Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Quantitative Trait Loci (QTL)" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Rozważania nad mapowaniem genetycznym QTL odpowiedzialnym za cechę żółtonasienności rzepaku ozimego (Brassica napus L.)
A consideration on genetic mapping of QTL responsible for the yellow-seedness in winter rapeseed (Brassica napus L.)
Autorzy:
Hernacki, Błażej
Bartkowiak-Broda, Iwona
Piotrowska, Aleksandra
Cegielska-Taras, Teresa
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42821929.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak ozimy (Brassica napus)
żółtonasienność
RAPD
AFLP
QTL – loci cech ilościowych
sprzężenie genetyczne
mapowanie
winter rapeseed (Brassica napus)
yellow-seedness
QTL — quantitative trait loci
genetic linkage
mapping
Opis:
Nasiona rzepaku żółtonasiennego zawierają mniej włókna pokarmowego, a więcej tłuszczu i białka, w porównaniu do ciemnych nasion rzepaku. Wpływa to pozytywnie na podatność nasion na tłoczenie i wartość paszową poekstrakcyjnej śruty oraz wytłoków. Jednocześnie jednak pogorszeniu ulegają odporność roślin na patogeny i cechy mechaniczne nasion. Głęboka zmiana genotypu wiąże się również z obniżeniem plenności. Charakterystyka genetyczna uzyskanych w Zakładzie Genetyki i Hodowli Roślin Oleistych IHAR podwójnie ulepszonych (00) linii rzepaku ozimego żółtonasiennego pozwoli na usprawnienie i właściwe ukierunkowanie hodowli tego typu odmian. Zastosowanie markerów molekularnych sprzężonych z danymi cechami pozwala na precyzyjną selekcję pożądanych genotypów. W celu opracowania markerów sprzężonych z cechą żółtonasienności utworzono dwie populacje mapujące linii podwojonych haploidów (DH) złożone z potomstwa otrzymanego w wyniku skrzyżowania dwóch linii zółtonasiennych DH z dwoma czarnonasiennymi liniami DH. Rośliny z obu populacji liczących po około sto linii są obecnie poddawane analizom cech fenotypowych oraz mapowaniu genetycznemu. Do tego ostatniego zadania wybrano kilkadziesiąt standardowych starterów RAPD typowych dla rzepaku oraz jedenaście starterów RAPD o sekwencjach projektowanych, generujących opisane w literaturze markery sprzężone z kolorem nasion. Przeprowadzone dotąd badania wykazały iż większość z tych markerów generuje polimorficzne obrazy rozkładu produktów amplifikacji. Oprócz tego w projekcie w dalszej perspektywie planowane jest użycie trzydziestu par starterów AFLP (z czego piętnaście par generuje opisane sprzężenie z kolorem nasion), ponadto mapę genomu uzupełni również analiza za pomocą mikrosatelitów. Opracowana szczegółowa mapa genomu linii żółtonasiennych ze sprzężonymi markerami dla genów istotnych z punktu widzenia hodowli zostanie porównana z innymi mapami genetycznymi rzepaku.
The yellow seeds of rapeseed contain less fibre and are characterized by higher fat and protein content than the dark seeds. These features have a positive influence on seed performance in oil pressing and on feeding value of the meal and mill cake. However, the resistance to pathogens and the values of mechanical traits are comparatively lower. Moreover, the substantial change in genotype effects in the decrease in yielding level of the yellow-seeded plants. Genetic characterization of double low (00) yellow-seeded lines obtained at the Department of Genetics and Breeding of Oilseed Crops of the Plant Breeding and Acclimatization Institute can contribute to improving the strategy of breading of yellow-seeded varieties. The use of molecular markers linked to specific traits is a simple way to fast and precise selection of desired genotypes. For mapping and searching for markers linked to the yellow-seedness, two populations were developed from two reciprocal crossings of two yellow-seeded doubled haploid (DH) lines and two DH black-seeded lines. Plants from both populations, each consisted of about one hundred individuals, have already been analyzed phenotypically and mapped genetically. For the latter task, several dozen standard Operon RAPD primers and eleven RAPD primers, which are described in literature as generating markers linked to the colour of seeds, were chosen. The results obtained hitherto strongly suggested that the majority of the primers used generate polymorphic products of DNA amplification. In further studies it is planned to use thirty pairs of AFLP primers, fifteen of which have been described to generate markers linked to the colour of seeds. Moreover, the genome map will be supplemented by the data from analysis done using microstatellites. Such a detailed genetic map of the genome of yellow-seeded lines with markers linked to important qualitative genes will be compared with other genetic maps of oilseed rape.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 221-229
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja QTL warunkujących długość liścia flagowego w dwóch populacjach mapujących żyta (Secale cereale L.)
Identification of QTLs affecting the flag leaf length in two mapping populations of rye (Secale cereale L.)
Autorzy:
Milczarski, Paweł
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41513744.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
długość liścia flagowego
QTL (loci cechy ilościowej)
żyto
flag leaf length
QTL (quantitative trait loci)
rye
Opis:
Celem niniejszych badań była identyfikacja regionów genomowych kontrolujących długość liścia flagowego (FLL) w dwóch populacjach mapujących żyta Ds2 × RXL10 i 541 × Ot1-3. Wykryto łącznie 5 QTL (dwa dla Ds2 × RXL10 i trzy dla 541 × Ot1-3), które zmapowano na chromosomach 2R, 4R i 7R. Tylko QTL zidentyfikowane na chromosomie 2R lokalizowały się w tym samym regionie u obu populacji mapujących. Najważniejsze QTL zlokalizowano na chromosomie 7R, lecz na różnych ramionach map obu mieszańców. Współczynnik determinacji (R2) obliczony dla wykrytych QTL mieścił się w szerokim zakresie od 4,5 do 30,9%. Identyfikacja QTL może pomóc w wyjaśnieniu mechanizm ów genetycznych rozwoju liścia flagowego u żyta.
The objective of this study was identification of genomic regions controlling the flag leaf length (FLL) in Ds2 × RXL10 and 541 × Ot1-3 mapping populations of rye. Five QTLs (two on Ds2 × RXL10 map and three on 541 × Ot1-3 map) were detected on chromosomes 2R, 4R and 7R. Only the QTL on chromosome 2R was identified in the same region on both maps. The most important QTLs are located on chromosome 7R, but on different arms in each map. The coefficient of determination (R2) for QTLs ranged from 4.5 to 30.9%. The identification of QTLs can be helpful in explaining the genetic mechanisms of flag leaf development in rye.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 250; 203-209
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja QTL wybranych cech morfologicznych związanych z wyleganiem u żyta (Secale cereale L.)
Identification of QTLs of morphological traits related to lodging of rye (Secale cereale L.)
Autorzy:
Milczarski, Paweł
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41513423.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
długość drugiego międzywęźla (SIT)
grubość drugiego międzywęźla (SIL)
QTL (Loci cechy ilościowej)
współczynnik wylegania (Lc)
żyto
SIL (second internode length)
SIT (second internode thickness)
QTL (quantitative trait loci)
(Lc) lodging coefficient
rye
Opis:
Celem niniejszych badań było rozpoznanie dziedzicznego podłoża wybranych cech morfologicznych związanych z odpornością roślin żyta na wyleganie. Do badań wykorzystano 100 osobników populacji F4 mieszańca Ds2 × RXL10. Wykonano pomiary biometryczne długości i grubości II międzywęźla (ISL, IST), oraz w oparciu o opublikowane wcześniej wyniki dla wysokości roślin wyliczono współczynnik wylegania (Lc) obliczany jako stosunek grubości II międzywęźla do wysokości roślin. Zidentyfikowano dwa QTL dla długości i trzy QTL dla grubości drugiego międzywęźla oraz 3 QTL dla współczynnika wylegania. Otrzymane QTL zmapowano na chromosomach 2R, 3R, 5R, 6R i 7R. Rozkład QTL na chromosomach wskazuje na różne podłoże genetyczne grubości II międzywęźla i pozostałych cech.
The aim of this study was identification of some morphological traits related to lodging resistance in rye. One hundred F4 lines of Ds2 × RXL10 mapping population were used. Each F4 lines plant was measured in respect to length (SIL) and thickness (SIT) of the second internode. With the use of earliner published data on the plant height (Ph), a lodging coefficient (Lc) was calculated as a ratio between the thickness of the second internode and plant height. Two QTLs for the length, three QTLs for the thickness of the second internode and three QTLs for the lodging coefficient were identified on chromosomes 2R, 3R, 5R, 6R and 7R. A distribution of QTLs on chromosomes indicated that genetic background of the second internode thickness differs from that of the other traits.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 250; 211-216
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wpływ sposobu zapylenia żyta na mapowanie QTL dla porastania przedżniwnego
Analysis of the impact of pollination method on the results of mapping QTL for pre-harvest sprouting in rye
Autorzy:
Myśków, Beata
Łań, Anna
Hanek, Monika
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198249.pdf
Data publikacji:
2012-06-28
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
loci cech ilościowych (QTL)
obcozapylenie
porastanie przedżniwne (PHS)
samozapylenie
żyto
open-pollination
pre-harvest sprouting (PHS)
Quantitative Trait Loci (QTL)
rye
self-pollination
Opis:
Mapa genetyczna populacji rekombinacyjnych linii wsobnych (RIL) wyprowadzonych z pokolenia F2 mieszańca żyta S120×S76 posłużyła do identyfikacji loci cech ilościowych (QTL) związanych z porastaniem przedżniwnym (PHS). Mapa siedmiu chromosomów żyta o łącznej długości 962cM składała się z 1285 markerów DArT (markery molekularne wykorzystujące enzymy restrykcyjne i metodę hybrydyzacji na mikropłytkach) oraz 62 loci uzyskanych z użyciem metody PCR (łańcuchowa reakcja polimerazy). Materiałem badawczym były linie RIL pochodzące z doświadczeń polowych prowadzonych w Szczecinie, na terenie hali wegetacyjnej ZUT w latach 2007–2010. Część kłosów poszczególnych RIL izolowano, podczas gdy pozostałe pozostawiano do swobodnego przepylenia. PHS oceniano po kilkudniowym zraszaniu dojrzałych, ściętych kłosów wodą i oznaczano jako procent ziaren skiełkowanych. Oceny fenotypowej dokonano na kłosach poddawanych samozapyleniu (I) w czterech latach, a w dwóch latach (2008, 2010) także na kłosach nieizolowanych (N). Celem pracy było porównanie lokalizacji QTL porastania wskazanej w wyniku oceny kłosów izolowanych i nieizolowanych. Na mapie wykryto łącznie 33 QTL przedżniwnego porastania, rozlokowane na wszystkich chromosomach. Na podstawie wyników z 2008 roku zmapowano po sześć różnych i jeden wspólny QTL dla wariantów oceny z kłosami samo- i obcozapylonymi. W 2010 roku stwierdzono obecność jednego QTL dla kłosów izolowanych, pokrywającego się z jednym z sześciu wykrytych w tym roku dla kłosów nieizolowanych. Nie stwierdzono żadnego pokrywającego się przedziału QTL w dwóch sezonach (2008 i 2010), niezależnie od typu zapłodnienia badanych roślin. Lokalizacja niektórych QTL z obu wariantów została potwierdzona na podstawie analiz z innych lat. Stwierdzono, że materiał roślinny do analizy QTL porastania przedżniwnego żyta mogą stanowić kłosy poddane obcozapyleniu, w uzupełnieniu lub zamiennie z kłosami samozapylonymi.
Rye mapping population of S120×S76 cross consisting of 143 genotypes of RIL-F8 generation and it has been used to analyze pre-harvest sprouting. The map of seven rye chromosomes was together 962 cM long and contained 1285 DArT and 62 PCR markers. Plant material was grown in an experimental field of the West Pomeranian University of Technology in Szczecin, Poland, in four years (2007–2010). PHS was measured as a percentage of germinating seeds per total number of seeds in the ear, after watering of mature, harvested spikes. Each RIL was represented by several self-pollinated spikes (6 for most genotypes) every season and by several open-pollinated spikes in two years (2008, 2010). The objective of the research was to determine the positions of QTL for pre-harvest sprouting on rye genetic map of RIL population using spikes of two types of pollinating and comparing them together. There were jointly 33 QTL for PHS detected, that were spread on all chromosomes. Data from 2008 based on isolated and non-isolated spikes allowed to map 12 different (six for each variant) and one coinciding QTL. There was one QTL detected with the use of isolated spikes in 2010 and it overlapped with one of six QTL revealed on the basis of non-isolated spikes in this year. Localization of some of these QTL was confirmed by QTL analysis from other seasons. There was no overlapping QTL between 2008 and 2010, regardless the method of plant pollinating. It was suggested that open-pollinated spikes could be used to study QTL for PHS equally well as the self-pollinated plants or as a complementary plant material.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2012, 264; 117-125
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies