Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Codon optimization" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-1 z 1
Tytuł:
The expression level of a recombinant lipase predicted in silico by different codon optimization algorithms
Autorzy:
Bello, Adebayo J.
Igwo-Ezikpe, Miriam
Toye, Emuejevoke T.
Okpuzor, Joy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1046552.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
COOL
Codon optimization
Cohnella
Escherichia coli
ExpOptimizer
JCat
algorithm
in silico
lipase
presyndocon
protein expression
Opis:
Optimizing codons of gene of interest has offered a value-added way to increase heterologous expression of proteins. Different algorithms have been designed to achieve this purpose. These algorithms make use of parameters such as codon Adaptation index (CAI), codon context (CC), percentage guanine-cytosine (GC) content and RNA instability for predicting optimal codons responsible for increased protein expression. Lipase 3646 is an enzyme with great potential for industrial applications. This enzymes has been described to possess thermostable properties with relative stability in high alkaline pH and at different concentrations of organic solvents and inhibitors. This research therefore used JCat, Codon optimization online (COOL), presyndocon and ExpOptimizer algorithms to predict expression level of lipase 3646 enzyme in silico by optimizing its gene coding sequence. The results showed that there were variations in the CAI generated by the algorithms for the same 3646 DNA sequence which suggests that each algorithm is specific for its own generated CAI. COOL algorithm prediction based on other parameters showed good results for potential expression of the lipase. Thus, we recommend COOL algorithm for codon optimization of the lipase 3646 gene for industrial applications.
Źródło:
World Scientific News; 2019, 137; 31-41
2392-2192
Pojawia się w:
World Scientific News
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-1 z 1

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies