Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "DNA polymerase" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Virulence and antibiotic resistance of Escherichia coli isolated from rooks
Autorzy:
Kmet, V.
Drugdova, Z.
Kmetova, M.
Stanko, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/51141.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
virulence
antibiotic resistance
Escherichia coli
isolation
rook
polymerase chain reaction
DNA microarray
Opis:
With regard to antibiotic resistance studies in various model animals in the urban environment, the presented study focused on the rook, many behavioural and ecological aspects of which are important from an epidemiological point of view. A total of 130 Escherichia coli strains isolated from rook faeces during a two-year period (2011–2012) were investigated for antibiotic resistance and virulence. Resistance to ampicillin (60%) and streptomycin (40%) were the most frequent, followed by resistance to fluoroquinolones (ciprofloxacin-22% and enrofloxacin-24%), tetracycline (18%), cotrimoxazol (17%) and florfenicol (14%). Ceftiofur resistance occured in 10.7 % of strains and cefquinom resistance in 1.5 % of strains. Twenty-five E.coli strains with a higher level of MICs of cephalosporins (over 2mg/L of ceftazidime and ceftriaxon) and fluoroquinolones were selected for detection of betalactamase genes (CTX-M, CMY), plasmid-mediated quinolone resistance qnrS, integrase 1, and for APEC (avian pathogenic E.coli) virulence factors (iutA, cvaC, iss, tsh, ibeA, papC, kpsII). Genes of CTX-M1, CMY-2, integrase 1, papC, cvaC, iutA were detected in one strain of E.coli, and qnrS, integrase 1, iss, cvaC, tsh were detected in another E.coli. DNA microarray revealed the absence of verotoxin and enterotoxin genes and pathogenicity islands. The results show that rooks can serve as a reservoir of antibiotic-resistant E. coli with avian pathogenic virulence factors for the human population, and potentially transmit such E.coli over long distances.
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2013, 20, 2
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Usefulness of PCR/RFLP and ERIC PCR techniques for epidemiological study of Haemophilus parasuis infections in pigs
Autorzy:
Jablonski, A.
Zebek, S.
Kolacz, R.
Pejsak, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/30649.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
animal disease
pig
animal infection
epidemiology
Haemophilus parasuis
genotyping
polymerase chain reaction
virulence
diagnosis
microorganism
DNA fragment
electrophoretic separation
environmental factor
molecular method
Opis:
Haemophilus parasuis belongs to opportunistic microorganisms of undefined virulence. The purpose of the studies was to compare suitability of PCR/RFLP in our modification and ERIC PCR for epidemiological study of domestic strains of H. parasuis. The results were evaluated taking into account two different aspects: suitability of the tests for isolating the highest possible number of clone groups and subjective evaluation of the method judged with respect to the following criteria: difficulty, availability of equipment and reagents as well as time and cost of the study. The results obtained in the present study show that the two methods used for typing of H. parasuis had high discriminatory power. Taking into account this parameter it can be concluded that ERIC PCR is more suitable than PCR/RFLP. This justifies the use of ERIC PCR for routine epidemiological analyses of mentioned pathogen. Taking into account the complexity of method used, ERIC-PCR based on random amplification of DNA, proved to be comparable to PCR/RFLP. The last mentioned technique is relatively less expensive and labour-consuming, especially when diagnostic PCR method is used for the epidemiological studies.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2011, 14, 1
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Use of random amplified polymorphic DNA [RAPD] assay for differentiation among isolates of Stagonospora spp. and Septoria tritici
Autorzy:
Czembor, P C
Arseniuk, E
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2047271.pdf
Data publikacji:
1996
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Stagonospora
Stagonospora avenae
Septoria tritici
random amplified polymorphic DNA
pathogen
polymerase chain reaction
DNA
molecular marker
fungal isolate
Stagonospora nodorum
genetic variation
Opis:
The genetic similarity of three species: Septoria tritici, Stagonospora nodorum and Stagonospora avenae f. sp. triticea - important pathogens in many cereal production areas worldwide was assessed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) assay. In preliminary research DNA of 14, 9, and 7 monopyenidios- pore isolates of S. nodorum, S. tritici, and S. a. tritícea, respectively, were amplified by PCR with four primers. Afterwards the research was focused on three mono- pyenidiospore isolates from each species studied. The isolates of each species selected for the study varied in pathogenicity and were diverse geographically. PCR with the set of 14 selected primers resulted in 99 different bands, ranged from 180 to 2500 base pairs in length. Most primers in PCR (especially RAD11, RAD31, RAD32, RAD33) revealed uniform bands for isolates of S. a. tritícea, that allow to identify this species among the others. The cluster analysis using Unweighed Pair-Group Method with Averaging (UPGMA) revealed interspecies disagreement among the isolates ranging from 32 to 53%. The intraspecies disagreement ranges were 17-20%, 38-43%, 42-44% for S. avenae f. sp. triticea, S. nodorum and S. tritici, respectively. Cluster analysis classified isolates into three homogeneous clusters. Each cluster grouped isolates of one species according to their current taxonomie ranks based on spore size, colony morphology and host ranges. In addition, two of the clusters represented by isolates of S. nodorum and S. a. tritícea were distinctly separated at a lower linkage distance from the third one comprising isolates of S. tritici. A slight inconsistency found in grouping some isolates indicates that such groupings should be done with caution. The present study indicates that the PCR- RAPD assay is of a potential use in taxonomy of Stagonospora spp. and Septoria tritici as well as in molecular identification of casual disease agents.
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 1996, 37, 3; 239-251
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Unidirectional orientation of twelve expressed tagged sites within 4o kb of human chromosomal region 22q13.1
Autorzy:
Pusch, C
Wang, Z.
Roe, B.
Blin, N.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2048293.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
RNA
human chromosome
chromosome
hybridization
genetic change
linear map
polymerase chain reaction
DNA
cosmid
cDNA
transcriptional orientation
Opis:
The single copy sequence D22S16 from human chromosomal region 22q13.1 that carries a putative conserved gene, was used to probe a chromosome 22-specific cosmid library. Genomic sequencing of one positive, 40 kb long cosmid (C1155) revealed a hereto unmapped gene (a subunit of DNA-dependent RNA polymerase II, POLR2F), a SOX9-related sequence and 12 expressed sequence tags. Although not parts of one consecutive gene, all 12 ESTs and, in addition, the polymerase gene are oriented in the same transcriptional direction within the genomic sequence represented by cosmid C1155.
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 1998, 39, 2; 199-204
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The use reverse transcription and polymerase chain reaction [RT-PCR] for the detection of hop latent viroid [HLVd]
Autorzy:
Cajza, M
Wypijewski, K.
Pospieszny, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65773.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
hop latent viroid
reverse transcription
viroid
hop
plant pathogen
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
Opis:
The simple method of nucleic acids extraction, based on guanidine thiocyanate extraction buffer, was sufficient for obtaining a good templates for RT-PCR. The RT-PCR reactions were performer from the start to the end (both the reverse transcription and the HLVd-cDNA amplification) in the same reaction mixture and in the very small volume of reaction (10 μI). Both pairs of primers designed by authors were good for reverse transcription and later for amplification of the HLVd-cDNA. The presence of gelatin as a stabilizer of DNA polymerase was indispensable for successful performance of RT-PCR.
Wiroidy, najmniejsze obecnie znane patogeny roślin, zbudowane z pojedynczej nici kolistego RNA, nie zawierające w swej budowie i nie kodujące żadnych białek, są groźnymi patogenami roślin wyższych, rozpowszechnionymi we wszystkich rejonach świata, szczególnie w uprawach roślin rozmnażanych wegetatywnie. Wiroid latentny chmielu (ang. hop latent viroid - HLVd) został wykryty dopiero w 1988 roku w chmielu. Do tej pory odnotowano go w rejonach uprawy chmielu na całym świecie. Chmiel, jedyny znany żywiciel tego patogena, ulega tylko infekcjom utajonym (latentnym). HLVd powoduje zarówno spadek masy plonu szyszek jak i zawartości alfa-kwasów w szyszkach. Bezobjawowe infekcje oraz brak białek strukturalnych i innych produktów translacji powodują, że obecnie patogena tego można wykrywać tylko przy pomocy elektroforezy (metoda bardzo zawodna, wymagająca wysokiego stężenia RNA patogena w tkance), sond hybrydyzacyjnych i rozwijanej w ostatnich latach metody RT-PCR. Podczas opracowywania RT-PCR do wykrywania HLVd w ekstraktach kwasów nukleinowych wykorzystywano dwie pary primerów specyficznych dla sekwencji nukleotydowej HLVd, charakteryzujących się różnymi temperaturami topnienia produktu. Wiroida wykrywano w ekstraktach kwasów nukleinowych z blaszek liściowych i z ogonków liściowych chmielu. Uproszczona metoda guanidynowa do izolacji totalnych kwasów nukleinowych okazała się wystarczająca do przeprowadzenia reakcji RT-PCR. Opracowana metoda charakteryzowała się bardzo dużą czułością, specyficznością (produkty amplifikacji cDNA-HLVd uzyskiwano tylko z próbek materiału roślinnego pochodzącego z roślin zawierających tego wiroida) i szybkością wykonania (dwa dni łącznie z ekstrakcją kwasów nukleinowych). Ponadto w zastosowanej metodzie opracowano warunki do przeprowadzenia zarówno odwrotnej transkrypcji i następnie amplifikacji powstałego cDNA wiroida w jednej probówce, w tej samej mieszaninie reakcyjnej . Oprócz tego wszystkie reakcje RT-PCR prowadzono w bardzo małej objętości równej 10 μl (2 μl zawiesiny kwasów nukleinowych i 8 μl mieszaniny reakcji RT-PCR). Maksymalne uproszczenie metody, wielokrotne obniżenie kosztów reakcji oraz charakterystyczna dla RT-PCR czułość, specyficzność i szybkość przeprowadzenia testu sprawiają, że może być ona wykorzystywana do rutynowego wykrywania nie tylko HLVd ale również innych wiroidów, wirusoidów i wirusów RNA.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The expression of UVR3 and two putative photolyases, PHR2 and At4g25290, is regulated by light
Autorzy:
Sztatelman, O.
Labuz, J.
Banas, A.K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80793.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
DNA strand
RNA polymerase
DNA polymerase
replication
transcription
light regulation
putative photolyase
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Segmented hybridization probes: modulating target affinity and base pairing selectivity
Autorzy:
Egetenmeyer, S.
Geiger, E.
Richert, C.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81071.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
oligonucleotide
DNA
RNA
hybridization
base pairing
molecular biology
polymerase chain reaction
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2012, 93, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Polymorphism of DNA in nematodes of genus Trichinella Railliet, 1895 according to the data of polymerase chain reaction
Autorzy:
Shendrick, A.
Benedictov, I.
Bessonov, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/838885.pdf
Data publikacji:
1998
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
polymorphism
Trichinella pseudospiralis
Trichinella
nematode
polymerase chain reaction
DNA
Trichinella spiralis
Źródło:
Annals of Parasitology; 1998, 44, 3
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
PCR for identification and typing of Helicobacter pylori isolated from children
Autorzy:
Dzierzanowska, D
Gzyl, A.
Rozynek, E.
Augustynowicz, E.
Wojda, U.
Celinska-Cedro, D.
Sankowska, M.
Wadstrom, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/69030.pdf
Data publikacji:
1996
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Fizjologiczne
Tematy:
antibiotic therapy
infection
Chlamydia
Mycobacterium
Helicobacter pylori
antibody
antigen
virus
gastroduodenal disease
microorganism
child
protein
polymerase chain reaction
Legionella
DNA
Źródło:
Journal of Physiology and Pharmacology; 1996, 47, 1
0867-5910
Pojawia się w:
Journal of Physiology and Pharmacology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Oral cavity as permanent reservoir of Helicobacter pylori and potential source of reinfection
Autorzy:
Pytko-Polonczyk, J
Konturek, S.J.
Karczewska, E.
Bielanski, W.
Kaczmarczyk-Stachowska, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/70310.pdf
Data publikacji:
1996
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Fizjologiczne
Tematy:
peptic ulcer
reinfection
dental plaque
gingival pocket
duodenal ulcer
urea breath test
saliva
stomach
DNA
Helicobacter pylori
oral activity
polymerase chain
Źródło:
Journal of Physiology and Pharmacology; 1996, 47, 1
0867-5910
Pojawia się w:
Journal of Physiology and Pharmacology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Mutations in DNA polymerase gamma cause error prone DNA synthesis in human mitochondrial disorders
Autorzy:
Copeland, William
Ponamarev, Mikhail
Nguyen, Dinh
Kunkel, Thomas
Longley, Matthew
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043659.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
aging
DNA replication
mitochondria
DNA repair
DNA polymerase
Opis:
This paper summarizes recent advances in understanding the links between the cell's ability to maintain integrity of its mitochondrial genome and mitochondrial genetic diseases. Human mitochondrial DNA is replicated by the two-subunit DNA polymerase γ (pol γ). We investigated the fidelity of DNA replication by pol γ with and without exonucleolytic proofreading and its p55 accessory subunit. Pol γ has high base substitution fidelity due to efficient base selection and exonucleolytic proofreading, but low frameshift fidelity when copying homopolymeric sequences longer than four nucleotides. Progressive external ophthalmoplegia (PEO) is a rare disease characterized by the accumulation of large deletions in mitochondrial DNA. Recently, several mutations in the polymerase and exonuclease domains of the human pol γ have been shown to be associated with PEO. We are analyzing the effect of these mutations on the human pol γ enzyme. In particular, three autosomal dominant mutations alter amino acids located within polymerase motif B of pol γ. These residues are highly conserved among family A DNA polymerases, which include T7 DNA polymerase and E. coli pol I. These PEO mutations have been generated in pol γ to analyze their effects on overall polymerase function as well as the effects on the fidelity of DNA synthesis. One mutation in particular, Y955C, was found in several families throughout Europe, including one Belgian family and five unrelated Italian families. The Y955C mutant pol γ retains a wild-type catalytic rate but suffers a 45-fold decrease in apparent binding affinity for the incoming dNTP. The Y955C derivative is also much less accurate than is wild-type pol γ, with error rates for certain mismatches elevated by 10- to 100-fold. The error prone DNA synthesis observed for the Y955C pol γ is consistent with the accumulation of mtDNA mutations in patients with PEO. The effects of other pol γ mutations associated with PEO are discussed.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2003, 50, 1; 155-167
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Monitoring of cellular chimerism in patients after sex-mismatched bone marrow transplantation: technical report
Autorzy:
Jolkowska, J
Ladon, D.
Wachowiak, J.
Witt, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2043435.pdf
Data publikacji:
2000
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
in situ
allogeneic transplantation
chimerism
molecular analysis
transplantation
minimal residual disease
acute myeloblastic leukemia
polymorphic microsatellite
bone marrow
hybridization
polymerase chain reaction
DNA
detection
Źródło:
Journal of Applied Genetics; 2000, 41, 3; 209-212
1234-1983
Pojawia się w:
Journal of Applied Genetics
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. V. Different mechanisms of regulation regarding the open reading frames
Autorzy:
Borowicz, B P
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/64980.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
regulation mechanism
gene expression
I-18 C gene
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
Opis:
Different mechanisms of regulation regarding the Open Reading Frames (ORFs) have been discussed to have a broader perspective that is necessary to evaluate the role of the ORFs of the I-18 C gene. This consideration includes the ORF II of the I-18 C gene which is the object of the presented research.
Omówiono różnorodne mechanizmy regulacji dotyczące Otwartych Ram Odczytu, w celu wytworzenia szerszego spojrzenia na to zagadnienie, które jest potrzebne do oceny roli poszczególnych Otwartych Ram Odczytu (ORF) genu I-18 C. Omówienie to dotyczy również ORF II genu I-18 C, co było przedmiotem zaprezentowanych badań.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. IV. The product of the applied technologies
Autorzy:
Borowicz, B P
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65915.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
I-18 C gene
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
Opis:
The Polymerase Chain Reaction and other molecular technologies were applied to isolate the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene. This research object was realized and the importance of this result has been discussed in view of the mechanisms of the regulation of gene expression.
Reakcja Łańcuchowa Polimerazy i inne technologie molekularne zostały zastosowane w celu izolacji fragmentu DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C. Cel badawczy został zrealizowany i omówiono znaczenie tego wyniku w świetle mechanizmów regulacji ekspresji genu.
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. III. The DNA amplification technology
Autorzy:
Borowicz, B P
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/66760.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
gene expression
I-18 C gene
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
DNA amplification
Opis:
The technology used to amplify and isolate the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans is described i.e. the Polymerase Chain Reactioin and the agarose gel electrophoresis of this reaction product, as well as the blunting reaction of the product and its isolation.
Opisano technologię zastosowaną do powielenia i izolacji fragmentu DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C Chironomus tentans, tj. Reakcję Łańcuchową Polimerazy (PCR) oraz elektroforezę w żelu agarozowym produktu tej reakcji jak również reakcję tzw. Stępiania końców wyżej wymienionego produktu i ostatecznie jego izolację .
Źródło:
Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:
Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies