Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Trikka, D." wg kryterium: Autor


Wyświetlanie 1-1 z 1
Tytuł:
Sampling Properties of Estimators of Nucleotide Diversity at Discovered snp Sites
Autorzy:
Renwick, A.
Bonnen, P. E.
Trikka, D.
Nelson, D. L.
Chakraborty, R.
Kimmel, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/908150.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
genetyka
statystyka
single nucleotide polymorphisms
ascertainment bias
nucleotide diversity
molecular evolution
Opis:
SNP sites are generally discovered by sequencing regions of the human genome in a limited number of individuals. This may leave SNP sites present in the region, but containing rare mutant nucleotides, undetected. Consequently, estimates of nucleotide diversity obtained from assays of detected SNP sites are biased. In this research we present a statistical model of the SNP discovery process, which is used to evaluate the extent of this bias. This model involves the symmetric Beta distribution of variant frequencies at SNP sites, with an additional probability that there is no SNP at any given site. Under this model of allele frequency distributions at SNP sites, we show that nucleotide diversity is always underestimated. However, the extent of bias does not seem to exceed 10-15% for the analyzed data. We find that our model of allele frequency distributions at SNP sites is consistent with SNP statistics derived based on new SNP data at ATM, BLM, RQL and WRN gene regions. The application of the theory to these new SNP data as well as to the literature data at the LPL gene region indicates that in spite of ascertainment biases, the observed differences of nucleotide diversity across these gene regions are real. This provides interesting evidence concerning the heterogeneity of the rates of nucleotide substitution across the genome.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2003, 13, 3; 385-394
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-1 z 1

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies