zróżnicowaną grupę organizmów żywych. Z powodu tak dużej różnorodności ważne jest dobranie odpowiednich metod, dających największy stopień różnicowania mikroorganizmów. Narzędziami umożliwiającym analizę zmienności genetycznej mikroorganizmów są techniki genetyczne, a wśród nich jedną z najważniejszych jest łańcuchowa reakcja polimerazy, czyli PCR (Polymerase Chain Reaction), technika opracowana w latach 1980. Niniejsza praca stanowi przegląd podstawowych zagadnień dotyczących badania zmienności genetycznej mikroorganizmów glebowych w oparciu o markery molekularne z wykorzystaniem technik bazujących na reakcji PCR tj. PCR-RFLP, TRFLP, ARDRA, RAPD.
Soil microorganisms represent a highly diverse group of living organisms in terms of genomic and phenotypic characteristics. Due to such a large diversity, it is important to select appropriate identification methods which would secure its most complete determination. Genetic techniques are proper tools of choice for analyzing genetic variability of microorganism, the most important of which is the polymerase chain reaction (PCR), developed in the 1980s. This work presents an overview of the basic issues concerning studies on genetic variability of soil microorganisms with help of molecular markers and application of PCR techniques such as PCR-RFLP, TRFLP, ARDRA, RAPD.
Źródło:
Kosmos; 2017, 66, 2; 193-206
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne i immunologiczne stosowane w diagnostyce grzybic
Molecular and immunological methods applied in diagnosis of mycoses
Autorzy:
Kuba, K
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/841048.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
diagnostyka lekarska
diagnostyka molekularna
metody diagnostyczne
diagnostyka immunologiczna
metody molekularne
metoda nested-PCR
testy serologiczne
metoda EIA
metoda RT-PCR
metoda RAPD
markery molekularne
metoda RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
metoda AFLP
metody immunologiczne
grzybice
Źródło:
Annals of Parasitology; 2008, 54, 3; 187-197
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne i immunologiczne stosowane w diagnostyce grzybic
Molecular and immunological methods applied in diagnosis of mycoses
Autorzy:
Kuba, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2143775.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
diagnostyka lekarska
diagnostyka molekularna
metody diagnostyczne
diagnostyka immunologiczna
metody molekularne
metoda nested-PCR
testy serologiczne
metoda EIA
metoda RT-PCR
metoda RAPD
markery molekularne
metoda RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
metoda AFLP
metody immunologiczne
grzybice
Opis:
The diagnosis of fungal infections remains a problem for the management of fungal diseases, particularly in the immunocompromised patients. Systemic Candida infections and invasive aspergillosis can be a serious problem for individuals who need intensive care. Traditional methods used for the identification and typing of medically important fungi, such as morphological and biochemical analysis, are time−consuming. For the diagnosis of mycoses caused by pathogenic fungi faster and more specific methods, especially after the dramatic increase in nosocomial invasive mycoses are needed. New diagnostic tools to detect circulating fungal antigens in biological fluids and PCR−based methods to detect species or genus−specific DNA or RNA have been developed. Antigen detection is limited to searching only one genus. Molecular genetic methods, especially PCR analysis, are becoming increasingly important as a part of diagnostics in the clinical mycology laboratory. Various modifications of the PCR method are used to detect DNA in clinical material, particularly multiple, nested and real−time PCR. Molecular methods may be used to detection of nucleic acids of fungi in clinical samples, to identify fungal cultures at the species level or to evaluate strain heterogeneity differences within the species. This article reviews some of the recent advances in the possibility of molecular diagnosis of fungal infections.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2008, 54, 3; 187-197
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Characteristics of selected molecular methods used in identification and assessment of genetic diversity of bacteria belonging to the genus Azotobacter
Autorzy:
Kozieł, Monika
Gałązka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2147979.pdf
Data publikacji:
2019-09-30
Wydawca:
Instytut Uprawy Nawożenia i Gleboznawstwa – Państwowy Instytut Badawczy
Tematy:
Azotobacter
ITS PCR
16S rRNA gen
PCR MP
RAPD
ARDRA
Opis:
Modern molecular techniques have greatly increased our knowledge concerning phylogenetic and functional diversity of microorganisms inhabiting the soil environment. Soil ecosys-tem is relatively complex with a high level of microbiologically diversity. The application of traditional culture-based techniques dose not reflect the total diversity of microbial community in-habiting in soil environment. On the other hand commonly used molecular methods allow for quick and accurate identification and evaluation of the genetic diversity of microorganisms in-habiting this environment. Free-living bacteria belonging to the genus Azotobacter commonly occurring in soil. Azotobacter spp. are the subject of many studies conducted both in Poland and in the world. The interest in these bacteria is largely related to their properties very useful for agriculture. Owing to their capability of fixing atmospheric nitrogen and making it available to plants and production of plant growth promotion and fungicidal substances, they are used in the production of soil bacterial inoculants. In addition, these bacteria are an excellent indicator of soil fertil-ity, which is why they are often used as test microorganisms in many studies. The paper presents an overview of molecular mi-crobiological techniques used to identify and evaluate the genetic diversity of Azotobacter spp. in studies conducted both in Poland and across the world. The ITS PCR, PCR-RFLP methods and 16S rRNA gene amplification are used to identify bacteria of the ge-nus Azotobacter, and PCR MP, RAPD PCR and ARDRA are used to assess the genetic diversity of these microorganisms.
Źródło:
Polish Journal of Agronomy; 2019, 38; 37-45
2081-2787
Pojawia się w:
Polish Journal of Agronomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Genetic diversity of F1 and F2 interspecific hybrids between dwarf birch (Betula nana L.) and Himalayan birch (B. utilis var. jacquemontii (Spach) Winkl. 'Doorenbos') using RAPD-PCR markers and ploidy analysis
Autorzy:
Czernicka, Małgorzata
Pławiak, Jarosław
Muras, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039274.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Betula nana
Betula utilis 'Doorenbos'
interspecific hybrids
ploidy analysis
RAPD-PCR
Opis:
Crosses between Betula nana and B. utilis 'Doorenbos' were undertaken in order to obtain interspecific hybrids which could be characterized by wide spreading stems, strong branching habit, decorative clear white bark and an interesting shape of purple leaves. The research purpose was to examine genetic diversity of the 16 F1 and F2 putative progenies by using the RAPD-PCR method and the ploidy analysis. A total of 242 RAPD markers were scored with 24 primers and 220 (90.9%) polymorphic bands were found. In the NJ dendrogram, cluster I consisted of the female parent - B. nana and 12 hybrids and cluster II grouped the male parent - B. utilis 'Doorenbos' with 4 hybrids (F2/2, F1/8, F1/7 and F2/1). The 2-D scaling by PCoA was in agreement with the similarity index, i.e. two hybrids (F1/8, F2/2) grouped with the male parent while others with female parent. Classification of the hybrid plants by chromosome counting demonstrated that 13 hybrids were confirmed with accurate chromosome counts as being diploid (2n=2x=28) and 3 plants (F1/7, F1/8, F2/2) as triploid with 42 chromosomes.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 2; 195-199
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Malus x oxysepala (M. domestica Borkh. x M. sylvestris Mill.) - a new spontaneous apple hybrid
Autorzy:
Czarna, A.
Nowinska, R.
Gawronska, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/58374.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
Malus x oxysepala
Malus domestica
Malus sylvestris
new hybrid
spontaneous hybrid
apple hybrid
hybrid
taxonomy
genetic similarity
RAPD-PCR method
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2013, 82, 2
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Podobieństwo genetyczne różnych populacji lucerny siewnej (Medicago sativa L. sl.) a ich potencjał plonowania
Genetic similarity of various populations of alfalfa (Medicago sativa L. sl.) and their seed yield potential
Autorzy:
Broda, Zbigniew
Dobrzycka, Agnieszka
Bocianowski, Jan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42798588.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
lucerna
plon nasion
RAPD-PCR
alfalfa
seed yield
Opis:
Dla 16 zróżnicowanych genotypowo populacji lucerny siewnej przeprowadzono obserwacje wybranych cech składających się na plon nasion, takich jak liczba strąków w owocostanie, liczba nasion w strąku, plon nasion z owocostanu oraz płodność. Dla tych samych 16 populacji wykonano w dwóch powtórzeniach analizę podobieństwa genetycznego z wykorzystaniem markerów RAPD. Do analiz użyto DNA izolowanego dwiema metodami (pierwsza — metoda Thomsona-Henry’ego oraz druga — metoda kolumienkowa) w celu zaobserwowania różnic w wynikach obu analiz. Dendrogramy podobieństwa otrzymane w wyniku obu analiz wyraźnie się różniły. W pierwszej serii markerów RAPD na dendrogramie podobieństwa wyróżniono 4 grupy, a w drugiej 5 grup podobieństwa genetycznego. Następnie wykonano analizę wariancji w celu sprawdzenia, czy zmienność obserwowanych cech jest większa pomiędzy, czy w obrębie grup podobieństwa.
Several traits affecting seed yield were observed in 16 genetically differentiated populations of alfalfa. The analyzed traits included number of pods per infrutescence, number of seeds per pod, seed yield per infrutescence and fertility. An analysis of genetic similarity was carried out for the populations using RAPD markers, in two series. For the first series the DNA was isolated using the Thomson-Henry’s method and for the other series – with the column method. The dendrograms of genetic similarity varied for both methods and included four and five groups of similarity, respectively. Variability of the observed traits was compared between and within the similarity groups using analysis of variance.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 252; 301-313
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
Characteristic of selected molecular markers
Autorzy:
Bolc, Paulina
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
Data publikacji:
2020-10-22
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery molekularne
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
ISSR
SRAP
SNP
PCR
polimorfizm
różnorodność genetyczna
molecular markers
polymorphism
genetic diversity
Opis:
Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The relationship between RAPD marker-by-marker interactions and quantitative traits of caraway (Carum carvi L.)
Autorzy:
Bocianowski, J.
Seidler-Łożykowska, K.
Nowosad, K.
Kuczyńska, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/12681131.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:
plant cultivation
caraway
Carum carvi
herbal plant
spice plant
quantitative trait
molecular marker
RAPD marker
RAPD-PCR reaction
Opis:
Application of molecular markers makes the selection process much more effective. Marker assisted selection is an important tool for plant breeders to increase the efficiency of a breeding process, especially for multigenic traits, highly influenced by the environment. Epistasis is the interaction between alleles from two or more loci determining the complex traits, and thus plays an important role in the development of quantitative traits of crops. In this paper, the relationships between RAPD marker-by-marker interactions and 22 quantitative traits of caraway (Carum carvi L.) were analyzed. Significant associations of 116 epistatic markers with at least one trait in 2004 as well as 112 in 2005 were found on the basis of multivariate regression analysis. The proportion of total phenotypic variances of individual trait explained by the marker-by-marker interactions ranged from 25.3% to 96.0%.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2019, 18, 3; 53-69
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Differentiation by random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) of Candida albicans isolated from upper respiratory tract in patients with non-small cell lung cancer
Autorzy:
Biernasiuk, Anna
Korona-Głowniak, Izabela
Grzegorczyk, Agnieszka
Malm, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039202.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
RAPD-PCR
Candida albicans
upper respiratory tract
genetic diversity
Opis:
Cancer patients are predisposed to fungal infections caused by Candida albicans, especially to oral or respiratory tract candidiasis. The aim of this study was to estimate genetic diversity by RAPD-PCR (random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction) of C. albicans isolated from upper respiratory tract of 100 patients with non-small cell lung cancer. Among 52 strains, 34 genotypes were defined. 10 clusters comprising 28 (53.85%) isolates with similarity coefficient ≥ 80% were formed. The remaining 24 (46.15%) isolates represented individual genotypes. The RAPD-PCR technique revealed genomic variability within C. albicans isolated from upper respiratory tract of the cancer patients.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 4; 727-729
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-13 z 13

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies