Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "16S rRNA gen" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-4 z 4
    Tytuł:
    Characteristics of selected molecular methods used in identification and assessment of genetic diversity of bacteria belonging to the genus Azotobacter
    Autorzy:
    Kozieł, Monika
    Gałązka, Anna
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2147979.pdf
    Data publikacji:
    2019-09-30
    Wydawca:
    Instytut Uprawy Nawożenia i Gleboznawstwa – Państwowy Instytut Badawczy
    Tematy:
    Azotobacter
    ITS PCR
    16S rRNA gen
    PCR MP
    RAPD
    ARDRA
    Opis:
    Modern molecular techniques have greatly increased our knowledge concerning phylogenetic and functional diversity of microorganisms inhabiting the soil environment. Soil ecosys-tem is relatively complex with a high level of microbiologically diversity. The application of traditional culture-based techniques dose not reflect the total diversity of microbial community in-habiting in soil environment. On the other hand commonly used molecular methods allow for quick and accurate identification and evaluation of the genetic diversity of microorganisms in-habiting this environment. Free-living bacteria belonging to the genus Azotobacter commonly occurring in soil. Azotobacter spp. are the subject of many studies conducted both in Poland and in the world. The interest in these bacteria is largely related to their properties very useful for agriculture. Owing to their capability of fixing atmospheric nitrogen and making it available to plants and production of plant growth promotion and fungicidal substances, they are used in the production of soil bacterial inoculants. In addition, these bacteria are an excellent indicator of soil fertil-ity, which is why they are often used as test microorganisms in many studies. The paper presents an overview of molecular mi-crobiological techniques used to identify and evaluate the genetic diversity of Azotobacter spp. in studies conducted both in Poland and across the world. The ITS PCR, PCR-RFLP methods and 16S rRNA gene amplification are used to identify bacteria of the ge-nus Azotobacter, and PCR MP, RAPD PCR and ARDRA are used to assess the genetic diversity of these microorganisms.
    Źródło:
    Polish Journal of Agronomy; 2019, 38; 37-45
    2081-2787
    Pojawia się w:
    Polish Journal of Agronomy
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Molecular diversity of the bacterial community associated with Acropora digitifera (Dana, 1846) corals on Rancabuaya coastline, Garut District, Indonesia
    Autorzy:
    Rizal, Achmad
    Akbarsyah, Nora
    Kdyp, Pringgo
    Permana, Rega
    Andhikawati, Aulia
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1030642.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
    Tematy:
    Acropora digitifera
    Bacteria
    Culture
    Gen 16S rRNA
    Metagenome
    Opis:
    Bacteria are one of the prokaryotic microorganisms that are symbiotic with coral reefs. The purpose of this study was to determine the diversity of bacterial communities associated with Acropora digitifera corals in the rancabuaya coastline of Garut district, West Java through a metagenomic and cultural approach. Stages of research include tissue isolation using waterpics, isolation of bacterial genomic DNA, sequencing using the NGS (Next Generation Sequencing) method of Hiseq using 16S rRNA V3-V4 region 341F and 806R primers for the metagenomic approach. While the culture approach, carried out inoculation, bacterial cultivation, gram staining, then proceed with the identification of molecular characteristics of DNA with 16S rRNA gene sequences. Dominantly, the results of bacterial identification were obtained as many as 77 species from 10 genera 10 families 10 orders of 10 classes and 4 phylum and unidentified reads of 6%. The results of the identification of 16S rRNA showed that the isolate ACD.P4.PH7.P had a close relationship with the Bacillus flexus strain BF strain zb strain with a similarity of 85.44%. Isolate ACD.P4.PH9.P has a close relationship with Bacillus sp. c234 with a 98.50% similarity. Isolate ACD.P4.PH9.K has an approach with the species Bacillus sp. strain 6RM1 with a similarity of 94.78%.
    Źródło:
    World Scientific News; 2020, 144; 384-396
    2392-2192
    Pojawia się w:
    World Scientific News
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Comparison of PCR-DGGE and Nested-PCR-DGGE Approach for Ammonia Oxidizers Monitoring in Membrane Bioreactors’ Activated Sludge
    zalety i wady wykorzystywania techniki nested-PCR w monitoringu bakterii utleniających amoniak w osadzie czynnym bioreaktora membranowego
    Autorzy:
    Ziembińska-Buczyńska, A.
    Wiszniowski, J.
    Ciesielski, S.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/204755.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    ammonia oxidizing bacteria
    AOB
    16S rRNA gene
    Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis
    PCR-DGGE
    nested-PCR
    utlenianie amoniaku
    bakteria utleniająca amoniak
    gen kodujący 16S rRNA
    Opis:
    Nitritation, the first stage of ammonia removal process is known to be limiting for total process performance. Ammonia oxidizing bacteria (AOB) which perform this process are obligatory activated sludge habitants, a mixture consisting of Bacteria, Protozoa and Metazoa used for biological wastewater treatment. Due to this fact they are an interesting bacterial group, from both the technological and ecological point of view. AOB changeability and biodiversity analyses both in wastewater treatment plants and lab-scale reactors are performed on the basis of 16S rRNA gene sequences using PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) as a molecular biology tool. AOB researches are usually led with nested PCR. Because the application of nested PCR is laborious and time consuming, we have attempted to check the possibility of using only first PCR round to obtain DGGE fingerprinting of microbial communities. In this work we are comparing the nested and non-nested PCR-DGGE monitoring of an AOB community and presenting advantages and disadvantages of both methods used. The experiment revealed that PCR technique is a very sensitive tool for the amplification of even a minute amount of DNA sample. But in the case of nested-PCR, the sensitivity is higher and the template amount could be even smaller. The nested PCR-DGGE seems to be a better tool for AOB community monitoring and complexity research in activated sludge, despite shorter fragments of DNA amplification which seems to be a disadvantage in the case of bacteria identification. It is recommended that the sort of analysis approach should be chosen according to the aim of the study: nested-PCR-DGGE for community complexity analysis, while PCR-DGGE for identification of the dominant bacteria.
    Nitiritacja – pierwszy etap nitryfikacji, jest uznawany za krok limitujący przebieg całości procesu utleniania amoniaku. Bakterie utleniające amoniak (ang. ammonia oxidizing bacteria, AOB), które prowadzą ten proces są stałymi mieszkańcami osadu czynnego – mieszaniny bakterii, Protozoa i Metazoa, wykorzystywanych do biologicznego oczyszczania ścieków. Z tego powodu są one interesujące zarówno z punktu widzenia technologii, jak i ekologii mikroorganizmów. Analizy zmienności i bioróżnorodności bakterii utleniających amoniak, zarówno w oczyszczalni ścieków, jak i w reaktorach w skali laboratoryjnej, są prowadzone w oparciu o sekwencje genu kodującego 16S rRNA z użyciem metody biologii molekularnej, jaką jest PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Analizy te są zazwyczaj prowadzone techniką tzw. nested-PCR. Ze względu na fakt, że metoda ta wymaga większego nakładu pracy i czasu, niż tradycyjny jednoetapowy PCR (ang. non-nested PCR) podjęto próbę sprawdzenia możliwości zastosowania techniki jednoetapowego PCR do uzyskania wzorów prążkowych DGGE bakterii utleniających amoniak. W tej pracy zaprezentowano wyniki analizy PCR-DGGE z użyciem technik nested i non-nested PCR oraz podjęto próbę wykazania ich wad i zalet.
    Źródło:
    Archives of Environmental Protection; 2014, 40, 4; 31-38
    2083-4772
    2083-4810
    Pojawia się w:
    Archives of Environmental Protection
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    The Application of PCR Reaction for Identification of MHB Bacteria Species
    Zastosowanie reakcji PCR do identyfikacji gatunkowej bakterii MHB
    Autorzy:
    Ząbkiewicz, A.
    Myga-Nowak, M.
    Bandurska, K.
    Paczyńska, J.
    Szybecka, A.
    Krupa, P.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/205412.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    mycorrhiza
    helper bacteria
    MHB
    16S rRNA gene
    mikoryza
    bakterie wspomagające
    gen 16sRNA
    Opis:
    This study characterizes mycorrhiza helper bacteria (MHB) from selected unpolluted locations as well as subjected to industrial emissions. To determine the species of bacteria isolated from the roots of ectomycorrhizal pine and birch, a method based on the sequence analysis of a 16S rRNA gene was used. The isolated bacteria were initially characterized by available biochemical methods and phenotypic observation. On the selected bacteria representatives isolation of DNA was performed, on which the PCR reaction was carried out. In this way amplified samples were automatically sequenced and the obtained results were compared to public databases. Among the isolated bacteria Pseudomonas fluorescens SBW25 and Burkholderia xenovorans LB400 species were dominant.
    W pracy scharakteryzowano bakterie wspomagające mikoryzę pochodzące z wybranych terenów ekologicznie czystych oraz z terenów poddanych emisji przemysłowej. Przedstawiono wykorzystanie metody opartej na analizie sekwencji genu 16S rRNA do określenia przynależności gatunkowej bakterii wyizolowanych z korzeni ektomikoryzowych sosny i brzozy. Wyizolowane bakterie zostały wstępnie scharakteryzowane przy pomocy dostępnych metod biochemicznych i obserwacji fenotypowej. Dla wybranych przedstawicieli dokonano izolacji DNA, względem którego przeprowadzono reakcję PCR. Powielone w ten sposób próbki automatycznie zsekwencjonowano, a uzyskane sekwencje porównywano w ogólnodostępnych bazach danych. Wśród wyizolowanych bakterii dominowały gatunki Pseudomonas fluorescens SBW25 oraz Burkholderia xenovorans LB400.
    Źródło:
    Archives of Environmental Protection; 2014, 40, 2; 115-122
    2083-4772
    2083-4810
    Pojawia się w:
    Archives of Environmental Protection
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-4 z 4

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies