Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "RAPD markers" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-8 z 8
Tytuł:
Zmienność genetyczna cisa w wybranych rezerwatach Polski
Genetic variability of yew in the selected Polish nature reserves
Autorzy:
Nawrocka-Grześkowiak, U.
Skuza, L.
Szucko, I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/989813.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
lesnictwo
drzewa lesne
cis pospolity
Taxus baccata
zmiennosc genetyczna
rezerwaty przyrody
populacje roslin
zroznicowanie genetyczne
markery genetyczne
markery RAPD
genetic diversity
molecular markers
taxus baccata
nature reserv
Opis:
Genetic variability of yew (Taxus baccata L.) trees in seven nature reserves (Jasień, Czarne Człuchowskie, Choczewo, Wierzchlas, Wirty, Rokita and Mogilno/Stary Sącz) in Poland was investigated by RAPD methods. The results showed high genetic differences between populations ranging from 22.7% among the population of Stary Sącz and hedge (+) to 86.1% between Wierzchlas and Rokita (+). Based on the results of RAPD analyses, the studied populations were divided into three groups of similarity. The first include Jasień and Choczewo the populations, the second Rokita (+), hedge (–) and Stary Sącz, and the third remaining populations. High level of genetic diversity was showed among the studied populations, is essential to the adaptability of the population of yew. This theoretically increases the chances of survival species thanks to the possibility of passing to preferred combinations of genes to the future generations.
Źródło:
Sylwan; 2015, 159, 06; 491-497
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod RAPD i ISSR do oceny podobieństwa genetycznego greckich form Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy
Application of RAPD and ISSR methods to genetic similarity estimation of Greek Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy populations
Autorzy:
Grądzielewska, Agnieszka
Paczos-Grzęda, Edyta
Gruszecka, Daniela
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42809908.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
Dasypyrum
ISSR
RAPD
markery molekularne
podobieństwo genetyczne
genetic similarity
molecular markers
Opis:
W pracy przeprowadzono ocenę podobieństwa genetycznego 9 greckich form Dasypyrum villosum L. (P.) Candargy pochodzących z trzech regionów Grecji (Tesalii oraz Zachodniej i Środkowej Macedonii) na podstawie polimorfizmu markerów RAPD i ISSR. Analizę podobieństwa genetycznego przeprowadzono z wykorzystaniem 18 wyselekcjonowanych starterów RAPD i 17 starterów ISSR. Ogółem otrzymano 122 fragmenty RAPD i 210 ISSR, z czego 50% było polimorficznych. Technika RAPD pozwoliła na identyfikację produktów specyficznych jedynie u pięciu z dziewięciu badanych form, podczas gdy przy udziale metody ISSR otrzymano takie fragmenty dla siedmiu populacji, najwięcej dla W6 7264. Dla obu zastosowanych w badaniach metod obliczono współczynnik informacji o polimorfizmie (PIC), którego wartość zawierała się w przedziale 0,13–0,68 dla RAPD i 0,15–0,52 dla ISSR, średnio odpowiednio 0,32 i 0,33. Na podstawie polimorfizmu markerów RAPD i ISSR oraz obu technik łącznie obliczono wartości indeksów podobieństwa genetycznego Dice’a, pomiędzy parami badanych populacji. Średnie podobieństwo badanych obiektów wyniosło odpowiednio 0,854, 0,871 i 0,864. Najbardziej odmienną od pozostałych była forma W6 7264. W oparciu o matryce podobieństw Dice’a skonstruowano dendrogramy obrazujące stosunki pokrewieństwa pomiędzy badanymi populacjami.
Estimation of genetic similarity between nine Greek Dasypyrum villosum L. (P.) Candargy populations native to three Greece regions (Thesally, West and Central Macedonia) was performed basing on polymorphism of RAPD and ISSR markers. Eighteen RAPD and seventeen ISSR selected primers were used in the genetic similarity analyses. In total, 122 RAPD and 210 ISSR products were obtained, out of which 50% were polymorphic. The RAPD method identified specific products only in five from nine populations studied, while ISSR in seven, most for W6 7264. Polymorphic information content (PIC) values calculated for the both methods, ranged from 0.13–0.68 for RAPD and 0.15–0.52 for ISSR. Mean values of PIC for RAPD and ISSR were 0.32 and 0.33, respectively. Based on the polymorphism of RAPD and ISSR markers and both methods combined, genetic similarities using Dice algorithm were estimated between pairs of populations analyzed. Mean genetic similarities were 0.854, 0.871 and 0.864, respectively. Most different from the others was W6 7264. Based on Dice matrix similarities, dendrograms showing relatedness between the analyzed populations were constructed.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 297-307
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie markerów RAPD do oceny zróżnicowania genotypowego polskich odmian pszenżyta ozimego
The application of RAPD markers to estimation of genotypic diversity of Polish winter triticale cultivars
Autorzy:
Kramek, Aneta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41455912.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery RAPD
pszenżyto
zróżnicowanie genotypowe
genotypic diversity
RAPD markers
triticale
Opis:
Celem pracy była ocena zróżnicowania genotypowego 22 polskich odmian pszenżyta ozimego za pomocą markerów RAPD. Ocenę polimorfizmu międzyodmianowego przeprowadzono w oparciu o 15 starterów RAPD, które zostały wyselekcjonowane spośród 48 wstępnie testowanych na pięciu genotypach pszenżyta ozimego. Wybrane oligonukleotydy amplifikowały łącznie 135 fragmentów DNA, z których 87 (64,44%) było polimorficznych. Wartość indeksów podobieństwa genetycznego wynosiła średnio 0,862 i wahała się od 0,734 pomiędzy odmianami Malno i Tewo do 0,903 między odmianami Marko i Fidelio. Największy dystans genetyczny w stosunku do pozostałych odmian stwierdzono u odmiany Tewo (0,785), a najbardziej podobną do wszystkich odmian okazała się odmiana Fidelio (0,855). Na podstawie przeprowadzonych badań stwierdzono niewielkie zróżnicowanie genotypowe analizowanych odmian pszenżyta ozimego.
The aim of this study was estimation of genotypic diversity of 22 Polish winter triticale cultivars based on RAPD markers. The estimation of intercultivar polymorphism was carried out basing on 15 RAPD primers, which were selected among 48 primers tested on 5 winter triticale genotypes. The chosen oligonucleotides generated 135 fragments of DNA, 87 of them (64.44%) were polymorphic. The mean value of similarity index was 0.862 and fluctuated from 0.734 between cv. Malno and cv. Tewo to 0.903 between cv. Marko and cv. Fidelio. The highest average genetic distance to all examined cultivars was observed in the cv. Tewo (0.785), the cv. Fidelio was the most similar to other cultivars. On the base of obtained results a low level of genotypic diversity was stated among the studied winter triticale cultivars.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 248; 43-51
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ metod izolacji DNA na podobieństwo genetyczne linii pszenicy ozimej (Triticum aestivum L.) przy zastosowaniu techniki RAPD-Pcr
The effect of DNA isolation methods on genetic similarity of winter wheat (Triticum aestivum L.) lines using RAPD-PCR techniques
Autorzy:
Tomkowiak, A.
Kurasiak-Popowska, D.
Weigt, D.
Mikołajczyk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1366472.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Badawczej i Dydaktycznej, COBRABiD
Tematy:
izolacja DNA
pszenica ozima
polimorfizm markerów RAPD
isolation of DNA
winter wheat
polymorphism of RAPD markers
Opis:
Celem badań było porównanie wpływu 4 metod izolacji DNA na wynik analizy markerami molekularnymi RAPD-PCR (ang. Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction) linii pszenicy ozimej. Przeprowadzono izolację DNA metodą Thomsona i Henry'ego, metodą kolumienkową przy pomocy kitu Quiagen DNeasy Plant Kit, przy pomocy kitu Genomic Mini AX Plant firmy A&A Biotechnology oraz zestawu Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit firmy Promega.Po izolacji przeprowadzono analizy molekularne RAPD-PCR, które wykorzystano jako wskaźnik służący do oceny metod izolacji DNA. Najlepszą metodą izolacji okazała się metoda z wykorzystaniem Quiagen DNeasy Plant Kit. Jakość DNA otrzymanego po izolacji tym kitem była najwyższa, a otrzymane elektroforogramy były najbardziej czytelne. Jest to jednak metoda izolacji DNA najdłuższa i najdroższa, co ogranicza jej wykorzystanie przy dużej liczbie badanych genotypów. Dobrą metodą izolacji DNA ze względu na jakość otrzymanych obrazów elektroforetycznych była metoda izolacji kitem Genomic Mini AX Plant. Metodą szybką i tanią okazała się metoda Thomsona i Henry'ego, niestety mniej wydajną w porównaniu do poprzednich. Metodą o największym zróżnicowaniu ilości otrzymanego DNA była izolacja z wykorzystaniem zestawu Maxwell.
The aim of this study was to compare the effect of 4 DNA isolation methods on the results of analyses using molecular markers of Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction (RAPD-PCR) in winter wheat lines. DNA was isolated using the method proposed by Thomson and Henry, the column method with a Quiagen DNeasy Plant Kit, a Genomic Mini AX Plant Kit by A&A Biotechnology and the Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit by Promega. After isolation RAPD-PCR analyses were carried out. The molecular study was an evaluation indicator of the DNA isolation methods. The best isolation method was that using the Quiagen DNeasy Plant Kit. Isolation using this kit provided the best DNA quality and the greatest legibility of electropherograms. However, it is the most time- and cost-intensive method of DNA isolation, which limits its applicability at a large number of tested genotypes. In terms of electrophoretic image quality good DNA isolation was provided by the method using a Genomic Mini AX Plant Kit. A rapid and cheap method was that proposed by Thomson and Henry; unfortunately, it was less efficient than the former ones. The greatest variation in the amounts of obtained DNA was observed for isolation using the Maxwell kit.
Źródło:
Aparatura Badawcza i Dydaktyczna; 2015, 20, 2; 90-109
2392-1765
Pojawia się w:
Aparatura Badawcza i Dydaktyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody oparte o amplifikację DNA techniką PCR wykorzystywane w ocenie bioróżnorodności mikroorganizmów glebowych
Methods based on DNA PCR-amplification for evaluation of the soil microbial diversity
Autorzy:
Łyszcz, Małgorzata
Gałązka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1034148.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tematy:
soil microorganism
genetic diversity
molecular markers
PCR based methods
ARDRA
PCR-RFLP
RAPD
REP-PCR
TRFLP
Opis:
Mikroorganizmy glebowe, pod względem cech genomowych i fenotypowych, stanowią wysoce zróżnicowaną grupę organizmów żywych. Z powodu tak dużej różnorodności ważne jest dobranie odpowiednich metod, dających największy stopień różnicowania mikroorganizmów. Narzędziami umożliwiającym analizę zmienności genetycznej mikroorganizmów są techniki genetyczne, a wśród nich jedną z najważniejszych jest łańcuchowa reakcja polimerazy, czyli PCR (Polymerase Chain Reaction), technika opracowana w latach 1980. Niniejsza praca stanowi przegląd podstawowych zagadnień dotyczących badania zmienności genetycznej mikroorganizmów glebowych w oparciu o markery molekularne z wykorzystaniem technik bazujących na reakcji PCR tj. PCR-RFLP, TRFLP, ARDRA, RAPD.
Soil microorganisms represent a highly diverse group of living organisms in terms of genomic and phenotypic characteristics. Due to such a large diversity, it is important to select appropriate identification methods which would secure its most complete determination. Genetic techniques are proper tools of choice for analyzing genetic variability of microorganism, the most important of which is the polymerase chain reaction (PCR), developed in the 1980s. This work presents an overview of the basic issues concerning studies on genetic variability of soil microorganisms with help of molecular markers and application of PCR techniques such as PCR-RFLP, TRFLP, ARDRA, RAPD.
Źródło:
Kosmos; 2017, 66, 2; 193-206
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
Characteristic of selected molecular markers
Autorzy:
Bolc, Paulina
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
Data publikacji:
2020-10-22
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery molekularne
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
ISSR
SRAP
SNP
PCR
polimorfizm
różnorodność genetyczna
molecular markers
polymorphism
genetic diversity
Opis:
Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Badanie samoniezgodności oraz podobieństwa genetycznego zróżnicowanych genotypowo form lucerny (Medicago sativa L.)
The study of self-incompatibility and genetic similarity of genetically differentiated forms of alfalfa (Medicago sativa L.)
Autorzy:
Broda, Zbigniew
Dobrzycka, Agnieszka
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41328230.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
lucerna
samoniezgodność
markery RAPD
podobieństwo genetyczne
alfalfa
self-incompatibility
RAPD markers
genetic similarity
Opis:
Celem pracy było określenie podobieństwa genetycznego 16 zróżnicowanych populacji lucerny za pomocą markerów molekularnych RAPD — PCR oraz ocena stopnia ich samoniezgodności. Badane obiekty utworzyły cztery grupy podobieństwa genetycznego, które wynosiło od 42% do 75%. Populacje o podobnym stopniu samoniezgodności nie znalazły się w tej samej grupie podobieństwa genetycznego. W celu zbadania samoniezgodności obserwowano wnikanie łagiewek pyłkowych do zalążni przy pomocy mikroskopu fluorescencyjnego. Na tej podstawie wyróżniono 4 populacje o wysokiej samoniezgodności (populacja Syn 7-3, linia F, mieszaniec F × B10, mutant ‘tf’) i 5 populacji o niskiej samoniezgodności (populacja Syn 9-3, linia B10, mieszaniec B10 × F, odmiana Ulstar i mutant ‘lp’).
The study purpose was to analyse genetic similarity between 16 populations of alfalfa using RAPD molecular markers and to describe their self-incompatiblity. The examined objects formed four groups of genetical similarity, which ranged from 42% to 75%. The populations with similar level of self-incompatibility were not in the same group of genetical similarity. To study the self-incompatibility effects, penetration of pollen tubes into the ovaries was observed with the use of fluorescence microscope. According to this, four populations with high self-incompatibility (population Syn 7-3, line F, hybrid F × B10, mutant ‘tf’) and five populations with low self-incompatibility (population Syn 9-3, line B10, hybrid B10 × F, Ulstar and mutant ‘lp’) were distinguished.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2007, 245; 205-214
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Analiza podobieństwa genetycznego wybranych gatunków w rodzaju Secale
The analysis of genetic similarity among Secale species
Autorzy:
Broda, Zbigniew
Kurasiak-Popowska, Danuta
Kowalska, Aleksandra
Ćwiklińska, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41446083.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery RAPD
podobieństwo genetyczne
żyto
RAPD markers
genetic similarity
rye
Opis:
Przedmiotem badań była analiza podobieństwa genetycznego form dzikich z rodzaju Secale. Materiałem roślinnym były gatunki żyta: Secale cereale subsp. afghanicum, Secale cereale subsp. dighoricum, Secale cereale subsp. segetale, Secale strictum subsp. africanum. Secale strictum subsp. anatolicum, Secale strictum subsp. ciliatoglume, Secale strictum subsp. kuprijanovii, Secale strictum, Secale sylvestre oraz Secale vavilovii. Analiza prążków RAPD pozwoliła na wytypowanie starterów generujących polimorficzne prążki, pozwalające zróżnicować badane gatunki i podgatunki z rodzaju Secale. Przeprowadzone badania pozwoliły na podział roślin na trzy grupy o różnym stopniu podobieństwa genetycznego. Wieloletnie gatunki z rodzaju Secale utworzyły jedną grupę podobień- stwa, a gatunki jednoroczne dwie grupy, w których podobieństwo wynosiło od 11 do 21%.
The aim of this study was the analysis of genetic similarity among Secale species. The plant material included: Secale cereale subsp. afghanicum, Secale cereale subsp. dighoricum, Secale cereale subsp. segetale, Secale strictum subsp. africanum, Secale strictum subsp. anatolicum, Secale strictum subsp. ciliatoglume, Secale strictum subsp. kuprijanovii, Secale strictum, Secale sylvestre and Secale vavilovii. Based on the RAPD (random amplified polymorphic DNA) analysis primers generating polymorphic products were selected, which made possible to differentiate species and subspecies of Secale. Three groups of the Secale species were distinguished according to the different degree of genetic similarity. Perennial species were classified in one group of similarity, and annual species in two groups, in which the similarity ranged from 11 to 21%.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 247; 65-71
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-8 z 8

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies