Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "DNA structure" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-14 z 14
Tytuł:
Ancient history of X-ray crystal structure of B-DNA oligomers and its perspective
Autorzy:
Grzeskowiak, K.
Ohishi, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80367.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
ancient history
X-ray crystallography
crystal structure
DNA oligomer
DNA binding protein
DNA binding drug
nanotechnology
methylation
nanotube
antitumour agent
DNA restriction
DNA sequence
protein
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Application of DNA markers against illegal logging as a new tool for the Forest Guard Service
Autorzy:
Nowakowska, J.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/38611.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
application
DNA marker
DNA structure
wood
molecular identification
Forest Guard Service
tree species
determination
DNA profile
polymerase chain reaction
Opis:
DNA markers are currently the most precise tool for forest tree species identification and can be used for comparative analyses of plant material. Molecular diagnosis of evidence and reference material is based on comparing the structure of DNA markers duplicated in the PCR reaction and estimation of the DNA profiles obtained in studied wood samples. For this purpose, the microsatellite DNA markers are the most suitable tool because of their high polymorphism and accurate detection of structural changes in the genome. The analysis of tree stump DNA profiles let avoid timely collection of data such as tree age, diameter, height and thickness, although such a piece of information may advantageous in wood identification process. For each examined tree species, i.e. Pinus sylvestris L., Picea abies (L.) Karst., Quercus robur L. and Q. petraea (Matt.) Liebl., Fagus sylvatica L., Betula pendula L., and Alnus glutinosa L., wood identification was possible via the DNA profiles established on a basis of minimum 4 microsatellite nuclear DNA loci, and at least one cytoplasmatic (mitochondrial or chloroplast) DNA marker. Determination of the DNA profiles provided fast and reliable comparison of genetic similarity between material of evidence (wood, needles, leaves, seeds) and material of reference (tree stumps) in the forest. This was done with high probability (approximately 98– 99%).
Źródło:
Folia Forestalia Polonica. Series A . Forestry; 2011, 53, 2
0071-6677
Pojawia się w:
Folia Forestalia Polonica. Series A . Forestry
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Brachypodium distachyon – a model plant to study grass genome structure, dynamics and evolution
Autorzy:
Idziak, D.
Hasterok, R.
Betekhtin, A.
Borowska-Zuchowska, N.
Braszewska-Zalewska, A.
Chwialkowska, K.
Gorkiewicz, R.
Kus, A.
Kwasniewska, J.
Kwasniewski, M.
Robaszkiewicz, E.
Siwinska, D.
Wolny, E.
Chrominski, K.
Tkacz, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/951271.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Brachypodium distachyon
model plant
grass
genome structure
Expressed Sequence Tag programme
fluorescent in situ hybridization
chromosome painting
DNA methylation
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Changes in distribution of 5 methylcytosine in male and female gametophyte of Hyacinthus orientalis before and after fertilization
Autorzy:
Kozlowska, M.
Niedojadlo, K.
Bednarska-Kozakiewicz, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80166.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
gene activity
chromatin structure
5-methylcytosine
female gametophyte
male gametophyte
seed development
flowering plant
Hyacinthus orientalis
fertilization
transcriptional activity
epigenetic factor
DNA methylation
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Cloning of the Haemophilus influenzae Dam methyltransferase and analysis of its relationship to the Dam methyltransferase encoded by the HP1 phage.
Autorzy:
Bujnicki, Janusz
Radlińska, Monika
Zaleski, Piotr
Piekarowicz, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044039.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
protein structure
sequence specificity
DNA methyltransferase
bioinformatics
molecular evolution
Opis:
In this paper we report cloning and experimental characterization of the DNA adenine methyltransferase (dam) gene from Haemophilus influenzae and comparison of ts product with the Dam protein from the lysogenic phage of H. influenzae, HP1. Molecular modeling of M.HinDam and M.HP1Dam was carried out, providing a framework for a comparative analysis of these enzymes and their close homologs in the tructural context. Both proteins share the common fold and essential cofactor-bind ng and catalytic residues despite overall divergence. However, subtle but significant differences in the cofactor-binding pocket have been identified. Moreover, while M.HinDam seems to contact its target DNA sequence using a number of loops, most of them are missing from M.HP1Dam. Analysis of both MTases suggests that their catalytic activity was derived from a common ancestor, but similar sequence specificities rose by convergence.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 4; 969-983
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Construction of Seabed Structures by New Development Covering Material Using Fly Ash
Konstrukcja struktur dna morza za pomocą nowych materiałów pokrywających z użyciem popiołów lotnych
Autorzy:
Shimada, H.
Sasaoka, T.
Fujita, S.
Wahyudi, S.
Yoshida, Y.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/318975.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przeróbki Kopalin
Tematy:
popiół lotny
materiał wprowadzany
struktura dna morskiego
fly ash
surfactant
injection material
seabed structure
Opis:
In recent years, many seabed structure materials are needed for extraction of methane hydrate and submarine hydrothermal polymetallic ore in Japan. Although covering material is required to make the protection disturbance for environmental issues at seabed, it has high mobility, and does not bleed, etc. after construction. Therefore, a construction material which uses a material mixture of the surface-active agent with fly ash was developed. Usage of fly ash instead of cement leads to improved mobility, reduced construction cost and so on. In considering these points, in order to clarify to what degree the contents of surfactant affects the properties of the injected fly ash mixture into the construction of seabed structures, different combinations of fly ash, surfactant and water were considered by means of multiple experiments.
W ostatnich latach istnieje potrzeba obecności wielu materiałów w strukturze dna morza aby możliwe było wydobycie uwodnionego metanu oraz hydrotermalnych podwodnych złóż polimetalicznych w Japonii. Materiał okładziny jest potrzebny aby ochraniać środowisko naturalne dna morza, posiada on dużą mobilność oraz nie odpowietrza się po zainstalowaniu. Wynaleziono materiał konstrukcyjny, który składa się z mieszaniny odczynnika powierzchniowo-czynnego z popiołem lotnym. Zastosowanie popiołu lotnego zamiast cementu prowadzi do lepszej mobilności, redukcji kosztów instalacji itp. Mając na względzie te cechy, aby stwierdzić w jakim stopniu zawartość surfaktanta wpływa na właściwości wprowadzonej mieszaniny popiołu lotnego do konstrukcji struktury dna morskiego zastosowano różne kombinacje popiołu lotnego, surfaktanta i wody. W tym celu przeprowadzono wiele eksperymentów.
Źródło:
Inżynieria Mineralna; 2016, R. 17, nr 1, 1; 143-151
1640-4920
Pojawia się w:
Inżynieria Mineralna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA replication stress-induced biphasic nuclear structures in Allium cepa root meristem cells
Autorzy:
Zabka, A.
Polit, J.T.
Maszewski, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/951326.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
DNA replication
cyclin-dependent kinase
cell division
biphasic nuclear structure
Allium cepa
root meristem cell
premature chromosome condensation
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
How to study G-quadruplex structures
Autorzy:
Malgowska, M.
Gudanis, D.
Teubert, A.
Dominiak, G.
Gdaniec, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80131.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
guanine
DNA molecule
RNA molecule
molecular structure
intramolecular structure
intermolecular structure
G-quadruplex structure
circular dichroism spectroscopy
ultraviolet spectroscopy
electrospray ionization mass spectrometry
nuclear magnetic resonance
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2012, 93, 4
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Interactions of antitumor triazoloacridinones with DNA
Autorzy:
Koba, Marcin
Konopa, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041077.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
biological activity
triazoloacridinones
DNA intercalation
DNA interstrand crosslinks
structure-activity relationship
metabolic activation
Opis:
Triazoloacridinones (TA) are a new group of potent antitumor compounds, from which the most active derivative, C-1305, has been selected for extended preclinical trials. This study investigated the mechanism of TA binding to DNA. Initially, for selected six TA derivatives differing in chemical structures as well as cytotoxicity and antitumor activity, the capability of noncovalent DNA binding was analyzed. We showed that all triazoloacridinones studied stabilized the DNA duplex at a low-concentration buffer but not at a salt concentration corresponding to that in cells. DNA viscometric studies suggested that intercalation to DNA did not play a major role in the mechanism of the cytotoxic action of TA. Studies involving cultured cells revealed that triazoloacridinone C-1305 after previous metabolic activation induced the formation of interstrand crosslinks in DNA of some tumor and fibroblast cells in a dose dependent manner. However, the detection of crosslink formation was possible only when the activity of topoisomerase II in cells was lowered. Furthermore, it was impossible to validate the relevance of the ability to crosslink DNA to biological activity of TA derivatives.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2007, 54, 2; 297-306
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Określenie pochodzenia wyłączonych drzewostanów nasiennych sosny rychtalskiej (Pinus sylvestris L.) z wykorzystaniem markerów mikrosatelitarnych
Determination of the origin of the rychtal Scots pine (Pinus sylvestris L.) seed tree stands using microsatellite markers
Autorzy:
Wójkiewicz, B.
Żukowska, W.B.
Urbaniak, L.
Kowalczyk, J.
Litkowiec, M.
Lewandowski, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/985719.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
lesnictwo
hodowla lasu
sosna zwyczajna
Pinus sylvestris
sosna rychtalska
drzewostany nasienne
pochodzenie roslin
zmiennosc genetyczna
analiza DNA
markery mikrosatelitarne
scots pine
genetic variation
gene pool
genetic structure
ssr markers
Opis:
The rychtal pine is one of the most valuable ecotypes of Scots pine (Pinus sylvestris L.) approved for the breeding purposes in Poland. However, it occupies stands typical for oaks and beeches as shown by the compatibility analysis of species composition in relation to the habitat type in which they occur. Such result raises some doubts in terms of the naturalness of the rychtal pine and calls its history and origin into question. In the present study, we used the set of nuclear microsatellite markers to characterize and compare the gene pool composition of the selected seed tree stands of the rychtal pine with 200−year−old pine trees which grow at the Syców Forest District (SW Poland). We aimed to know to what extent the set of alleles specified for the group of the oldest trees from natural habitats is represented in the younger forest tree stands of the rychtal pine. The analysis of molecular variance (AMOVA) and clustering analysis showed that the gene pool of the studied pine populations was homogenous (FST=0,02%, K=1). The parameters of genetic variation were similar for all populations except for the mean number of alleles. On average, 25 new alleles were found in two rychtal pine seed tree stands as compared to the set of alleles found in the group of old pine trees. However, all alleles defined for old pines were also present in the gene pool of younger rychtal pine forest stands. The differences in the gene pool richness result most likely from quite high differences in the number of individuals analyzed from each population. In conclusion, our results indicate the common origin of the studied Scots pine populations.
Źródło:
Sylwan; 2019, 163, 08; 637-644
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structure and dynamics of a DNA duplex containing single a-anomeric deoxyadenosine residue.
Autorzy:
Bielecki, Łukasz
Adamiak, Ryszard
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044170.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
structure
base stacking
bending
α-anomers
dynamics
DNA
Opis:
Structure and dynamics of an undecamer DNA duplex containing a single α-anomeric deoxyadenosine residue placed in opposition to a thymidine unit have been studied using simulation of molecular dynamics in aqueous solution. Despite several noticeable deviations from the B-DNA duplex structure caused by the anomerisation, such as: West type puckering of the α-anomeric sugar, disrupted base stacking pattern and unstable duplex bending, the formation of a non-classical α-dA-T pair was observed. A novel way of visual presentation of trajectory data allowing high throughput screening of the conformational parameters is presented.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 1; 103-111
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Structure and functions of lampbrush chromosomes
Autorzy:
Andraszek, K.
Smalec, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81204.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
lampbrush chromosome
oocyte
transcriptional activity
physiological process
morphological structure
cytogenetic technique
in situ hybridization
DNA replication
cytogenetic investigation
karyotype evolution
genome mapping
meiotic chromosome
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2011, 92, 4
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The effect of mono- and divalent cations on Tetrahymena thermophila telomeric repeat fragment. A photon correlation spectroscopy study.
Autorzy:
Włodarczyk, Agnieszka
Patkowski, Adam
Grzybowski, Przemysław
Dobek, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041510.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
chromosome ends
G-quadruplex
telomeric DNA
photon correlation spectroscopy
structure transition
Opis:
The structure of the Tetrahymena thermophila telomeric sequence d(TGGGGT)4 was studied by photon correlation spectroscopy (PCS) in aqueous solution in the presence of NaCl, KCl and SrCl2. The sample studied was polydisperse in all conditions studied. Translational diffusion coefficients DT describing the diffusion modes observed were determined. On the basis of a comparison between the experimental DT values with those calculated assuming the bead model, two forms were identified as telomeric quadruplex structures: monomer and tetramer. In the presence of SrCl2 formation of aggregates was observed, with a size that reached several micrometres. The relative weighted concentrations of the structures observed for different concentrations of a salt and DNA were determined. The results obtained in the presence of monovalent ions were qualitatively similar and could be presented in a coherent plot in which the concentration of salt was expressed by the number of ions per DNA molecule. A large number of ions per DNA molecule favoured tetramer formation while a small number favoured the monomer form. A structural phase transition from the monomer to the tetramer induced by a change in the number of ions per DNA molecule was observed. The main difference between the results for Na+ and K+ was a greater effectiveness of the K+ ions in formation of tetramers. The effect of Sr2+ ions on the structures formed was different than that of the monovalent ions. The results obtained in the presence of Sr2+ could not be described as a function of the number of ions per DNA molecule.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2004, 51, 4; 971-981
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Use of meta-networks to evaluate key agents, knowledge and resources in the planning of construction projects
Wykorzystanie meta-sieci do oceny kluczowych agentów, wiedzy i zasobów w planowaniu przedsięwzięć budowlanych
Autorzy:
Śladowski, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/231273.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
analiza metasieci
MNA
dynamic network analysis
DNA
planowanie
przedsięwzięcie budowlane
rewaloryzacja
obiekt zabytkowy
meta-network analysis
planning
construction project
refurbishment
historical structure
Opis:
The article proposes a new approach to the identification of key agents, knowledge and resources required to complete tasks being performed as a part of construction projects. The author used the concept of meta-networks to model the relations between agents, knowledge, resources and tasks of a project. Up until now, the identification of key means of production employed a measure of performance of the project that was modelled using a metanetwork. However, this measure is limited as it does not take into consideration the significance of individual tasks or the relations between them. The author thus proposed a structural modification of the performance measure for the purposes of identifying key agents, knowledge and resources of a planned project. A case study analysis has confirmed the application potential of the proposed approach. In practice, the results that were obtained can aid planners in evaluating the performance of a project's plan. Information about key agents, knowledge and resources can constitute the basis for drafting alternative plans which would be more resistant to failure due to the possible loss of key means of production over the course of carrying out a project.
W artykule zaproponowano nowe podejście do identyfikacji kluczowych agentów (uczestników), wiedzy i zasobów potrzebnych do realizacji zadań w ramach przedsięwzięć budowlanych. Do modelowania relacji pomiędzy agentami, wiedzą, zasobami oraz zadaniami przedsięwzięcia wykorzystano koncepcję meta-sieci. opracowanej przez [9, 10, 11] i opartej na integracji i analizie wielu sieci równocześnie, które określają zależności pomiędzy elementami analizowanego systemu. Dotychczas do identyfikacji kluczowych środków produkcji wykorzystywana była miara wydajności (performance) modelowanego przez meta-sieć przedsięwzięcia, Jednak miara ta (określająca procent zadań które mogą być wykonane dzięki temu, że do ich realizacji są przypisani Agenci, wiedza i zasoby) ma istotne ograniczenie, gdyż nie uwzględnia ważności poszczególnych zadań jak również relacji pomiędzy nimi. Przykładowo, brak możliwości wykonania jednego zadania krytycznego, które planowane jest do realizacji jako jedno z pierwszych, uniemożliwi realizację kolejnych, co jest gorszym mankamentem planu niż brak możliwości realizacji nawet większej ilości zadań, które nie są krytyczne i terminy ich realizacji są późniejsze. Zaproponowano więc modyfikację strukturalnej miary wydajności (performance) na potrzebę identyfikacji kluczowych agentów, wiedzy i zasobów planowanego przedsięwzięcia.
Źródło:
Archives of Civil Engineering; 2018, 64, 3; 111-129
1230-2945
Pojawia się w:
Archives of Civil Engineering
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-14 z 14

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies