- Tytuł:
-
Modeling and simulation in KRAB zinc-finger research
Modelowanie i symulacja w badanich KRAB palców cynkowych - Autorzy:
-
Frischmuth, K.
Thiesen, H. J. - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/404049.pdf
- Data publikacji:
- 2010
- Wydawca:
- Polskie Towarzystwo Symulacji Komputerowej
- Tematy:
-
modelowanie
symulacja
palce cynkowe
KRAB
biologia systemowa
modelling
simulation
zinc fingers
systems biology - Opis:
-
The human genome encodes about 350 KRAB zinc finger genes. The KRAB domain represents one of the strongest repression domains found in mammalian organisms. Antisera against numerous KRAB-ZNF proteins have been generated to dissect their biological functions in respect to expression patterns in normal and cancer tissues, which finally allows systems biology oriented modeling approaches. By numerical simulation we study the temporal evolution of a set of genes, assuming a certain model for interactions between their expression levels. Classification methods like SVM play an important role in the identification of the model.
Geny człowieka kodują około 350 KRAB palców cynkowych. Dziedzina KRAB reprezentuje jedną z najmocniejszych dziedzin supresji pośród wszystkich znalezionych w organizmach ssaków. Wygenerowano antysera do licznych białek KRAB palców cynkowych, żeby rozróżnić ich funkcje biologiczne na podstawie poziomu ekspresji w tkankach zdrowych i rakowych. W ten sposób stworzono bazę do modelowania w ramach biologii systemowej. Za pomocą symulacji numerycznej badamy czasową ewolucję zbioru genów na podstawie pewnych założeń dotyczących interakcji między ich poziomami ekspresji. Przy identyfikacji modelu ważną rolę odgrywają metody klasyfikacji typu Maszyn Wektorów Podpierających. - Źródło:
-
Symulacja w Badaniach i Rozwoju; 2010, 1, 2; 131-137
2081-6154 - Pojawia się w:
- Symulacja w Badaniach i Rozwoju
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł